Основной фермент состоит из субъединиц фермента , которые необходимы для каталитической активности, как и основной фермент РНК-полимераза. [1]
Примером основного фермента является фермент РНК- полимераза без сигма-фактора (σ). Этот фермент состоит только из двух альфа (2α), одной бета (β), одного бета-простого числа (β’) и одного омега (ω). Это всего лишь один пример основного фермента. ДНК Pol I также можно охарактеризовать как имеющую ядро и голоферментные сегменты, из которых 5'-экзонуклеазу можно удалить без разрушения функциональности фермента.