Таким образом, двумя субстратами этого фермента являются АТФ и D-аланин , тогда как его тремя продуктами являются АДФ , фосфат и D-аланил-D-аланин .
Этот фермент принадлежит к семейству лигаз , в частности тех, которые образуют связи углерод-азот, как лигазы кислота-D-аминокислота (пептидные синтазы). Систематическое название данного фермента класс Д-аланин: D-аланин - лигаза (ADP-образующие) . Другие широко используемые названия включают аланин: аланин-лигаза (образующая АДФ) и аланилаланинсинтетаза . Этот фермент участвует в метаболизме d-аланина и биосинтезе пептидогликана . Известно, что фосфинат и D-циклосерин ингибируют этот фермент .
Считается, что N-концевой участок D-аланин-D-аланин-лигазы участвует в связывании субстрата , в то время как C-конец считается каталитическим доменом. [1]
Структурные исследования
По состоянию на конец 2007 г. было решено 8 структур для этого класса ферментов с кодами доступа PDB 1EHI , 1IOV , 1IOW , 2DLN , 2FB9 , 2I80 , 2I87 и 2I8C .
Рекомендации
^ Ропер DI, Huyton T, Вагин A, Додсон G (август 2000). «Молекулярная основа устойчивости к ванкомицину у клинически значимых энтерококков: кристаллическая структура D-аланил-D-лактатлигазы (VanA)» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 97 (16): 8921–5. Bibcode : 2000PNAS ... 97.8921R . DOI : 10.1073 / pnas.150116497 . PMC 16797 . PMID 10908650 .
дальнейшее чтение
Ито, Э; Строминджер JL (1962). «Ферментативный синтез пептида в бактериальных уридиновых нуклеотидах II. Ферментативный синтез и добавление D-аланил-D-аланина». J. Biol. Chem . 237 : 2696–2703.
ФК Нейгауз (1962). «Кинетические исследования D-Ala-D-Ala синтетазы». Кормили. Proc . 21 : 229.
ван Хейенорт Дж (2001). «Последние достижения в формировании мономерной единицы бактериального пептидогликана». Nat. Prod. Rep . 18 (5): 503–19. DOI : 10.1039 / a804532a . PMID 11699883 .
Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и InterPro : IPR011127
Биологический портал
Эта статья о ферменте EC 6.3 является незавершенной . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .