Из Википедии, свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Betatorquevirus
Классификация вирусов е
(без рейтинга):Вирус
Царство :incertae sedis
Царство:incertae sedis
Тип:incertae sedis
Класс:incertae sedis
Приказ:incertae sedis
Семья:Anelloviridae
Род:Betatorquevirus
Типовой вид
Torque teno mini virus 1
Виды [1]

Betatorquevirus является родом от вирусов в семье Anelloviridae , в группе II в классификации Балтимор . Род Betatorquevirus включает типовой вид Torque teno mini virus 1 и другие одноименные вирусы, пронумерованные от 1 до 12. Таким образом, термин «Torque teno mini virus» используется как синонимы Betatorquevirus .

Первоначальное открытие [ править ]

Открытие TTMV, как и оригинального изолята вируса Torque Teno (TTV), было случайным. После того, как TTV был выделен в 1997 году от пациента из Японии, были созданы праймеры для более подробного изучения TTV. TTV-специфические праймеры, использованные в ПЦР образцов плазмы человека, дали последовательности, которые частично совпадали с последовательностями TTV, но были заметно короче. [2] [3] В конечном итоге выяснилось, что геном TTV составляет 3,6–3,9 т.п.н., а геном TTMV - 2,8–2,9 т.п.н. Другой TT-подобный вирус, позже выделенный в 2007 году, Torque teno midi virus или TTMDV, имеет геном размером 3,2 т.п.н. [3]

Геном и капсид [ править ]

TTMV имеет сходные морфологические особенности с другими анелловирусами человека. Капсид имеет симметрию икосаэдра T = 1. [2] Вирион не имеет липидной оболочки и поэтому является «голым», что делает его чрезвычайно простым вирусом. По оценкам, вирион имеет диаметр чуть менее 30 нм. [2] [3]

Геном имеет форму круга и состоит из одноцепочечной ДНК отрицательной полярности. Его длина составляет 2,86–2,91 килобаз. [2] Анелловирусы известны наличием 3 или 4 перекрывающихся вложенных открытых рамок считывания; TTMV имеет 3 перекрывающихся ORF. [2] [4] ORF-2 и ORF-3 перекрываются с ORF-1 на противоположных концах. Для TTMV ORF-1 составляет около 663 остатков, а ORF-2 - около 91 остатка. [2] Сразу после ТАТА-бокса находится высококонсервативный участок длиной 130 нуклеотидов. [3]

Филогения и распространение [ править ]

TTMV сильно расходится. [2] [3] Первое филогенетическое дерево, созданное из геномных последовательностей TTMV, выявило большой кластер штаммов; ORF-1 имеет расхождения более 42% на уровне нуклеотидов и более 67% на уровне аминокислот. [2]

TTMV также широко распространен, как и другие анелловирусы человека. Последующие исследования после того, как это было обнаружено, показали, что распространенность ДНК TTMV среди доноров крови составляет 48–72%. [3] Вероятно, он может инфицировать широкий спектр тканей, так как был выделен из различных жидкостей и тканей организма, включая слюну, фекалии, плазму / сыворотку, PBMC , костный мозг, селезенку, поджелудочную железу, почки, нервную ткань, лимфатические узлы. , сперма и мазки из шейки матки. [2] [3] Его точный механизм передачи неизвестен, но считается, что он возможен через кровь, половым, фекально-оральным и респираторным путями. [2]

Недавние исследования показали, что люди могут иметь множественные инфекции TT-вирусов. [3] [4]

Клинический [ править ]

Хотя TTV потенциально связаны с заболеваниями, и их патогенность обсуждается с момента их открытия, TTMV в настоящее время не известен как явная причина каких-либо заболеваний человека. [2] TTMV был выделен из ряда parapneumoic эмпиемы . [5] Однако его клиническое значение остается неясным.

Ссылки [ править ]

  1. ^ «Таксономия вирусов: выпуск 2018b» (HTML) . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) . Март 2019 . Проверено 28 февраля 2020 .
  2. ^ a b c d e f g h i j k Спандоль, Соня; Чимпонериу, Данух; Берка, Лавиния Мариана; Михэеску, Григоре (апрель 2015 г.). «Анелловирусы человека: обновление молекулярных, эпидемиологических и клинических аспектов». Архив вирусологии . 160 (4): 893–908. DOI : 10.1007 / s00705-015-2363-9 . PMID 25680568 . 
  3. ^ Б с д е е г ч Окамото, H (2009). История открытий и патогенность вирусов TT . Актуальные темы микробиологии и иммунологии . 331 . С. 1–20. DOI : 10.1007 / 978-3-540-70972-5_1 . ISBN 978-3-540-70971-8. PMID  19230554 .
  4. ^ a b Чжан Ю (6 мая 2016 г.). «Новый вид мини-вируса крутящего момента тено (TTMV) в десневой ткани пациентов с хроническим пародонтитом» . Научные отчеты . 6 (26739): 26739. Bibcode : 2016NatSR ... 626739Z . DOI : 10.1038 / srep26739 . PMC 4879676 . PMID 27221159 .  
  5. ^ Гальмес J, Li Y, Rajoharison A, Ren L, Dollet S, Ричард N, Vernet G, Javouhey E, Ван J, Telles Ю.Н., Параньюс-Baccalà G (2012) Потенциальная Подразумевается новых крутящего момента TENO мини вирусов в парапневмонических плевры в дети. Eur Respir J

Внешние ссылки [ править ]

  • Таксономия вирусов ICTV, 2009 г.
  • Таксономия UniProt
  • Анелловирус в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
  • ICTVdb
  • ViralZone: Betatorquevirus