Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску

Кармовирус
Journal.pone.0142415.g001.D.png
Просвечивающая электронная микрофотография вирионов вируса мягкой мозаики фасоли (BMMV)
Классификация вирусов
Группа:
Группа IV ( (+) оцРНК )
Семья:
Tombusviridae
Род:
Кармовирус
Типовой вид

Кармовирус - это род вирусов семейства Tombusviridae . Растения служат естественными хозяевами. В настоящее время в этом роду насчитывается 19 видов, включая типовой вид вируса крапчатости гвоздики . [1] [2] Он классифицируется по системе классификации Балтимора как вирус группы IV, имеющий одноцепочечныйгеном с положительной РНК . [3]

История [ править ]

Предложенный на собрании ICTV 1987 года как неназначенный род и отнесенный к Tombusviridae в 1993 году [4], ICTV распознает 19 видов на момент выпуска 2013 года. [3] [5]

В 1987 -м заседания следующего были предложено в качестве членов: гвоздика пятнистость вирус , вирус морщинки репы , вирус мозаики Galinsoga , вирус пятнистости Глицина , гибискус вирус хлоротичной кольцевой пятнистости (HCRSV) , вирус пролома цветка пеларгонии , вирус кактуса Saguaro . Вирус мозаики Galinsoga и вирус крапчатости глицина в настоящее время не являются членами.

Кроме того, следующий были предложены в качестве ориентировочных членов: Bean мягкого вирус мозаики , вирус пятнистости Blackgram * виген вирус пятнистости , бузины латентного вируса , * Дыня некротического вируса пятна , Нарцисс вирус Кончика некроз , вирус Подорожника 6 , Tephrosia бессимптомно вирус . (Таксономическое предложение 30) Только те, которые отмечены звездочкой *, были приняты до версии 2013 года.

Таксономия [ править ]

Группа: оцРНК (+)

Заказ: не назначен
  • Семья: Tombusviridae
    • Род: Carmovirus
      • Вирус, передаваемый через воду Ahlum
      • Вирус разрыва цветка ангелония
      • Вирус мягкой мозаики фасоли
      • Вирус крапчатости калибрахоа
      • Вирус хлоротической пятнистости кардамина
      • Вирус крапчатости гвоздики
      • Вирус крапчатости коровьего гороха
      • Переносимый через почву вирус огурца
      • Вирус хлоротической кольцевой пятнистости гибискуса
      • Вирус кольцевой пятнистости жимолости
      • Вирус некротического кольца радужки японского
      • Вирус некротической пятнистости дыни
      • Вирус очистки вен люпина нутка
      • Вирус некроза стеблей гороха
      • Вирус ломки цветков пеларгонии
      • Вирус кактуса сагуаро
      • Вирус желтой крапчатой ​​мозаики сои
      • Вирус морщинистости репы
      • Вирус Веддела, передающийся через воду

[2]

Структура [ править ]

Вирусы в Carmovirus не имеют оболочки, имеют икосаэдрическую и сферическую геометрию и симметрию T = 3. Диаметр составляет около 28-34 нм, состоит из 32 капсомеров. Геномы линейны, около 4-5,4 килобайт. Каждая субъединица состоит из 180 белков. По весу вирон на 80% состоит из белка и на 20% из нуклеиновых кислот. [1]

РодСтруктураСимметрияКапсидГеномное расположениеГеномная сегментация
КармовирусИкосаэдрТ = 3Без оболочкиЛинейныйОдночастный

Жизненный цикл [ править ]

Репликация вируса происходит в цитоплазме. Попадание в хозяйскую клетку достигается за счет проникновения в хозяйскую клетку. Репликация следует модели репликации вируса с положительной цепью РНК. Транскрипция вируса с положительной цепочкой РНК с использованием модели преждевременной терминации субгеномной транскрипции РНК является методом транскрипции. Трансляция происходит путем вирусной инициации и подавления прекращения. Вирус покидает клетку-хозяина за счет движения вируса по канальцам. Растения служат естественным хозяином. Пути передачи: механический, семенной и контактный. [1]

РодДетали хостаТканевый тропизмДетали входаДетали выпускаСайт репликацииСайт сборкиПередача инфекции
КармовирусРастенияНиктоВирусное движение; механическая инокуляцияВирусное движениеЦитоплазмаЦитоплазмаМеханический: контактный; семя

Рекомбинация [ править ]

Рекомбинация РНК часто происходит во время репликации кармовирусов, облегчая репарацию вирусного генома и способствуя изменчивости последовательностей. [6] Рекомбинация происходит с помощью механизма, при котором вирусная РНК-зависимая РНК-полимераза переключает матрицы во время синтеза РНК (рекомбинация с выбором копии). [6]

Эпидемиология [ править ]

Естественным хозяином вируса является вид Caryophyllaceae , ответственный за крапчатость гвоздики, но он может заразить гораздо более широкий круг растений. Симптомы - это локализованные поражения, в которых произошла гибель клеток. Вирус распространяется через членистоногие-векторы, несущие инфицированный сок. Хотя это заболевание широко распространено среди гвоздик, симптомы относительно легкие и не представляют серьезной проблемы. Однако у других растений, таких как лилия Калла , болезнь вызывает большее беспокойство, поскольку это растение имеет важное экономическое значение для Тайваня .

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c «Вирусная зона» . ExPASy . Дата обращения 15 июня 2015 .
  2. ^ а б ICTV. «Таксономия вирусов: выпуск 2014 г.» . Дата обращения 15 июня 2015 .
  3. ^ a b Неизвестный автор (2004). 00.074.0.02. Кармовирус. В: ICTVdB - Универсальная база данных вирусов , версия 3. Бюхен-Осмонд, К. (Эд), ICTVdB Management, Колумбийский университет, Нью-Йорк, США.
  4. ^ «ПРОТОКОЛ 7-го ЗАСЕДАНИЯ ICTV ЭДМОНТОН, КАНАДА, 12 АВГУСТА 1987» (PDF) . Архивировано из оригинального (PDF) 13 декабря 2014 года . Проверено 11 декабря 2014 .
  5. ^ История таксономии ICTV для Carmovirus
  6. ^ а б Ченг С.П., Надь П.Д. Механизм рекомбинации РНК в кармо- и томбусвирусах: доказательства переключения матрицы РНК-зависимой РНК-полимеразой in vitro. J Virol. 2003 ноя; 77 (22): 12033-47. DOI: 10.1128 / jvi.77.22.12033-12047.2003. PMID: 14581540; PMCID: PMC254248

Библиография [ править ]

  • Кармовирус, индекс вирусов Спрингера, 2011 г.

Внешние ссылки [ править ]

  • Вирусы растений Онлайн запись
  • ICTVdb запись
  • Описание статьи Вирусы растений
  • Вступление в Американское фитопатологическое общество
  • Вирусная зона : Кармовирус
  • ICTV