Вирус морщинки турнепса (TCV) является патогенным вирусом растений семейства Tombusviridae . Впервые он был выделен из репы ( Brassica campestris ssp. rapa ).
TCV представляет собой небольшой (4054 пары оснований ) одноцепочечный РНК-вирус с положительным смыслом (вирусная РНК имеет ту же ориентацию, что и мРНК). Было показано, что он заражает различные виды растений (включая Nicotiana benthamiana ), включая обычную модель растений, Arabidopsis thaliana . Его гРНК кодирует пять белков : p28 и p88 (репликация), p8 и p9 (движение) и CP (белок оболочки или капсидирование ). [1] Структура вируса была определена с разрешением 3,2 ангстрема с помощью рентгеновской кристаллографии в 1986 году.. [2]
В геноме TCV охарактеризован ряд некодирующих элементов РНК ; примерами являются шпилька 5 и основной промотор . [3] [4]
Репликация вирусной РНК начинается с миграции р28 на митохондриальную мембрану. p28 мигрирует к наружной митохондриальной мембране и инвагинирует ее; несколько молекул р88 приносят новообразованные везикулы. Вирусная РНК связывается с p28, связанным с мембраной, и РНК-зависимая РНК-полимераза , или p88, инициирует репликацию РНК с положительной цепью с образованием промежуточного соединения с отрицательной цепью. Промежуточный продукт с отрицательной цепью используется в качестве матрицы для получения потомства РНК с положительной цепью. [5] Белки оболочки p8, p9 и p38 участвуют в движении в растении. [6]
Было обнаружено , что небольшие вспомогательные вирусы , известные как сателлитные РНК , коинфицируют растения только в присутствии TCV. [7] Эти некодирующие РНК усиливают симптомы инфекции TCV. Размножение сателлитной РНК зависит от TCV и механизма хозяина. Сателлит C имеет гомологию последовательности с 3'-концом TCV, тогда как сателлит D имеет гомологию последовательности с 5'-концом спутника C.