Anelloviridae является семья из вирусов . Они классифицируются как вирусы позвоночных и имеют капсид без оболочки, округлый с изометрической, икосаэдрической симметрией и число триангуляции 3.
Anelloviridae | |
---|---|
Классификация вирусов | |
(без рейтинга): | Вирус |
Царство : | incertae sedis |
Королевство: | incertae sedis |
Тип: | incertae sedis |
Класс: | incertae sedis |
Заказ: | incertae sedis |
Семья: | Anelloviridae |
Название происходит от итальянского anello «кольцо», обозначающего кольцевой геном анелловирусов.
Геном
Генома не является сегментированным и содержит одну молекулу круговой , отрицательной смысловой, одноцепочечной ДНК . Полный геном имеет длину 3000–4000 нуклеотидов . [1] Они также содержат некодирующую область с одной-двумя последовательностями 80–110 нуклеотидов, которые содержат высокое содержание GC, формируя вторичную структуру стержней и петель. [2] Геном имеет открытые рамки считывания и высокую степень генетического разнообразия. [3]
Хотя механизм репликации изучен недостаточно, anelloviridae, по-видимому, использует механизм катящегося круга, когда первая оцДНК превращается в дцДНК. Для репликации требуется полимераза хозяина, но сам геном не кодирует вирусную полимеразу, и в результате anelloviridae должны реплицироваться внутри ядра клетки. [4]
Anelloviridae также имеет две основные открытые рамки считывания, ORF1 и ORF2. Они инициируются двумя разными кодонами AUG. [5] Также могут быть сформированы дополнительные ORF. Эти ORF могут частично перекрываться. [2]
Считается, что ORF1 кодирует предполагаемый капсидный белок и связанный с репликацией белок анелловирусов. Специфическая роль этих белков, связанных с репликацией, все еще изучается. [6]
Считается, что ORF2 кодирует либо белок с активностью фосфатазы (TTMV), либо пептид, который подавляет NG-B-пути (TTV). Было замечено наличие высококонсервативного мотива в N-концевой части.
Клинический
Виды анелловирусов широко распространены и генетически разнообразны. Их виром присутствует у большинства людей. Они попадают в клетку в раннем возрасте и постоянно размножаются. [7] Это происходит в первый месяц жизни. Однако остается спорным вопрос о том, является ли первая инфекция симптоматической или нет. Они, вероятно, подавляются иммунитетом хозяина, поскольку анелловирусы увеличиваются во время иммуносупрессии хозяина. [5]
Общая распространенность среди населения в целом составляет более 90% и была обнаружена на всех континентах. [2] Они вызывают хронические вирусные инфекции человека, которые еще не были связаны с болезнью. Также нет доказательств того, что вирусный клиренс обнаруживается у инфицированных людей. [5] Как минимум 200 различных видов присутствуют у людей и животных. [8]
Было показано, что множественные методы передачи, такие как капли слюны и материнский или половой путь. [2]
Таксономия
Семейство включает следующие роды: [9]
- Алепторковирус
- Альфаторковирус
- Betatorquevirus
- Chitorquevirus
- Dalettorquevirus
- Deltatorquevirus
- Эпсилонторквирус
- Etatorquevirus
- Гамматорквирус
- Gimeltorquevirus
- Гировирус
- Hetorquevirus
- Iotatorquevirus
- Каппаторвирус
- Lambdatorquevirus
- Mutorquevirus
- Nutorquevirus
- Omegatorquevirus
- Omicrontorquevirus
- Pitorquevirus
- Psitorquevirus
- Роторквирус
- Sigmatorquevirus
- Tautorquevirus
- Tettorquevirus
- Thetatorquevirus
- Ипсилонторквирус
- Wawtorquevirus
- Xitorquevirus
- Zayintorquevirus
- Zetatorquevirus
Рекомендации
- ^ Управление ICTVdB (2006). 00.107.0.01. Анелловирус. В: ICTVdB - Универсальная база данных вирусов, версия 4. Бюхен-Осмонд, К. (Эд), Колумбийский университет, Нью-Йорк, США.
- ^ a b c d Бьяджини, Филипп (2011). Таксон вирусов . Эльзевир (Лондон).
- ^ Viralzone
- ^ Viralzone
- ^ а б в Качоровская, Иоанна; ван дер Хук, Лия (01.05.2020). «Анелловирусы человека: разнообразные, вездесущие и комменсальные члены вирома» . FEMS Microbiology Reviews . 44 (3): 305–313. DOI : 10.1093 / femsre / fuaa007 . ISSN 0168-6445 . PMC 7326371 . PMID 32188999 .
- ^ «Anelloviridae - вирусы оцДНК (2011 г.) - вирусы оцДНК (2011 г.) - ICTV» . talk.ictvonline.org . Проверено 20 ноября 2020 .
- ^ Фриер, Джулия; Магги, Фабрицио; Пиффери, Массимо; Ди Чикко, Мария Э .; Peroni, Diego G .; Пистелло, Мауро (10.04.2018). «Виром и его основной компонент, анелловирус, сложная система, формирующая иммунную защиту человека и, возможно, влияющая на развитие астмы и респираторных заболеваний в детстве» . Границы микробиологии . 9 : 686. DOI : 10,3389 / fmicb.2018.00686 . ISSN 1664-302X . PMC 5902699 . PMID 29692764 .
- ^ Бернардин Ф., Оперскальский Э., Буш М., Делварт Э. (май 2010 г.). «Трансфузионная передача широко распространенных комменсальных вирусов человека». Переливание . 50 (11): 2474–2483. DOI : 10.1111 / j.1537-2995.2010.02699.x . PMID 20497515 . S2CID 29973708 .
- ^ «Таксономия вирусов: выпуск 2020 г.» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV). Март 2021 . Проверено 23 мая 2021 года .
Внешние ссылки
- Анелловирус в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
- ICTVdb
- Вирусная зона