Alphatorquevirus является родом от вирусов в семье Anelloviridae , в группе II в классификации Балтимор . Он охватывает многие виды вируса, ранее известные как TTV, вирус, передаваемый при переливании крови, или вирус тено-тено, SENV, SANBAN и другие. [1] Род насчитывает 26 видов.
Альфаторковирус | |
---|---|
Классификация вирусов | |
(без рейтинга): | Вирус |
Царство : | incertae sedis |
Королевство: | incertae sedis |
Тип: | incertae sedis |
Класс: | incertae sedis |
Заказ: | incertae sedis |
Семья: | Anelloviridae |
Род: | Альфаторковирус |
Таксономия
В род входят следующие виды: [2]
- Вирус Torque teno chlorocebus 1
- Вирус Torque teno chlorocebus 2
- Вирус Torque teno chlorocebus 3
- Вирус Torque teno chlorocebus 5
- Torque teno virus 1
- Вирус Torque Teno 2
- Torque teno virus 3
- Torque teno virus 4
- Torque teno virus 5
- Torque teno virus 6
- Torque teno virus 7
- Torque teno virus 9
- Torque teno virus 10
- Torque teno virus 13
- Torque teno virus 14
- Torque teno virus 15
- Torque teno virus 17
- Torque teno virus 18
- Torque teno virus 19
- Torque teno virus 20
- Torque teno virus 21
- Torque teno virus 24
- Torque teno virus 25
- Torque teno virus 26
- Torque teno virus 29
- Torque teno virus 31
История
TTV, передаваемый при переливании крови, или вирус тено-тено, впервые был обнаружен у японского пациента в 1997 году ученым-исследователем Т. Нисидзава. [3] Вирус чрезвычайно распространен, даже у здоровых людей, так же , как 100% распространены в некоторых странах, и примерно 10% от доноров крови в Великобритании и США. Хотя сам по себе он не вызывает симптомов гепатита , он часто обнаруживается у пациентов с заболеванием печени. [4] По большей части считается, что инфекция TTV протекает бессимптомно .
Первоначально обнаруженный у японских пациентов с гепатитом неизвестной причины, TTV был обнаружен в различных популяциях без доказанной патологии, включая доноров крови. Этот новый вирус был первоначально обнаружен в 1997 году посредством анализа репрезентативных различий (RDA) в плазме японского пациента (инициалы TT) с посттрансфузионным гепатитом . Последовательность (N22) из 500 нуклеотидов ( нуклеотидов ) сначала была охарактеризована и в дальнейшем увеличена до примерно 3700 нуклеотидов (клон TA278). [5] В то время анализ последовательности показал, что TTV был связан с семейством Parvoviridae . В конце 1998 года два независимых исследования продемонстрировали наличие дополнительной GC-богатой области размером около 120 нуклеотидов, что привело к открытию кольцевой природы генома TTV (~ 3800 нуклеотидов). Это открытие установило родство TTV с семейством Circoviridae . [6]
Этимология
Первоначально вирус был назван TTV в честь пациента с инициалами TT. Позже было принято название вируса крутящего момента (ожерелья) teno (от латинского tenuis - «тонкий»), так как он сохранил первоначальную аббревиатуру. [7]
Вирусное распространение
Большое количество эпидемиологических исследований позволило четко указать на глобальное распространение вируса ( Африка , Северная и Южная Америка , Азия , Европа , Океания ) среди сельского и городского населения. Несмотря на то, что связь между инфекцией TTV и данной патологией не была показана, была предложена гипотеза о связи между вирусной нагрузкой и иммунным статусом хозяина. Более того, хотя изначально предполагалось, что он передается только при переливании крови [8], глобальное распространение вируса в популяциях и его обнаружение в различных биологических образцах (плазма, слюна, фекалии и т. Д.) Предполагают комбинированные способы распространения и в частности распространение каплями слюны. [9] Также была предложена передача половым путем. [10]
Родственные вирусы были обнаружены у шимпанзе, обезьян, африканских обезьян, тупай, цыплят, свиней, коров, овец и собак. [11]
Сообщалось о вертикальной передаче инфекции у свиней. [12] [13]
Геном
Геном TTV представляет собой кольцевой одноцепочечный фрагмент ДНК с отрицательным смыслом, длиной примерно 3,8 т.п.н. это вирус без оболочки с диаметром вириона около 40 нм. Несмотря на некоторое сходство с представителями группы Circoviridae , он не обладает гомологией последовательностей с какими-либо известными вирусами. Он относится к семейству Anelloviridae .
Его геном содержит 2 большие открытые рамки считывания , кодирующие 770 и 202 аминокислоты , а также несколько более мелких ORF. Геномная область -154 / -76 содержит критический промотор.
Изоляты были разделены на пять основных клад, пронумерованных от 1 до 5. В геногруппу 3 TTV также входят 8 штаммов вирусов, известных как от SENV-A до H.
Клинический
В настоящее время считается, что эти вирусы не вызывают заболевания у людей. Заражение этими вирусами, как правило, приводит к пожизненной виремии, и их возможная связь с заболеванием все еще исследуется. Более высокая, чем обычно, вирусная нагрузка была связана с тяжелыми идиопатическими воспалительными миопатиями, раком и волчанкой.
Исследование образцов фекалий 135 бразильцев с гастроэнтеритом показало наличие вируса у 121 (91%). [14] Наличие нескольких генотипов было обычным явлением.
Сообщалось о присутствии этого вируса при остром повреждении легких и обострениях идиопатического фиброза легких. [15]
Сообщалось о повышении вирусной нагрузки в случаях врожденной недостаточности связывающего маннозу лектина. [16]
Сообщалось о возможном случае апластической анемии с гепатитом. [17]
Сообщается об одном случае посттрансплантационного гепатита. [18]
Была предложена связь с раком головы / шеи. [19]
Репликация
О репликации TTV известно немного, однако, основываясь на исследованиях цирковирусов на животных, кажется, что необходима двухцепочечная структура репликации. Некоторые исследования описали присутствие двухцепочечной ДНК TTV в различных тканях и органах, что указывает на активную репликацию в этих локализациях. [20] Эти данные также минимизируют гипотетическое значение TTV при заболеваниях печени. В настоящее время нет других данных по TLMV (TTV-подобный мини-вирус - штамм, поражающий людей).
Рекомендации
- ^ Бьяджини P (2009). «Классификация TTV и родственных вирусов (анелловирусов)». Curr. Вершина. Microbiol. Иммунол . 331 : 21–33. DOI : 10.1007 / 978-3-540-70972-5_2 . PMID 19230555 .
- ^ «Таксономия вирусов: выпуск 2020 г.» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV). Март 2021 . Проверено 23 мая 2021 года .
- ^ Nishizawa, T; Окамото, H; Кониши, К; Yoshizawa, H; Миякава, Y; Маюми, М. (8 декабря 1997 г.). «Новый ДНК-вирус (TTV), связанный с повышенным уровнем трансаминаз при посттрансфузионном гепатите неизвестной этиологии». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях . 241 (1): 92–7. DOI : 10.1006 / bbrc.1997.7765 . PMID 9405239 .
- ^ Бьяджини, П: "Цирковирусы человека", страницы 95-101. Ветеринарная микробиология, 2004.
- ^ Nishizawa, T .; Окамото, H .; Кониши, К .; Yoshizawa, H .; Miyakawa, Y .; Маюми, М. (1997). «Новый ДНК-вирус (TTV), связанный с повышенным уровнем трансаминаз при посттрансфузионном гепатите неизвестной этиологии». Biochem. Биофиз. Res. Commun . 241 : 92–97. DOI : 10.1006 / bbrc.1997.7765 . PMID 9405239 .
- ^ Miyata, H .; Tsunoda, H .; Кази, А .; Yamada, A .; Хан, Массачусетс; Йунг, Би Джей; Murakami, J .; Камахора, Т .; Шираки, К .; Хино, С. (1999). «Идентификация новой GC-богатой 113-нуклеотидной области для завершения кольцевого однонитевого ДНК-генома вируса TT, первого цирковируса человека» . J. Virol . 73 (5): 3582–3586. DOI : 10,1128 / JVI.73.5.3582-3586.1999 . PMC 104131 . PMID 10196248 .
- ^ "Сайт AABB" (PDF) . Проверено 25 декабря 2017 года .
- ^ Biagini, P .; Gallian, P .; Cantaloube, JF; De Micco, P .; де Lamballerie, X. (1998). «Присутствие вируса TT у французских доноров крови и потребителей инъекционных наркотиков». J. Hepatol . 29 (4): 684–685. DOI : 10.1016 / s0168-8278 (98) 80167-0 . PMID 9824281 .
- ^ Gallian, P .; Biagini, P .; Чжун, С .; Louinssi, M .; Yeo, W .; Cantaloube, JF; Attoui, H .; de Micco, P .; Джонсон, П.Дж.; де Ламбальери, X. (2000). «Вирус TT: исследование молекулярной эпидемиологии и передачи генотипов 1, 2 и 3». J. Clin. Virol . 17 (1): 43–49. DOI : 10.1016 / s1386-6532 (00) 00066-4 . PMID 10814938 .
- ^ Чжэн, штат Мичиган; Линь, У; Ли, диджей; Руан, HB; Чен, Y; Ву, TT (2010). «Коинфекция TTV и HPV в мазках из шейки матки у пациентов с поражениями шейки матки в прибрежной зоне провинции Чжэцзян». Чжунхуа Ши Ян Хэ Линь Чуанг Бин дю Сюэ За Чжи . 24 (2): 110–112. PMID 21110428 .
- ^ Хино, S; Мията, H (2007). «Torque teno virus (TTV): текущее состояние». Rev Med Virol . 17 (1): 45–57. DOI : 10.1002 / rmv.524 . PMID 17146841 .
- ^ Мартинес-Гино, L; Кекарайнен, Т; Сегалес, Дж (2009). «Доказательства вертикальной передачи вируса Torque teno (TTV) у свиней». Териогенология . 71 (9): 1390–1395. DOI : 10.1016 / j.theriogenology.2009.01.010 . PMID 19249089 .
- ^ Поццуто, Т; Мюллер, Б. Михан, B; Ринглер, СС; Макинтош, штат Калифорния; Ellis, JA; Mankertz, A; Краковка, S (2009). « Внутриутробная передача тено-вирусов свиного крутящего момента». Vet Microbiol . 137 (3–4): 375–379. DOI : 10.1016 / j.vetmic.2009.02.001 . PMID 19282113 .
- ^ Пинхо-Насименто, Калифорния; Leite, JP; Niel, C; Диниз-Мендес, Л. (2011). «Вирус Torque teno в образцах кала пациентов с гастроэнтеритом: распространенность, распределение геногрупп и вирусная нагрузка». J Med Virol . 83 (6): 1107–11. DOI : 10.1002 / jmv.22024 . PMID 21503927 .
- ^ Wootton SC, Kim DS, Kondoh Y, Chen E, Lee JS, Song JW, Huh JW, Taniguchi H, Chiu C, Boushey H, Lancaster LH, Wolters PJ, Derisi J, Ganem D, Collard HR (2011) Вирусная инфекция при обострении идиопатического фиброза легких. Am J Respir Crit Care Med.
- ^ Maggi F, Pifferi M, Michelucci A, Albani M, Sbranti S, Lanini L, Simi P, Macchia P, Pistello M, Bendinelli M (2011) Размер нагрузки вируса Torque teno virus виремии у пациентов с выбранными врожденными дефектами врожденного иммунитета. Clin Vaccine Immunol. 18 (4): 692–694.
- ^ Ishimura M, Ohga S, Ichiyama M, Kusuhara K, Takada H, Hara T, Takahashi M, Okamoto H (2010) Апластическая анемия, ассоциированная с гепатитом, во время первичной инфекции вируса крутящего момента генотипа 1a. Eur J Pediatr. Июль 2010 г .; 169 (7): 899–902
- ^ Пьяджио Ж, Доди Ж, Bottino G, Andorno Е, Джентиле R, Ferrari С, Барабино G , Джанноне А, Immordino G, Miggino М, Магони Росси А, Moraglia Е, Gasloli G, Гелли М, Ферранте R, Морелли N, Casaccia M, Valente U (2009) Torque Teno Virus - причина вирусного заболевания печени после трансплантации печени: отчет о болезни. Transplant Proc. 41 (4): 1378–1379.
- ^ Hettmann, A; Demcsák, A; Бах, Б; Decsi, G; Dencs, Á; Палинко, D; Rovó, L; Надь, К; Минаровиц, Дж; Такач, М. (2016). «Обнаружение и филогенетический анализ Torque Teno Virus в образцах биопсии слюны и опухоли от пациентов с раком головы и шеи» . Интервирология . 59 (2): 123–129. DOI : 10.1159 / 000452974 . PMID 27924796 .
- ^ Окамото, H .; Nishizawa, T .; Takahashi, M .; Asabe, S .; Цуда, Ф .; Йошикава, А. (2001a). «Гетерогенное распределение вируса tt различных генотипов во многих тканях инфицированных людей». Вирусология . 288 (2): 358–368. DOI : 10.1006 / viro.2001.1097 . PMID 11601907 .
Внешние ссылки
- Таксономия вирусов ICTV, 2009 г. [1]
- Таксономия UniProt [2]
- Анелловирус в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
- ICTVdb
- ViralZone : Альфаторквирус