Page semi-protected
Listen to this article
Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску

Эволюция - это изменение наследственных характеристик биологических популяций на протяжении последующих поколений . [1] [2] Эти характеристики являются выражениями из генов , которые передаются от родителей к потомству во время воспроизведения . Различные характеристики, как правило, существуют в любой данной популяции в результате мутации , генетической рекомбинации и других источников генетической изменчивости . [3] Эволюция происходит, когда эволюционные процессы, такие как естественный отбор (включаяполовой отбор ) и генетический дрейф влияют на эту вариацию, в результате чего определенные характеристики становятся более частыми или редкими в популяции. [4] Именно этот процесс эволюции привел к появлению биоразнообразия на всех уровнях биологической организации , включая уровни видов , отдельных организмов и молекул . [5] [6]

Научная теория эволюции путем естественного отбора была задумана независимо от Чарльза Дарвина и Альфреда Рассела Уоллеса в середине 19-го века и подробно изложены в книге Дарвина Происхождение видов . [7] Эволюция путем естественного отбора была впервые продемонстрирована наблюдением, что часто рождается больше потомства, чем может выжить. Далее следуют три наблюдаемых факта о живых организмах: (1) признаки различаются у разных людей в отношении их морфологии, физиологии и поведения ( фенотипическая изменчивость ), (2) разные черты придают разную скорость выживания и воспроизводства.(дифференциальная приспособленность ) и (3) признаки могут передаваться из поколения в поколение ( наследуемость приспособленности). [8] Таким образом, в последовательных поколениях члены популяции с большей вероятностью будут заменены потомками родителей с благоприятными характеристиками, которые позволили им выживать и воспроизводиться в соответствующей среде . В начале 20 века другие конкурирующие идеи эволюции, такие как мутационизм и ортогенез, были опровергнуты, поскольку современный синтез примирил дарвиновскую эволюцию с классической генетикой., который установил, что адаптивная эволюция вызвана естественным отбором, воздействующим на менделевскую генетическую изменчивость. [9]

У всей жизни на Земле есть последний универсальный общий предок (LUCA) [10] [11] [12], который жил примерно 3,5–3,8 миллиарда лет назад. [13] Окаменелости включают в себя переход от раннего биогенного графита , [14] к микробному мату ископаемых, [15] [16] [17] к фоссилизируемым многоклеточные организмам . Существующие модели биоразнообразия сформировались в результате многократного образования новых видов ( видообразование ), изменений внутри видов ( анагенез ) и утраты видов ( исчезновение).) на протяжении всей эволюционной истории жизни на Земле. [18] Морфологические и биохимические признаки более схожи между видами, имеющими более позднего общего предка , и могут быть использованы для реконструкции филогенетических деревьев . [19] [20]

Эволюционные биологи продолжали изучать различные аспекты эволюции, формируя и проверяя гипотезы, а также конструируя теории, основанные на данных, полученных в полевых или лабораторных условиях, и на данных, полученных с помощью методов математической и теоретической биологии . Их открытия повлияли не только на развитие биологии, но и на множество других научных и промышленных областей, включая сельское хозяйство , медицину и информатику . [21]

История эволюционной мысли

Лукреций
Альфред Рассел Уоллес
Томас Роберт Мальтус
В 1842 году Чарльз Дарвин написал свой первый набросок « Происхождение видов» . [22]

Классические времена

Предположение, что один тип организмов мог происходить от другого, восходит к некоторым первым досократовским греческим философам , таким как Анаксимандр и Эмпедокл . [23] Такие предложения сохранились до римских времен. Поэт и философ Лукреций следовал Эмпедокла в его мастерской De Rerum Natura ( О природе вещей ). [24] [25]

Средневековый

В отличие от этих материалистических взглядов, аристотелизм рассматривал все естественные вещи как актуализацию фиксированных природных возможностей, известных как формы . [26] [27] Это было частью средневекового телеологического понимания природы, в котором все вещи должны играть определенную роль в божественном космическом порядке. Вариации этой идеи стали стандартным пониманием средневековья и были интегрированы в христианскуюобучения, но Аристотель не требовал, чтобы реальные типы организмов всегда однозначно соответствовали точным метафизическим формам, и конкретно приводил примеры того, как могут возникать новые типы живых существ. [28]

Додарвиновский

В 17 - м веке, новый метод в современной науке отверг аристотелевскую подход. Он искал объяснения природных явлений в терминах физических законов, которые были одинаковыми для всех видимых вещей и не требовали существования каких-либо фиксированных природных категорий или божественного космического порядка. Однако этот новый подход медленно укоренился в биологических науках, последнем бастионе концепции фиксированных природных типов. Джон Рэй применил один из ранее более общих терминов для фиксированных природных типов, «виды», к типам растений и животных, но он строго определил каждый тип живых существ как вид и предложил, чтобы каждый вид мог быть определен по характеристикам, которые увековечили сами поколение за поколением.[29] Биологическая классификация, введенная Карлом Линнеем в 1735 году, явно признала иерархическую природу видовых отношений, но все же рассматривала виды как фиксированные в соответствии с божественным планом. [30]

Другие естествоиспытатели того времени размышляли об эволюционном изменении видов с течением времени в соответствии с законами природы. В 1751 году Пьер Луи Мопертюи писал о естественных модификациях, происходящих во время воспроизводства и накапливающихся в течение многих поколений для создания новых видов. [31] Жорж-Луи Леклерк, граф де Бюффон предположил, что виды могут перерождаться в разные организмы, а Эразм Дарвин предположил, что все теплокровные животные могли происходить от одного микроорганизма (или «нити»). [32] Первой полноценной эволюционной схемой была теория «трансмутации» Жан-Батиста Ламарка 1809 года [33], которая предусматриваласпонтанное зарождение, непрерывно производящее простые формы жизни, которые развивали большую сложность в параллельных линиях с присущей прогрессивной тенденцией, и постулировал, что на локальном уровне эти линии адаптировались к окружающей среде, унаследовав изменения, вызванные их использованием или неиспользованием родителями. [34] (Последний процесс позже был назван ламаркизмом .) [34] [35] [36] Эти идеи были осуждены авторитетными натуралистами как предположения, лишенные эмпирической поддержки. В частности, Жорж Кювье настаивал на том, что виды не связаны между собой и фиксированы, а их сходство отражает божественный замысел для функциональных нужд. Тем временем идеи доброжелательного дизайна Рэя были развитыУильям Пейли в « Естественное богословие или свидетельства существования и атрибутов божества» (1802 г.), в котором предлагались сложные приспособления как свидетельство божественного замысла и которым восхищался Чарльз Дарвин. [37] [38]

Дарвиновская революция

Решающий разрыв с концепцией постоянных типологических классов или типов в биологии произошел с теорией эволюции через естественный отбор, которую Чарльз Дарвин сформулировал в терминах переменных популяций. Дарвин использовал выражение « происхождение с модификацией », а не «эволюция». [39] Отчасти под влиянием «Эссе о принципе народонаселения» (1798 г.) Томаса Роберта МальтусаДарвин отметил, что рост населения приведет к «борьбе за существование», в которой преобладают благоприятные вариации по мере того, как другие погибают. В каждом поколении многие потомки не доживают до эпохи воспроизводства из-за ограниченных ресурсов. Это могло бы объяснить разнообразие растений и животных от общей родословной через действие законов природы одинаково для всех типов организмов. [40] [41] [42] [43] Дарвин развивал свою теорию «естественного отбора» с 1838 года и писал свою «большую книгу» по этому вопросу, когда Альфред Рассел Уоллес прислал ему версию практически той же теории в 1858 г. Их отдельные статьи были представлены вместе на заседании 1858 г.Линнеевское общество Лондона . [44] В конце 1859 года Дарвин опубликовал свой «реферат» под названием «Происхождение видов», который подробно объяснил естественный отбор таким образом, что привел к все более широкому принятию дарвиновских концепций эволюции за счет альтернативных теорий . Томас Генри Хаксли применил идеи Дарвина к людям, используя палеонтологию и сравнительную анатомию, чтобы предоставить убедительные доказательства того, что люди и обезьяны имели общее происхождение. Некоторых это беспокоило, поскольку это подразумевало, что у людей нет особого места во Вселенной . [45]

Пангенезис и наследственность

Механизмы репродуктивной наследственности и происхождение новых признаков оставались загадкой. С этой целью Дарвин разработал свою предварительную теорию пангенезиса . [46] В 1865 году Грегор Мендель сообщил, что черты наследуются предсказуемым образом через независимый набор и сегрегацию элементов (позже известных как гены). В конечном итоге законы наследования Менделя вытеснили большую часть теории пангенезиса Дарвина. [47] Август Вейсманн провел важное различие между половыми клетками , дающими начало гаметам (например, сперматозоидами и яйцеклетками ), и соматическими клетками.тела, демонстрируя, что наследственность передается только по зародышевой линии. Хьюго де Фрис соединил теорию пангенеза Дарвина с различием клеток зародыша и сомы Вейсмана и предположил, что пангены Дарвина концентрируются в ядре клетки и при экспрессии могут перемещаться в цитоплазму, чтобы изменить структуру клетки . Де Фрис был также одним из исследователей, которые сделали работу Менделя широко известной, полагая, что менделевские черты соответствуют передаче наследственных вариаций вдоль зародышевой линии. [48] Чтобы объяснить, как возникают новые варианты, де Фрис разработал теорию мутаций.это привело к временному разрыву между теми, кто принимал дарвиновскую эволюцию, и биометристами, которые были союзниками де Вриза. [49] [50] В 1930-х годах пионеры в области популяционной генетики , такие как Рональд Фишер , Сьюэлл Райт и Дж. Б.С. Холдейн, заложили основы эволюции на прочную статистическую философию. Таким образом было разрешено ложное противоречие между теорией Дарвина, генетическими мутациями и менделевской наследственностью . [51]

'Современный синтез'

В 1920-х и 1930-х годах так называемый современный синтез соединил естественный отбор и популяционную генетику, основанную на менделевской наследственности, в единую теорию, которая применялась в целом к ​​любой отрасли биологии. Современный синтез объяснил закономерности, наблюдаемые у разных видов в популяциях, через переходы ископаемых в палеонтологии. [51]

Дальнейшие синтезы

С тех пор современный синтез получил дальнейшее развитие в свете многочисленных открытий для объяснения биологических явлений во всей и интегративной шкале биологической иерархии , от генов до популяций. [52]

Публикация структуры ДНК по Джеймс Уотсон и Фрэнсис Крик с вкладом Розалинд Франклин в 1953 году показали , физический механизм наследования. [53] Молекулярная биология улучшила понимание взаимосвязи между генотипом и фенотипом . Также были достигнуты успехи в филогенетической систематике , отображающей переход признаков в сравнительную и проверяемую структуру посредством публикации и использования эволюционных деревьев . [54] В 1973 году биолог-эволюционист Феодосий Добжанский написал, что "ничто в биологии не имеет смысла, кроме как в свете эволюции , «потому что оно выявило связи между тем, что сначала казалось разрозненными фактами естественной истории, в связную объяснительную совокупность знаний, которая описывает и предсказывает многие наблюдаемые факты о жизни на этой планете. [55]

Одно расширение, известное как эволюционная биология развития и неофициально называемое «evo-DevO», подчеркивает, как изменения между поколениями (эволюция) влияют на паттерны изменений внутри отдельных организмов ( развитие ). [56] [57] С начала 21 века и в свете открытий, сделанных в последние десятилетия, некоторые биологи выступали за расширенный эволюционный синтез , который мог бы объяснить эффекты негенетических способов наследования, таких как эпигенетика , родительские эффекты , экологическая и культурная наследственность , а также способность к развитию . [58] [59]

Наследственность

Структура ДНК . Основания в центре, окружены фосфатно-сахарными цепями двойной спирали .

Эволюция организмов происходит через изменение наследственных черт - унаследованных характеристик организма. У людей, например, цвет глаз является наследственной характеристикой, и человек может унаследовать «черту карих глаз» от одного из своих родителей. [60] Унаследованные признаки контролируются генами, и полный набор генов в геноме организма (генетическом материале) называется его генотипом. [61]

Полный набор наблюдаемых признаков, составляющих структуру и поведение организма, называется его фенотипом. Эти черты возникают из-за взаимодействия его генотипа с окружающей средой. [62] В результате многие аспекты фенотипа организма не наследуются. Например, загорелая кожа возникает в результате взаимодействия генотипа человека и солнечного света; таким образом, загар не передается детям людей. Однако некоторые люди загорают легче, чем другие, из-за различий в генотипах; Яркий пример - люди с наследственной чертой альбинизма , которые совсем не загорают и очень чувствительны к солнечным ожогам . [63]

Наследственные черты передаются от одного поколения к другому через ДНК, молекулу, которая кодирует генетическую информацию. [61] ДНК представляет собой длинный биополимер, состоящий из четырех типов оснований. Последовательность оснований в определенной молекуле ДНК определяет генетическую информацию аналогично последовательности букв, составляющих предложение. Перед делением клетки ДНК копируется, так что каждая из двух полученных клеток унаследует последовательность ДНК. Части молекулы ДНК, которые определяют одну функциональную единицу, называются генами; разные гены имеют разные последовательности оснований. Внутри клетки длинные цепи ДНК образуют конденсированные структуры, называемые хромосомами . Конкретное расположение последовательности ДНК в хромосоме известно каклокус . Если последовательность ДНК в локусе у разных людей различается, разные формы этой последовательности называются аллелями. Последовательности ДНК могут изменяться в результате мутаций, производя новые аллели. Если в гене происходит мутация, новый аллель может повлиять на признак, который контролирует ген, изменяя фенотип организма. [64] Однако, хотя это простое соответствие между аллелем и признаком работает в некоторых случаях, большинство признаков являются более сложными и контролируются локусами количественных признаков (множественными взаимодействующими генами). [65] [66]

Недавние открытия подтвердили важные примеры наследственных изменений, которые нельзя объяснить изменениями последовательности нуклеотидов в ДНК. Эти явления классифицируются как системы эпигенетической наследственности. [67] метилирование ДНК маркировки хроматин , самоподдерживающийся метаболические циклы, молчание генов с помощью РНК - интерференции и трехмерная конформация из белков (таких как прионы ) являются областями , где эпигенетические системы наследования были обнаружены на организмическую уровне. [68] Биологи развития предполагают, что сложные взаимодействия в генетических сетяхи коммуникация между клетками может приводить к наследственным вариациям, которые могут лежать в основе некоторых механизмов пластичности развития и канализации . [69] Наследственность может также иметь место в еще более крупных масштабах. Например, экологическая наследственность в процессе создания ниши определяется регулярной и повторяющейся деятельностью организмов в окружающей их среде. Это порождает унаследованные эффекты, которые изменяют и возвращают режим выбора последующих поколений. Потомки наследуют гены и характеристики окружающей среды, порожденные экологическими действиями предков. [70] Другие примеры наследуемости в эволюции, которые не находятся под прямым контролем генов, включают наследованиекультурные особенности и симбиогенез . [71] [72]

Источники вариации

Черный морф в эволюции берёзовой бабочки

Эволюция может происходить, если в популяции достаточно генетических вариаций . Вариации происходят из-за мутаций в геноме, перетасовки генов в результате полового размножения и миграции между популяциями ( поток генов ). Несмотря на постоянное введение новых вариаций через мутации и поток генов, большая часть генома вида идентична у всех особей этого вида. [73] Однако даже относительно небольшие различия в генотипах могут привести к резким различиям в фенотипах: например, шимпанзе и люди различаются только примерно в 5% геномов. [74]

Фенотип отдельного организма является результатом как его генотипа, так и влияния окружающей среды, в которой он жил. Значительная часть фенотипической изменчивости в популяции вызвана генотипической изменчивостью. [66] Современный эволюционный синтез определяет эволюцию как изменение во времени этой генетической вариации. Частота одного конкретного аллеля станет более или менее преобладающей по сравнению с другими формами этого гена. Вариация исчезает, когда новый аллель достигает точки фиксации - когда он либо исчезает из популяции, либо полностью заменяет предковый аллель. [75]

До открытия менделевской генетики распространенной гипотезой было смешанное наследование . Но при смешанном наследовании генетическая изменчивость будет быстро утеряна, что сделает эволюцию путем естественного отбора маловероятной. Принцип Харди – Вайнберга позволяет решить, как поддерживается вариация в популяции с менделевским наследованием. Частоты аллелей (вариаций в гене) останутся постоянными при отсутствии отбора, мутации, миграции и генетического дрейфа. [76]

Мутация

Дублирование части хромосомы

Мутации - это изменения в последовательности ДНК генома клетки. Когда происходят мутации, они могут изменить продукт гена , или помешать гену функционировать, или не иметь никакого эффекта. На основании исследований на мухе Drosophila melanogaster было высказано предположение, что если мутация изменяет белок, продуцируемый геном, это, вероятно, будет вредным, причем около 70% этих мутаций будут иметь повреждающие эффекты, а остальные будут либо нейтральными, либо слабыми. выгодный. [77]

Мутации могут включать дублирование больших участков хромосомы (обычно в результате генетической рекомбинации ), что может привести к появлению дополнительных копий гена в геноме. [78] Дополнительные копии генов являются основным источником сырья, необходимого для развития новых генов. [79] Это важно, потому что большинство новых генов эволюционируют внутри генных семейств из уже существующих генов, имеющих общих предков. [80] Например, человеческий глаз использует четыре гена для создания структур, воспринимающих свет: три для цветного зрения и один для ночного видения ; все четверо произошли от одного предкового гена. [81]

Новые гены могут быть сгенерированы из наследственного гена, когда дублирующаяся копия мутирует и приобретает новую функцию. Этот процесс становится проще после дублирования гена, потому что это увеличивает избыточность системы; один ген в паре может приобретать новую функцию, в то время как другая копия продолжает выполнять свою первоначальную функцию. [82] [83] Другие типы мутаций могут даже генерировать совершенно новые гены из ранее некодирующей ДНК. [84] [85]

Генерация новых генов может также включать дупликацию небольших частей нескольких генов, при этом эти фрагменты затем рекомбинируются с образованием новых комбинаций с новыми функциями. [86] [87] Когда новые гены собираются из перетасованных ранее существовавших частей, домены действуют как модули с простыми независимыми функциями, которые можно смешивать вместе для создания новых комбинаций с новыми и сложными функциями. [88] Например, поликетидсинтазы - это крупные ферменты, которые производят антибиотики ; они содержат до ста независимых доменов, каждый из которых катализирует один этап в общем процессе, например этап на конвейере. [89]

Секс и рекомбинация

У бесполых организмов гены наследуются вместе или связаны , поскольку они не могут смешиваться с генами других организмов во время воспроизводства. Напротив, потомство половых организмов содержит случайные смеси хромосом их родителей, которые производятся посредством независимого отбора. В родственном процессе, называемом гомологичной рекомбинацией , половые организмы обмениваются ДНК между двумя совпадающими хромосомами. [90] Рекомбинация и повторная сортировка не изменяют частоты аллелей, а вместо этого изменяют, какие аллели связаны друг с другом, производя потомство с новыми комбинациями аллелей. [91] Пол обычно увеличивает генетическую изменчивость и может увеличить скорость эволюции. [92][93]

Эта диаграмма показывает двойную цену секса . Если каждый человек были внести свой вклад в такое же количество потомства (два), (а) сексуальное население остается тем же самым размером каждого поколения, где (б) бесполое размножение парный населения в размере каждого поколения.

Двукратная стоимость секса впервые была описана Джоном Мейнардом Смитом . [94] Первая цена заключается в том, что у видов с половым диморфизмом только один из двух полов может рожать детенышей. Эта стоимость не распространяется на виды-гермафродиты, такие как большинство растений и многих беспозвоночных . Вторая цена заключается в том, что любой человек, который размножается половым путем, может передать только 50% своих генов любому отдельному потомству, и еще меньше передается с каждым новым поколением. [95] Тем не менее, половое размножение - более распространенный способ размножения среди эукариот и многоклеточных организмов. Гипотеза красной королевыбыл использован для объяснения значения полового размножения как средства обеспечения непрерывной эволюции и адаптации в ответ на коэволюцию с другими видами в постоянно меняющейся среде. [95] [96] [97] [98]

Генетический поток

Поток генов - это обмен генами между популяциями и между видами. [99] Следовательно, он может быть источником изменчивости, который является новым для популяции или вида. Поток генов может быть вызван перемещением особей между отдельными популяциями организмов, что может быть вызвано перемещением мышей между внутренними и прибрежными популяциями или перемещением пыльцы между толерантными к тяжелым металлам и чувствительными к тяжелым металлам популяциями травы.

Перенос генов между видами включает образование гибридных организмов и горизонтальный перенос генов . Горизонтальный перенос генов - это перенос генетического материала от одного организма к другому, не являющемуся его потомством; это наиболее распространено среди бактерий . [100] В медицине это способствует распространению устойчивости к антибиотикам , поскольку, когда одна бактерия приобретает гены устойчивости, она может быстро передать их другим видам. [101] Произошел горизонтальный перенос генов от бактерий к эукариотам, таким как дрожжи Saccharomyces cerevisiae и долгоносик из фасоли адзуки Callosobruchus chinensis . [102][103] Примером крупномасштабного переноса являются бделлоидные эукариотические коловратки , которые получили ряд генов от бактерий, грибов и растений. [104] Вирусы также могут переносить ДНК между организмами, что позволяет переносить гены даже через биологические домены . [105]

Масштабный перенос генов также произошел между предками эукариотических клеток и бактериями во время приобретения хлоропластов и митохондрий . Возможно, сами эукариоты произошли в результате горизонтального переноса генов между бактериями и археями . [106]

Механизмы

Мутация, сопровождаемая естественным отбором, приводит к более темной окраске популяции.

С неодарвиновской точки зрения, эволюция происходит, когда есть изменения в частотах аллелей в популяции скрещивающихся организмов [76], например, аллель черного окраса в популяции моли становится все более распространенным. Механизмы, которые могут привести к изменениям частот аллелей, включают естественный отбор, генетический дрейф, поток генов и смещение мутаций.

Естественный отбор

Эволюция посредством естественного отбора - это процесс, при котором признаки, улучшающие выживание и воспроизводство, становятся более распространенными в следующих поколениях популяции. Его часто называют «самоочевидным» механизмом, потому что он обязательно следует из трех простых фактов: [8]

  • В популяциях организмов существует изменчивость в отношении морфологии, физиологии и поведения (фенотипическая изменчивость).
  • Разные черты дают разную выживаемость и воспроизводимость (дифференциальная приспособленность).
  • Эти черты могут передаваться из поколения в поколение (наследственность приспособленности).

Производится больше потомства, чем может выжить, и эти условия вызывают конкуренцию между организмами за выживание и воспроизводство. Следовательно, организмы с признаками, дающими им преимущество перед конкурентами, с большей вероятностью передадут свои признаки следующему поколению, чем организмы с признаками, не дающими преимущества. [107] Эта телеономия - качество, посредством которого процесс естественного отбора создает и сохраняет черты, которые, по- видимому , подходят для выполняемых ими функциональных ролей. [108] Последствия отбора включают неслучайное спаривание [109] и генетический автостоп .

Центральная концепция естественного отбора - это эволюционная приспособленность организма. [110] Пригодность измеряется способностью организма выживать и воспроизводиться, что определяет размер его генетического вклада в следующее поколение. [110] Однако приспособленность - это не то же самое, что общее количество потомков: вместо этого приспособленность указывается долей последующих поколений, несущих гены организма. [111] Например, если бы организм мог хорошо выжить и быстро размножаться, но его потомство было бы слишком маленьким и слабым, чтобы выжить, этот организм внес бы небольшой генетический вклад в будущие поколения и, следовательно, имел бы низкую приспособленность. [110]

Если аллель увеличивает приспособленность больше, чем другие аллели этого гена, то с каждым поколением этот аллель будет становиться все более распространенным в популяции. Эти черты , как говорят, «выбран для » . Примерами качеств, которые могут улучшить приспособленность, являются повышенная выживаемость и повышенная плодовитость . И наоборот, более низкая приспособленность, вызванная наличием менее полезного или вредного аллеля, приводит к тому, что этот аллель становится более редким - они «отбираются против ». [112] Важно отметить, что приспособленность аллеля не является фиксированной характеристикой; при изменении окружающей среды ранее нейтральные или вредные черты могут стать полезными, а ранее полезные черты - вредными. [64]Однако, даже если направление отбора действительно изменится на противоположное, черты, которые были утрачены в прошлом, могут не развиться повторно в идентичной форме (см . Закон Долло ). [113] [114] Однако повторная активация неактивных генов, если они не были удалены из генома и подавлялись, возможно, в течение сотен поколений, может привести к повторному появлению признаков, которые считались утраченными. как в задних конечностях дельфинов , зубы в кур , крыла в бескрылых палках насекомых , хвостах и дополнительные соски у людей и т.д. [115] «отсылки» , такие как они известны как атавизмы .

Эти диаграммы отображают различные типы генетического отбора. На каждом графике переменная оси X представляет собой тип фенотипического признака, а переменная оси Y - количество организмов. Группа A - это исходная популяция, а Группа B - это популяция после отбора.
· График 1 показывает направленный отбор , при котором предпочтение отдается одному крайнему фенотипу .
· График 2 отображает стабилизирующий отбор , где промежуточный фенотип предпочтительнее крайних признаков.
· График 3 показывает деструктивный отбор , при котором крайние фенотипы предпочтительнее промежуточных.

Естественный отбор в популяции по признаку, который может варьироваться в пределах диапазона значений, например роста, можно разделить на три различных типа. Первый - это направленный отбор , который представляет собой смещение среднего значения признака с течением времени - например, организм постепенно становится выше. [116] Во-вторых, разрушительный отбор - это отбор по крайним значениям черт, который часто приводит к тому, что два разных значения становятся наиболее распространенными, с отбором по среднему значению. Это было бы тогда, когда преимущество имели либо низкие, либо высокие организмы, но не средние. Наконец, при стабилизации отбора происходит отбор против крайних значений черт на обоих концах, что приводит к снижениюотклонение от среднего значения и меньшее разнообразие. [107] [117] Это может, например, привести к тому, что организмы в конечном итоге будут иметь схожую высоту.

В большинстве случаев естественный отбор делает природу мерой, с которой индивиды и индивидуальные черты имеют большую или меньшую вероятность выживания. «Природа» в этом смысле относится к экосистеме , то есть к системе, в которой организмы взаимодействуют со всеми другими элементами, как физическими, так и биологическими , в своей локальной среде. Юджин Одум , основатель экологии , определил экосистему как: «Любая единица, которая включает в себя все организмы ... в данной области, взаимодействующие с физической средой, так что поток энергии приводит к четко определенной трофической структуре, биотическому разнообразию, и материальные циклы (т. е. обмен материалами между живыми и неживыми частями) внутри системы… » [118]Каждая популяция в экосистеме занимает определенную нишу или положение с определенными отношениями с другими частями системы. Эти отношения включают историю жизни организма, его положение в пищевой цепи и его географический ареал. Такое широкое понимание природы позволяет ученым выделить определенные силы, которые вместе составляют естественный отбор.

Естественный отбор может действовать на разных уровнях организации , таких как гены, клетки, отдельные организмы, группы организмов и виды. [119] [120] [121] Выбор может действовать на нескольких уровнях одновременно. [122] Примером отбора, происходящего ниже уровня отдельного организма, являются гены, называемые транспозонами , которые могут реплицироваться и распространяться по геному. [123] Отбор на более высоком уровне, чем индивидуальный, такой как групповой отбор , может способствовать развитию сотрудничества. [124]

Генетический автостоп

Рекомбинация позволяет разделить аллели одной и той же цепи ДНК. Однако скорость рекомбинации невысока (примерно два события на хромосому на поколение). В результате гены, расположенные близко друг к другу на хромосоме, не всегда могут быть удалены друг от друга, а гены, которые расположены близко друг к другу, имеют тенденцию унаследоваться вместе, явление, известное как сцепление . [125] Эта тенденция измеряется путем определения того, насколько часто два аллеля встречаются вместе на одной хромосоме по сравнению с ожидаемыми , что называется их неравновесием по сцеплению . Набор аллелей, который обычно наследуется в группе, называется гаплотипом.. Это может быть важно, когда один аллель в конкретном гаплотипе очень полезен: естественный отбор может управлять селективным движением , которое также приведет к тому, что другие аллели в гаплотипе станут более распространенными в популяции; этот эффект называется генетическим автостопом или генетическим проектом. [126] Генетический отбор, вызванный тем фактом, что одни нейтральные гены генетически связаны с другими, находящимися в процессе отбора, может быть частично захвачен подходящим эффективным размером популяции. [127]

Половой отбор

Особым случаем естественного отбора является половой отбор, который представляет собой отбор по любому признаку, который увеличивает успех спаривания за счет увеличения привлекательности организма для потенциальных партнеров. [128] Черты, развившиеся в результате полового отбора, особенно заметны у самцов нескольких видов животных. Несмотря на сексуальные предпочтения, такие черты, как громоздкие рога, брачные крики, большой размер тела и яркие цвета, часто привлекают хищников, что ставит под угрозу выживание отдельных самцов. [129] [130] Этот недостаток выживания уравновешивается более высоким репродуктивным успехом у самцов, которые демонстрируют эти трудно поддельные , сексуально отобранные черты. [131]

Генетический дрейф

Моделирование генетического дрейфа 20 несвязанных аллелей в популяциях 10 (вверху) и 100 (внизу). Дрейф к фиксации происходит быстрее в меньшей популяции.

Генетический дрейф - это случайные колебания частот аллелей в популяции от одного поколения к другому. [132] Когда селективные силы отсутствуют или относительно слабы, частоты аллелей с равной вероятностью будут дрейфовать вверх или вниз в каждом последующем поколении, потому что аллели подвержены ошибкам выборки . [133]Этот дрейф останавливается, когда аллель в конечном итоге становится фиксированным, либо путем исчезновения из популяции, либо полностью заменяя другие аллели. Таким образом, генетический дрейф может исключить некоторые аллели из популяции исключительно случайно. Даже в отсутствие селективных сил генетический дрейф может привести к тому, что две отдельные популяции, которые начинали с одной и той же генетической структуры, разделятся на две расходящиеся популяции с разными наборами аллелей. [134]

Нейтральная теория молекулярной эволюции предположил , что большинство эволюционных изменений являются результатом фиксации нейтральных мутаций генетического дрейфа. [135] Следовательно, в этой модели большинство генетических изменений в популяции являются результатом постоянного давления мутаций и генетического дрейфа. [136] От этой формы нейтральной теории в настоящее время в значительной степени отказались, поскольку она, похоже, не соответствует генетической изменчивости, наблюдаемой в природе. [137] [138] Однако более свежая и хорошо обоснованная версия этой модели - это почти нейтральная теория , согласно которой мутация, которая будет эффективно нейтральной в небольшой популяции, не обязательно будет нейтральной в большой популяции. [107]Другие альтернативные теории предполагают, что генетический дрейф затмевается другими стохастическими силами в эволюции, такими как генетический автостоп, также известный как генетический проект. [133] [127] [139]

Время фиксации нейтрального аллеля в результате дрейфа генов зависит от размера популяции, причем фиксация происходит быстрее в меньших популяциях. [140] Количество особей в популяции не имеет решающего значения, это показатель, известный как эффективный размер популяции. [141] Эффективная популяция обычно меньше, чем общая популяция, так как она учитывает такие факторы, как уровень инбридинга и стадия жизненного цикла, на которой популяция самая маленькая. [141] Эффективный размер популяции не может быть одинаковым для всех генов в одной и той же популяции. [142]

Обычно трудно измерить относительную важность процессов отбора и нейтральности, включая дрейф. [143] Сравнительная важность адаптивных и неадаптивных сил в управлении эволюционными изменениями является областью текущих исследований . [144]

Генетический поток

Поток генов включает обмен генами между популяциями и между видами. [99] Наличие или отсутствие потока генов коренным образом меняет ход эволюции. Из-за сложности организмов любые две полностью изолированные популяции в конечном итоге разовьют генетическую несовместимость в результате нейтральных процессов, как в модели Бейтсона-Добжанского-Мюллера , даже если обе популяции останутся практически идентичными с точки зрения их адаптации к окружающей среде.

Если генетическая дифференциация между популяциями развивается, поток генов между популяциями может привнести черты или аллели, которые являются невыгодными для местной популяции, и это может привести к тому, что у организмов в этих популяциях появятся механизмы, предотвращающие спаривание с генетически отдаленными популяциями, что в конечном итоге приведет к появлению новых видов. . Таким образом, обмен генетической информацией между людьми имеет фундаментальное значение для развития концепции биологических видов (BSC).

Во время разработки современного синтеза Сьюэлл Райт разработал свою теорию смещения баланса , которая рассматривала поток генов между частично изолированными популяциями как важный аспект адаптивной эволюции. [145] Однако в последнее время значительная критика важности теории сдвига баланса. [146]

Предвзятость мутации

Смещение мутации обычно понимается как разница в ожидаемых скоростях для двух разных видов мутации, например смещение перехода-трансверсии, смещение GC-AT, смещение делеции-вставки. Это связано с идеей предвзятости в развитии .

Холдейн [147] и Фишер [148] утверждали, что, поскольку мутация - это слабое давление, которое легко преодолевается отбором, тенденции мутации будут неэффективными, кроме как в условиях нейтральной эволюции или чрезвычайно высокой скорости мутаций. Этот аргумент противоположного давления долгое время использовался для того, чтобы отвергнуть возможность внутренних тенденций в эволюции [149], пока молекулярная эра не вызвала возобновление интереса к нейтральной эволюции.

Noboru Sueoka [150] и Ernst Freese [151] предположили, что систематические ошибки в мутации могут быть ответственны за систематические различия в составе геномных GC между видами. Идентификация штамма-мутатора E. coli, имеющего тенденцию к GC, в 1967 году [152] наряду с предложением нейтральной теории , установила правдоподобность мутационных объяснений молекулярных паттернов, которые сейчас широко распространены в литературе по молекулярной эволюции.

Например, ошибки мутаций часто используются в моделях использования кодонов. [153] Такие модели также включают эффекты отбора, следуя модели мутации-отбора-дрейфа [154], которая допускает как смещения мутаций, так и дифференциальный отбор на основе эффектов на трансляцию. Гипотезы о предвзятости мутаций сыграли важную роль в развитии представлений об эволюции состава генома, включая изохоры. [155] Различные ошибки вставки и удаления в разных таксонах могут привести к эволюции генома разного размера. [156] [157] Гипотеза Линча относительно размера генома основана на мутационных предубеждениях в сторону увеличения или уменьшения размера генома.

Однако мутационные гипотезы эволюции состава претерпели сокращение масштабов, когда было обнаружено, что (1) конверсия генов, обусловленная GC, вносит важный вклад в состав диплоидных организмов, таких как млекопитающие [158] и (2) бактериальные геномы часто имеют AT-смещенная мутация. [159]

Современные представления о роли мутационных предубеждений отражают теорию, отличную от теории Холдейна и Фишера. Более поздняя работа [149] показала, что первоначальная теория «давления» предполагает, что эволюция основана на постоянных вариациях: когда эволюция зависит от введения новых аллелей, мутационные искажения и ошибки развития во введении могут налагать искажения на эволюцию, не требуя нейтральной эволюции или высокая частота мутаций .

Некоторые недавние исследования сообщают, что мутации, участвующие в адаптации, отражают общие предубеждения мутаций [160] [161] [162], хотя другие оспаривают эту интерпретацию. [163]

Результаты

Воспроизвести медиа
Наглядная демонстрация быстрой эволюции устойчивости к антибиотикам у E. coli, растущей на планшете с возрастающими концентрациями триметоприма . [164]

Эволюция влияет на все аспекты формы и поведения организмов. Наиболее заметны специфические поведенческие и физические адаптации, являющиеся результатом естественного отбора. Эти приспособления повышают физическую форму, помогая таким действиям, как поиск пищи, избегание хищников или привлечение партнеров. Организмы также могут реагировать на отбор, сотрудничая друг с другом, обычно помогая своим родственникам или вступая во взаимовыгодный симбиоз . В более долгосрочной перспективе эволюция порождает новые виды путем разделения предковых популяций организмов на новые группы, которые не могут или не будут скрещиваться.

Эти результаты эволюции различаются по шкале времени как макроэволюция против микроэволюции. Макроэволюция относится к эволюции, которая происходит на уровне видов или выше, в частности, к видообразованию и исчезновению; тогда как микроэволюция относится к меньшим эволюционным изменениям внутри вида или популяции, в частности к сдвигам в частоте аллелей и адаптации. [165] В целом, макроэволюция рассматривается как результат длительных периодов микроэволюции. [166] Таким образом, различие между микро- и макроэволюцией не является фундаментальным - разница просто во времени. [167]Однако в макроэволюции могут быть важны черты всего вида. Например, большое количество вариаций среди людей позволяет виду быстро адаптироваться к новым местам обитания , уменьшая вероятность его исчезновения, в то время как широкий географический диапазон увеличивает вероятность видообразования, повышая вероятность того, что часть популяции будет стать изолированным. В этом смысле микроэволюция и макроэволюция могут включать отбор на разных уровнях - с микроэволюцией, действующей на гены и организмы, в отличие от макроэволюционных процессов, таких как отбор видов, воздействующих на целые виды и влияющих на скорость их видообразования и исчезновения. [168] [169] [170]

Распространенное заблуждение состоит в том, что у эволюции есть цели, долгосрочные планы или врожденная тенденция к «прогрессу», выраженная в таких убеждениях, как ортогенез и эволюционизм; На самом деле, однако, эволюция не имеет долгосрочной цели и не обязательно приводит к большей сложности. [171] [172] [173] Хотя сложные виды эволюционировали, они возникают как побочный эффект увеличения общего числа организмов, а простые формы жизни все еще более распространены в биосфере. [174] Например, подавляющее большинство видов - микроскопические прокариоты , которые, несмотря на свой небольшой размер, составляют около половины мировой биомассы , [175]и составляют подавляющую часть биоразнообразия Земли. [176] Таким образом, простые организмы были доминирующей формой жизни на Земле на протяжении всей ее истории и продолжают оставаться основной формой жизни до наших дней, при этом сложная жизнь кажется более разнообразной только потому, что она более заметна . [177] Действительно, эволюция микроорганизмов особенно важна для современных эволюционных исследований , поскольку их быстрое размножение позволяет изучать экспериментальную эволюцию и наблюдать за эволюцией и адаптацией в реальном времени. [178] [179]

Приспособление

Гомологические кости конечностей четвероногих . Кости этих животных имеют одинаковую базовую структуру, но адаптированы для конкретных целей.

Адаптация - это процесс, который делает организмы более приспособленными к их среде обитания. [180] [181] Кроме того, термин адаптация может относиться к признаку, который важен для выживания организма. Например, приспособление лошадиных зубов к измельчению травы. Используя термин « адаптация» для обозначения эволюционного процесса и адаптивного признака продукта (части тела или функции), можно различить два значения этого слова. Адаптации производятся естественным отбором. [182] Следующие определения принадлежат Феодосию Добжанскому:

  1. Адаптация - это эволюционный процесс, в результате которого организм становится лучше приспособлен к своей среде обитания или местам обитания. [183]
  2. Адаптированность - это состояние адаптации: степень, в которой организм способен жить и воспроизводиться в данном наборе сред обитания. [184]
  3. Адаптивная черта является одним из аспектов картины развития организма , который включает или повышает вероятность того , что организм выживать и воспроизводиться. [185]

Адаптация может вызвать либо усиление новой функции, либо потерю наследственной особенности. Примером, демонстрирующим оба типа изменений, является адаптация бактерий к отбору антибиотиков, при этом генетические изменения, вызывающие устойчивость к антибиотикам, как за счет модификации мишени лекарства, так и за счет повышения активности переносчиков, которые выкачивают лекарство из клетки. [186] Другими яркими примерами являются бактерии Escherichia coli, развивающие способность использовать лимонную кислоту в качестве питательного вещества в долгосрочном лабораторном эксперименте , [187] Flavobacterium развивает новый фермент, который позволяет этим бактериям расти на побочных продуктах нейлона. производство, [188] [189]и почвенная бактерия Sphingobium, развивающая совершенно новый метаболический путь , разрушающий синтетический пестицид пентахлорфенол . [190] [191] Интересная, но все же противоречивая идея состоит в том, что некоторые адаптации могут увеличить способность организмов генерировать генетическое разнообразие и адаптироваться посредством естественного отбора (увеличивая эволюционируемость организмов). [192] [193] [194] [195] [196]

Усатые киты скелет. Буквы a и b обозначают кости плавников , которые были адаптированы из костей передних ног , в то время как c указывает на рудиментарные кости ног, что предполагает адаптацию от суши к морю. [197]

Адаптация происходит через постепенное изменение существующих структур. Следовательно, структуры со сходной внутренней организацией могут выполнять разные функции в родственных организмах. Это результат того, что единая предковая структура приспособлена функционировать по-разному. Кости в крыльях летучих мышей , например, очень похожи на кости ног мышей и рук приматов из-за того, что все эти структуры произошли от общего предка млекопитающих. [198] Однако, поскольку все живые организмы в какой-то степени родственны, [199] даже органы, которые, по-видимому, не имеют или почти не имеют структурного сходства, такие как членистоногие , кальмары и позвоночныеглаза или конечности и крылья членистоногих и позвоночных могут зависеть от общего набора гомологичных генов, контролирующих их сборку и функцию; это называется глубокой гомологией . [200] [201]

В процессе эволюции некоторые структуры могут потерять свою первоначальную функцию и стать рудиментарными структурами . [202] Такие структуры могут иметь небольшую функцию или вообще не иметь ее у современных видов, но все же иметь четкую функцию у предковых или других близкородственных видов. Примеры включают псевдогены , [203] нефункциональные остатки глаз у слепых пещерных рыб, [204] крылья у нелетающих птиц, [205] наличие тазовых костей у китов и змей, [197] и половые признаки у организмов. которые воспроизводятся путем бесполого размножения. [206] Примеры рудиментарных структур у людей включают зубы мудрости ,[207] копчик , [202] червеобразный отросток , [202] и другие поведенческие остаткитакие как мурашки [208] [209] и примитивные рефлексы . [210] [211] [212]

Однако многие черты, которые кажутся простыми адаптациями, на самом деле являются экзаптациями : структуры, изначально адаптированные для одной функции, но по совпадению стали полезными для некоторых других функций в процессе. [213] Одним из примеров является африканская ящерица Holaspis guentheri , у которой развилась чрезвычайно плоская голова, позволяющая прятаться в щелях, что можно увидеть, посмотрев на ее ближайших родственников. Однако у этого вида голова стала настолько уплощенной, что помогает скользить с дерева на дерево - эксаптация. [213] Внутри клеток молекулярные машины, такие как бактериальные жгутики [214] и механизмы сортировки белков [215]эволюционировал путем привлечения нескольких ранее существовавших белков, которые ранее выполняли разные функции. [165] Другой пример - привлечение ферментов гликолиза и метаболизма ксенобиотиков в качестве структурных белков, называемых кристаллинами, в хрусталиках глаз организмов. [216] [217]

Область современных исследований в эволюционной биологии развития - это эволюционная основа адаптаций и эксаптаций. [218] Это исследование рассматривает происхождение и эволюцию эмбрионального развития и то, как модификации развития и процессов развития создают новые особенности. [219] Эти исследования показали, что эволюция может изменить развитие, чтобы произвести новые структуры, такие как эмбриональные костные структуры, которые развиваются в челюсть у других животных, вместо того чтобы формировать часть среднего уха у млекопитающих . [220]Также возможно, что структуры, которые были потеряны в ходе эволюции, снова появятся из-за изменений в генах развития, таких как мутация у кур, из-за которой у эмбрионов вырастают зубы, похожие на зубы крокодилов . [221] Сейчас становится ясно, что большинство изменений в форме организмов происходит из-за изменений в небольшом наборе консервативных генов. [222]

Коэволюция

Обыкновенная подвязочная змея ( Thamnophis sirtalis sirtalis ) выработала устойчивость к защитному веществу тетродотоксину у своей жертвы-амфибии.

Взаимодействие между организмами может вызвать как конфликт, так и сотрудничество. Когда взаимодействие происходит между парами видов, такими как патоген и хозяин или хищник и его жертва, у этих видов могут развиваться согласованные наборы адаптаций. Здесь эволюция одного вида вызывает адаптацию у второго вида. Эти изменения у второго вида затем, в свою очередь, вызывают новые адаптации у первого вида. Этот цикл отбора и реакции называется коэволюцией. [223] Примером может служить производство тетродотоксина у тритона с грубой кожей и развитие устойчивости к тетродотоксину у его хищника, обыкновенной подвязочной змеи . В этой паре хищник-жертваэволюционная гонка вооружений произвела высокий уровень токсина у тритона и, соответственно, высокий уровень устойчивости к токсину у змеи. [224]

Сотрудничество

Не все совместно эволюционирующие взаимодействия между видами связаны с конфликтами. [225] Возникло много случаев взаимовыгодного взаимодействия. Например, между растениями и микоризными грибами, которые растут на их корнях и помогают растениям поглощать питательные вещества из почвы, существует тесное сотрудничество . [226] Это взаимная связь, поскольку растения обеспечивают грибы сахарами в результате фотосинтеза . Здесь грибы фактически растут внутри клеток растений, позволяя им обмениваться питательными веществами со своими хозяевами, посылая сигналы , подавляющие иммунную систему растений . [227]

Также возникли коалиции организмов одного вида. Крайним случаем является эусоциальность социальных насекомых, таких как пчелы , термиты и муравьи , когда стерильные насекомые кормят и охраняют небольшое количество организмов в колонии , способных к размножению. В еще меньшем масштабе соматические клетки, составляющие тело животного, ограничивают их размножение, поэтому они могут поддерживать стабильный организм, который затем поддерживает небольшое количество половых клеток животного для производства потомства. Здесь соматические клетки реагируют на определенные сигналы, которые инструктируют их, расти, оставаться такими, какие они есть, или умереть. Если клетки игнорируют эти сигналы и размножаются ненадлежащим образом, их неконтролируемый роствызывает рак . [228]

Такое сотрудничество внутри вида могло развиться в процессе родственного отбора , когда один организм действует, чтобы помочь вырастить потомство родственника. [229] Это действие выбрано, потому что, если помогающий человек содержит аллели, которые способствуют вспомогательному действию, вполне вероятно, что его родственники также будут содержать эти аллели и, таким образом, эти аллели будут переданы. [230] Другие процессы, которые могут способствовать сотрудничеству, включают групповой отбор , когда сотрудничество приносит пользу группе организмов. [231]

Видообразование

Четыре географических способа видообразования

Видообразование - это процесс, при котором вид разделяется на два или более видов-потомков. [232]

Есть несколько способов определить понятие «вид». Выбор определения зависит от особенностей рассматриваемого вида. [233] Например, некоторые видовые концепции более применимы к организмам, воспроизводящим половым путем, в то время как другие лучше подходят для бесполых организмов. Несмотря на разнообразие представлений о различных видах, эти различные концепции можно отнести к одному из трех широких философских подходов: скрещиванию, экологическому и филогенетическому. [234] Концепция биологических видов (BSC) является классическим примером метода скрещивания. Определено эволюционным биологом Эрнстом Майромв 1942 году BSC заявляет, что «виды - это группы фактически или потенциально скрещивающихся природных популяций, которые репродуктивно изолированы от других таких групп». [235] Несмотря на широкое и долгосрочное использование, BSC, как и другие, не лишен противоречий, например, потому что эти концепции не могут быть применены к прокариотам, [236] и это называется проблемой видов . [233] Некоторые исследователи предприняли попытку унифицированного монистического определения видов, в то время как другие придерживаются плюралистического подхода и предполагают, что могут быть разные способы логической интерпретации определения вида. [233] [234]

Для того, чтобы популяции стали новыми видами, необходимы препятствия для воспроизводства между двумя расходящимися половыми популяциями. Поток генов может замедлить этот процесс, распространяя новые генетические варианты также на другие популяции. В зависимости от того, насколько далеко два вида разошлись с момента их последнего общего предка , у них все еще может быть возможность произвести потомство, как в случае спаривания лошадей и ослов для получения мулов . [237] Такие гибриды обычно бесплодны.. В этом случае близкородственные виды могут регулярно скрещиваться, но гибриды будут отбираться против, и виды останутся разными. Однако время от времени образуются жизнеспособные гибриды, и эти новые виды могут обладать либо промежуточными свойствами между своими родительскими видами, либо обладать совершенно новым фенотипом. [238] Важность гибридизации в производстве новых видов животных неясна, хотя случаи были замечены у многих типов животных [239], особенно хорошо изученным примером является серая квакша . [240]

Видообразование наблюдалось несколько раз как в контролируемых лабораторных условиях (см. Лабораторные эксперименты по видообразованию ), так и в природе. [241] У организмов, размножающихся половым путем, видообразование является результатом репродуктивной изоляции, за которой следует генеалогическое расхождение. Есть четыре основных географических способа видообразования. Наиболее распространенным у животных является аллопатрическое видообразование , которое происходит в популяциях, изначально изолированных географически, например, в результате фрагментации среды обитания или миграции. Отбор в этих условиях может привести к очень быстрым изменениям внешнего вида и поведения организмов. [242] [243]Поскольку отбор и дрейф действуют независимо на популяции, изолированные от остальных их видов, разделение может в конечном итоге привести к появлению организмов, которые не могут скрещиваться. [244]

Второй способ видообразования - это перипатрическое видообразование , которое происходит, когда небольшие популяции организмов становятся изолированными в новой среде. Это отличается от аллопатрического видообразования тем, что изолированные популяции численно намного меньше, чем родительская популяция. Здесь эффект основателя вызывает быстрое видообразование после увеличения инбридинга, увеличивает селекцию гомозигот, что приводит к быстрым генетическим изменениям. [245]

Третий способ - парапатрическое видообразование . Это похоже на перипатрическое видообразование в том, что небольшая популяция попадает в новую среду обитания, но отличается тем, что между этими двумя популяциями нет физического разделения. Вместо этого видообразование является результатом эволюции механизмов, которые уменьшают поток генов между двумя популяциями. [232] Обычно это происходит, когда произошли резкие изменения в среде обитания родительского вида. Одним из примеров является трава Anthoxanthum odoratum , которая может подвергаться парапатрическому видообразованию в ответ на локальное загрязнение металлами из шахт. [246]Здесь развиваются растения, которые обладают устойчивостью к высоким уровням металлов в почве. Отбор против скрещивания с родительской популяцией, чувствительной к металлам, привел к постепенному изменению времени цветения устойчивых к металлам растений, что в конечном итоге привело к полной репродуктивной изоляции. Отбор против гибридов между двумя популяциями может вызвать подкрепление , которое представляет собой эволюцию признаков, способствующих спариванию внутри вида, а также смещение признаков , когда два вида становятся более разными по внешнему виду. [247]

Географическая изоляция из вьюрков на Галапагосских островах выпустил более десятка новых видов.

Наконец, в симпатрическом видообразовании виды расходятся без географической изоляции или изменений среды обитания. Эта форма встречается редко, поскольку даже небольшой поток генов может устранить генетические различия между частями популяции. [248] Обычно симпатрическое видообразование у животных требует эволюции как генетических различий, так и неслучайного спаривания , чтобы позволить репродуктивную изоляцию развиваться. [249]

Один тип симпатрического видообразования включает скрещивание двух родственных видов для получения нового гибридного вида. Это не характерно для животных, поскольку гибриды животных обычно бесплодны. Это происходит потому , что во время мейоза в гомологичных хромосомах от каждого родителя из разных видов и не могут успешно выполнить сопряжение. Однако это чаще встречается у растений, потому что растения часто удваивают количество хромосом, образуя полиплоиды . [250] Это позволяет хромосомам от каждого родительского вида образовывать подходящие пары во время мейоза, поскольку хромосомы каждого родителя уже представлены парой. [251] Примером такого события видообразования является случай, когда растенияСкрещивание Arabidopsis thaliana и Arabidopsis arenosa дало новый вид Arabidopsis suecica . [252] Это произошло около 20 000 лет назад, [253] и процесс видообразования был повторен в лаборатории, что позволяет изучить генетические механизмы, участвующие в этом процессе. [254] Действительно, удвоение хромосом внутри вида может быть частой причиной репродуктивной изоляции, поскольку половина удвоенных хромосом не будет иметь себе равных при скрещивании с недвойственными организмами. [255]

События видообразования важны в теории прерывистого равновесия , которая объясняет закономерность в летописи окаменелостей коротких «всплесков» эволюции, перемежающихся относительно длительными периодами застоя, когда виды остаются относительно неизменными. [256] В этой теории видообразование и быстрая эволюция связаны с естественным отбором и генетическим дрейфом, наиболее сильно влияющими на организмы, претерпевающие видообразование в новых средах обитания или небольших популяциях. В результате периоды застоя в летописи окаменелостей соответствуют родительской популяции, а организмы, претерпевающие видообразование и быструю эволюцию, обнаруживаются в небольших популяциях или географически ограниченных средах обитания и поэтому редко сохраняются в виде окаменелостей. [169]

Вымирание

Тираннозавр рекс . ОТСУТСТВИЯ птичьи динозавры вымерли в вымирание мела и палеогена в конце мелового периода.

Вымирание - это исчезновение целого вида. Вымирание - обычное явление, так как виды регулярно появляются в результате видообразования и исчезают в результате исчезновения. [257] Почти все виды животных и растений, которые жили на Земле, в настоящее время вымерли, [258] и исчезновение, похоже, является конечной судьбой всех видов. [259] Эти вымирания происходили непрерывно на протяжении всей истории жизни, хотя скорость вымирания резко возрастает из-за случайных событий массового вымирания . [260] мелового палеогена вымирание , в течение которого нептичьих динозавры вымерли, является самым известным, но ранее массовое пермское вымираниебыло еще более серьезным: примерно 96% всех морских видов были полностью исчезли. [260] голоцен вымирание является постоянным массовым вымиранием связаны с расширением человечества по всему миру за последние несколько тысяч лет. Современные темпы исчезновения в 100–1000 раз превышают фоновые, и к середине 21 века могут исчезнуть до 30% существующих видов. [261] Человеческая деятельность в настоящее время является основной причиной продолжающегося вымирания; [262] [263] глобальное потепление может еще больше ускорить его в будущем. [264] Несмотря на предполагаемое исчезновение более 99 процентов всех видов, которые когда-либо жили на Земле, [265] [266]По оценкам, в настоящее время на Земле обитает около 1 триллиона видов, из них описана лишь одна тысячная процента. [267]

Роль вымирания в эволюции не очень хорошо изучена и может зависеть от того, какой тип вымирания рассматривается. [260] Причины непрерывных вымираний «низкого уровня», которые образуют большинство вымираний, могут быть результатом конкуренции между видами за ограниченные ресурсы ( принцип конкурентного исключения ). [56] Если один вид сможет конкурировать с другим, это может привести к отбору видов, при этом наиболее подходящие виды выживут, а другие виды будут вымерены. [120] Периодические массовые вымирания также важны, но вместо того, чтобы действовать как селективная сила, они резко сокращают разнообразие неспецифическим образом и способствуют всплескам быстрой эволюции и видообразования у выживших.[268]

Эволюционная история жизни

Хронология жизни
-4500 -
-
-4000 -
-
-3500 -
-
-3000 -
-
-2500 -
-
-2000 -
-
-1500 -
-
-1000 -
-
-500 -
-
0 -
Вода
Одноклеточная жизнь
Фотосинтез
Эукариоты
Многоклеточная жизнь
Членистоногие Моллюски
Растения
Динозавры    
Млекопитающие
Цветы
Птицы
Приматы
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
Самая ранняя Земля ( -4540 )
Самая ранняя вода
Самая ранняя жизнь
LHB метеориты
Самый ранний кислород
Атмосферный кислород
Кислородный кризис
Древнейшие грибы
Половое размножение
Самые ранние растения
Самые ранние животные
Эдиакарская биота
Кембрийский взрыв
Тетрапода
Самые ранние обезьяны
Р ч п е г о г о я гр
П р о т е р о з о и к
Т с ч е с п
H a d e a n
Понгола
Гуронский
Криогенный
Андский
Кару
Четвертичный
Ледниковые периоды
( миллион лет назад )

Происхождение жизни

Земли составляет около 4,54 миллиарда лет. [269] [270] [271] Самое раннее неоспоримое свидетельство существования жизни на Земле датируется по крайней мере 3,5 миллиарда лет назад, [13] [272] во время эоархейской эры, когда геологическая кора начала затвердевать после более раннего расплавленного Хадейского эона . Окаменелости микробного мата были найдены в песчанике возрастом 3,48 миллиарда лет в Западной Австралии. [15] [16] [17] Другим ранним физическим свидетельством наличия биогенного вещества является графит в метаосадочных породах возрастом 3,7 миллиарда лет, обнаруженных в Западной Гренландии [14]а также «остатки биотической жизни », обнаруженные в скалах возрастом 4,1 миллиарда лет в Западной Австралии. [273] [274] Комментируя австралийские открытия, Стивен Блэр Хеджес написал: «Если жизнь возникла на Земле относительно быстро, то она могла бы стать обычным явлением во Вселенной». [273] [275] В июле 2016 года ученые сообщили об идентификации набора из 355 генов от последнего универсального общего предка (LUCA) всех организмов, живущих на Земле. [276]

По оценкам, более 99 процентов всех видов, насчитывающих более пяти миллиардов видов [277] , когда-либо обитавших на Земле, вымерли. [265] [266] Оценки числа существующих на Земле видов варьируются от 10 миллионов до 14 миллионов, [278] [279] из которых, по оценкам, около 1,9 миллиона названы [280] и 1,6 миллиона зарегистрированы в центральной базе данных. на сегодняшний день [281] по крайней мере 80 процентов еще не описаны.

Считается, что высокоэнергетическая химия произвела самовоспроизводящуюся молекулу около 4 миллиардов лет назад, а полмиллиарда лет спустя существовал последний общий предок всей жизни . [11] Текущий научный консенсус состоит в том, что сложная биохимия, из которой состоит жизнь, возникла в результате более простых химических реакций. [282] [283] Начало жизни могло включать самореплицирующиеся молекулы, такие как РНК [284], и сборку простых клеток. [285]

Общий спуск

Все организмы на Земле произошли от общего предка или наследственного генофонда . [199] [286] Современные виды представляют собой этап в процессе эволюции, а их разнообразие является результатом долгой серии событий видообразования и исчезновения. [287] Общее происхождение организмов было впервые выведено из четырех простых фактов об организмах: во-первых, они имеют географическое распространение, которое нельзя объяснить местной адаптацией. Во-вторых, разнообразие жизни - это не набор совершенно уникальных организмов, а организмов, имеющих общие морфологические сходства. В-третьих, рудиментарные чертыбез четкой цели напоминают по функциональным наследственным признакам. В-четвертых, организмы можно классифицировать, используя эти сходства, в иерархию вложенных групп, аналогичную генеалогическому древу. [288]

В гуманоидах являются потомками общего предка .

Современные исследования показали, что из-за горизонтального переноса генов это «древо жизни» может быть более сложным, чем простое ветвящееся дерево, поскольку некоторые гены независимо распространились между отдаленно родственными видами. [289] [290] Чтобы решить эту и другие проблемы, некоторые авторы предпочитают использовать « Коралл жизни » в качестве метафоры или математической модели для иллюстрации эволюции жизни. Эта точка зрения восходит к идее, кратко упомянутой Дарвином, но позже от которой отказались. [291]

Прошлые виды также оставили записи о своей эволюционной истории. Ископаемые останки вместе со сравнительной анатомией современных организмов составляют морфологическую или анатомическую летопись. [292] Сравнивая анатомию как современных, так и вымерших видов, палеонтологи могут сделать вывод о происхождении этих видов. Однако этот подход наиболее эффективен для организмов с твердыми частями тела, такими как раковины, кости или зубы. Кроме того, поскольку прокариоты, такие как бактерии и археи, имеют ограниченный набор общих морфологий, их окаменелости не предоставляют информации об их происхождении.

Совсем недавно доказательства общего происхождения были получены в результате изучения биохимических сходств между организмами. Например, все живые клетки используют один и тот же базовый набор нуклеотидов и аминокислот . [293] Развитие молекулярной генетики выявило свидетельства эволюции, оставшиеся в геномах организмов: датирование, когда виды расходились, посредством молекулярных часов, вызванных мутациями. [294] Например, это сравнение последовательностей ДНК показало, что люди и шимпанзе имеют 98% общих геномов, и анализ нескольких областей, в которых они различаются, помогает пролить свет на то, когда существовал общий предок этих видов. [295]

Эволюция жизни

EuryarchaeotaNanoarchaeotaCrenarchaeotaProtozoaAlgaePlantSlime moldsAnimalFungusGram-positive bacteriaChlamydiaeChloroflexiActinobacteriaPlanctomycetesSpirochaetesFusobacteriaCyanobacteriaThermophilesAcidobacteriaProteobacteria
Эволюционное древо, показывающее отклонение современных видов от их общего предка, в центре. [296] Три домена окрашены в синий цвет, бактерии - в синий, археи - в зеленый, а эукариоты - в красный.

Прокариоты населяли Землю примерно 3–4 миллиарда лет назад. [297] [298] Никаких очевидных изменений в морфологии или клеточной организации у этих организмов не произошло в течение следующих нескольких миллиардов лет. [299] Эукариотические клетки возникли между 1,6 и 2,7 миллиардами лет назад. Следующее крупное изменение в клеточной структуре произошло, когда бактерии были поглощены эукариотическими клетками в кооперативной ассоциации, называемой эндосимбиозом . [300] [301] Поглощенные бактерии и клетка-хозяин подверглись совместной эволюции, при этом бактерии превратились либо в митохондрии, либо в гидрогеносомы . [302] Еще одно заражение цианобактериями.-подобные организмы привели к образованию хлоропластов у водорослей и растений. [303]

История жизни была историей одноклеточных эукариот, прокариот и архей примерно до 610 миллионов лет назад, когда многоклеточные организмы начали появляться в океанах в эдиакарский период. [297] [304] эволюция многоклеточности произошла в нескольких независимых событиях, в организмах , как разнообразно , как губки , бурые водоросли , цианобактерий, миксомицеты и миксобактерии . [305] В январе 2016 года ученые сообщили, что около 800 миллионов лет назад небольшое генетическое изменение в одной молекуле под названием GK-PID могло позволить организмам перейти от одного клеточного организма к одной из многих клеток.[306]

Вскоре после появления этих первых многоклеточных организмов в течение примерно 10 миллионов лет появилось значительное количество биологического разнообразия в результате события, названного кембрийским взрывом . Здесь большинство видов современных животных появилось в летописи окаменелостей, а также уникальные линии, которые впоследствии вымерли. [307] Были предложены различные триггеры кембрийского взрыва, включая накопление кислорода в атмосфере в результате фотосинтеза. [308]

Около 500 миллионов лет назад растения и грибы заселили землю, а вскоре за ними последовали членистоногие и другие животные. [309] Насекомые были особенно успешными и даже сегодня составляют большинство видов животных. [310] Амфибии впервые появились около 364 миллионов лет назад, за ними последовали ранние амниоты и птицы около 155 миллионов лет назад (оба из « рептилийных » линий), млекопитающие около 129 миллионов лет назад, гоминины около 10 миллионов лет назад и современные люди. около 250 000 лет назад. [311] [312] [313]Однако, несмотря на эволюцию этих крупных животных, более мелкие организмы, похожие на те типы, которые развились на ранних этапах этого процесса, по-прежнему очень успешны и доминируют на Земле, при этом большая часть как биомассы, так и видов является прокариотами. [176]

Приложения

Концепции и модели, используемые в эволюционной биологии, такие как естественный отбор, имеют множество приложений. [314]

Искусственный отбор - это преднамеренный отбор признаков в популяции организмов. Это использовалось в течение тысяч лет при приручении растений и животных. [315] В последнее время такой отбор стал жизненно важной частью генной инженерии , когда селектируемые маркеры, такие как гены устойчивости к антибиотикам, используются для манипулирования ДНК. Белки с ценными свойствами эволюционировали в результате повторяющихся циклов мутации и отбора (например, модифицированные ферменты и новые антитела ) в процессе, называемом направленной эволюцией . [316]

Понимание изменений, произошедших в ходе эволюции организма, может выявить гены, необходимые для построения частей тела, гены, которые могут быть вовлечены в генетические нарушения человека . [317] Например, мексиканская тетра - пещерная рыба- альбинос , потерявшая зрение в процессе эволюции. Совместное размножение разных популяций этой слепой рыбы дало потомство с функциональными глазами, так как разные мутации произошли в изолированных популяциях, которые развивались в разных пещерах. [318] Это помогло идентифицировать гены, необходимые для зрения и пигментации. [319]

Эволюционная теория имеет множество приложений в медицине. Многие болезни человека не являются статичными явлениями, но могут эволюционировать. Вирусы, бактерии, грибки и раковые образования становятся устойчивыми к иммунной защите хозяина , а также к фармацевтическим препаратам . [320] [321] [322] Те же проблемы возникают в сельском хозяйстве с устойчивостью к пестицидам [323] и гербицидам [324] . Возможно, мы подошли к концу эффективного срока службы большинства доступных антибиотиков [325] и предсказываем эволюцию и возможность эволюции [326]наших патогенов, и разработка стратегий для замедления или обхода этого требует более глубоких знаний о сложных силах, движущих эволюцию на молекулярном уровне. [327]

В информатике моделирование эволюции с использованием эволюционных алгоритмов и искусственной жизни началось в 1960-х годах и было расширено за счет моделирования искусственного отбора. [328] Искусственная эволюция стала широко признанным методом оптимизации в результате работ Инго Рехенберга в 1960-х годах. Он использовал стратегии эволюции для решения сложных инженерных задач. [329] Генетические алгоритмы, в частности, стали популярными благодаря трудам Джона Генри Холланда . [330] Практические приложения также включают автоматическую эволюцию компьютерных программ . [331]Эволюционные алгоритмы теперь используются для решения многомерных задач более эффективно, чем программное обеспечение, созданное людьми-разработчиками, а также для оптимизации проектирования систем. [332]

Социальные и культурные отклики

Когда в 1870-х годах эволюция получила широкое признание, карикатуры на Чарльза Дарвина с обезьяной или телом обезьяны символизировали эволюцию. [333]

В XIX веке, особенно после публикации « Происхождения видов» в 1859 году, идея о том, что жизнь эволюционировала, была активным источником академических дебатов, сосредоточенных на философских, социальных и религиозных последствиях эволюции. Сегодня современный эволюционный синтез принимается подавляющим большинством ученых. [56] Тем не менее, эволюция остается спорным понятием для некоторых теистов . [334]

В то время как различные религии и конфессии примирили свои убеждения с эволюцией посредством таких концепций, как теистическая эволюция , есть креационисты, которые считают, что эволюции противоречат мифы о творении, встречающиеся в их религиях, и которые выдвигают различные возражения против эволюции . [165] [335] [336] Как показали ответы на публикацию « Остатков естественной истории сотворения мира» в 1844 году, наиболее противоречивым аспектом эволюционной биологии является то, что эволюция человека подразумевает, что люди имеют общее происхождение с обезьянами и что умственное иморальные способности человечества имеют те же естественные причины, что и другие унаследованные черты животных. [337] В некоторых странах, особенно в Соединенных Штатах, эти противоречия между наукой и религией подпитывают текущие противоречия между творением и эволюцией, религиозный конфликт, сосредоточенный на политике и государственном образовании . [338] В то время как другие научные области, такие как космология [339] и наука о Земле [340], также противоречат буквальным интерпретациям многих религиозных текстов , эволюционная биология встречает значительно большее сопротивление со стороны религиозных буквалистов.

Преподавание эволюции в американских классах биологии средней школы было необычным на протяжении большей части первой половины 20 века. Решение по делу о Скоупс от 1925 г. привело к тому, что этот предмет стал очень редким в американских учебниках по вторичной биологии для целого поколения, но позже он был постепенно возвращен и стал юридически защищенным решением по делу Эпперсон против Арканзаса 1968 г. С тех пор конкурирующая религиозная вера в креационизм была юридически запрещена в программах средней школы в различных решениях 1970-х и 1980-х годов, но вернулась в псевдонаучной форме как разумный замысел (ID), чтобы быть исключенной еще раз в деле Китцмиллер против Дувра 2005 года . Дело районного школьного округа .[341] Дебаты по поводу идей Дарвина не вызвали серьезных споров в Китае. [342]

Смотрите также

  • Аргумент от плохого дизайна
  • Биологическая классификация
  • Доказательства общего происхождения
  • Эволюция в изменчивой среде
  • Эволюционная антропология
  • Эволюционная экология
  • Эволюционная эпистемология
  • Эволюционная нейробиология
  • Эволюция биологической сложности
  • Эволюция растений
  • Проект Стив
  • Хронология эволюционной истории жизни
  • Универсальный дарвинизм

Рекомендации

  1. ^ Hall & Hallgrímsson 2008 , стр.  4-6
  2. ^ «Ресурсы эволюции» . Вашингтон, округ Колумбия: Национальные академии наук, инженерии и медицины . 2016. Архивировано 3 июня 2016 года .
  3. ^ Futuyma & Киркпатрик 2017 , стр 79-102, Глава 4:. Мутация и вариации
  4. ^ Скотт-Филлипс, Томас С .; Laland, Kevin N .; Шукер, Дэвид М .; Дикинс, Томас Э .; Уэст, Стюарт А. (май 2014 г.). "Перспектива строительства ниши: критическая оценка" . Эволюция . 68 (5): 1231–1243. DOI : 10.1111 / evo.12332 . ISSN 0014-3820 . PMC 4261998 . PMID 24325256 .   Эволюционные процессы обычно рассматриваются как процессы, посредством которых происходят эти изменения. Четыре таких процесса широко признаны: естественный отбор (в широком смысле, включая половой отбор), генетический дрейф, мутации и миграция (Fisher 1930; Haldane 1932). Последние два порождают вариацию; первые два сортируют это.
  5. ^ Hall & Hallgrímsson 2008 , стр. 3-5
  6. ^ Voet, Voet и Pratt 2016 . С. 1-22, Глава 1: Введение в химию жизни
  7. ^ Дарвин 1859
  8. ^ a b Левонтин, Ричард К. (ноябрь 1970 г.). «Единицы отбора» (PDF) . Ежегодный обзор экологии и систематики . 1 : 1–18. DOI : 10.1146 / annurev.es.01.110170.000245 . ISSN 1545-2069 . JSTOR 2096764 . Архивировано (PDF) из оригинала 06.02.2015.   
  9. ^ Futuyma & Киркпатрик 2017 , стр 3-26, Глава 1:. Эволюционная биология
  10. ^ Kampourakis 2014 , стр.  127-129
  11. ^ a b Дулиттл, У. Форд (февраль 2000 г.). «Искоренение древа жизни» (PDF) . Scientific American . 282 (2): 90–95. Bibcode : 2000SciAm.282b..90D . DOI : 10.1038 / Scientificamerican0200-90 . ISSN 0036-8733 . PMID 10710791 . Архивировано из оригинального (PDF) 07 сентября 2006 года . Проверено 5 апреля 2015 .   
  12. ^ Глансдорф, Николас; Инь Сюй; Лабедан, Бернард (9 июля 2008 г.). «Последний всеобщий общий предок: возникновение, конституция и генетическое наследие неуловимого предшественника» . Биология Директ . 3 : 29. DOI : 10.1186 / 1745-6150-3-29 . ISSN 1745-6150 . PMC 2478661 . PMID 18613974 .   
  13. ^ a b Шопф, Дж. Уильям ; Кудрявцев Анатолий Б .; Czaja, Andrew D .; Трипати, Абхишек Б. (5 октября 2007 г.). «Свидетельства архейской жизни: строматолиты и микрофоссилий». Докембрийские исследования . 158 (3–4): 141–155. Bibcode : 2007PreR..158..141S . DOI : 10.1016 / j.precamres.2007.04.009 . ISSN 0301-9268 . 
  14. ^ a b Отомо, Йоко; Какегава, Такеши; Исида, Акизуми; и другие. (Январь 2014). «Доказательства биогенного графита в метаосадочных породах Исуа раннего архея». Природа Геонауки . 7 (1): 25–28. Bibcode : 2014NatGe ... 7 ... 25оС . DOI : 10.1038 / ngeo2025 . ISSN 1752-0894 . 
  15. ^ a b Боренштейн, Сет (13 ноября 2013 г.). «Самая старая найденная окаменелость: познакомьтесь со своей микробной мамой» . Волнуйтесь . Йонкерс, Нью-Йорк: Интерактивная сеть Mindspark . Ассошиэйтед Пресс . Архивировано 29 июня 2015 года . Проверено 31 мая 2015 .
  16. ^ a b Перлман, Джонатан (13 ноября 2013 г.). «Найдены древнейшие признаки жизни на Земле» . Дейли телеграф . Лондон: Telegraph Media Group . Архивировано 16 декабря 2014 года . Проверено 15 декабря 2014 .
  17. ^ а б Ноффке, Нора; Кристиан, Даниэль; Уэйси, Дэвид; Хейзен, Роберт М. (16 ноября 2013 г.). "Осадочные структуры, вызванные микробами, регистрирующие древнюю экосистему в формации Дрессера возрастом около 3,48 миллиардов лет, Пилбара, Западная Австралия" . Астробиология . 13 (12): 1103–1124. Bibcode : 2013AsBio..13.1103N . DOI : 10.1089 / ast.2013.1030 . ISSN 1531-1074 . PMC 3870916 . PMID 24205812 .   
  18. ^ Futuyma 2004 , стр. 33
  19. ^ Панно 2005 , стр. XV-16
  20. NAS 2008 , стр. 17 Архивировано 30 июня 2015 г., в Wayback Machine.
  21. ^ Футуйма, Дуглас Дж. , Изд. (1999). «Эволюция, наука и общество: эволюционная биология и национальная программа исследований» (PDF) (краткое содержание). Нью-Брансуик, Нью-Джерси: Управление университетских публикаций, Рутгерс, Государственный университет Нью-Джерси . OCLC 43422991 . Архивировано из оригинального (PDF) 31 января 2012 года . Проверено 24 ноября 2014 .  
  22. Перейти ↑ Darwin 1909 , p. 53
  23. ^ Кирк, Raven & Шофилд 1983 , стр. 100-142, 280-321
  24. ^ Лукреций
  25. ^ Седли, Дэвид (2003). «Лукреций и Новый Эмпедокл» (PDF) . Лидс Международные классические исследования . 2 (4). ISSN 1477-3643 . Архивировано из оригинального (PDF) 23 августа 2014 года . Проверено 25 ноября 2014 .  
  26. ^ Торри, Гарри Бил; Фелин, Фрэнсис (март 1937 г.). «Был ли Аристотель эволюционистом?». Ежеквартальный обзор биологии . 12 (1): 1–18. DOI : 10.1086 / 394520 . ISSN 0033-5770 . JSTOR 2808399 . S2CID 170831302 .   
  27. ^ Халл, Дэвид Л. (декабрь 1967). «Метафизика эволюции». Британский журнал истории науки . Кембридж : Издательство Кембриджского университета от имени Британского общества истории науки . 3 (4): 309–337. DOI : 10.1017 / S0007087400002892 . JSTOR 4024958 . 
  28. Mason 1962 , стр. 43–44
  29. Перейти ↑ Mayr 1982 , pp. 256–257
    • Луч 1686
  30. Ваггонер, Бен (7 июля 2000 г.). «Карл Линней (1707–1778)» . Эволюция (онлайн-выставка). Беркли, Калифорния: Музей палеонтологии Калифорнийского университета . Архивировано 30 апреля 2011 года . Проверено 11 февраля 2012 .
  31. Перейти ↑ Bowler 2003 , pp. 73–75
  32. ^ "Эразм Дарвин (1731-1802)" . Эволюция (онлайн-выставка). Беркли, Калифорния: Музей палеонтологии Калифорнийского университета. 4 октября 1995 года архивации от оригинала на 2012-01-19 . Проверено 11 февраля 2012 .
  33. Ламарк 1809
  34. ^ a b Nardon & Grenier 1991 , стр. 162
  35. ^ Ghiselin, Майкл Т. (сентябрь-октябрь 1994). «Воображаемый Ламарк: взгляд на фальшивую историю» в школьных учебниках » . Письмо из учебника . OCLC 23228649 . Архивировано из оригинала на 2008-02-12 . Проверено 23 января 2008 . 
  36. ^ Jablonka, Ева ; Лэмб, Мэрион Дж. (Август 2007 г.). «Краткая информация об эволюции в четырех измерениях». Поведенческие науки и науки о мозге . 30 (4): 353–365. DOI : 10.1017 / S0140525X07002221 . ISSN 0140-525X . PMID 18081952 . S2CID 15879804 .   
  37. ^ Burkhardt & Smith 1991
    • «Дарвин, CR в Лаббок, Джон» . Заочный проект Дарвина . Кембридж: Кембриджский университет . Архивировано 15 декабря 2014 года . Проверено 1 декабря 2014 . Письмо 2532, 22 ноября 1859 г.
  38. ^ Sulloway, Frank J. (июнь 2009). «Почему Дарвин отверг разумный замысел». Журнал биологических наук . 34 (2): 173–183. DOI : 10.1007 / s12038-009-0020-8 . ISSN 0250-5991 . PMID 19550032 . S2CID 12289290 .   
  39. ^ «Результаты поиска по запросу« спуск с модификацией »- Полное собрание сочинений Чарльза Дарвина в Интернете» .
  40. Собер, Эллиотт (16 июня 2009 г.). "Дарвин написал" Происхождение " наоборот? . Proc. Natl. Акад. Sci. США 106 (Приложение 1): 10048–10055. Bibcode : 2009PNAS..10610048S . DOI : 10.1073 / pnas.0901109106 . ISSN 0027-8424 . PMC 2702806 . PMID 19528655 .    
  41. Перейти ↑ Mayr 2002 , p. 165
  42. Перейти ↑ Bowler 2003 , pp. 145–146
  43. ^ Сокал, Роберт Р .; Кровелло, Теодор Дж. (Март – апрель 1970 г.). «Концепция биологических видов: критическая оценка». Американский натуралист . 104 (936): 127–153. DOI : 10.1086 / 282646 . ISSN 0003-0147 . JSTOR 2459191 . S2CID 83528114 .   
  44. ^ Дарвин, Чарльз ; Уоллес, Альфред (20 августа 1858 г.). «О склонности видов к формированию разновидностей; и о сохранении разновидностей и видов естественными средствами отбора» . Журнал трудов Линнеевского общества Лондона. Зоология . 3 (9): 45–62. DOI : 10.1111 / j.1096-3642.1858.tb02500.x . ISSN 1096-3642 . Архивировано 14 июля 2007 года . Проверено 13 мая 2007 . 
  45. Десмонд, Адриан Дж. (17 июля 2014 г.). «Томас Генри Хаксли» . Энциклопедия Britannica Online . Чикаго, Иллинойс: Encyclopædia Britannica, Inc. Архивировано 19 января 2015 года . Проверено 2 декабря 2014 .
  46. ^ Ю. -С. Лю; XM Zhou; MX Zhi; XJ Li; QL Wang (сентябрь 2009 г.). «Вклад Дарвина в генетику». Журнал прикладной генетики . 50 (3): 177–184. DOI : 10.1007 / BF03195671 . ISSN 1234-1983 . PMID 19638672 . S2CID 19919317 .   
  47. ^ Вейлинг, Франц (июль 1991). «Историческое исследование: Иоганн Грегор Мендель 1822–1884». Американский журнал медицинской генетики . 40 (1): 1–25, обсуждение 26. doi : 10.1002 / ajmg.1320400103 . PMID 1887835 . 
  48. Райт 1984 , стр. 480
  49. ^ Provine 1971
  50. ^ Stamhuis, Ида Х .; Meijer, Onno G .; Зевенхейзен, Эрик Дж. А. (июнь 1999 г.). «Гуго де Фриз о наследственности, 1889–1903: статистика, менделевские законы, пангены, мутации». Исида . 90 (2): 238–267. DOI : 10.1086 / 384323 . JSTOR 237050 . PMID 10439561 . S2CID 20200394 .   
  51. ^ a b Bowler 1989 , стр. 307-318.
  52. ^ Левинсон 2019 .
  53. ^ Уотсон, JD ; Крик, FHC (25 апреля 1953 г.). «Молекулярная структура нуклеиновых кислот: структура нуклеиновой кислоты дезоксирибозы» (PDF) . Природа . 171 (4356): 737–738. Bibcode : 1953Natur.171..737W . DOI : 10.1038 / 171737a0 . ISSN 0028-0836 . PMID 13054692 . S2CID 4253007 . Архивировано (PDF) из оригинала 23.08.2014 . Проверено 4 декабря 2014 .     Мы не ускользнули от нашего внимания, что определенное спаривание, которое мы постулировали, сразу же предполагает возможный механизм копирования генетического материала.
  54. Перейти ↑ Hennig 1999 , p. 280
  55. Добжанский, Феодосий (март 1973). «Ничто в биологии не имеет смысла, кроме как в свете эволюции» (PDF) . Американский учитель биологии . 35 (3): 125–129. CiteSeerX 10.1.1.324.2891 . DOI : 10.2307 / 4444260 . JSTOR 4444260 . S2CID 207358177 . Архивировано (PDF) из оригинала 23.10.2015.    
  56. ^ a b c Кучера, Ульрих ; Никлас, Карл Дж. (Июнь 2004 г.). «Современная теория биологической эволюции: расширенный синтез». Naturwissenschaften . 91 (6): 255–276. Bibcode : 2004NW ..... 91..255K . DOI : 10.1007 / s00114-004-0515-у . ISSN 1432-1904 . PMID 15241603 . S2CID 10731711 .   
  57. ^ Avise, Джон С .; Айяла, Франсиско Дж. (11 мая 2010 г.). «В свете эволюции IV: Состояние человека» (PDF) . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 107 (Приложение 2): 8897–8901. DOI : 10.1073 / pnas.1003214107 . ISSN 0027-8424 . PMC 3024015 . PMID 20460311 . Архивировано (PDF) из оригинала 23.08.2014 . Проверено 29 декабря 2014 .    
  58. ^ Danchin, Этьен; Шармантье, Энн; Шампанское, Фрэнсис А .; Месуди, Алекс; Пужоль, Бенуа; Бланше, Саймон (июнь 2011 г.). «За пределами ДНК: интеграция инклюзивного наследования в расширенную теорию эволюции». Природа Обзоры Генетики . 12 (7): 475–486. DOI : 10.1038 / nrg3028 . ISSN 1471-0056 . PMID 21681209 . S2CID 8837202 .   
  59. ^ Pigliucci & Müller 2010
  60. ^ Штурм, Ричард А .; Фрудакис, Тони Н. (август 2004 г.). «Цвет глаз: порталы в гены пигментации и происхождение». Тенденции в генетике . 20 (8): 327–332. DOI : 10.1016 / j.tig.2004.06.010 . ISSN 0168-9525 . PMID 15262401 .  
  61. ^ a b Пирсон, Хелен (25 мая 2006 г.). «Генетика: что такое ген?». Природа . 441 (7092): 398–401. Bibcode : 2006Natur.441..398P . DOI : 10.1038 / 441398a . ISSN 0028-0836 . PMID 16724031 . S2CID 4420674 .   
  62. ^ Visscher, Питер М .; Хилл, Уильям Г .; Рэй, Наоми Р. (апрель 2008 г.). «Наследственность в эпоху геномики - концепции и заблуждения». Природа Обзоры Генетики . 9 (4): 255–266. DOI : 10.1038 / nrg2322 . ISSN 1471-0056 . PMID 18319743 . S2CID 690431 .   
  63. ^ Oetting, Уильям S .; Блестящий, Мюррей Х .; Кинг, Ричард А. (август 1996 г.). «Клинический спектр альбинизма у человека». Молекулярная медицина сегодня . 2 (8): 330–335. DOI : 10.1016 / 1357-4310 (96) 81798-9 . ISSN 1357-4310 . PMID 8796918 .  
  64. ^ a b Futuyma 2005 [ необходима страница ]
  65. Перейти ↑ Phillips, Patrick C. (ноябрь 2008 г.). «Эпистаз - важнейшая роль взаимодействия генов в структуре и эволюции генетических систем» . Природа Обзоры Генетики . 9 (11): 855–867. DOI : 10.1038 / nrg2452 . ISSN 1471-0056 . PMC 2689140 . PMID 18852697 .   
  66. ^ a b Ронглинг Ву; Мин Лин (март 2006 г.). «Функциональное картирование - как отображать и изучать генетическую архитектуру динамических сложных признаков». Природа Обзоры Генетики . 7 (3): 229–237. DOI : 10.1038 / nrg1804 . ISSN 1471-0056 . PMID 16485021 . S2CID 24301815 .   
  67. ^ Jablonka, Ева; Раз, Гал (июнь 2009 г.). «Трансгенерационное эпигенетическое наследование: распространенность, механизмы и последствия для изучения наследственности и эволюции» (PDF) . Ежеквартальный обзор биологии . 84 (2): 131–176. CiteSeerX 10.1.1.617.6333 . DOI : 10.1086 / 598822 . ISSN 0033-5770 . PMID 19606595 . S2CID 7233550 .     
  68. ^ Босдорф, Оливер; Аркури, Давиде; Richards, Christina L .; Пильуччи, Массимо (май 2010 г.). «Экспериментальное изменение метилирования ДНК влияет на фенотипическую пластичность экологически значимых признаков у Arabidopsis thaliana » (PDF) . Эволюционная экология . 24 (3): 541–553. DOI : 10.1007 / s10682-010-9372-7 . ISSN 0269-7653 . S2CID 15763479 .   
  69. ^ Jablonka, Ева; Лэмб, Мэрион Дж. (Декабрь 2002 г.). «Меняющаяся концепция эпигенетики». Летопись Нью-Йоркской академии наук . 981 (1): 82–96. Bibcode : 2002NYASA.981 ... 82J . DOI : 10.1111 / j.1749-6632.2002.tb04913.x . ISSN 0077-8923 . PMID 12547675 . S2CID 12561900 .   
  70. ^ Лаланд, Кевин Н .; Стерельный, Ким (сентябрь 2006 г.). «Перспектива: семь причин (не) игнорировать строительство ниши» . Эволюция . 60 (9): 1751–1762. DOI : 10.1111 / j.0014-3820.2006.tb00520.x . ISSN 0014-3820 . PMID 17089961 . S2CID 22997236 .   
  71. ^ Чепмен, Майкл Дж .; Маргулис, Линн (декабрь 1998 г.). «Морфогенез путем симбиогенеза» (PDF) . Международная микробиология . 1 (4): 319–326. ISSN 1139-6709 . PMID 10943381 . Архивировано из оригинального (PDF) 23 августа 2014 года . Проверено 9 декабря 2014 .   
  72. ^ Уилсон, Дэвид Слоан ; Уилсон, Эдвард О. (декабрь 2007 г.). «Переосмысление теоретических основ социобиологии» (PDF) . Ежеквартальный обзор биологии . 82 (4): 327–348. DOI : 10.1086 / 522809 . ISSN 0033-5770 . PMID 18217526 . S2CID 37774648 . Архивировано из оригинального (PDF) 11.05.2011.    
  73. ^ Butlin, Roger K.; Tregenza, Tom (February 28, 1998). "Levels of genetic polymorphism: marker loci versus quantitative traits". Philosophical Transactions of the Royal Society B. 353 (1366): 187–198. doi:10.1098/rstb.1998.0201. ISSN 0962-8436. PMC 1692210. PMID 9533123.
    • Бутлин, Роджер К .; Tregenza, Том (29 декабря 2000 г.). «Поправка на Бутлина и Трегенза, уровни генетического полиморфизма: маркерные локусы по сравнению с количественными признаками» . Философские труды Королевского общества B . 355 (1404): 1865. DOI : 10.1098 / rstb.2000.2000 . ISSN  0962-8436 . Некоторые значения в таблице 1 на стр. 193 были даны неверно. Ошибки не влияют на выводы, сделанные в статье. Исправленная таблица воспроизводится ниже.
  74. ^ Веттербом, Анна; Севов, Мари; Кавелье, Лючия; Бергстрём, Томас Ф. (ноябрь 2006 г.). «Сравнительный геномный анализ человека и шимпанзе указывает на ключевую роль инделей в эволюции приматов». Журнал молекулярной эволюции . 63 (5): 682–690. Bibcode : 2006JMolE..63..682W . DOI : 10.1007 / s00239-006-0045-7 . ISSN 0022-2844 . PMID 17075697 . S2CID 7257193 .   
  75. ^ Амос, Уильям; Харвуд, Джон (28 февраля 1998 г.). «Факторы, влияющие на уровни генетического разнообразия в естественных популяциях» . Философские труды Королевского общества B . 353 (1366): 177–186. DOI : 10.1098 / rstb.1998.0200 . ISSN 0962-8436 . PMC 1692205 . PMID 9533122 .   
  76. ^ a b Ewens 2004 [ необходима страница ]
  77. ^ Сойер, Стэнли А .; Парш, Джон; Чжан Чжи; Хартл, Дэниел Л. (17 апреля 2007 г.). «Преобладание положительного отбора среди почти нейтральных аминокислотных замен у Drosophila » . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 104 (16): 6504–6510. Bibcode : 2007PNAS..104.6504S . DOI : 10.1073 / pnas.0701572104 . ISSN 0027-8424 . PMC 1871816 . PMID 17409186 .   
  78. ^ Гастингс, П.Дж.; Лупски, Джеймс Р .; Розенберг, Сьюзен М .; Ира, Гжегож (август 2009 г.). «Механизмы изменения числа копий гена» . Природа Обзоры Генетики . 10 (8): 551–564. DOI : 10.1038 / nrg2593 . ISSN 1471-0056 . PMC 2864001 . PMID 19597530 .   
  79. ^ Кэрролл, Гренье и Уэтерби 2005 [ необходима страница ]
  80. ^ Харрисон, Пол М .; Герштейн, Марк (17 мая 2002 г.). «Изучение геномов на протяжении веков: семейства белков, псевдогены и эволюция протеома». Журнал молекулярной биологии . 318 (5): 1155–1174. DOI : 10.1016 / S0022-2836 (02) 00109-2 . ISSN 0022-2836 . PMID 12083509 .  
  81. ^ Bowmaker, Джеймс К. (май 1998). «Эволюция цветового зрения у позвоночных» . Глаз . 12 (3b): 541–547. DOI : 10.1038 / eye.1998.143 . ISSN 0950-222X . PMID 9775215 . S2CID 12851209 .   
  82. ^ Грегори, Т. Райан ; Хеберт, Пол Д. Н. (апрель 1999 г.). «Модуляция содержания ДНК: приблизительные причины и конечные последствия» . Геномные исследования . 9 (4): 317–324. doi : 10.1101 / gr.9.4.317 (неактивный 2021-01-16). ISSN 1088-9051 . PMID 10207154 . Архивировано 23 августа 2014 года . Проверено 11 декабря 2014 .  CS1 maint: DOI inactive as of January 2021 (link)
  83. ^ Hurles, Мэтью (13 июля 2004). «Дублирование генов: торговля запасными частями в геномах» . PLOS Биология . 2 (7): e206. DOI : 10.1371 / journal.pbio.0020206 . ISSN 1545-7885 . PMC 449868 . PMID 15252449 .   
  84. ^ Лю, На; Окамура, Кацутомо; Тайлер, Дэвид М .; и другие. (Октябрь 2008 г.). «Эволюция и функциональная диверсификация генов микроРНК животных» . Клеточные исследования . 18 (10): 985–996. DOI : 10.1038 / cr.2008.278 . ISSN 1001-0602 . PMC 2712117 . PMID 18711447 .   
  85. ^ Siepel, Адам (октябрь 2009). «Дарвиновская алхимия: человеческие гены из некодирующей ДНК» . Геномные исследования . 19 (10): 1693–1695. DOI : 10.1101 / gr.098376.109 . ISSN 1088-9051 . PMC 2765273 . PMID 19797681 .   
  86. ^ Оренго, Кристина А .; Торнтон, Джанет М. (июль 2005 г.). «Семейства белков и их эволюция - структурная перспектива». Ежегодный обзор биохимии . Ежегодные обзоры . 74 : 867–900. DOI : 10.1146 / annurev.biochem.74.082803.133029 . ISSN 0066-4154 . PMID 15954844 . S2CID 7483470 .   
  87. ^ Лонг, Маньюань; Бетран, Эстер; Торнтон, Кевин; Ван, Вэнь (ноябрь 2003 г.). «Происхождение новых генов: взгляды молодых и старых». Природа Обзоры Генетики . 4 (11): 865–875. DOI : 10.1038 / nrg1204 . ISSN 1471-0056 . PMID 14634634 . S2CID 33999892 .   
  88. ^ Ван, Минглей; Каэтано-Аноллес, Густаво (14 января 2009 г.). "Эволюционная механика организации доменов в протеомах и рост модульности в белковом мире". Структура . 17 (1): 66–78. DOI : 10.1016 / j.str.2008.11.008 . ISSN 1357-4310 . PMID 19141283 .  
  89. ^ Вайсман, Кира Дж .; Мюллер, Рольф (14 апреля 2008 г.). «Белковые взаимодействия в мультиферментных мегасинтетазах». ChemBioChem . 9 (6): 826–848. DOI : 10.1002 / cbic.200700751 . ISSN 1439-4227 . PMID 18357594 . S2CID 205552778 .   
  90. ^ Radding, Чарльз М. (декабрь 1982). «Гомологичное спаривание и обмен цепями в генетической рекомбинации». Ежегодный обзор генетики . 16 : 405–437. DOI : 10.1146 / annurev.ge.16.120182.002201 . ISSN 0066-4197 . PMID 6297377 .  
  91. ^ Агроэл, Aneil F. (5 сентября 2006). «Эволюция пола: почему организмы меняют свои генотипы?». Текущая биология . 16 (17): R696 – R704. CiteSeerX 10.1.1.475.9645 . DOI : 10.1016 / j.cub.2006.07.063 . ISSN 0960-9822 . PMID 16950096 . S2CID 14739487 .    
  92. ^ Петерс, Эндрю Д .; Отто, Сара П. (июнь 2003 г.). «Освобождение генетической изменчивости через пол». BioEssays . 25 (6): 533–537. DOI : 10.1002 / bies.10291 . ISSN 0265-9247 . PMID 12766942 .  
  93. ^ Годдард, Мэтью Р .; Годфрей, Х. Чарльз Дж .; Берт, Остин (31 марта 2005 г.). «Секс увеличивает эффективность естественного отбора в экспериментальных популяциях дрожжей». Природа . 434 (7033): 636–640. Bibcode : 2005Natur.434..636G . DOI : 10,1038 / природа03405 . ISSN 0028-0836 . PMID 15800622 . S2CID 4397491 .   
  94. ^ Мэйнард Смит 1978 [ нужна страница ]
  95. ^ а б Ридли 2004 , стр. 314
  96. ^ Ван Вален, Ли (1973). «Новый эволюционный закон» (PDF) . Эволюционная теория . 1 : 1–30. ISSN 0093-4755 . Архивировано из оригинального (PDF) 22 декабря 2014 года . Проверено 24 декабря 2014 .  
  97. ^ Гамильтон, WD ; Аксельрод, Роберт ; Танезе, Рэйко (1 мая 1990 г.). «Половое размножение как приспособление к сопротивлению паразитам (обзор)» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 87 (9): 3566–3573. Bibcode : 1990PNAS ... 87.3566H . DOI : 10.1073 / pnas.87.9.3566 . ISSN 0027-8424 . PMC 53943 . PMID 2185476 .   
  98. ^ Birdsell & Wills 2003 , стр. 113-117
  99. ^ a b Morjan, Carrie L .; Ризеберг, Лорен Х. (июнь 2004 г.). «Как виды развиваются коллективно: последствия потока генов и отбора для распространения выгодных аллелей» . Молекулярная экология . 13 (6): 1341–1356. DOI : 10.1111 / j.1365-294X.2004.02164.x . ISSN 0962-1083 . PMC 2600545 . PMID 15140081 .   
  100. ^ Баучер, Ян; Douady, Christophe J .; Папке, Р. Тейн; и другие. (Декабрь 2003 г.). «Боковой перенос генов и происхождение прокариотических групп». Ежегодный обзор генетики . 37 : 283–328. DOI : 10.1146 / annurev.genet.37.050503.084247 . ISSN 0066-4197 . PMID 14616063 .  
  101. ^ Уолш, Тимоти Р. (октябрь 2006 г.). «Комбинаторная генетическая эволюция мультирезистентности». Текущее мнение в микробиологии . 9 (5): 476–482. DOI : 10.1016 / j.mib.2006.08.009 . ISSN 1369-5274 . PMID 16942901 .  
  102. Кондо, Нацуко; Никох, Наруо; Идзичи, Нобуюки; и другие. (29 октября 2002 г.). «Фрагмент генома эндосимбионта Wolbachia перенесен на Х-хромосому насекомого-хозяина» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 99 (22): 14280–14285. Bibcode : 2002PNAS ... 9914280K . DOI : 10.1073 / pnas.222228199 . ISSN 0027-8424 . PMC 137875 . PMID 12386340 .   
  103. Перейти ↑ Sprague, George F., Jr. (декабрь 1991 г.). «Генетический обмен между царствами». Текущее мнение в области генетики и развития . 1 (4): 530–533. DOI : 10.1016 / S0959-437X (05) 80203-5 . ISSN 0959-437X . PMID 1822285 .  
  104. ^ Гладышев, Евгений А .; Мезельсон, Мэтью ; Архипова Ирина Р. (30 мая 2008 г.). «Массивный горизонтальный перенос генов у Bdelloid коловраток» . Наука . 320 (5880): 1210–1213. Bibcode : 2008Sci ... 320.1210G . DOI : 10.1126 / science.1156407 . ISSN 0036-8075 . PMID 18511688 . S2CID 11862013 .   
  105. ^ Бальдо, Анджела М .; МакКлюр, Марселла А. (сентябрь 1999 г.). «Эволюция и горизонтальная передача генов, кодирующих dUTPase, в вирусах и их хозяевах» . Журнал вирусологии . 73 (9): 7710–7721. DOI : 10,1128 / JVI.73.9.7710-7721.1999 . ISSN 0022-538X . PMC 104298 . PMID 10438861 .   
  106. ^ Ривера, Мария C .; Лейк, Джеймс А. (9 сентября 2004 г.). «Кольцо жизни свидетельствует о происхождении эукариот в результате слияния геномов». Природа . 431 (7005): 152–155. Bibcode : 2004Natur.431..152R . DOI : 10,1038 / природа02848 . ISSN 0028-0836 . PMID 15356622 . S2CID 4349149 .   
  107. ^ a b c Херст, Лоуренс Д. (февраль 2009 г.). «Фундаментальные концепции генетики: генетика и понимание селекции». Природа Обзоры Генетики . 10 (2): 83–93. DOI : 10.1038 / nrg2506 . ISSN 1471-0056 . PMID 19119264 . S2CID 1670587 .   
  108. Дарвин 1859 , Глава XIV
  109. ^ Отто, Сара П .; Серведио, Мария Р .; Нуисмер, Скотт Л. (август 2008 г.). «Частотно-зависимый отбор и эволюция ассортативного спаривания» . Генетика . 179 (4): 2091–2112. DOI : 10.1534 / genetics.107.084418 . ISSN 0016-6731 . PMC 2516082 . PMID 18660541 .   
  110. ^ a b c Орр, Х. Аллен (август 2009 г.). «Фитнес и его роль в эволюционной генетике» . Природа Обзоры Генетики . 10 (8): 531–539. DOI : 10.1038 / nrg2603 . ISSN 1471-0056 . PMC 2753274 . PMID 19546856 .   
  111. Рианна Холдейн, JBS (14 марта 1959 г.). «Теория естественного отбора сегодня». Природа . 183 (4663): 710–713. Bibcode : 1959Natur.183..710H . DOI : 10.1038 / 183710a0 . ISSN 0028-0836 . PMID 13644170 . S2CID 4185793 .   
  112. ^ Ланде, Рассел ; Арнольд, Стеван Дж. (Ноябрь 1983 г.). «Измерение отбора по коррелированным персонажам» . Эволюция . 37 (6): 1210–1226. DOI : 10.1111 / j.1558-5646.1983.tb00236.x . ISSN 0014-3820 . JSTOR 2408842 . PMID 28556011 . S2CID 36544045 .    
  113. ^ Голдберг, Эмма Э .; Игич, Борис (ноябрь 2008 г.). «О филогенетических тестах необратимой эволюции». Эволюция . 62 (11): 2727–2741. DOI : 10.1111 / j.1558-5646.2008.00505.x . ISSN 0014-3820 . PMID 18764918 . S2CID 30703407 .   
  114. ^ Коллин, Рэйчел; Мильетта, Мария Пиа (ноябрь 2008 г.). «Перевернутое мнение о законе Долло». Тенденции в экологии и эволюции . 23 (11): 602–609. DOI : 10.1016 / j.tree.2008.06.013 . ISSN 0169-5347 . PMID 18814933 .  
  115. ^ Томич, Ненад; Мейер-Рохов, Виктор Бенно (2011). «Атавизмы: медицинские, генетические и эволюционные последствия». Перспективы биологии и медицины . 54 (3): 332–353. DOI : 10,1353 / pbm.2011.0034 . ISSN 0031-5982 . PMID 21857125 . S2CID 40851098 .   
  116. ^ Hoekstra, Hopi E .; Hoekstra, Джонатан М .; Берриган, Дэвид; и другие. (31 июля 2001 г.). «Сила и темп направленного отбора в дикой природе» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 98 (16): 9157–9160. Bibcode : 2001PNAS ... 98.9157H . DOI : 10.1073 / pnas.161281098 . ISSN 0027-8424 . PMC 55389 . PMID 11470913 .   
  117. ^ Фельзенштейн, Джозеф (ноябрь 1979). «Экскурсии по границе раздела подрывного и стабилизирующего отбора» . Генетика . 93 (3): 773–795. ISSN 0016-6731 . PMC 1214112 . PMID 17248980 .   
  118. ^ Одум 1971 , стр. 8
  119. ^ Окаша 2006
  120. ^ a b Гулд, Стивен Джей (28 февраля 1998 г.). «Дальнейшие путешествия Гулливера: необходимость и трудность иерархической теории отбора» . Философские труды Королевского общества B . 353 (1366): 307–314. DOI : 10.1098 / rstb.1998.0211 . ISSN 0962-8436 . PMC 1692213 . PMID 9533127 .   
  121. Перейти ↑ Mayr, Ernst (18 марта 1997 г.). «Объекты отбора» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 94 (6): 2091–2094. Bibcode : 1997PNAS ... 94.2091M . DOI : 10.1073 / pnas.94.6.2091 . ISSN 0027-8424 . PMC 33654 . PMID 9122151 .   
  122. Перейти ↑ Maynard Smith 1998 , pp. 203–211; обсуждение 211–217
  123. ^ Хикки, Донал А. (1992). «Эволюционная динамика мобильных элементов у прокариот и эукариот». Genetica . 86 (1–3): 269–274. DOI : 10.1007 / BF00133725 . ISSN 0016-6707 . PMID 1334911 . S2CID 6583945 .   
  124. ^ Gould, Stephen Jay; Lloyd, Elisabeth A. (October 12, 1999). "Individuality and adaptation across levels of selection: how shall we name and generalise the unit of Darwinism?". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 96 (21): 11904–11909. Bibcode:1999PNAS...9611904G. doi:10.1073/pnas.96.21.11904. ISSN 0027-8424. PMC 18385. PMID 10518549.
  125. ^ Лиен, Сигбьёрн; Шида, Джоанна; Шехингер, Биргит; и другие. (Февраль 2000 г.). «Доказательства гетерогенности в рекомбинации в псевдоавтосомной области человека: анализ высокого разрешения с помощью типирования сперматозоидов и радиационно-гибридного картирования» . Американский журнал генетики человека . 66 (2): 557–566. DOI : 10.1086 / 302754 . ISSN 0002-9297 . PMC 1288109 . PMID 10677316 .   
  126. Бартон, Николас Х. (29 ноября 2000 г.). «Генетический автостоп» . Философские труды Королевского общества B . 355 (1403): 1553–1562. DOI : 10.1098 / rstb.2000.0716 . ISSN 0962-8436 . PMC 1692896 . PMID 11127900 .   
  127. ^ a b Гиллеспи, Джон Х. (ноябрь 2001 г.). «Имеет ли значение размер популяции вида для его эволюции?» . Эволюция . 55 (11): 2161–2169. DOI : 10.1111 / j.0014-3820.2001.tb00732.x . ISSN 0014-3820 . PMID 11794777 . S2CID 221735887 .   
  128. ^ Андерссон, Мальте; Симмонс, Ли У. (июнь 2006 г.). «Половой выбор и выбор партнера» (PDF) . Тенденции в экологии и эволюции . 21 (6): 296–302. CiteSeerX 10.1.1.595.4050 . DOI : 10.1016 / j.tree.2006.03.015 . ISSN 0169-5347 . PMID 16769428 . Архивировано (PDF) из оригинала на 2013-03-09.    
  129. ^ Кокко, Ханна ; Брукс, Роберт; Макнамара, Джон М .; Хьюстон, Аласдер И. (7 июля 2002 г.). «Континуум полового отбора» . Труды Королевского общества B . 269 (1498): 1331–1340. DOI : 10.1098 / rspb.2002.2020 . ISSN 0962-8452 . PMC 1691039 . PMID 12079655 .   
  130. ^ Куинн, Томас П .; Хендри, Эндрю П .; Бак, Грегори Б. (2001). «Уравновешивание естественного и полового отбора у нерки: взаимодействие между размером тела, репродуктивными возможностями и уязвимостью перед хищниками со стороны медведей» (PDF) . Исследования эволюционной экологии . 3 : 917–937. ISSN 1522-0613 . Архивировано (PDF) из оригинала 5 марта 2016 года . Проверено 15 декабря 2014 .  
  131. ^ Хант, Джон; Брукс, Роберт; Дженнионс, Майкл Д .; и другие. (23 декабря 2004 г.). «Высококачественные мужские полевые сверчки вкладывают большие средства в сексуальную демонстрацию, но умирают молодыми». Природа . 432 (7020): 1024–1027. Bibcode : 2004Natur.432.1024H . DOI : 10,1038 / природа03084 . ISSN 0028-0836 . PMID 15616562 . S2CID 4417867 .   
  132. ^ Futuyma & Киркпатрик 2017 , стр 55-66, гл3: Естественный отбор и адаптация
  133. ↑ a b Masel, Joanna (25 октября 2011 г.). «Генетический дрейф» . Текущая биология . 21 (20): R837 – R838. DOI : 10.1016 / j.cub.2011.08.007 . ISSN 0960-9822 . PMID 22032182 . S2CID 17619958 .   
  134. ^ Ланде, Рассел (1989). "Фишерианская и райтовская теории видообразования". Геном . 31 (1): 221–227. DOI : 10.1139 / g89-037 . ISSN 0831-2796 . PMID 2687093 .  
  135. ^ Кимура, Моту (1991). «Нейтральная теория молекулярной эволюции: обзор последних данных» . Японский журнал генетики человека . 66 (4): 367–386. DOI : 10.1266 / jjg.66.367 . ISSN 0021-504X . PMID 1954033 .  
  136. ^ Кимура, Моту (1989). «Нейтральная теория молекулярной эволюции и мировоззрение нейтралистов». Геном . 31 (1): 24–31. DOI : 10.1139 / g89-009 . ISSN 0831-2796 . PMID 2687096 .  
  137. ^ Kreitman, Martin (август 1996). «Нейтральная теория мертва. Да здравствует нейтральная теория». BioEssays . 18 (8): 678–683, обсуждение 683. doi : 10.1002 / bies.950180812 . ISSN 0265-9247 . PMID 8760341 .  
  138. Перейти ↑ Leigh, EG, Jr. (ноябрь 2007 г.). «Нейтральная теория: историческая перспектива» . Журнал эволюционной биологии . 20 (6): 2075–2091. DOI : 10.1111 / j.1420-9101.2007.01410.x . ISSN 1010-061X . PMID 17956380 . S2CID 2081042 .   
  139. ^ Neher, Ричард А .; Шрайман, Борис I. (август 2011 г.). «Генетический проект и квазинейтральность в больших факультативно сексуальных популяциях» . Генетика . 188 (4): 975–996. arXiv : 1108,1635 . Bibcode : 2011arXiv1108.1635N . DOI : 10.1534 / genetics.111.128876 . ISSN 0016-6731 . PMC 3176096 . PMID 21625002 .   
  140. Отто, Сара П .; Уитлок, Майкл С. (июнь 1997 г.). «Вероятность фиксации в популяциях изменяющегося размера» (PDF) . Генетика . 146 (2): 723–733. DOI : 10.1093 / генетика / 146.2.723 . ISSN 0016-6731 . PMC 1208011 . PMID 9178020 . Архивировано (PDF) из оригинала 19 марта 2015 года . Проверено 18 декабря 2014 .    
  141. ^ a b Чарльзуорт, Брайан (март 2009 г.). «Основные концепции генетики: эффективный размер популяции и закономерности молекулярной эволюции и вариации». Природа Обзоры Генетики . 10 (3): 195–205. DOI : 10.1038 / nrg2526 . ISSN 1471-0056 . PMID 19204717 . S2CID 205484393 .   
  142. ^ Каттер, Ашер Д .; Чхве, Джэ Ён (август 2010 г.). «Естественный отбор формирует нуклеотидный полиморфизм в геноме нематоды Caenorhabditis briggsae » . Геномные исследования . 20 (8): 1103–1111. DOI : 10.1101 / gr.104331.109 . ISSN 1088-9051 . PMC 2909573 . PMID 20508143 .   
  143. ^ Митчелл-Олдс, Томас; Уиллис, Джон Х .; Гольдштейн, Дэвид Б. (ноябрь 2007 г.). «Какие эволюционные процессы влияют на естественную генетическую изменчивость фенотипических признаков?». Природа Обзоры Генетики . 8 (11): 845–856. DOI : 10.1038 / nrg2207 . ISSN 1471-0056 . PMID 17943192 . S2CID 14914998 .   
  144. Nei, Masatoshi (декабрь 2005 г.). «Селекционизм и нейтрализм в молекулярной эволюции» . Молекулярная биология и эволюция . 22 (12): 2318–2342. DOI : 10.1093 / molbev / msi242 . ISSN 0737-4038 . PMC 1513187 . PMID 16120807 .   
    • Nei, Masatoshi (May 2006). "Selectionism and Neutralism in Molecular Evolution". Molecular Biology and Evolution (Erratum). 23 (5): 2318–42. doi:10.1093/molbev/msk009. ISSN 0737-4038. PMC 1513187. PMID 16120807.
  145. ^ Wright, Sewall (1932). "The roles of mutation, inbreeding, crossbreeding and selection in evolution". Proceedings of the VI International Congress of Genetrics. 1: 356–366. Archived from the original on 2014-08-23. Retrieved 2014-12-18.
  146. ^ Coyne, Jerry A.; Barton, Nicholas H.; Turelli, Michael (June 1997). "Perspective: A Critique of Sewall Wright's Shifting Balance Theory of Evolution". Evolution. 51 (3): 643–671. doi:10.2307/2411143. ISSN 0014-3820. JSTOR 2411143. PMID 28568586.
  147. ^ Холдейн, JBS (июль 1927). «Математическая теория естественного и искусственного отбора, часть V: отбор и мутация». Труды Кембриджского философского общества . 26 (7): 838–844. Bibcode : 1927PCPS ... 23..838H . DOI : 10.1017 / S0305004100015644 .
  148. ^ Фишер 1930
  149. ^ a b Ямпольский, Лев Ю .; Штольцфус, Арлин (20 декабря 2001 г.). «Предвзятость во введении вариации как ориентирующего фактора эволюции». Эволюция и развитие . 3 (2): 73–83. DOI : 10.1046 / j.1525-142x.2001.003002073.x . PMID 11341676 . S2CID 26956345 .  
  150. ^ Sueoka, Нобору (1 апреля 1962). «О генетической основе вариабельности и неоднородности состава оснований ДНК» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 48 (4): 582–592. Bibcode : 1962PNAS ... 48..582S . DOI : 10.1073 / pnas.48.4.582 . PMC 220819 . PMID 13918161 .  
  151. Перейти ↑ Freese, Ernst (июль 1962 г.). «Об эволюции основного состава ДНК». Журнал теоретической биологии . 3 (1): 82–101. DOI : 10.1016 / S0022-5193 (62) 80005-8 .
  152. ^ Кокс, Эдвард С .; Яновский, Чарльз (1 ноября 1967 г.). «Измененные соотношения оснований в ДНК штамма-мутатора Escherichia coli» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 58 (5): 1895–1902. Bibcode : 1967PNAS ... 58.1895C . DOI : 10.1073 / pnas.58.5.1895 . PMC 223881 . PMID 4866980 .  
  153. ^ Шах, Премаль; Гилкрист, Майкл А. (21 июня 2011 г.). «Объяснение сложных моделей использования кодонов с отбором на эффективность трансляции, смещение мутаций и генетический дрейф» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 108 (25): 10231–10236. Bibcode : 2011PNAS..10810231S . DOI : 10.1073 / pnas.1016719108 . PMC 3121864 . PMID 21646514 .  
  154. ^ Bulmer, Michael G. (November 1991). "The selection-mutation-drift theory of synonymous codon usage". Genetics. 129 (3): 897–907. doi:10.1093/genetics/129.3.897. PMC 1204756. PMID 1752426.
  155. ^ Fryxell, Karl J .; Цукеркандль, Эмиль (сентябрь 2000 г.). «Дезаминирование цитозина играет главную роль в эволюции изохор млекопитающих» . Молекулярная биология и эволюция . 17 (9): 1371–1383. DOI : 10.1093 / oxfordjournals.molbev.a026420 . PMID 10958853 . 
  156. ^ Петров, Дмитрий А .; Сангстер, Тодд А .; Джонстон, Дж. Спенсер; и другие. (11 февраля 2000 г.). «Доказательства потери ДНК как фактор, определяющий размер генома». Наука . 287 (5455): 1060–1062. Bibcode : 2000Sci ... 287.1060P . DOI : 10.1126 / science.287.5455.1060 . ISSN 0036-8075 . PMID 10669421 . S2CID 12021662 .   
  157. Петров, Дмитрий А. (май 2002 г.). «Потеря ДНК и эволюция размера генома у дрозофилы ». Genetica . 115 (1): 81–91. DOI : 10,1023 / A: 1016076215168 . ISSN 0016-6707 . PMID 12188050 . S2CID 5314242 .   
  158. ^ Дюре, Лоран; Гальтье, Николя (сентябрь 2009 г.). «Предвзятая конверсия генов и эволюция геномных ландшафтов млекопитающих». Ежегодный обзор геномики и генетики человека . Ежегодные обзоры. 10 : 285–311. DOI : 10.1146 / annurev-genom-082908-150001 . ISSN 1527-8204 . PMID 19630562 . S2CID 9126286 .   
  159. ^ Хершберг, Рут; Петров, Дмитрий Александрович (9 сентября 2010 г.). «Доказательства того, что мутации повсеместно склонны к AT у бактерий» . PLOS Genetics . 6 (9): e1001115. DOI : 10.1371 / journal.pgen.1001115 . PMC 2936535 . PMID 20838599 .  
  160. ^ Штольцфус, Арлин; Маккэндлиш, Дэвид М. (сентябрь 2017 г.). «Мутационные предубеждения влияют на параллельную адаптацию» . Молекулярная биология и эволюция . 34 (9): 2163–2172. DOI : 10.1093 / molbev / msx180 . PMC 5850294 . PMID 28645195 .  
  161. ^ Пейн, Джошуа Л .; Менардо, Фабрицио; Траунер, Андрей; и другие. (13 мая 2019 г.). «Смещение перехода влияет на развитие устойчивости Mycobacterium tuberculosis к антибиотикам » . PLOS Биология . 17 (5): e3000265. DOI : 10.1371 / journal.pbio.3000265 . PMC 6532934 . PMID 31083647 .  
  162. ^ Сторц, Джей Ф .; Натараджан, Чандрасекар; Синьор, Энтони В .; и другие. (22 июля 2019 г.). «Роль смещения мутации в адаптивной молекулярной эволюции: понимание конвергентных изменений в функции белков» . Философские труды Королевского общества B . 374 (1777): 20180238. DOI : 10.1098 / rstb.2018.0238 . PMC 6560279 . PMID 31154983 .  
  163. ^ Свенссон, Эрик I .; Бергер, Дэвид (1 мая 2019 г.). «Роль мутационного уклона в адаптивной эволюции». Тенденции в экологии и эволюции . 34 (5): 422–434. DOI : 10.1016 / j.tree.2019.01.015 . PMID 31003616 . 
  164. ^ Байм, Майкл; Либерман, Тами Д .; Келсич, Эрик Д .; и другие. (9 сентября 2016 г.). «Пространственно-временная микробная эволюция на антибиотических ландшафтах» . Наука . 353 (6304): 1147–1151. Bibcode : 2016Sci ... 353.1147B . DOI : 10.1126 / science.aag0822 . ISSN 0036-8075 . PMC 5534434 . PMID 27609891 .   
  165. ^ a b c Скотт, Юджени С .; Мацке, Николас Дж. (15 мая 2007 г.). «Биологический дизайн в научных классах» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 104 (Приложение 1): 8669–8676. Bibcode : 2007PNAS..104.8669S . DOI : 10.1073 / pnas.0701505104 . ISSN 0027-8424 . PMC 1876445 . PMID 17494747 .   
  166. ^ Хендри, Эндрю Пол; Киннисон, Майкл Т. (ноябрь 2001 г.). «Введение в микроэволюцию: скорость, закономерность, процесс». Genetica . 112–113 (1): 1–8. DOI : 10,1023 / A: 1013368628607 . ISSN 0016-6707 . PMID 11838760 . S2CID 24485535 .   
  167. ^ Леруа, Armand М. (март-апрель 2000). «Масштабная независимость эволюции». Эволюция и развитие . 2 (2): 67–77. CiteSeerX 10.1.1.120.1020 . DOI : 10.1046 / j.1525-142x.2000.00044.x . ISSN 1520-541X . PMID 11258392 . S2CID 17289010 .    
  168. ^ Gould 2002 , стр. 657-658.
  169. ^ a b Гулд, Стивен Джей (19 июля 1994 г.). «Темп и мода в макроэволюционной реконструкции дарвинизма» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 91 (15): 6764–6771. Bibcode : 1994PNAS ... 91.6764G . DOI : 10.1073 / pnas.91.15.6764 . ISSN 0027-8424 . PMC 44281 . PMID 8041695 .   
  170. ^ Яблонски, Дэвид (2000). «Микро- и макроэволюция: масштабы и иерархия в эволюционной биологии и палеобиологии». Палеобиология . 26 (sp4): 15–52. DOI : 10,1666 / 0094-8373 (2000) 26 [15: MAMSAH] 2.0.CO; 2 . ISSN 0094-8373 . 
  171. ^ Догерти, Michael J. (20 июля 1998). "Человеческая раса развивается или исчезает?" . Scientific American . ISSN 0036-8733 . Архивировано 06 мая 2014 года . Проверено 11 сентября 2015 . 
  172. ^ Исаак, Марк, изд. (22 июля 2003 г.). «Утверждение CB932: Эволюция вырожденных форм» . Архив TalkOrigins . Хьюстон, Техас: The TalkOrigins Foundation, Inc. Архивировано 23 августа 2014 года . Проверено 19 декабря 2014 .
  173. Перейти ↑ Lane 1996 , p. 61
  174. Кэрролл, Шон Б. (22 февраля 2001 г.). «Случайность и необходимость: эволюция морфологической сложности и разнообразия». Природа . 409 (6823): 1102–1109. Bibcode : 2001Natur.409.1102C . DOI : 10.1038 / 35059227 . ISSN 0028-0836 . PMID 11234024 . S2CID 4319886 .   
  175. ^ Уитмен, Уильям Б .; Коулман, Дэвид С .; Вибе, Уильям Дж. (9 июня 1998 г.). «Прокариоты: невидимое большинство» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 95 (12): 6578–6583. Bibcode : 1998PNAS ... 95.6578W . DOI : 10.1073 / pnas.95.12.6578 . ISSN 0027-8424 . PMC 33863 . PMID 9618454 .   
  176. ^ a b Schloss, Patrick D .; Хандельсман, Джо (декабрь 2004 г.). «Статус микробной переписи» . Обзоры микробиологии и молекулярной биологии . 68 (4): 686–691. DOI : 10.1128 / MMBR.68.4.686-691.2004 . ISSN 1092-2172 . PMC 539005 . PMID 15590780 .   
  177. ^ Nealson, Kenneth H. (январь 1999). «Поствикингская микробиология: новые подходы, новые данные, новые идеи». Истоки жизни и эволюция биосфер . 29 (1): 73–93. Bibcode : 1999OLEB ... 29 ... 73N . DOI : 10,1023 / A: 1006515817767 . ISSN 0169-6149 . PMID 11536899 . S2CID 12289639 .   
  178. ^ Баклинг, Ангус; Маклин, Р. Крейг; Брокхерст, Майкл А .; Колгрейв, Ник (12 февраля 2009 г.). «Бигль в бутылке». Природа . 457 (7231): 824–829. Bibcode : 2009Natur.457..824B . DOI : 10,1038 / природа07892 . ISSN 0028-0836 . PMID 19212400 . S2CID 205216404 .   
  179. ^ Елена, Сантьяго Ф .; Ленски, Ричард Э. (июнь 2003 г.). «Эволюционные эксперименты с микроорганизмами: динамика и генетические основы адаптации». Природа Обзоры Генетики . 4 (6): 457–469. DOI : 10.1038 / nrg1088 . ISSN 1471-0056 . PMID 12776215 . S2CID 209727 .   
  180. Перейти ↑ Mayr 1982 , p. 483: «Адаптация ... больше не могла считаться статическим состоянием, продуктом творческого прошлого, а превратилась в непрерывный динамический процесс».
  181. ^ Шестое издание Оксфордского научного словаря (2010) определяет адаптацию как «любое изменение в структуре или функционировании последовательных поколений населения, которое делает его более приспособленным к окружающей среде».
  182. Орр, Х. Аллен (февраль 2005 г.). «Генетическая теория адаптации: краткая история». Природа Обзоры Генетики . 6 (2): 119–127. DOI : 10.1038 / nrg1523 . ISSN 1471-0056 . PMID 15716908 . S2CID 17772950 .   
  183. Добжанский, 1968 , с. 1–34.
  184. Добжанский, 1970 , стр. 4–6, 79–82, 84–87
  185. Добжанский, Феодосий (март 1956 г.). "Генетика природных популяций. XXV. Генетические изменения в популяциях Drosophila pseudoobscura и Drosophila persimilis в некоторых местах в Калифорнии". Эволюция . 10 (1): 82–92. DOI : 10.2307 / 2406099 . ISSN 0014-3820 . JSTOR 2406099 .  
  186. ^ Накадзима, Акира; Сугимото, Ёко; Ёнеяма, Хироши; Накаэ, Тайцзи (июнь 2002 г.). «Высокий уровень устойчивости к фторхинолонам у синегнойной палочки из-за взаимодействия насоса оттока MexAB-OprM и мутации ДНК-гиразы». Микробиология и иммунология . 46 (6): 391–395. DOI : 10.1111 / j.1348-0421.2002.tb02711.x . ISSN 1348-0421 . PMID 12153116 . S2CID 22593331 .   
  187. ^ Блаунт, Захари Д .; Borland, Christina Z .; Ленски, Ричард Э. (10 июня 2008 г.). «Инаугурационная статья: историческая случайность и эволюция ключевого нововведения в экспериментальной популяции Escherichia coli » . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 105 (23): 7899–7906. Bibcode : 2008PNAS..105.7899B . DOI : 10.1073 / pnas.0803151105 . ISSN 0027-8424 . PMC 2430337 . PMID 18524956 .   
  188. ^ Окада, Хиросуке; Негоро, Сейджи; Кимура, Хироюки; Накамура, Шуничи (10 ноября 1983 г.). «Эволюционная адаптация ферментов, кодируемых плазмидами, для разложения олигомеров нейлона». Природа . 306 (5939): 203–206. Bibcode : 1983Natur.306..203O . DOI : 10.1038 / 306203a0 . ISSN 0028-0836 . PMID 6646204 . S2CID 4364682 .   
  189. ^ Оно, Сусуму (апрель 1984). «Рождение уникального фермента из альтернативной рамки считывания ранее существовавшей, внутренне повторяющейся кодирующей последовательности» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 81 (8): 2421–2425. Bibcode : 1984PNAS ... 81.2421O . DOI : 10.1073 / pnas.81.8.2421 . ISSN 0027-8424 . PMC 345072 . PMID 6585807 .   
  190. ^ Копли, Шелли Д. (июнь 2000 г.). «Эволюция метаболического пути деградации токсичных ксенобиотиков: лоскутный подход». Направления биохимических наук . 25 (6): 261–265. DOI : 10.1016 / S0968-0004 (00) 01562-0 . ISSN 0968-0004 . PMID 10838562 .  
  191. ^ Кроуфорд, Рональд Л .; Юнг, Карина М .; Ремень, Дженис Л. (октябрь 2007 г.). «Недавняя эволюция пентахлорфенол (PCP) -4-монооксигеназы (PcpB) и связанные с ними пути бактериальной деградации PCP». Биодеградация . 18 (5): 525–539. DOI : 10.1007 / s10532-006-9090-6 . ISSN 0923-9820 . PMID 17123025 . S2CID 8174462 .   
  192. ^ Eshel, Илан (декабрь 1973). «Выбор клонов и оптимальные скорости мутации». Журнал прикладной теории вероятностей . 10 (4): 728–738. DOI : 10.2307 / 3212376 . ISSN 1475-6072 . JSTOR 3212376 .  
  193. ^ Альтенберг 1995 , с. 205-259
  194. ^ Масел, Джоанна; Бергман, Авив (июль 2003 г.). «Эволюция свойств эволюционируемости дрожжевого приона [PSI +]». Эволюция . 57 (7): 1498–1512. DOI : 10.1111 / j.0014-3820.2003.tb00358.x . ISSN 0014-3820 . PMID 12940355 . S2CID 30954684 .   
  195. ^ Ланкастер, Алекс К .; Бардилл, Дж. Патрик; Верно, Хизер Л .; Масел, Джоанна (февраль 2010 г.). «Скорость самопроизвольного появления дрожжевого приона [ PSI +] и его значение для эволюции свойств эволюционируемости системы [ PSI +]» . Генетика . 184 (2): 393–400. DOI : 10.1534 / genetics.109.110213 . ISSN 0016-6731 . PMC 2828720 . PMID 19917766 .   
  196. ^ Драги, Джереми; Вагнер, Гюнтер П. (февраль 2008 г.). «Эволюция эволюционируемости в модели развития» . Эволюция . 62 (2): 301–315. DOI : 10.1111 / j.1558-5646.2007.00303.x . ISSN 0014-3820 . PMID 18031304 . S2CID 11560256 .   
  197. ^ а б Бейдер, Ларс; Холл, Брайан К. (ноябрь 2002 г.). «Конечности у китов и безконечность у других позвоночных: механизмы эволюционной трансформации и потери в процессе развития». Эволюция и развитие . 4 (6): 445–458. DOI : 10.1046 / j.1525-142X.2002.02033.x . ISSN 1520-541X . PMID 12492145 . S2CID 8448387 .   
  198. ^ Янг, Натан М .; Халльгремссон, Бенедикт (декабрь 2005 г.). «Последовательная гомология и эволюция ковариационной структуры конечностей млекопитающих». Эволюция . 59 (12): 2691–2704. DOI : 10.1554 / 05-233.1 . ISSN 0014-3820 . PMID 16526515 . S2CID 198156135 .   
  199. ^ а б Пенни, Дэвид; Пул, Энтони (декабрь 1999 г.). «Природа последнего универсального общего предка». Текущее мнение в области генетики и развития . 9 (6): 672–677. DOI : 10.1016 / S0959-437X (99) 00020-9 . ISSN 0959-437X . PMID 10607605 .  
  200. ^ Холл, Брайан К. (август 2003 г.). «Происхождение с модификацией: единство, лежащее в основе гомологии и гомоплазии, как видно через анализ развития и эволюции». Биологические обзоры . 78 (3): 409–433. DOI : 10.1017 / S1464793102006097 . ISSN 1464-7931 . PMID 14558591 . S2CID 22142786 .   
  201. ^ Шубин, Нил ; Табин, Клиффорд Дж .; Кэрролл, Шон Б. (12 февраля 2009 г.). «Глубокая гомология и истоки эволюционной новизны». Природа . 457 (7231): 818–823. Bibcode : 2009Natur.457..818S . DOI : 10,1038 / природа07891 . ISSN 0028-0836 . PMID 19212399 . S2CID 205216390 .   
  202. ^ a b c Фонг, Дэниел Ф .; Кейн, Томас С .; Калвер, Дэвид К. (ноябрь 1995 г.). «Рудигиализация и утрата нефункциональных персонажей». Ежегодный обзор экологии и систематики . 26 : 249–268. DOI : 10.1146 / annurev.es.26.110195.001341 . ISSN 1545-2069 . 
  203. ^ ЧжаоЛэй Чжан; Герштейн, Марк (август 2004 г.). «Масштабный анализ псевдогенов в геноме человека». Текущее мнение в области генетики и развития . 14 (4): 328–335. DOI : 10.1016 / j.gde.2004.06.003 . ISSN 0959-437X . PMID 15261647 .  
  204. ^ Джеффри, Уильям Р. (май – июнь 2005 г.). «Адаптивная эволюция дегенерации глаз у мексиканской слепой пещерной рыбы». Журнал наследственности . 96 (3): 185–196. CiteSeerX 10.1.1.572.6605 . DOI : 10.1093 / jhered / esi028 . ISSN 0022-1503 . PMID 15653557 .   
  205. ^ Максвелл, Эрин Э .; Ларссон, Ханс CE (май 2007 г.). «Остеология и миология крыла эму ( Dromaius novaehollandiae ) и ее влияние на эволюцию рудиментарных структур». Журнал морфологии . 268 (5): 423–441. DOI : 10.1002 / jmor.10527 . ISSN 0362-2525 . PMID 17390336 . S2CID 12494187 .   
  206. ^ van der Kooi, Casper J .; Швандер, Таня (ноябрь 2014 г.). «О судьбе половых признаков при асексуальности» (PDF) . Биологические обзоры . 89 (4): 805–819. DOI : 10.1111 / brv.12078 . ISSN 1464-7931 . PMID 24443922 . S2CID 33644494 . Архивировано (PDF) из оригинала 23.07.2015 . Проверено 5 августа 2015 .    
  207. ^ Сильвестри, Энтони Р., младший; Сингх, Икбал (апрель 2003 г.). «Нерешенная проблема третьего моляра: будет ли людям лучше без него?» . Журнал Американской стоматологической ассоциации . 134 (4): 450–455. DOI : 10,14219 / jada.archive.2003.0194 . ISSN 0002-8177 . PMID 12733778 . Архивировано из оригинала на 2014-08-23.  
  208. ^ Койн 2009 , стр. 62
  209. Перейти ↑ Darwin 1872 , pp. 101, 103
  210. Перейти ↑ Gray 2007 , p. 66
  211. Перейти ↑ Coyne 2009 , pp. 85–86
  212. Стивенс 1982 , стр. 87
  213. ^ a b Gould 2002 , стр. 1235–1236.
  214. ^ Паллен, Марк Дж .; Мацке, Николас Дж. (Октябрь 2006 г.). «От происхождения видов до происхождения жгутиков бактерий» (PDF) . Обзоры природы микробиологии (PDF). 4 (10): 784–790. DOI : 10.1038 / nrmicro1493 . ISSN 1740-1526 . PMID 16953248 . S2CID 24057949 . Архивировано из оригинального (PDF) 26 декабря 2014 года . Проверено 25 декабря 2014 .    
  215. ^ Клементс, Эбигейл; Бурзак, Деян; Гацос, Ксения; и другие. (15 сентября 2009 г.). «Снижаемая сложность митохондриальной молекулярной машины» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 106 (37): 15791–15795. Bibcode : 2009PNAS..10615791C . DOI : 10.1073 / pnas.0908264106 . ISSN 0027-8424 . PMC 2747197 . PMID 19717453 .   
  216. ^ Пятигорский и др. 1994 , стр. 241–250.
  217. ^ Wistow, Graeme (август 1993). «Линзовые кристаллины: набор генов и эволюционный динамизм». Направления биохимических наук . 18 (8): 301–306. DOI : 10.1016 / 0968-0004 (93) 90041-K . ISSN 0968-0004 . PMID 8236445 .  
  218. ^ Джонсон, Норман А .; Портер, Адам Х. (ноябрь 2001 г.). «К новому синтезу: популяционная генетика и эволюционная биология развития». Genetica . 112–113 (1): 45–58. DOI : 10,1023 / A: 1013371201773 . ISSN 0016-6707 . PMID 11838782 . S2CID 1651351 .   
  219. ^ Baguñà, Жаум; Гарсия-Фернандес, Хорди (2003). «Эво-Дево: длинный и извилистый путь» . Международный журнал биологии развития . 47 (7–8): 705–713. ISSN 0214-6282 . PMID 14756346 . Архивировано 28 ноября 2014 года.  
    • С любовью, Алан С. (март 2003 г.). «Эволюционная морфология, инновации и синтез эволюционной биологии и биологии развития». Биология и философия . 18 (2): 309–345. DOI : 10,1023 / A: 1023940220348 . ISSN  0169-3867 . S2CID  82307503 .
  220. Аллин, Эдгар Ф. (декабрь 1975 г.). «Эволюция среднего уха млекопитающих». Журнал морфологии . 147 (4): 403–437. DOI : 10.1002 / jmor.1051470404 . ISSN 0362-2525 . PMID 1202224 . S2CID 25886311 .   
  221. ^ Харрис, Мэтью П .; Хассо, Шон М .; Фергюсон, Марк У.Дж .; Фэллон, Джон Ф. (21 февраля 2006 г.). "Развитие зубов первого поколения архозавров у куриного мутанта". Текущая биология . 16 (4): 371–377. DOI : 10.1016 / j.cub.2005.12.047 . ISSN 0960-9822 . PMID 16488870 . S2CID 15733491 .   
  222. Кэрролл, Шон Б. (11 июля 2008 г.). "Evo-Devo и расширяющийся эволюционный синтез: генетическая теория морфологической эволюции". Cell . 134 (1): 25–36. DOI : 10.1016 / j.cell.2008.06.030 . ISSN 0092-8674 . PMID 18614008 . S2CID 2513041 .   
  223. Уэйд, Майкл Дж. (Март 2007 г.). «Коэволюционная генетика экологических сообществ». Природа Обзоры Генетики . 8 (3): 185–195. DOI : 10.1038 / nrg2031 . ISSN 1471-0056 . PMID 17279094 . S2CID 36705246 .   
  224. ^ Геффени, Шана; Броди, Эдмунд Д., младший; Рубен, Питер С .; Броди, Эдмунд Д., III (23 августа 2002 г.). «Механизмы адаптации в гонке вооружений хищник-жертва: ТТХ-устойчивые натриевые каналы». Наука . 297 (5585): 1336–1339. Bibcode : 2002Sci ... 297.1336G . DOI : 10.1126 / science.1074310 . ISSN 0036-8075 . PMID 12193784 . S2CID 8816337 .   
    • Броди, Эдмунд Д., младший; Риденхур, Бенджамин Дж .; Броди, Эдмунд Д., III (октябрь 2002 г.). «Эволюционная реакция хищников на опасную добычу: горячие и холодные точки в географической мозаике совместной эволюции подвязочных змей и тритонов». Эволюция . 56 (10): 2067–2082. DOI : 10.1554 / 0014-3820 (2002) 056 [2067: teropt] 2.0.co; 2 . ISSN  0014-3820 . PMID  12449493 .
    • Кэрролл, Шон Б. (21 декабря 2009 г.). «Все, что не убивает некоторых животных, может сделать их смертельными» . Нью-Йорк Таймс . Нью-Йорк. ISSN  0362-4331 . Архивировано 23 апреля 2015 года . Проверено 26 декабря 2014 .
  225. Перейти ↑ Sachs, Joel L. (сентябрь 2006 г.). «Сотрудничество внутри и между видами» . Журнал эволюционной биологии . 19 (5): 1415–1418, обсуждение 1426–1436. DOI : 10.1111 / j.1420-9101.2006.01152.x . ISSN 1010-061X . PMID 16910971 . S2CID 4828678 .   
    • Новак, Мартин А. (8 декабря 2006 г.). «Пять правил развития сотрудничества» . Наука . 314 (5805): 1560–1563. Bibcode : 2006Sci ... 314.1560N . DOI : 10.1126 / science.1133755 . ISSN  0036-8075 . PMC  3279745 . PMID  17158317 .
  226. ^ Пашковский, Ута (август 2006). «Мутуализм и паразитизм: инь и янь растительных симбиозов». Текущее мнение в биологии растений . 9 (4): 364–370. DOI : 10.1016 / j.pbi.2006.05.008 . ISSN 1369-5266 . PMID 16713732 .  
  227. ^ Хауз, Беттина; Фестер, Томас (май 2005 г.). «Молекулярно-клеточная биология арбускулярного микоризного симбиоза». Planta . 221 (2): 184–196. DOI : 10.1007 / s00425-004-1436-х . ISSN 0032-0935 . PMID 15871030 . S2CID 20082902 .   
  228. ^ Бертрам, Джон С. (декабрь 2000 г.). «Молекулярная биология рака». Молекулярные аспекты медицины . 21 (6): 167–223. DOI : 10.1016 / S0098-2997 (00) 00007-8 . ISSN 0098-2997 . PMID 11173079 .  
  229. ^ Рив, Х. Керн; Хельдоблер, Берт (5 июня 2007 г.). «Возникновение суперорганизма через межгрупповую конкуренцию» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 104 (23): 9736–9740. Bibcode : 2007PNAS..104.9736R . DOI : 10.1073 / pnas.0703466104 . ISSN 0027-8424 . PMC 1887545 . PMID 17517608 .   
  230. ^ Аксельрод, Роберт; Гамильтон, WD (27 марта 1981 г.). «Эволюция сотрудничества». Наука . 211 (4489): 1390–1396. Bibcode : 1981Sci ... 211.1390A . DOI : 10.1126 / science.7466396 . ISSN 0036-8075 . PMID 7466396 .  
  231. ^ Уилсон, Эдвард O .; Хёльдоблер, Берт (20 сентября 2005 г.). «Евсоциальность: происхождение и последствия» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 102 (38): 13367–1371. Bibcode : 2005PNAS..10213367W . DOI : 10.1073 / pnas.0505858102 . ISSN 0027-8424 . PMC 1224642 . PMID 16157878 .   
  232. ^ a b Гаврилец, Сергей (октябрь 2003 г.). «Перспектива: модели видообразования: чему мы научились за 40 лет?». Эволюция . 57 (10): 2197–2215. DOI : 10.1554 / 02-727 . ISSN 0014-3820 . PMID 14628909 . S2CID 198158082 .   
  233. ^ a b c de Queiroz, Кевин (3 мая 2005 г.). «Эрнст Майр и современная концепция видов» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 102 (Приложение 1): 6600–6607. Bibcode : 2005PNAS..102.6600D . DOI : 10.1073 / pnas.0502030102 . ISSN 0027-8424 . PMC 1131873 . PMID 15851674 .   
  234. ^ a b Ereshefsky, Марк (декабрь 1992 г.). «Исключительный плюрализм». Философия науки . 59 (4): 671–690. DOI : 10.1086 / 289701 . ISSN 0031-8248 . JSTOR 188136 . S2CID 224829314 .   
  235. Перейти ↑ Mayr 1942 , p. 120
  236. ^ Фрейзер, Кристоф; Альм, Эрик Дж .; Польз, Мартин Ф .; и другие. (6 февраля 2009 г.). «Проблема бактериальных видов: понимание генетического и экологического разнообразия». Наука . 323 (5915): 741–746. Bibcode : 2009Sci ... 323..741F . DOI : 10.1126 / science.1159388 . ISSN 0036-8075 . PMID 19197054 . S2CID 15763831 .   
  237. Short, Roger Valentine (октябрь 1975 г.). «Вклад мула в научную мысль». Журнал репродукции и фертильности. Приложение (23): 359–364. ISSN 0449-3087 . OCLC 1639439 . PMID 1107543 .   
  238. ^ Gross, Briana L .; Ризеберг, Лорен Х. (май – июнь 2005 г.). "Экологическая генетика видообразования гомоплоидных гибридов" . Журнал наследственности . 96 (3): 241–252. DOI : 10.1093 / jhered / esi026 . ISSN 0022-1503 . PMC 2517139 . PMID 15618301 .   
  239. ^ Берк, Джон М .; Арнольд, Майкл Л. (декабрь 2001 г.). «Генетика и приспособленность гибридов». Ежегодный обзор генетики . 35 : 31–52. DOI : 10.1146 / annurev.genet.35.102401.085719 . ISSN 0066-4197 . PMID 11700276 . S2CID 26683922 .   
  240. ^ Vrijenhoek, Robert C. (April 4, 2006). "Polyploid Hybrids: Multiple Origins of a Treefrog Species". Current Biology. 16 (7): R245–R247. doi:10.1016/j.cub.2006.03.005. ISSN 0960-9822. PMID 16581499. S2CID 11657663.
  241. ^ Rice, William R.; Hostert, Ellen E. (December 1993). "Laboratory Experiments on Speciation: What Have We Learned in 40 Years?". Evolution. 47 (6): 1637–1653. doi:10.1111/j.1558-5646.1993.tb01257.x. ISSN 0014-3820. JSTOR 2410209. PMID 28568007. S2CID 42100751.
    • Jiggins, Chris D.; Bridle, Jon R. (March 2004). "Speciation in the apple maggot fly: a blend of vintages?". Trends in Ecology & Evolution. 19 (3): 111–114. doi:10.1016/j.tree.2003.12.008. ISSN 0169-5347. PMID 16701238.
    • Boxhorn, Joseph (September 1, 1995). "Observed Instances of Speciation". TalkOrigins Archive. Houston, Texas: The TalkOrigins Foundation, Inc. Archived from the original on 2009-01-22. Retrieved 2008-12-26.
    • Weinberg, James R.; Starczak, Victoria R.; Jörg, Daniele (August 1992). "Evidence for Rapid Speciation Following a Founder Event in the Laboratory". Evolution. 46 (4): 1214–1220. doi:10.2307/2409766. ISSN 0014-3820. JSTOR 2409766. PMID 28564398.
  242. ^ Herrel, Anthony; Huyghe, Katleen; Vanhooydonck, Bieke; et al. (March 25, 2008). "Rapid large-scale evolutionary divergence in morphology and performance associated with exploitation of a different dietary resource". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 105 (12): 4792–4795. Bibcode:2008PNAS..105.4792H. doi:10.1073/pnas.0711998105. ISSN 0027-8424. PMC 2290806. PMID 18344323.
  243. ^ Losos, Jonathan B.; Warhelt, Kenneth I.; Schoener, Thomas W. (May 1, 1997). "Adaptive differentiation following experimental island colonization in Anolis lizards". Nature. 387 (6628): 70–73. Bibcode:1997Natur.387...70L. doi:10.1038/387070a0. ISSN 0028-0836. S2CID 4242248.
  244. ^ Hoskin, Conrad J.; Higgle, Megan; McDonald, Keith R.; Moritz, Craig (October 27, 2005). "Reinforcement drives rapid allopatric speciation". Nature. 437 (7063): 1353–1356. Bibcode:2005Natur.437.1353H. doi:10.1038/nature04004. ISSN 0028-0836. PMID 16251964. S2CID 4417281.
  245. ^ Templeton, Alan R. (April 1980). "The Theory of Speciation VIA the Founder Principle". Genetics. 94 (4): 1011–1038. ISSN 0016-6731. PMC 1214177. PMID 6777243. Archived from the original on 2014-08-23. Retrieved 2014-12-29.
  246. ^ Antonovics, Janis (July 2006). "Evolution in closely adjacent plant populations X: long-term persistence of prereproductive isolation at a mine boundary". Heredity. 97 (1): 33–37. doi:10.1038/sj.hdy.6800835. ISSN 0018-067X. PMID 16639420. S2CID 12291411.
  247. ^ Nosil, Patrik; Crespi, Bernard J.; Gries, Regine; Gries, Gerhard (March 2007). "Natural selection and divergence in mate preference during speciation". Genetica. 129 (3): 309–327. doi:10.1007/s10709-006-0013-6. ISSN 0016-6707. PMID 16900317. S2CID 10808041.
  248. ^ Savolainen, Vincent; Anstett, Marie-Charlotte; Lexer, Christian; et al. (May 11, 2006). "Sympatric speciation in palms on an oceanic island". Nature. 441 (7090): 210–213. Bibcode:2006Natur.441..210S. doi:10.1038/nature04566. ISSN 0028-0836. PMID 16467788. S2CID 867216.
    • Barluenga, Marta; Stölting, Kai N.; Salzburger, Walter; et al. (February 9, 2006). "Sympatric speciation in Nicaraguan crater lake cichlid fish". Nature. 439 (7077): 719–23. Bibcode:2006Natur.439..719B. doi:10.1038/nature04325. ISSN 0028-0836. PMID 16467837. S2CID 3165729.
  249. ^ Gavrilets, Sergey (March 21, 2006). "The Maynard Smith model of sympatric speciation". Journal of Theoretical Biology. 239 (2): 172–182. doi:10.1016/j.jtbi.2005.08.041. ISSN 0022-5193. PMID 16242727.
  250. ^ Wood, Troy E.; Takebayashi, Naoki; Barker, Michael S.; et al. (August 18, 2009). "The frequency of polyploid speciation in vascular plants". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 106 (33): 13875–13879. Bibcode:2009PNAS..10613875W. doi:10.1073/pnas.0811575106. ISSN 0027-8424. PMC 2728988. PMID 19667210.
  251. ^ Hegarty, Matthew J.; Hiscock, Simon J. (May 20, 2008). "Genomic Clues to the Evolutionary Success of Polyploid Plants". Current Biology. 18 (10): R435–R444. doi:10.1016/j.cub.2008.03.043. ISSN 0960-9822. PMID 18492478. S2CID 1584282.
  252. ^ Jakobsson, Mattias; Hagenblad, Jenny; Tavaré, Simon; et al. (June 2006). "A Unique Recent Origin of the Allotetraploid Species Arabidopsis suecica: Evidence from Nuclear DNA Markers". Molecular Biology and Evolution. 23 (6): 1217–1231. doi:10.1093/molbev/msk006. ISSN 0737-4038. PMID 16549398.
  253. ^ Säll, Torbjörn; Jakobsson, Mattias; Lind-Halldén, Christina; Halldén, Christer (September 2003). "Chloroplast DNA indicates a single origin of the allotetraploid Arabidopsis suecica". Journal of Evolutionary Biology. 16 (5): 1019–1029. doi:10.1046/j.1420-9101.2003.00554.x. ISSN 1010-061X. PMID 14635917. S2CID 29281998.
  254. ^ Bomblies, Kirsten; Weigel, Detlef (December 2007). "Arabidopsis—a model genus for speciation". Current Opinion in Genetics & Development. 17 (6): 500–504. doi:10.1016/j.gde.2007.09.006. ISSN 0959-437X. PMID 18006296.
  255. ^ Sémon, Marie; Wolfe, Kenneth H. (December 2007). "Consequences of genome duplication". Current Opinion in Genetics & Development. 17 (6): 505–512. doi:10.1016/j.gde.2007.09.007. ISSN 0959-437X. PMID 18006297.
  256. ^ Eldredge & Gould 1972, pp. 82–115
  257. ^ Benton, Michael J. (April 7, 1995). "Diversification and extinction in the history of life". Science. 268 (5207): 52–58. Bibcode:1995Sci...268...52B. doi:10.1126/science.7701342. ISSN 0036-8075. PMID 7701342.
  258. ^ Raup, David M. (March 28, 1986). "Biological extinction in Earth history". Science. 231 (4745): 1528–1533. Bibcode:1986Sci...231.1528R. doi:10.1126/science.11542058. ISSN 0036-8075. PMID 11542058. S2CID 23012011.
  259. ^ Avise, John C.; Hubbell, Stephen P.; Ayala, Francisco J. (August 12, 2008). "In the light of evolution II: Biodiversity and extinction". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 105 (Suppl. 1): 11453–11457. Bibcode:2008PNAS..10511453A. doi:10.1073/pnas.0802504105. ISSN 0027-8424. PMC 2556414. PMID 18695213.
  260. ^ a b c Raup, David M. (July 19, 1994). "The role of extinction in evolution". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 91 (15): 6758–6763. Bibcode:1994PNAS...91.6758R. doi:10.1073/pnas.91.15.6758. ISSN 0027-8424. PMC 44280. PMID 8041694.
  261. ^ Novacek, Michael J.; Cleland, Elsa E. (May 8, 2001). "The current biodiversity extinction event: scenarios for mitigation and recovery". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 98 (10): 5466–5470. Bibcode:2001PNAS...98.5466N. doi:10.1073/pnas.091093698. ISSN 0027-8424. PMC 33235. PMID 11344295.
  262. ^ Pimm, Stuart; Raven, Peter; Peterson, Alan; et al. (July 18, 2006). "Human impacts on the rates of recent, present and future bird extinctions". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 103 (29): 10941–10946. Bibcode:2006PNAS..10310941P. doi:10.1073/pnas.0604181103. ISSN 0027-8424. PMC 1544153. PMID 16829570.
  263. ^ Barnosky, Anthony D.; Koch, Paul L.; Feranec, Robert S.; et al. (October 1, 2004). "Assessing the Causes of Late Pleistocene Extinctions on the Continents". Science. 306 (5693): 70–75. Bibcode:2004Sci...306...70B. CiteSeerX 10.1.1.574.332. doi:10.1126/science.1101476. ISSN 0036-8075. PMID 15459379. S2CID 36156087.
  264. ^ Lewis, Owen T. (January 29, 2006). "Climate change, species–area curves and the extinction crisis". Philosophical Transactions of the Royal Society B. 361 (1465): 163–171. doi:10.1098/rstb.2005.1712. ISSN 0962-8436. PMC 1831839. PMID 16553315.
  265. ^ a b Stearns & Stearns 1999, p. X
  266. ^ a b Novacek, Michael J. (November 8, 2014). "Prehistory's Brilliant Future". The New York Times. New York. ISSN 0362-4331. Archived from the original on 2014-12-29. Retrieved 2014-12-25.
  267. ^ "Researchers find that Earth may be home to 1 trillion species". National Science Foundation. Arlington County, Virginia. May 2, 2016. Archived from the original on 2016-05-04. Retrieved 2016-05-06.
  268. ^ Jablonski, David (May 8, 2001). "Lessons from the past: Evolutionary impacts of mass extinctions". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 98 (10): 5393–5398. Bibcode:2001PNAS...98.5393J. doi:10.1073/pnas.101092598. ISSN 0027-8424. PMC 33224. PMID 11344284.
  269. ^ "Age of the Earth". United States Geological Survey. July 9, 2007. Archived from the original on 2005-12-23. Retrieved 2015-05-31.
  270. ^ Dalrymple 2001, pp. 205–221
  271. ^ Manhesa, Gérard; Allègre, Claude J.; Dupréa, Bernard; Hamelin, Bruno (May 1980). "Lead isotope study of basic-ultrabasic layered complexes: Speculations about the age of the earth and primitive mantle characteristics". Earth and Planetary Science Letters. 47 (3): 370–382. Bibcode:1980E&PSL..47..370M. doi:10.1016/0012-821X(80)90024-2. ISSN 0012-821X.
  272. ^ Raven & Johnson 2002, p. 68
  273. ^ a b Borenstein, Seth (19 October 2015). "Hints of life on what was thought to be desolate early Earth". Excite. Yonkers, NY: Mindspark Interactive Network. Associated Press. Archived from the original on 23 October 2015. Retrieved 8 October 2018.
  274. ^ Bell, Elizabeth A.; Boehnike, Patrick; Harrison, T. Mark; Mao, Wendy L. (November 24, 2015). "Potentially biogenic carbon preserved in a 4.1 billion-year-old zircon" (PDF). Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 112 (47): 14518–14521. Bibcode:2015PNAS..11214518B. doi:10.1073/pnas.1517557112. ISSN 0027-8424. PMC 4664351. PMID 26483481. Archived (PDF) from the original on 2015-11-06. Retrieved 2015-12-30.
  275. ^ Schouten, Lucy (October 20, 2015). "When did life first emerge on Earth? Maybe a lot earlier than we thought". The Christian Science Monitor. Boston, Massachusetts: Christian Science Publishing Society. ISSN 0882-7729. Archived from the original on 2016-03-22. Retrieved 2018-07-11.
  276. ^ Wade, Nicholas (July 25, 2016). "Meet Luca, the Ancestor of All Living Things". The New York Times. New York: The New York Times Company. ISSN 0362-4331. Archived from the original on July 28, 2016. Retrieved 2016-07-25.
  277. ^ McKinney 1997, p. 110
  278. ^ Mora, Camilo; Tittensor, Derek P.; Adl, Sina; et al. (August 23, 2011). "How Many Species Are There on Earth and in the Ocean?". PLOS Biology. 9 (8): e1001127. doi:10.1371/journal.pbio.1001127. ISSN 1545-7885. PMC 3160336. PMID 21886479.
  279. ^ Miller & Spoolman 2012, p. 62
  280. ^ Chapman 2009
  281. ^ Roskov, Y.; Abucay, L.; Orrell, T.; Nicolson, D.; et al., eds. (2016). "Species 2000 & ITIS Catalogue of Life, 2016 Annual Checklist". Species 2000. Leiden, Netherlands: Naturalis Biodiversity Center. ISSN 2405-884X. Archived from the original on 2016-11-12. Retrieved 2016-11-06.
  282. ^ Peretó, Juli (March 2005). "Controversies on the origin of life" (PDF). International Microbiology. 8 (1): 23–31. ISSN 1139-6709. PMID 15906258. Archived from the original (PDF) on 2015-08-24.
  283. ^ Marshall, Michael (11 November 2020). "Charles Darwin's hunch about early life was probably right - In a few scrawled notes to a friend, biologist Charles Darwin theorised how life began. Not only was it probably correct, his theory was a century ahead of its time". BBC News. Retrieved 11 November 2020.
  284. ^ Joyce, Gerald F. (July 11, 2002). "The antiquity of RNA-based evolution". Nature. 418 (6894): 214–221. Bibcode:2002Natur.418..214J. doi:10.1038/418214a. ISSN 0028-0836. PMID 12110897. S2CID 4331004.
  285. ^ Trevors, Jack T.; Psenner, Roland (December 2001). "From self-assembly of life to present-day bacteria: a possible role for nanocells". FEMS Microbiology Reviews. 25 (5): 573–582. doi:10.1111/j.1574-6976.2001.tb00592.x. ISSN 1574-6976. PMID 11742692.
  286. ^ Theobald, Douglas L. (May 13, 2010). "A formal test of the theory of universal common ancestry". Nature. 465 (7295): 219–222. Bibcode:2010Natur.465..219T. doi:10.1038/nature09014. ISSN 0028-0836. PMID 20463738. S2CID 4422345.
  287. ^ Bapteste, Eric; Walsh, David A. (June 2005). "Does the 'Ring of Life' ring true?". Trends in Microbiology. 13 (6): 256–261. doi:10.1016/j.tim.2005.03.012. ISSN 0966-842X. PMID 15936656.
  288. ^ Darwin 1859, p. 1
  289. ^ Doolittle, W. Ford; Bapteste, Eric (February 13, 2007). "Pattern pluralism and the Tree of Life hypothesis". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 104 (7): 2043–2049. Bibcode:2007PNAS..104.2043D. doi:10.1073/pnas.0610699104. ISSN 0027-8424. PMC 1892968. PMID 17261804.
  290. ^ Kunin, Victor; Goldovsky, Leon; Darzentas, Nikos; Ouzounis, Christos A. (July 2005). "The net of life: Reconstructing the microbial phylogenetic network". Genome Research. 15 (7): 954–959. doi:10.1101/gr.3666505. ISSN 1088-9051. PMC 1172039. PMID 15965028.
  291. ^ Darwin 1837, p. 25
  292. ^ Jablonski, David (June 25, 1999). "The Future of the Fossil Record". Science. 284 (5423): 2114–2116. doi:10.1126/science.284.5423.2114. ISSN 0036-8075. PMID 10381868. S2CID 43388925.
  293. ^ Mason, Stephen F. (September 6, 1984). "Origins of biomolecular handedness". Nature. 311 (5981): 19–23. Bibcode:1984Natur.311...19M. doi:10.1038/311019a0. ISSN 0028-0836. PMID 6472461. S2CID 103653.
  294. ^ Wolf, Yuri I.; Rogozin, Igor B.; Grishin, Nick V.; Koonin, Eugene V. (September 1, 2002). "Genome trees and the tree of life". Trends in Genetics. 18 (9): 472–479. doi:10.1016/S0168-9525(02)02744-0. ISSN 0168-9525. PMID 12175808.
  295. ^ Varki, Ajit; Altheide, Tasha K. (December 2005). "Comparing the human and chimpanzee genomes: searching for needles in a haystack". Genome Research. 15 (12): 1746–1758. CiteSeerX 10.1.1.673.9212. doi:10.1101/gr.3737405. ISSN 1088-9051. PMID 16339373.
  296. ^ Ciccarelli, Francesca D.; Doerks, Tobias; von Mering, Christian; et al. (March 3, 2006). "Toward Automatic Reconstruction of a Highly Resolved Tree of Life" (PDF). Science. 311 (5765): 1283–1287. Bibcode:2006Sci...311.1283C. CiteSeerX 10.1.1.381.9514. doi:10.1126/science.1123061. ISSN 0036-8075. PMID 16513982. S2CID 1615592. Archived (PDF) from the original on 2016-03-04.
  297. ^ a b Cavalier-Smith, Thomas (June 29, 2006). "Cell evolution and Earth history: stasis and revolution". Philosophical Transactions of the Royal Society B. 361 (1470): 969–1006. doi:10.1098/rstb.2006.1842. ISSN 0962-8436. PMC 1578732. PMID 16754610.
  298. ^ Schopf, J. William (June 29, 2006). "Fossil evidence of Archaean life". Philosophical Transactions of the Royal Society B. 361 (1470): 869–885. doi:10.1098/rstb.2006.1834. ISSN 0962-8436. PMC 1578735. PMID 16754604.
    • Altermann, Wladyslaw; Kazmierczak, Józef (November 2003). "Archean microfossils: a reappraisal of early life on Earth". Research in Microbiology. 154 (9): 611–617. doi:10.1016/j.resmic.2003.08.006. ISSN 0923-2508. PMID 14596897.
  299. ^ Schopf, J. William (July 19, 1994). "Disparate rates, differing fates: tempo and mode of evolution changed from the Precambrian to the Phanerozoic". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 91 (15): 6735–6742. Bibcode:1994PNAS...91.6735S. doi:10.1073/pnas.91.15.6735. ISSN 0027-8424. PMC 44277. PMID 8041691.
  300. ^ Poole, Anthony M.; Penny, David (January 2007). "Evaluating hypotheses for the origin of eukaryotes". BioEssays. 29 (1): 74–84. doi:10.1002/bies.20516. ISSN 0265-9247. PMID 17187354.
  301. ^ Dyall, Sabrina D.; Brown, Mark T.; Johnson, Patricia J. (April 9, 2004). "Ancient Invasions: From Endosymbionts to Organelles". Science. 304 (5668): 253–257. Bibcode:2004Sci...304..253D. doi:10.1126/science.1094884. ISSN 0036-8075. PMID 15073369. S2CID 19424594.
  302. ^ Martin, William (October 2005). "The missing link between hydrogenosomes and mitochondria". Trends in Microbiology. 13 (10): 457–459. doi:10.1016/j.tim.2005.08.005. ISSN 0966-842X. PMID 16109488.
  303. ^ Lang, B. Franz; Gray, Michael W.; Burger, Gertraud (December 1999). "Mitochondrial genome evolution and the origin of eukaryotes". Annual Review of Genetics. 33: 351–397. doi:10.1146/annurev.genet.33.1.351. ISSN 0066-4197. PMID 10690412.
    • McFadden, Geoffrey Ian (December 1, 1999). "Endosymbiosis and evolution of the plant cell". Current Opinion in Plant Biology. 2 (6): 513–519. doi:10.1016/S1369-5266(99)00025-4. ISSN 1369-5266. PMID 10607659.
  304. ^ DeLong, Edward F.; Pace, Norman R. (August 1, 2001). "Environmental Diversity of Bacteria and Archaea" (PDF). Systematic Biology. 50 (4): 470–478. CiteSeerX 10.1.1.321.8828. doi:10.1080/106351501750435040. ISSN 1063-5157. PMID 12116647. Archived (PDF) from the original on 2016-02-22.
  305. ^ Kaiser, Dale (December 2001). "Building a multicellular organism". Annual Review of Genetics. 35: 103–123. doi:10.1146/annurev.genet.35.102401.090145. ISSN 0066-4197. PMID 11700279. S2CID 18276422.
  306. ^ Zimmer, Carl (January 7, 2016). "Genetic Flip Helped Organisms Go From One Cell to Many". The New York Times. New York. ISSN 0362-4331. Archived from the original on 2016-01-07. Retrieved 2016-01-07.
  307. ^ Valentine, James W.; Jablonski, David; Erwin, Douglas H. (March 1, 1999). "Fossils, molecules and embryos: new perspectives on the Cambrian explosion". Development. 126 (5): 851–859. ISSN 0950-1991. PMID 9927587. Archived from the original on 2015-03-01. Retrieved 2014-12-30.
  308. ^ Ohno, Susumu (January 1997). "The reason for as well as the consequence of the Cambrian explosion in animal evolution". Journal of Molecular Evolution. 44 (Suppl. 1): S23–S27. Bibcode:1997JMolE..44S..23O. doi:10.1007/PL00000055. ISSN 0022-2844. PMID 9071008. S2CID 21879320.
    • Valentine, James W.; Jablonski, David (2003). "Morphological and developmental macroevolution: a paleontological perspective". The International Journal of Developmental Biology. 47 (7–8): 517–522. ISSN 0214-6282. PMID 14756327. Archived from the original on 2014-10-24. Retrieved 2014-12-30.
  309. ^ Waters, Elizabeth R. (December 2003). "Molecular adaptation and the origin of land plants". Molecular Phylogenetics and Evolution. 29 (3): 456–463. doi:10.1016/j.ympev.2003.07.018. ISSN 1055-7903. PMID 14615186.
  310. ^ Mayhew, Peter J. (August 2007). "Why are there so many insect species? Perspectives from fossils and phylogenies". Biological Reviews. 82 (3): 425–454. doi:10.1111/j.1469-185X.2007.00018.x. ISSN 1464-7931. PMID 17624962. S2CID 9356614.
  311. ^ Carroll, Robert L. (May 2007). "The Palaeozoic Ancestry of Salamanders, Frogs and Caecilians". Zoological Journal of the Linnean Society. 150 (Supplement s1): 1–140. doi:10.1111/j.1096-3642.2007.00246.x. ISSN 1096-3642.
  312. ^ Wible, John R.; Rougier, Guillermo W.; Novacek, Michael J.; Asher, Robert J. (June 21, 2007). "Cretaceous eutherians and Laurasian origin for placental mammals near the K/T boundary". Nature. 447 (7147): 1003–1006. Bibcode:2007Natur.447.1003W. doi:10.1038/nature05854. ISSN 0028-0836. PMID 17581585. S2CID 4334424.
  313. ^ Witmer, Lawrence M. (July 28, 2011). "Palaeontology: An icon knocked from its perch". Nature. 475 (7357): 458–459. doi:10.1038/475458a. ISSN 0028-0836. PMID 21796198. S2CID 205066360.
  314. ^ Bull, James J.; Wichman, Holly A. (November 2001). "Applied evolution". Annual Review of Ecology and Systematics. 32: 183–217. doi:10.1146/annurev.ecolsys.32.081501.114020. ISSN 1545-2069.
  315. ^ Doebley, John F.; Gaut, Brandon S.; Smith, Bruce D. (December 29, 2006). "The Molecular Genetics of Crop Domestication". Cell. 127 (7): 1309–1321. doi:10.1016/j.cell.2006.12.006. ISSN 0092-8674. PMID 17190597. S2CID 278993.
  316. ^ Jäckel, Christian; Kast, Peter; Hilvert, Donald (June 2008). "Protein Design by Directed Evolution". Annual Review of Biophysics. 37: 153–173. doi:10.1146/annurev.biophys.37.032807.125832. ISSN 1936-122X. PMID 18573077.
  317. ^ Maher, Brendan (April 8, 2009). "Evolution: Biology's next top model?". Nature. 458 (7239): 695–698. doi:10.1038/458695a. ISSN 0028-0836. PMID 19360058. S2CID 41648315.
  318. ^ Borowsky, Richard (January 8, 2008). "Restoring sight in blind cavefish". Current Biology. 18 (1): R23–R24. doi:10.1016/j.cub.2007.11.023. ISSN 0960-9822. PMID 18177707. S2CID 16967690.
  319. ^ Gross, Joshua B.; Borowsky, Richard; Tabin, Clifford J. (January 2, 2009). Barsh, Gregory S. (ed.). "A novel role for Mc1r in the parallel evolution of depigmentation in independent populations of the cavefish Astyanax mexicanus". PLOS Genetics. 5 (1): e1000326. doi:10.1371/journal.pgen.1000326. ISSN 1553-7390. PMC 2603666. PMID 19119422.
  320. ^ Merlo, Lauren M.F.; Pepper, John W.; Reid, Brian J.; Maley, Carlo C. (December 2006). "Cancer as an evolutionary and ecological process". Nature Reviews Cancer. 6 (12): 924–935. doi:10.1038/nrc2013. ISSN 1474-175X. PMID 17109012. S2CID 8040576.
  321. ^ Pan, Dabo; Weiwei Xue; Wenqi Zhang; et al. (October 2012). "Understanding the drug resistance mechanism of hepatitis C virus NS3/4A to ITMN-191 due to R155K, A156V, D168A/E mutations: a computational study". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - General Subjects. 1820 (10): 1526–1534. doi:10.1016/j.bbagen.2012.06.001. ISSN 0304-4165. PMID 22698669.
  322. ^ Woodford, Neil; Ellington, Matthew J. (January 2007). "The emergence of antibiotic resistance by mutation". Clinical Microbiology and Infection. 13 (1): 5–18. doi:10.1111/j.1469-0691.2006.01492.x. ISSN 1198-743X. PMID 17184282.
  323. ^ Labbé, Pierrick; Berticat, Claire; Berthomieu, Arnaud; et al. (November 16, 2007). "Forty Years of Erratic Insecticide Resistance Evolution in the Mosquito Culex pipiens". PLOS Genetics. 3 (11): e205. doi:10.1371/journal.pgen.0030205. ISSN 1553-7390. PMC 2077897. PMID 18020711.
  324. ^ Neve, Paul (October 2007). "Challenges for herbicide resistance evolution and management: 50 years after Harper". Weed Research. 47 (5): 365–369. doi:10.1111/j.1365-3180.2007.00581.x. ISSN 0043-1737.
  325. ^ Rodríguez-Rojas, Alexandro; Rodríguez-Beltrán, Jerónimo; Couce, Alejandro; Blázquez, Jesús (August 2013). "Antibiotics and antibiotic resistance: A bitter fight against evolution". International Journal of Medical Microbiology. 303 (6–7): 293–297. doi:10.1016/j.ijmm.2013.02.004. ISSN 1438-4221. PMID 23517688.
  326. ^ Schenk, Martijn F.; Szendro, Ivan G.; Krug, Joachim; de Visser, J. Arjan G.M. (June 28, 2012). "Quantifying the Adaptive Potential of an Antibiotic Resistance Enzyme". PLOS Genetics. 8 (6): e1002783. doi:10.1371/journal.pgen.1002783. ISSN 1553-7390. PMC 3386231. PMID 22761587.
  327. ^ Read, Andrew F.; Lynch, Penelope A.; Thomas, Matthew B. (April 7, 2009). "How to Make Evolution-Proof Insecticides for Malaria Control". PLOS Biology. 7 (4): e1000058. doi:10.1371/journal.pbio.1000058. ISSN 1545-7885. PMC 3279047. PMID 19355786.
  328. ^ Fraser, Alex S. (January 18, 1958). "Monte Carlo Analyses of Genetic Models". Nature. 181 (4603): 208–209. Bibcode:1958Natur.181..208F. doi:10.1038/181208a0. ISSN 0028-0836. PMID 13504138. S2CID 4211563.
  329. ^ Rechenberg 1973
  330. ^ Holland 1975
  331. ^ Koza 1992
  332. ^ Jamshidi, Mo (August 15, 2003). "Tools for intelligent control: fuzzy controllers, neural networks and genetic algorithms". Philosophical Transactions of the Royal Society A. 361 (1809): 1781–1808. Bibcode:2003RSPTA.361.1781J. doi:10.1098/rsta.2003.1225. ISSN 1364-503X. PMID 12952685. S2CID 34259612.
  333. ^ Browne 2003, pp. 376–379
  334. ^ For an overview of the philosophical, religious and cosmological controversies, see:
    • Dennett 1995
    For the scientific and social reception of evolution in the 19th and early 20th centuries, see:
    • Johnston, Ian C. (1999). "Section Three: The Origins of Evolutionary Theory". ... And Still We Evolve: A Handbook for the Early History of Modern Science (3rd revised ed.). Nanaimo, BC: Liberal Studies Department, Malaspina University-College. Archived from the original on 2016-04-16. Retrieved 2015-01-01.
    • Bowler 2003
    • Zuckerkandl, Emile (December 30, 2006). "Intelligent design and biological complexity". Gene. 385: 2–18. doi:10.1016/j.gene.2006.03.025. ISSN 0378-1119. PMID 17011142.
  335. ^ Ross, Marcus R. (May 2005). "Who Believes What? Clearing up Confusion over Intelligent Design and Young-Earth Creationism" (PDF). Journal of Geoscience Education. 53 (3): 319–323. Bibcode:2005JGeEd..53..319R. CiteSeerX 10.1.1.404.1340. doi:10.5408/1089-9995-53.3.319. ISSN 1089-9995. S2CID 14208021. Archived (PDF) from the original on 2008-05-11. Retrieved 2008-04-28.
  336. ^ Hameed, Salman (December 12, 2008). "Bracing for Islamic Creationism" (PDF). Science. 322 (5908): 1637–1638. doi:10.1126/science.1163672. ISSN 0036-8075. PMID 19074331. S2CID 206515329. Archived from the original (PDF) on 2014-11-10.
  337. ^ Bowler 2003
  338. ^ Miller, Jon D.; Scott, Eugenie C.; Okamoto, Shinji (August 11, 2006). "Public Acceptance of Evolution". Science. 313 (5788): 765–766. doi:10.1126/science.1126746. ISSN 0036-8075. PMID 16902112. S2CID 152990938.
  339. ^ Spergel, David Nathaniel; Verde, Licia; Peiris, Hiranya V.; et al. (2003). "First-Year Wilkinson Microwave Anisotropy Probe (WMAP) Observations: Determination of Cosmological Parameters". The Astrophysical Journal Supplement Series. 148 (1): 175–194. arXiv:astro-ph/0302209. Bibcode:2003ApJS..148..175S. doi:10.1086/377226. S2CID 10794058.
  340. ^ Wilde, Simon A.; Valley, John W.; Peck, William H.; Graham, Colin M. (January 11, 2001). "Evidence from detrital zircons for the existence of continental crust and oceans on the Earth 4.4 Gyr ago". Nature. 409 (6817): 175–178. Bibcode:2001Natur.409..175W. doi:10.1038/35051550. ISSN 0028-0836. PMID 11196637. S2CID 4319774.
  341. ^ Branch, Glenn (March 2007). "Understanding Creationism after Kitzmiller". BioScience. 57 (3): 278–284. doi:10.1641/B570313. ISSN 0006-3568. S2CID 86665329.
  342. ^ Xiaoxing Jin (March 2019). "Translation and transmutation: the Origin of Species in China". The British Journal for the History of Science. Cambridge: Cambridge University Press on behalf of The British Society for the History of Science. 52 (1): 117–141. doi:10.1017/S0007087418000808. PMID 30587253. S2CID 58605626.

Bibliography

  • Altenberg, Lee (1995). "Genome growth and the evolution of the genotype-phenotype map". In Banzhaf, Wolfgang; Eeckman, Frank H. (eds.). Evolution and Biocomputation: Computational Models of Evolution. Lecture Notes in Computer Science. 899. Berlin; New York: Springer-Verlag Berlin Heidelberg. pp. 205–259. CiteSeerX 10.1.1.493.6534. doi:10.1007/3-540-59046-3_11. ISBN 978-3-540-59046-0. ISSN 0302-9743. LCCN 95005970. OCLC 32049812.
  • Ayala, Francisco J.; Avise, John C., eds. (2014). Essential Readings in Evolutionary Biology. Baltimore, Maryland: Johns Hopkins University Press. ISBN 978-1-4214-1305-1. LCCN 2013027718. OCLC 854285705.
  • Birdsell, John A.; Wills, Christopher (2003). "The Evolutionary Origin and Maintenance of Sexual Recombination: A Review of Contemporary Models". In MacIntyre, Ross J.; Clegg, Michael T. (eds.). Evolutionary Biology. Evolutionary Biology. 33. New York: Springer Science+Business Media. ISBN 978-1-4419-3385-0. ISSN 0071-3260. OCLC 751583918.
  • Bowler, Peter J. (1989). The Mendelian Revolution: The Emergence of Hereditarian Concepts in Modern Science and Society