Caenorhabditis tropicalis

Caenorhabditis tropicalis
Научная классификация
Царство:	Animalia
Тип:	Нематода
Класс:	Хромадорея
Заказ:	Рабдитида
Семья:	Рабдитиды
Род:	Caenorhabditis
Разновидность:	С. тропический
Биномиальное имя
*Caenorhabditis tropicalis* Феликс, Брэндл и Каттер, 2014 г. ^[1]
Синонимы
Caenorhabditis sp. 11

Caenorhabditis tropicalis - это вид нематод Caenorhabditis , принадлежащий к супергруппе Elegans и группе Elegans внутри этого рода. ^[2] Это близкий родственник C. wallacei. C. tropicalis часто собирают в тропиках Южной Америки, на Карибских островах и на различных островах в Индийском и Тихом океанах с гниющих фруктов, цветов и стеблей. C. tropicalis упоминался как « C. sp. 11 ”до 2014 г. ^[1]

Анатомия

Средняя длина тела взрослого гермафродита и взрослого самца C. tropicalis составила 1378,63 мкм и 992,85 мкм, соответственно, что делает самцов и гермафродитов C. tropicalis в среднем больше, чем у других видов-гермафродитов, таких как C. elegans и C. briggsae . ^[3]

Форма спикулы

Спикулы самцов C. tropicalis имеют длинную, тонкую, заостренную и простую морфологию, что является общей чертой среди видов Caenorhabditis за пределами надгруппы Elegans (за исключением C. japonica и C. afra ). ^[2]

Размножение

C. tropicalis демонстрирует гермафродитный способ размножения. ^[1] Подобно C. elegans и C. briggsae, андродомные популяции C. tropicalis состоят из протандрозных гермафродитов (кариотип половой хромосомы XX) и самцов X0. Эти три вида не являются ближайшими родственниками друг друга, что подтверждает независимое эволюционное происхождение гермафродитизма и андродиотизма . ^[1] Самовоспроизводящаяся гермафродитная репродуктивная стратегия этих видов является примером конвергентной эволюции .

Экология

C. tropicalis был впервые обнаружен на острове Реюньон в Индийском океане в 2008 году, с последующим сбором на островах Пуэрто-Рико и Кабо-Верде в Атлантическом океане, Французской Гвиане и Бразилии в Южной Америке и на Гавайях в Тихом океане. Образцы C. tropicalis пока отобраны только из тропических регионов. ^[2] Это один из наиболее часто собираемых видов Caenorhabditis в заповеднике Нураг во Французской Гвиане, где он был выделен как в образцах подстилки, так и в гниющих фруктах и цветах. ^[4]

Как и другие виды Caenorhabditis, обитающие в тропических лесах Французской Гвианы, C. tropicalis обычно встречается среди гниющих цветочных субстратов. Этот вид демонстрирует преимущественную связь с гниющими цветками на ранних стадиях распада, на что указывает снижение связи с цветками на более поздних стадиях распада. ^[4]

C. tropicalis продемонстрировал межвидовые ассоциации с Nematocida major , внутриклеточным патогеном, который, как также было замечено, связан с C. elegans и C. briggsae , двумя другими гермафродитными видами нематод Caenorhabditis . Инфекции N. major этими нематодами наблюдались только в тропических регионах, хотя C. elegans преимущественно встречается в регионах с умеренным климатом. ^[5]

Генетика

Геном эталонного штамма C. tropicalis JU1373 состоит из примерно 79,32 миллиона пар оснований и 22 326 генов, кодирующих белок. Эти характеристики генома делают его больше, чем геном C. elegans , который состоит примерно из 100,29 миллиона пар оснований и 20 326 генов, кодирующих белок. ^[6] Как и все известные виды Caenorhabditis , геном C. tropicalis разделен на шесть хромосом (пять аутосом и одна половая хромосома «X»).

Депрессия аутбридинга

Подобно другим видам Androdioecious Caenorhabditis, C. tropicalis демонстрирует депрессию аутбридинга, опосредованную Medea-подобными элементами, что может привести к летальности потомства C. tropicalis , что приводит к меньшим размерам популяции, вероятно, именно поэтому C. tropicalis сталкивается с эволюционным течением. давление, чтобы продемонстрировать высокие показатели инбридинга. Скрещивания между штаммами C. tropicalis, изолированными из разных мест, привели к более высокой частоте дефектного потомства по сравнению с скрещиваниями между штаммами C. tropicalis из одного и того же места. ^[7] Высокие показатели инбридинга у C. tropicalis.впоследствии привело к значительному снижению геномного разнообразия у этого вида по сравнению с другими нематодами Caenorhabditis . ^[8] C. tropicalis , наряду с C. briggsae и C. elegans , два других гермафродитных вида Caenorhabditis демонстрируют на 20-40% меньшие размеры генома по сравнению с гонохорическими видами или видами Caenorhabditis мужского и женского пола . ^[9]

использованная литература

^ ^a ^b ^c ^d Феликс, Мари-Анна; Брандл, Кристиан; Каттер, Ашер Д. (11 апреля 2014 г.). «Оптимизированная система для диагностики видов Caenorhabditis (Nematoda: Rhabditidae) с названиями 15 различных биологических видов» . PLOS ONE . 9 (4): e94723. Bibcode : 2014PLoSO ... 994723F . DOI : 10.1371 / journal.pone.0094723 . PMC 3984244 . PMID 24727800 .
^ a b c Кионтке, Карин С; Феликс, Мари-Анн; Эйлион, Майкл; Рокман, Мэтью V; Брандл, Кристиан; Пениго, Жан-Батист; Fitch, Дэвид Х.А. (2011 г.). «Филогения и молекулярные штрих-коды для Caenorhabditis с многочисленными новыми видами гниющих плодов» . BMC Evolutionary Biology . 11 (1): 339. DOI : 10.1186 / 1471-2148-11-339 . PMC 3277298 . PMID 22103856 . S2CID 3170363 .
^ Vielle, Энн; Каллемейн-Торре, Николас; Жимон, Клотильда; Пулле, Навсикая; Грей, Джереми К .; Каттер, Ашер Д .; Брандл, Кристиан (ноябрь 2016 г.). «Конвергентная эволюция гигантизма сперматозоидов и причины развития изменчивости размера сперматозоидов у нематод Caenorhabditis» (PDF) . Эволюция . 70 (11): 2485–2503. DOI : 10.1111 / evo.13043 . PMID 27565121 . S2CID 16937726 .
^ а б Феррари, Селин; Салле, Ромен; Каллемейн-Торре, Николас; Джовелин, Ричард; Каттер, Ашер Д .; Брандл, Кристиан (декабрь 2017 г.). «Колонизация эфемерных местообитаний и разнообразие неотропических видов нематод Caenorhabditis» . BMC Ecology . 17 (1): 43. DOI : 10,1186 / s12898-017-0150-г . PMC 5738176 . PMID 29258487 .
^ Чжан, Гаотянь; Сакс, Мартин; Прево, Мари-Кристин; Луаллен, Роберт Дж .; Troemel, Emily R .; Феликс, Мари-Анна (12 декабря 2016 г.). «Большая коллекция новых микроспоридий, инфицирующих нематоды, и их разнообразных взаимодействий с Caenorhabditis elegans и другими родственными нематодами» . PLOS Патогены . 12 (12): e1006093. DOI : 10.1371 / journal.ppat.1006093 . PMC 5179134 . PMID 27942022 .
^ Слос, Дитер; Sudhaus, Уолтер; Стивенс, Льюис; Берт, Вим; Блэкстер, Марк (23 февраля 2017 г.). «Caenorhabditis monodelphis sp. N .: определение морфологии стебля и геномики рода Caenorhabditis» (PDF) . BMC Zoology . 2 (1): 4. DOI : 10,1186 / s40850-017-0013-2 . S2CID 20541147 . ProQuest 2348204867 .
↑ Бен-Давид, Эяль; Плиота, Пинелопи; Widen, Sonya A .; Корешова, Алевтина; Лемус-Вергара, Цицики; Верпуховский, Филипп; Мандали, Шридхар; Брандл, Кристиан; Бурга, Алехандро; Кругляк, Леонид (март 2021 г.). «Вездесущие эгоистичные элементы токсина-антидота у видов Caenorhabditis» . Текущая биология . 31 (5): 990–1001.e5. DOI : 10.1016 / j.cub.2020.12.013 . PMID 33417886 . S2CID 230972352 .
^ Благородный, Люк М; Юэн, Джон; Стивенс, Льюис; Моя, Николас; Персо, Риад; Москателли, Марк; Джексон, Жаклин Л; Чжан, Гаотянь; Читракар, Роджин; Боуг, Л. Райан; Брандл, Кристиан; Андерсен, Эрик С; Зайдель, Ханна С; Рокман, Мэтью V (11 января 2021 г.). «Самопомощь - самый безопасный секс для Caenorhabditis tropicalis» . eLife . 10 : e62587. DOI : 10.7554 / elife.62587 . PMC 7853720 . PMID 33427200 .
^ Птица, Дэвид МакК .; Blaxter, Mark L .; Маккартер, Джеймс П .; Митрева, Македонка; Sternberg, Paul W .; Томас, В. Келли (декабрь 2005 г.). "Белая книга по сравнительной геномике нематод" . Журнал нематологии . 37 (4): 408–416. PMC 2620993 . PMID 19262884 .

внешняя ссылка

UniProt . «Caenorhabditis tropicalis» .

Эта статья о круглых червях Rhabditida незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[Félix_et_al_2014-1] Феликс, Мари-Анна; Брандл, Кристиан; Каттер, Ашер Д. (11 апреля 2014 г.). «Оптимизированная система для диагностики видов Caenorhabditis (Nematoda: Rhabditidae) с названиями 15 различных биологических видов» . PLOS ONE . 9 (4): e94723. Bibcode : 2014PLoSO ... 994723F . DOI : 10.1371 / journal.pone.0094723 . PMC 3984244 . PMID 24727800 .

[Kiontke_et_al_2011-2] Кионтке, Карин С; Феликс, Мари-Анн; Эйлион, Майкл; Рокман, Мэтью V; Брандл, Кристиан; Пениго, Жан-Батист; Fitch, Дэвид Х.А. (2011 г.). «Филогения и молекулярные штрих-коды для Caenorhabditis с многочисленными новыми видами гниющих плодов» . BMC Evolutionary Biology . 11 (1): 339. DOI : 10.1186 / 1471-2148-11-339 . PMC 3277298 . PMID 22103856 . S2CID 3170363 .

[Vielle_et_al_2016-3] Vielle, Энн; Каллемейн-Торре, Николас; Жимон, Клотильда; Пулле, Навсикая; Грей, Джереми К .; Каттер, Ашер Д .; Брандл, Кристиан (ноябрь 2016 г.). «Конвергентная эволюция гигантизма сперматозоидов и причины развития изменчивости размера сперматозоидов у нематод Caenorhabditis» (PDF) . Эволюция . 70 (11): 2485–2503. DOI : 10.1111 / evo.13043 . PMID 27565121 . S2CID 16937726 .

[Ferrari_et_al_2017-4] а б Феррари, Селин; Салле, Ромен; Каллемейн-Торре, Николас; Джовелин, Ричард; Каттер, Ашер Д .; Брандл, Кристиан (декабрь 2017 г.). «Колонизация эфемерных местообитаний и разнообразие неотропических видов нематод Caenorhabditis» . BMC Ecology . 17 (1): 43. DOI : 10,1186 / s12898-017-0150-г . PMC 5738176 . PMID 29258487 .

[Zhang_et_al_2016-5] Чжан, Гаотянь; Сакс, Мартин; Прево, Мари-Кристин; Луаллен, Роберт Дж .; Troemel, Emily R .; Феликс, Мари-Анна (12 декабря 2016 г.). «Большая коллекция новых микроспоридий, инфицирующих нематоды, и их разнообразных взаимодействий с Caenorhabditis elegans и другими родственными нематодами» . PLOS Патогены . 12 (12): e1006093. DOI : 10.1371 / journal.ppat.1006093 . PMC 5179134 . PMID 27942022 .

[Slos_et_al_2017-6] Слос, Дитер; Sudhaus, Уолтер; Стивенс, Льюис; Берт, Вим; Блэкстер, Марк (23 февраля 2017 г.). «Caenorhabditis monodelphis sp. N .: определение морфологии стебля и геномики рода Caenorhabditis» (PDF) . BMC Zoology . 2 (1): 4. DOI : 10,1186 / s40850-017-0013-2 . S2CID 20541147 . ProQuest 2348204867 .

[Ben-David_et_al_2021-7] Бен-Давид, Эяль; Плиота, Пинелопи; Widen, Sonya A .; Корешова, Алевтина; Лемус-Вергара, Цицики; Верпуховский, Филипп; Мандали, Шридхар; Брандл, Кристиан; Бурга, Алехандро; Кругляк, Леонид (март 2021 г.). «Вездесущие эгоистичные элементы токсина-антидота у видов Caenorhabditis» . Текущая биология . 31 (5): 990–1001.e5. DOI : 10.1016 / j.cub.2020.12.013 . PMID 33417886 . S2CID 230972352 .

[Noble_et_al_2021-8] Благородный, Люк М; Юэн, Джон; Стивенс, Льюис; Моя, Николас; Персо, Риад; Москателли, Марк; Джексон, Жаклин Л; Чжан, Гаотянь; Читракар, Роджин; Боуг, Л. Райан; Брандл, Кристиан; Андерсен, Эрик С; Зайдель, Ханна С; Рокман, Мэтью V (11 января 2021 г.). «Самопомощь - самый безопасный секс для Caenorhabditis tropicalis» . eLife . 10 : e62587. DOI : 10.7554 / elife.62587 . PMC 7853720 . PMID 33427200 .

[Bird_et_al_2005-9] Птица, Дэвид МакК .; Blaxter, Mark L .; Маккартер, Джеймс П .; Митрева, Македонка; Sternberg, Paul W .; Томас, В. Келли (декабрь 2005 г.). "Белая книга по сравнительной геномике нематод" . Журнал нематологии . 37 (4): 408–416. PMC 2620993 . PMID 19262884 .

[1]