Критическая оценка предсказания взаимодействий (CAPRI) представляет собой сообщество в масштабах эксперимента при моделировании молекулярной структуры из белковых комплексов , иначе известная как белок-белок стыковка .
CAPRI [1] - это продолжающаяся серия мероприятий, в которых исследователи всего сообщества пытаются стыковать одни и те же белки, как было предоставлено экспертами. Раунды проводятся примерно каждые шесть месяцев. Каждый раунд содержит от одного до шести целевых белок-белковых комплексов, структура которых недавно была определена экспериментально. Координаты и находятся в частной собственности оценщиков в сотрудничестве со структурными биологами, которые их определили. Эксперимент CAPRI является двойным слепым в том смысле, что заявители не знают решенной структуры, а эксперты не знают соответствия между представлением и личностью его создателя.
См. Также [ править ]
- Критическая оценка методов прогнозирования структуры белка (CASP) - аналогичное упражнение в области прогнозирования структуры белка.
- Критическая оценка функциональной аннотации (CAFA)
Ссылки [ править ]
- ↑ Жоэль Жанин; Ким Хенрик; Джон Молт; Линн Тен Эйк; Майкл Дж. Э. Стернберг; Шандор Вайда; Илья Ваксер; Шошана Водак (1 июля 2003 г.). «CAPRI: критическая оценка прогнозируемых взаимодействий». Белки . 52 (1): 2–9. CiteSeerX 10.1.1.461.3355 . DOI : 10.1002 / PROT.10381 . ISSN 1097-0134 . PMID 12784359 . S2CID 31489448 . Викиданные Q28208450 .
Внешние ссылки [ править ]
Список серверов прогнозов, участвующих в CAPRI [ править ]
- ClusPro
- ГРАММ-X
- FireDock
- HADDOCK - белок-белковый докинг с высокой степенью неоднозначности
- pyDockWEB - структурное предсказание белок-белковых взаимодействий
- ПатчДок
- SmoothDock
- 3D-Garden - глобальный и ограниченный исследовательский центр стыковки
- РойДок
- ДОК / ПИРОГ