Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Дэвид П. Бартель
НациональностьАмериканец
Альма-матерГошен колледж , Гарвардский университет
ИзвестенМикроРНК
НаградыGrand Prix scientifique de la Fondation Louis D. (2005)
Премия NAS в области молекулярной биологии (2005)
Научная карьера
ПоляБиохимия , молекулярная биология
УчрежденияИнститут Уайтхеда , Массачусетский технологический институт
ТезисРаспознавание и катализ РНК: I. Новые рибозимы из случайных последовательностей; II. Взаимодействие HIV rev-RRE  (1993)
ДокторантДжек Шостак

Дэвид П. Бартель - американский молекулярный биолог, наиболее известный своей работой над микроРНК . Бартель является профессором по биологии в Массачусетском технологическом институте , член Уайтхеда института и исследователь Медицинского института Говарда Хьюза (HHMI).

Биография [ править ]

Бартель заработал свой BA степень в биологии из Гошен колледжа в 1982 году и его Ph.D. степень в области вирусологии из Гарвардского университета в 1993 году, при наставничестве со стороны Джек Шостак . [1]

Находясь в лаборатории Шостака, Бартел выделил первые рибозимы непосредственно из случайной последовательности, используя эволюцию in vitro (в том числе лигазу класса I). [2] После того, как он стал независимым в Институте Уайтхеда, он развил этот рибозим, чтобы он функционировал как РНК-зависимая РНК-полимераза для расширения праймеров на внешние РНК-матрицы, поддерживая теорию «мира РНК». [3] [4]

Позже Бартель сместил свои исследования в сторону биологии микроРНК и, в частности, на понимание их регуляторных функций. [5] МикроРНК представляют собой короткие фрагменты РНК длиной около 22 нуклеотидов, которые подавляют экспрессию генов за счет подавления информационных РНК (мРНК). Его лаборатория была одной из трех, которые обнаружили, что у животных есть многие из этих малых регуляторных РНК, [6] [7] [8], и он был первым, кто описал микроРНК в растениях. [9] [10] Работая с микроРНК, он разработал методологию, которая прогнозирует их регулирующие цели, и создал веб-инструмент TargetScan , который делает эти прогнозы доступными для исследовательского сообщества. [11] [12][13] [14] [15] Его исследование также показало, что большинство человеческих мРНК регулируются микроРНК и что микроРНК преимущественно действуют, снижая уровни своих мРНК-мишеней. [13] [16]

Бартель также открыл несколько других типов регуляторных РНК, включая гетерохроматические миРНК, которые заглушают ДНК вместо РНК. [17] Кроме того, Бартел исследует роль длинных некодирующих РНК (lncRNAs) и то, как нетранслируемые области и хвосты мРНК задействуют и опосредуют регуляторные явления. [5]

Бартел является основателем и научным консультантом Alnylam Pharmaceuticals, компании, основанной в 2002 году с целью продвижения «терапии РНКи (РНК-интерференции) как нового класса инновационных лекарств». [18]

В 2006 году Бартель занял второе место по версии Thomson Reuters в рейтинге «цитируемости» в области молекулярной биологии / генетики. Он получил несколько наград и был избран членом Национальной академии наук в 2011 году [19].

Ссылки [ править ]

  1. ^ "Дэвид П. Бартель '82" . Бюллетень Гошен . 2007 . Проверено 8 марта 2014 .
  2. ^ Наука . 1993 10 сентября; 261 (5127): 1411-8. « Выделение новых рибозимов из большого пула случайных последовательностей ». Бартель Д.П., Шостак Ю.В.
  3. ^ Trends Cell Biol. 1999 декабрь; 9 (12): M9-M13. « Построение мира РНК ». Бартель Д.П., Унрау П.Дж.
  4. ^ Джонстон, WK; Unrau, PJ; Лоуренс, MS; Glasner, ME; Бартель, Д.П. (18 мая 2001 г.). «РНК-катализируемая полимеризация РНК: точное и общее расширение праймера на основе шаблонов РНК». Наука . 292 (5520): 1319–25. Bibcode : 2001Sci ... 292.1319J . CiteSeerX 10.1.1.70.5439 . DOI : 10.1126 / science.1060786 . PMID 11358999 . S2CID 14174984 .   
  5. ^ а б "Дэвид Бартель" . HHMI . Проверено 7 октября +2016 .
  6. ^ «Наука». 2001 26 октября; 294 (5543): 853-8. «Идентификация новых генов, кодирующих небольшие экспрессируемые РНК». Лагос-Кинтана M1, Rauhut R, Lendeckel W, Tuschl T.
  7. ^ «Наука». 2001 26 октября; 294 (5543): 858-62. « Обильный класс крошечных РНК с вероятной регуляторной ролью у Caenorhabditis elegans ». Лау NC1, Лим Л.П., Вайнштейн Э.Г., Бартель Д.П.
  8. ^ «Наука». 2001 26 октября; 294 (5543): 862-4. « Обширный класс малых РНК у Caenorhabditis elegans . Lee RC1, Ambros V.
  9. ^ "Genes Dev." 2002, 1 июля; 16 (13): 1616-26. « МикроРНК в растениях ». Рейнхарт BJ1, Вайнштейн Э.Г., Родес М.В., Бартель Б., Бартель Д.П.
  10. ^ "Клетка". 2002 23 августа; 110 (4): 513-20. « Прогнозирование мишеней микроРНК растений ». Родес MW1, Рейнхарт Б.Дж., Лим LP, Бурдж CB, Бартель Б., Бартель Д.П.
  11. ^ "Клетка". 2005 14 января; 120 (1): 15-20. « Консервативное спаривание семян, часто фланкированное аденозинами, указывает на то, что тысячи человеческих генов являются мишенями для микроРНК ». Льюис Б.П., Бердж CB, Бартель Д.П.
  12. ^ "Mol Cell". 6 июля 2007 г.; 27 (1): 91-105. « Специфичность нацеливания микроРНК у млекопитающих: детерминанты за пределами спаривания семян ». Гримсон А1, Фар К.К., Джонстон В.К., Гаррет-Энгеле П., Лим LP, Бартель Д.П.
  13. ^ a b "Genome Res." 2009 Янв; 19 (1): 92-105. « Большинство мРНК млекопитающих являются консервативными мишенями для микроРНК ». Фридман RC1, Фарх К.К., Бурдж CB, Бартель Д.П.
  14. ^ Агарвал, Викрам; Белл, Джордж В .; Нам, Джин-Ву; Бартель, Дэвид П. (2015-08-12). «Предсказание эффективных сайтов-мишеней микроРНК в мРНК млекопитающих» . eLife . 4 : e05005. DOI : 10.7554 / eLife.05005 . ISSN 2050-084X . PMC 4532895 . PMID 26267216 .   
  15. ^ Agarwal, V; Субтельный, АО; Thiru, P; Улицкий, я; Бартель, Д.П. (4 октября 2018 г.). «Прогнозирование эффективности нацеливания на микроРНК у дрозофилы» . Геномная биология . 19 (1): 152. DOI : 10.1186 / s13059-018-1504-3 . PMC 6172730 . PMID 30286781 .  
  16. ^ Го, H; Инголия, Северная Каролина; Weissman, JS; Бартель, Д.П. (12 августа 2010 г.). «МикроРНК млекопитающих преимущественно снижают уровни целевой мРНК» . Природа . 466 (7308): 835–40. Bibcode : 2010Natur.466..835G . DOI : 10,1038 / природа09267 . PMC 2990499 . PMID 20703300 .  
  17. ^ Рейнхарт, BJ; Бартель, Д.П. (13 сентября 2002 г.). «Малые РНК соответствуют центромерным гетерохроматическим повторам». Наука . 297 (5588): 1831. DOI : 10.1126 / science.1077183 . PMID 12193644 . S2CID 42288846 .  
  18. ^ "Научно-консультативный совет" . Alnylam.com . Проверено 5 октября +2016 .
  19. ^ "Член Уайтхеда Дэвид Бартел избран в Национальную академию наук" . Проверено 25 января 2015 года .

Внешние ссылки [ править ]

  • Его биография из Медицинского института Говарда Хьюза
  • Сайт Bartel Lab
  • TargetScan
  • Семинар Дэвида Бартеля: микроРНК