BioPlex ( б iophysical я nteractions из вывода RFeome основанного ком плекс ES) является открытым ресурсом доступа для изучения белка -protein взаимодействий. [1] [2] [3] Это результат сотрудничества Гарвардской медицинской школы и компании Biogen . BioPlex 1.0 сообщил о 23 744 взаимодействиях между 7 668 белками. [4] BioPlex 2.0 расширил эти наблюдения, чтобы обнаружить более 29 000 новых взаимодействий. [5]
Основная технология заключается в экспрессии белка-«приманки» в клетках человека. Эти белки приманки взаимодействуют с другими белками, и затем комплексы белков приманки и «жертвы» выделяются аффинной очисткой . Взаимодействующие белки жертвы идентифицируются с помощью масс-спектрометрии .
Использование в исследованиях [ править ]
Определение партнеров по взаимодействию плохо охарактеризованных белков может дать ключ к разгадке функции этих белков, а знание того, в каком «белковом сообществе» находится ген болезни, может дать лучший контекст для его действия. [5]
См. Также [ править ]
Ссылки [ править ]
- ^ анон. «БиоПлекс» . harvard.edu . harvard.edu . Дата обращения 24 мая 2017 .
- ^ анон (2015-07-18). «Facebook для протеома» . technology.org . technology.org . Дата обращения 24 мая 2017 .
- ^ анон. «Новое исследование отображает белковые взаимодействия для четверти генома человека» . Phys.org/ . Phys.org . Дата обращения 24 мая 2017 .
- ^ Huttlin EL, Ting L, Bruckner RJ, Gebreab F, Gygi MP, Szpyt J, Tam S, Zarraga G, Colby G, Baltier K, Dong R, Guarani V, Vaites LP, Ordureau A, Rad R, Erickson BK, Wühr M, Chick J, Zhai B, Kolippakkam D, Mintseris J, Obar RA, Harris T, Artavanis-Tsakonas S, Sowa ME, De Camilli P, Paulo JA, Harper JW, Gygi SP (2015). «Сеть BioPlex: систематическое исследование человеческого взаимодействия» . Cell . 162 (2): 425–40. DOI : 10.1016 / j.cell.2015.06.043 . PMC 4617211 . PMID 26186194 .
- ^ a b Huttlin EL, Bruckner RJ, Paulo JA, Cannon JR, Ting L, Baltier K, Colby G, Gebreab F, Gygi MP, Parzen H, Szpyt J, Tam S, Zarraga G, Pontano-Vaites L, Swarup S, White AE, Schweppe DK, Rad R, Erickson BK, Obar RA, Guruharsha KG, Li K, Artavanis-Tsakonas S, Gygi SP, Harper JW (2017). «Архитектура человеческого интерактома определяет белковые сообщества и сети болезней» . Природа . 545 (7655): 505–509. DOI : 10.1038 / nature22366 . PMC 5531611 . PMID 28514442 .
