 | |
| Разработчики) | Балаж Салкаи, Чаба Керепеси, Балинт Варга, Винс Гролмуш |
|---|---|
| Стабильный выпуск | 3.0 |
| Написано в | Perl , JavaScript , WebGL |
| Доступно в | английский |
| Тип | Коннектомика |
| Веб-сайт | pitgroup |
Сервер Budapest Reference Connectome вычисляет часто возникающие анатомические связи мозга 418 здоровых людей. [1] [2] Он был подготовлен из диффузионных наборов данных МРТ проекта Human Connectome в эталонный коннектом (или график мозга ), который можно загрузить в форматах CSV и GraphML и визуализировать на сайте в 3D.
Особенности [ править ]
Будапештский эталонный коннектом имеет 1015 узлов, соответствующих анатомически идентифицированным областям серого вещества. Пользователь может установить множество параметров, и результирующий консенсусный коннектом легко визуализируется на веб-странице. [2] Пользователи могут масштабировать, вращать и запрашивать анатомические метки узлов графического компонента.
Фон [ править ]
Будапештский справочный коннектом - это согласованный граф мозговых графов 96 субъектов в версии 2 и 418 субъектов в версии 3. Возвращаются только те ребра, которые присутствуют в заданном проценте субъектов. Каждое из выбранных ребер имеет определенный вес в каждом из графов, содержащих это ребро, поэтому эти множественные веса объединяются в один вес, беря либо их среднее (т.е. среднее), либо медианное значение. Пользовательский интерфейс позволяет настраивать эти параметры: пользователь может выбрать минимальную частоту возвращаемых ребер. Существует возможность просмотра и сравнения эталонных коннектомов типа "мама" или "папа". Женские коннектомы содержат значительно больше ребер, чем мужские, и большая часть ребер в женских коннектомах проходит между двумя полушариями. [3] [4][5]
Открытия [ править ]
Будапештский эталонный коннектом привел исследователей к открытию Консенсус-коннектомной динамики графов человеческого мозга . Ребра, появляющиеся на всех графах мозга, образуют связанный подграф вокруг ствола мозга . Позволяя постепенно уменьшать частоту ребер, этот основной подграф непрерывно растет, как куст . Динамика роста может отражать индивидуальное развитие мозга и давать возможность направить некоторые грани консенсусного графа человеческого мозга. [6]
Ссылки [ править ]
- ^ Szalkai, Балаж; и другие. (2015). "Будапештский эталонный сервер Connectome v2.0". Письма неврологии . 595 : 60–2. arXiv : 1412.3151 . DOI : 10.1016 / j.neulet.2015.03.071 . PMID 25862487 .
- ^ а б Салкаи, Балаж; Керепеси, Чаба; Варга, Балинт; Гролмуш, Винс (2017). «Параметризуемые консенсусные коннектомы из проекта Human Connectome: Будапештский эталонный сервер Connectome v3.0» . Когнитивная нейродинамика . 11 (1): 113–116. arXiv : 1602.04776 . DOI : 10.1007 / s11571-016-9407-Z . PMC 5264751 . PMID 28174617 .
- ^ Ingalhalikar, M .; Smith, A .; Паркер, Д .; Саттертуэйт, штат ТД; Эллиотт, Массачусетс; Ruparel, K .; Hakonarson, H .; Гур, RE; Гур, RC; Верма, Р. (2013). «Половые различия в структурном коннектоме человеческого мозга» . Труды Национальной академии наук . 111 (2): 823–828. Bibcode : 2014PNAS..111..823I . DOI : 10.1073 / pnas.1316909110 . ISSN 0027-8424 . PMC 3896179 . PMID 24297904 .
- ^ Szalkai, Балаж; Варга, Балинт; Гролмуш, Винс (2015). «Теоретический анализ графов показывает: женский мозг связан лучше, чем мужской» . PLOS ONE . 10 (7): e0130045. arXiv : 1501.00727 . Bibcode : 2015PLoSO..1030045S . DOI : 10.1371 / journal.pone.0130045 . ISSN 1932-6203 . PMC 4488527 . PMID 26132764 .
- ^ Szalkai, Балаж; Варга, Балинт; Гролмуш, Винс (2017). «Теоретико-графические параметры с компенсацией смещения размера мозга также лучше в женских структурных коннектомах». Визуализация мозга и поведение . DOI : 10.1007 / s11682-017-9720-0 . PMID 28447246 .
- ^ Керепеси, Чаба; и другие. (2016). «Как направить грани коннектомов: динамика консенсусных коннектомов и развитие связей в человеческом мозге» . PLOS ONE . 11 (6): e0158680. arXiv : 1509.05703 . Bibcode : 2016PLoSO..1158680K . DOI : 10.1371 / journal.pone.0158680 . PMC 4928947 . PMID 27362431 .
