Христос Узунис
Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Христос Узунис
Родился
Христос А. Узунис

1965 (55–56 лет)
Греция
Альма-матерУниверситет Аристотеля в Салониках (бакалавр)
Йоркский университет (магистр, доктор наук)
Научная карьера
Поля
Системы вычислительной биологии, биомедицина,
биоинформатика,
эволюция [1]
УчрежденияЕвропейская лаборатория молекулярной биологии
SRI Международный
европейский институт биоинформатики [2]
Королевский колледж Лондонский
центр исследований и технологий Эллада [3]
ТезисРоль сохранения последовательности в предсказании структуры белка.  (1993)
ДокторантКрис Сандер
Веб-сайтbcplab .wordpress .com / who / режиссер

Христос А. Узунис - вычислительный биолог и руководитель исследований в CERTH в Салониках . [4] [5] [1] [6]

Образование

Узунис получил степень бакалавра биологических наук в Университете Аристотеля в Салониках в 1987 году. [4] Затем он получил степень магистра наук. получил степень доктора биологических вычислений в Йоркском университете в 1988 году [4] и продолжил работу над докторской диссертацией с Крисом Сандером в Европейской лаборатории молекулярной биологии в Гейдельберге , Германия, получив докторскую степень в Йоркском университете в 1993 году [4] [7].

Карьера и исследования

После получения докторской степени Узунис был научным сотрудником программы Human Frontiers Science Program (HFSP) в SRI International , Менло-Парк, Калифорния . Ouzounis начал свою собственную лабораторию, исследование вычислительной геномики, в Европейской лаборатории молекулярной биологии , Европейского института биоинформатики (EMBL-EBI) в 1996 году.

Узунис перевел свою лабораторию в Лондонский Королевский колледж (KCL) в 2007 году в качестве профессора, председателя и директора Центра биоинформатики KCL. После реструктуризации King's в 2009-2010 годах он решил вернуться в Грецию , присоединившись к CPERI в CERTH в Салониках . Его исследовательские интересы включают структуру, функции и эволюцию генома, эволюцию функции белков, эволюцию систем обработки генетической информации, теорию и приложения сравнения биологических последовательностей, представление данных и знаний для геномики, неконтролируемое машинное обучение в очень больших наборах данных, вдохновленное биологией. аппаратная и программная инженерия (неопубликованные работы), синтетическая биология, экзобиология и научная коммуникация.

Некоторые из его наиболее известных вкладов в области вычислительной геномики включают автоматическую аннотацию последовательностей, [8] открытие методов геномного контекста, [9] [10] [11] вывод о метаболических путях из последовательностей генома, [12] [13 ] ] разработка методов крупномасштабной кластеризации сходства последовательностей, [14] [15] определение последнего универсального общего предка ( LUCA ), [16] [17] и количественная оценка моделей горизонтального переноса генов через "сеть" жизни". [18] Он также проявляет большой интерес к развитиювычислительная биология как образцовая парадигма в истории современной науки. [19]

Среди его бывших аспирантов Дэвид Крейл (2001), [ необходима цитата ] Антон Энрайт (2002) [ необходима ссылка ] Дж. М. Перегрин-Альварес (2003), [ цитата необходима ] Виктор Кунин (2004) [ необходима цитата ] Никос Дарзентас (2005) [ необходима цитата ] и Игнат Дроздов (2010). [ необходима цитата ]

Награды и награды

Узунис - заместитель редактора журнала PLOS Computational Biology (с 2007 г.). Он также является заместителем редактора журнала BioSystems и почетным редактором журнала Bioinformatics . Он является одним из основателей Международного общества вычислительной биологии (ISCB), инициативы «Микробиокосмос» (Греция), Греческого общества вычислительной биологии, биоинформатики и греческой биоинформатики. [4] Узунис был приглашенным профессором Университета Торонто (2011-2014).

использованная литература

  1. ^ a b Публикации Христоса Узуниса, проиндексированные Google Scholar
  2. ^ «От деревьев жизни к безмасштабным сетям: новое видение бактериальной эволюции» . Европейский Союз, CORDIS . CORDIS , Европейский Союз .
  3. ^ "Христос А. Узунис Биография" .
  4. ^ a b c d e "Консультативный совет фонда спасательной шлюпки" .
  5. ^ "Библиография Христоса Узуниса" . Проверено 5 октября 2019 .
  6. ^ Публикации Христоса Узуниса из Europe PubMed Central
  7. ^ Ouzounis, Christos (1993). Роль сохранения последовательности в предсказании структуры белка (кандидатская диссертация). Йоркский университет. OCLC 53486615 . EThOS uk.bl.ethos.387193 .  
  8. ^ Casari, G .; Андраде, Массачусетс; Bork, P .; Boyle, J .; Дарувар, А .; Ouzounis, C .; Schneider, R .; Tamames, J .; Валенсия, А .; Сандер, К. (1995-08-24). «Непростые времена для биоинформатики». Природа . 376 (6542): 647–648. Bibcode : 1995Natur.376..647C . DOI : 10.1038 / 376647a0 . hdl : 10993/19513 . ISSN 0028-0836 . PMID 7651513 .  
  9. ^ Ouzounis, C .; Кирпидес, Н. (1996). «Возникновение основных клеточных процессов в эволюции». Письма FEBS . 390 (2): 119–123. DOI : 10.1016 / 0014-5793 (96) 00631-х . ISSN 0014-5793 . PMID 8706840 .  
  10. ^ Tamames, J .; Casari, G .; Ouzounis, C .; Валенсия, А. (1997). «Консервативные кластеры функционально родственных генов в двух бактериальных геномах». Журнал молекулярной эволюции . 44 (1): 66–73. Bibcode : 1997JMolE..44 ... 66T . DOI : 10.1007 / pl00006122 . ISSN 0022-2844 . PMID 9010137 .  
  11. ^ Энрайт, AJ; Iliopoulos, I .; Кирпидес, Северная Каролина; Узунис, Калифорния (1999). «Карты взаимодействия белков для полных геномов на основе событий слияния генов». Природа . 402 (11): 87–90. Bibcode : 1999Natur.402 ... 86E . DOI : 10.1038 / 47056 . PMID 10573422 . 
  12. ^ Карп, PD; Ouzounis, C .; Пейли, С. (1996). «HinCyc: база знаний о полном геноме и метаболических путях H. influenzae». Ход работы. Международная конференция по интеллектуальным системам для молекулярной биологии . 4 : 116–124. ISSN 1553-0833 . PMID 8877511 .  
  13. ^ Карп, Питер Д .; Ouzounis, Christos A .; Мур-Кохлак, Кэролайн; Голдовский, Леон; Кайпа, Паллави; Арен, Даг; Цока, София; Дарзентас, Никос; Кунин Виктор; Лопес-Бигас, Нурия (2005). «Расширение коллекции BioCyc баз данных путей / геномов до 160 геномов» . Исследования нуклеиновых кислот . 33 (19): 6083–6089. DOI : 10.1093 / NAR / gki892 . ISSN 1362-4962 . PMC 1266070 . PMID 16246909 .   
  14. ^ Энрайт, AJ; van Dongen, S .; Узунис, Калифорния (2002). «Эффективный алгоритм для крупномасштабного обнаружения семейств белков» . Исследования нуклеиновых кислот . 30 (7): 1575–1584. DOI : 10.1093 / NAR / 30.7.1575 . PMC 101833 . PMID 11917018 .  
  15. ↑ Кунин, Виктор; Арен, Даг; Голдовский, Леон; Янссен, Пол; Узунис, Христос А. (2005). «Измерение сохранения генома по таксонам: разделенные штаммы и объединенные королевства» . Исследования нуклеиновых кислот . 33 (2): 616–621. DOI : 10.1093 / NAR / gki181 . ISSN 1362-4962 . PMC 548337 . PMID 15681613 .   
  16. ^ Kyrpides, N .; Overbeek, R .; Узунис, К. (1999). «Универсальные белковые семейства и функциональное содержание последнего универсального общего предка». Журнал молекулярной эволюции . 49 (4): 413–423. Bibcode : 1999JMolE..49..413K . DOI : 10.1007 / pl00006564 . ISSN 0022-2844 . PMID 10485999 .  
  17. ^ Ouzounis, Кристос A .; Кунин Виктор; Дарзентас, Никос; Голдовский, Леон (2006). «Минимальная оценка генного содержания последнего универсального общего предка - экзобиология с наземной точки зрения». Исследования в области микробиологии . 157 (1): 57–68. DOI : 10.1016 / j.resmic.2005.06.015 . ISSN 0923-2508 . PMID 16431085 .  
  18. ↑ Кунин, Виктор; Голдовский, Леон; Дарзентас, Никос; Узунис, Христос А. (2005). «Сеть жизни: реконструкция микробной филогенетической сети» . Геномные исследования . 15 (7): 954–959. DOI : 10.1101 / gr.3666505 . ISSN 1088-9051 . PMC 1172039 . PMID 15965028 .   
  19. ^ Ouzounis, Christos A. (2012). «Взлет и упадок биоинформатики? Перспективы и прогресс» . PLOS вычислительная биология . 8 (4): e1002487. Bibcode : 2012PLSCB ... 8E2487O . DOI : 10.1371 / journal.pcbi.1002487 . ISSN 1553-7358 . PMC 3343106 . PMID 22570600 .   
Источник « https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Christos_Ouzounis&oldid=1043692321 »
Contribute a better translation