Расширенные публикации или расширенные электронные книги - это форма электронной публикации для распространения и обмена результатами исследований, первое формальное определение которых можно отследить до 2009 года. [1] Как и многие формы цифровых публикаций, они обычно имеют уникальный идентификатор (возможно, постоянный идентификатор ) и описательную информацию метаданных . В отличие от традиционных цифровых публикаций (например, статьи в формате PDF), расширенные публикации часто предназначены для обслуживания конкретных научных областей и обычно состоят из набора взаимосвязанных частей.соответствующие исследовательским ресурсам нескольких видов (например, наборы данных, видео, изображения, таблицы стилей, услуги, рабочие процессы, базы данных, презентации) и текстовые описания исследования (например, статьи, главы, разделы, таблицы). Природа и формат таких частей и взаимосвязей между ними зависят от области применения и могут сильно различаться от случая к случаю. [2]
Основные мотивы, лежащие в основе расширенных публикаций, заключаются в ограниченности традиционной научной литературы для описания всего контекста и результатов исследовательской деятельности. Их цель - выйти «за рамки простого PDF» ( инициатива FORCE11 [3] ) и поддержать ученых с помощью передовых инструментов ИКТ для более широкого распространения результатов своих исследований без потери повествовательного духа «публикации» как средства распространения. Эта тенденция подтверждается несколькими усовершенствованными системами публикации, разработанными в литературе, предлагающими исследовательским сообществам одну или несколько из следующих функций: упаковка связанных исследовательских ресурсов; Возможности чтения Web 2.0; Связывание результатов исследований; Воспроизведение и оценка научных экспериментов.
Первое усовершенствование, введенное для того, чтобы выйти за рамки обычной оцифровки публикации и исследовать новые возможности в цифровой научной коммуникации, вероятно, сопровождало цифровую публикацию (например, файл PDF) дополнительными материалами. В таких сценариях ученые могут обмениваться пакетами, состоящими из публикаций и дополнительных материалов, в попытке лучше представить гипотезу и результаты исследования, представленные в публикации.
Расширенная система публикаций | Рекомендации |
---|---|
PDF-файл с расширением ReadCube | ReadCube Papers Дополнительные возможности просмотра, [4] Журналы Wiley: что такое ReadCube [5] |
Журналы с политикой дополнительных материалов | Политика дополнительных данных Elsevier, [6] Журналы SAGE: Руководство для авторов по дополнительным файлам [7] |
Модульная статья | Кирч, Йост Г. (2002) [8] |
ЗНАНИЯ | Гербер А. и Хантер Дж. (2010) [9] |
Возможности чтения Web 2.0
Эта категория подходов фокусируется на расширенных моделях данных публикации, части, метаданные и отношения которых определены с целью улучшения взаимодействия с конечным пользователем при визуализации и обнаружении исследовательских материалов. Эти подходы являются естественным продолжением традиционных публикаций, ориентированных на чтение, и обычно объединяют все инструменты, предоставляемые веб- инфраструктурой и ее источниками данных. [10] В частности, они исследуют возможности:
- структурирование повествовательного текста на взаимосвязанные части;
- повторное использование вселенной веб-ресурсов для обогащения текста;
- включая динамические формы содержания в тексте.
Расширенная система публикаций | Рекомендации |
---|---|
PDF-файл с расширением ReadCube | Wiley Journals: что такое ReadCube [5] |
Документы D4Science Live | Кандела Л., Кастелли Д., Пагано П. и Сими М. (2005) [11] |
Наука | Финк и Борн (2007) [12] |
PLOS забытые тропические болезни | Шоттон, Портвин, Клайн и Майлз (2009) [13] |
Проект ветеранских лент | ван ден Хеувел, ван Хорик, Сандерс, Скаглиола и Виткамп (2010) [14] |
Документы Утопии | Attwood, TK, Kell, DB, McDermott, P., Marsh, J., Pettifer, SR, & Thorne, D. (2010) [15] |
Богатые Интернет-публикации | Breure, Voorbij и Hoogerwerf (2011) [16] |
ЕДИНСТВЕННЫЙ | Фам, Малик, Фостер, Ди Лауро и Монтелла (2012) [17] |
Статья Эльзевьера о будущем | Альберсберг, И.Дж., Хеман, Ф., Коерс, Х., и Зудилова-Сейнстра, Э. (2012) [18] |
Книжная полка | Хеппнер (2013) [19] |
Связывание результатов исследований
Научные сообщества, организации и финансирующие агентства поддерживают инициативы, стандарты и передовые методы публикации и цитирования наборов данных и публикаций в Интернете . [20] [21] Примерами являются DataCite , [22] EPIC [23] и CrossRef , [24], которые устанавливают общие передовые методы присвоения информации метаданных и постоянных идентификаторов наборам данных и публикациям. Практика публикации данных и цитирования поддерживается исследовательскими сообществами, которые считают, что наборы данных должны быть открытыми и повторно используемыми, чтобы улучшить научную деятельность. [25] [26] В связи с этим было построено несколько усовершенствованных информационных систем публикации, чтобы предложить возможность дополнить публикацию ссылками на соответствующие исследовательские данные, возможно, хранящиеся в репозиториях данных или базах данных по конкретным дисциплинам. Наличие связей между литературой и данными поддерживает открытие использованных и произведенных научных данных, усиливает цитируемость данных, облегчает повторное использование данных и вознаграждает за драгоценную работу, лежащую в основе процедур управления данными.
Расширенная система публикаций | Рекомендации |
---|---|
PDF-файл с расширением ReadCube | Фентон (2016) [27] |
СФЕРА | Чунг, Хантер, Лаштабег и Дреннан (2008) [28] |
CENS ORE Агрегации | Пепе, Майерник, Боргман и Ван де Сомпель (2009) [29] |
европаPMC | McEntyre et al. (2011) [30] |
WormBase | Юк и др. (2012) [31] |
Проект расширенных публикаций DANS | Фарас, Францен, Сток, Сесинк и Рабина (2012) [32] |
БиоЧай | Гарсия и др. (2013) [33] |
Многопрофильные расширенные публикации OpenAIRE | Hoogerwerf et al. (2013) [34] |
Воспроизведение и оценка научных экспериментов
Ученые должны быть оснащены оборудованием, необходимым для повторения или воспроизведения чужого эксперимента. В расширенных публикациях с исполняемыми частями повествовательные части сопровождаются исполняемыми рабочими процессами с целью воспроизведения и повторения экспериментов.
Расширенная система публикаций | Рекомендации |
---|---|
Пакеты научных моделей | Хантер (2006a), [35] Хантер (2006b), [36] Хантер и Чунг (2007) [37] |
MyExperiment ( объекты исследования ) | De Roure et al. (2009); [38] Bechhofer, Soure, Gamble, Goble, & Buchan (2010) [39] |
IODA | Сициарек и Вишневски (2011) [40] |
Папье-маше | Браммер, Кросби, Мэтьюз и Уильямс (2011) [41] |
Среда создания коллажей | Новаковски и др. (2011) [42] |
RRID от SciCrunch | Джеффри и др. (2014) [43] |
ПОДЕЛИТЬСЯ | Ван Горп и Мазанек (2011) [44] |
Рекомендации
- ^ Vernooy-Герритсен, Марьян (2009). Новые стандарты для усовершенствованных публикаций и технологий репозиториев: обзор технологий . Издательство Амстердамского университета.
- ^ Барди, Алессия; Манги, Паоло (2014). «Расширенные публикации: модели данных и информационные системы» . LIBER Ежеквартально . Ассоциация европейских исследовательских библиотек. 23 (4): 240–273. DOI : 10,18352 / lq.8445 .
- ^ «Инициатива FORCE11» .
- ^ «Как мне просматривать и прикреплять файлы дополнений к ссылкам?» . support.readcube.com . Проверено 4 сентября 2019 .
- ^ а б «ReadCube - Исследователи - Интернет-библиотека Wiley» . onlinelibrary.wiley.com . Проверено 4 сентября 2019 .
- ^ «Политика в отношении дополнительных данных Elsevier» .
- ^ «Журналы SAGE: Руководство для авторов по дополнительным файлам» .
- ^ Кирч, Йост Г. (2002). «Новые методы электронной публикации 2: Новые формы научных статей». Learned Publishing . Ассоциация издателей образованного и профессионального общества. 15 (1): 27–32. DOI : 10.1087 / 095315102753303652 . S2CID 20722855 .
- ^ Гербер, А .; Хантер, Дж. (2010). «Создание, редактирование и визуализация составных объектов для литературной науки» . Журнал цифровой информации . 11 (1). ISSN 1368-7506 .
- ^ Янковский, Северо-Запад; Scharnhorst, A .; Tatum, C .; Татум, З. (2013). «Расширение научных публикаций: Разработка гибридных монографий в области гуманитарных и социальных наук» . Научная и исследовательская коммуникация . 4 (1).
- ^ Candela, L .; Castelli, D .; Pagano, P .; Сими, М. (2005). «От неоднородных информационных пространств к виртуальным документам». Электронные библиотеки: реализация стратегий и обмен опытом . Конспект лекций по информатике. 3815 . п. 11. DOI : 10.1007 / 11599517_2 . ISBN 978-3-540-30850-8. S2CID 206594203 .
- ^ Финк, Дж. Линн; Борн, Филип Э. (2007). «Изобретая научное общение для электронного века» . CTWatch Quarterly . 3 (3).
- ^ Шоттон, Д .; Portwin, K .; Klyne, G .; Майлз, А. (2009). Борн, Филип Э. (ред.). «Приключения в семантическом издании: примеры семантических улучшений исследовательской статьи» . PLOS вычислительная биология . 5 (4): e1000361. Bibcode : 2009PLSCB ... 5E0361S . DOI : 10.1371 / journal.pcbi.1000361 . PMC 2663789 . PMID 19381256 .
- ^ van den Heuvel, H .; van Horik, R .; Scagliola, SI; Сандерс, EP; Виткамп, П. (2010). «Ленты-ветераны: корпус исследований, инструмент обработки фрагментов и расширенные публикации для электронных гуманитарных наук». Труды LREC . 7-я Международная конференция по языковым ресурсам и оценке (LREC). С. 2687–2692. ЛВП : 2066/85921 .
- ^ Attwood, TK ; Келл, ДБ ; McDermott, P .; Marsh, J .; Петтифер, SR ; Торн, Д. (2010). «Утопические документы: соединение научной литературы с данными исследований» . Биоинформатика . 26 (18): i568 – i574. DOI : 10.1093 / биоинформатики / btq383 . PMC 2935404 . PMID 20823323 .
- ^ Breure, L .; Voorbij, H .; Хугерверф, М. (2011). «Богатые Интернет-публикации:« Покажи, что говоришь » » . Журнал цифровой информации . 12 (1).
- ^ Pham, Q .; Малик, Т .; Фостер, I .; Lauro, R .; Монтелла, Р. (2012). «ЕДИНСТВЕННЫЙ: Соединение научных статей с научными объектами». Происхождение и аннотация данных и процессов . Конспект лекций по информатике. 7525 . п. 203. DOI : 10.1007 / 978-3-642-34222-6_16 . ISBN 978-3-642-34221-9.
- ^ Зудилова-Сейнстра, Э .; Koers, H .; Heeman, F .; Ольберсберг, И. Дж. (2012). «Статья будущего Elsevier, повышающая удобство работы пользователей и интегрирующая данные с помощью приложений» . Insights: журнал UKSG . 25 : 33–43. DOI : 10.1629 / 2048-7754.25.1.33 .
- ^ Хеппнер, Массачусетс (2012). «Книжная полка NCBI: книги и документы в области наук о жизни и здравоохранения» . Исследования нуклеиновых кислот . 41 (выпуск базы данных): D1251 – D1260. DOI : 10.1093 / NAR / gks1279 . PMC 3531209 . PMID 23203889 .
- ^ Reilly, A .; Schallier, W .; Schrimpf, S .; Smit, E .; Уилкинсон, М. (2013). «Отчет об интеграции данных и публикаций» . Научная и исследовательская коммуникация . 4 (1).
- ^ Mooney, H .; Ньютон, М. (2012). «Анатомия цитирования данных: открытие, повторное использование и кредит» . Журнал библиотечного дела и научного общения . 1 : 1035. DOI : 10,7710 / 2162-3309.1035 .
- ^ «ДатаСайт» . Проверено 27 января 2014 года .
- ^ «EPIC - Европейский консорциум постоянных идентификаторов» . Проверено 28 января 2014 .
- ^ «CrossRef» . Проверено 27 января 2014 года .
- ^ Callaghan, S .; Donegan, S .; Pepler, S .; Thorley, M .; Cunningham, N .; Kirsch, P .; Ault, L .; Bell, P .; Bowie, R .; Leadbetter, A .; Lowry, R .; Moncoiffé, G .; Харрисон, К .; Smith-Haddon, B .; Weatherby, A .; Райт, Д. (2012). «Превращение данных в первоклассный научный продукт: цитирование и публикация данных центрами экологических данных НКРЭ» . Международный журнал цифрового курирования . 7 : 107–113. DOI : 10.2218 / ijdc.v7i1.218 .
- ^ Парсонс, Массачусетс; Фокс, Пенсильвания (2013). «Является ли публикация данных правильной метафорой?» . Журнал Data Science . 12 : WDS32 – WDS46. DOI : 10.2481 / dsj.wds-042 .
- ^ Фентон, Уильям (3 марта 2016 г.). «5 инструментов, которые упрощают управление цитированием и обмен ссылками» . PCMAG . Проверено 4 сентября 2019 .
- ^ Cheung, K .; Хантер, Дж .; Лаштабег, А .; Дреннан, Дж. (2008). «СФЕРА: Система публикации и редактирования научных составных объектов» . Международный журнал цифрового курирования . 3 (2): 4–18. DOI : 10.2218 / ijdc.v3i2.55 .
- ^ Pepe, A .; Майерник, М .; Боргман, CL; ван де Сомпель, Х. (2009). «Технология для представления научной практики: данные, жизненные циклы и цепочки создания стоимости» . Журнал Американского общества информационных наук и технологий .
- ^ McEntyre, Johanna R .; Ананиаду, София; Эндрюс, Стивен; Блэк, Уильям Дж .; Боулдерстон, Ричард; Баттери, Паула; Чаплин, Дэвид; Чевуру, Сандипредди; Кобли, Норман; Коулман, Ли-Энн; Дэйви, Пол; Гупта, Бхарти; Хаджи-Голам, Лесли; Хокинс, Крейг; Хорн, Алан; Хаббард, Саймон Дж .; Ким, Джи-Хьюб; Левин, Ян; Lyte, Vic; Макинтайр, Росс; Мансур, Сами; Мейсон, Линда; Макнот, Джон; Ньюболд, Элизабет; Нобата, Чикаши; Онг, Эрнест; Пиллай, Шармила; Ребхольц-Шуманн, Дитрих; Рози, Хизер; Роуботэм, Роб; Рупп, CJ; Стоер, Питер; Воан, Филип (2011). «UKPMC: ресурс полнотекстовых статей для наук о жизни» . Исследования нуклеиновых кислот . 39 (выпуск базы данных): D58 – D65. DOI : 10.1093 / NAR / gkq1063 . PMC 3013671 . PMID 21062818 .
- ^ Юк, К .; Харрис, TW; Bieri, T .; Cabunoc, A .; Chan, J .; Чен, ВДЖ; Davis, P .; de la Cruz, N .; Duong, A .; Fang, R .; Ganesan, U .; Grove, C .; Howe, K .; Kadam, S .; Кишор, Р .; Lee, R .; Li, Y .; Muller, H. -M .; Накамура, С .; Nash, B .; Озерский, П .; Паулини, М .; Raciti, D .; Рангараджан, А .; Schindelman, G .; Ши, X .; Schwarz, EM; Ann Tuli, M .; Ван Аукен, К .; Ван, Д. (2011). « База червей 2012: больше геномов, больше данных, новый веб-сайт» . Исследования нуклеиновых кислот . 40 (выпуск базы данных): D735 – D741. DOI : 10.1093 / NAR / gkr954 . PMC 3245152 . PMID 22067452 .
- ^ Фарас, диджей; Frantzen, J .; Stock, C .; Сесинк, Л .; Рабина, Д.Л. (2012). «Связывание полнотекстовой серой литературы с базовыми исследованиями и данными после публикации: Расширенный проект публикаций 2011-2012» (PDF) . Серый журнал . 8 (3): 181–189.
- ^ Гарсия Кастро, Л .; McLaughlin, C .; Гарсия, А. (2013). «Biotea: RDFizing Pub Med Central в поддержку статьи как интерфейса к Сети данных» . Журнал биомедицинской семантики . 4 : S5. DOI : 10.1186 / 2041-1480-4-S1-S5 . PMC 3804025 . PMID 23734622 .
- ^ Хугерверф, М. (2009). «Долговечные расширенные публикации» (PDF) . Труды африканской цифровой стипендии и курирования . Проверено 27 января 2014 года .
- ^ Хантер, Джейн (2006). Научные модели: ориентированный на пользователя подход к интеграции научных данных и электронных библиотек . VALA2006. С. 1–16 . Проверено 27 января 2014 года .
- ^ Хантер, Дж. (2006). «Пакеты научных публикаций - Избирательный подход к передаче и архивированию научных результатов» . Международный журнал цифрового курирования . 1 : 33–52. DOI : 10,2218 / ijdc.v1i1.4 .
- ^ Хантер, Дж .; Чунг, К. (2007). «Provenance Explorer - графический интерфейс для создания пакетов научных публикаций из следов происхождения». Международный журнал электронных библиотек . 7 (1-2): 99-107. DOI : 10.1007 / s00799-007-0018-5 . S2CID 18156460 .
- ^ Де Рур, Д .; Гобл, К .; Стивенс, Р. (2009). «Разработка и реализация виртуальной исследовательской среды myExperiment для совместного использования рабочих процессов в социальных сетях» . Компьютерные системы будущего поколения . 25 (5): 561–567. DOI : 10.1016 / j.future.2008.06.010 .
- ^ Bechhofer, S .; De Roure, D .; Gamble, M .; Goble, C .; Бьюкен, И. (2010). «Объекты исследования: обмен и повторное использование цифровых знаний» . Предшествующая природа . DOI : 10.1038 / npre.2010.4626.1 .
- ^ Siciarek, J .; Вишневский, Б. (2011). «IODA - интерактивная архитектура открытых документов» . Процедуры информатики . 4 : 668–677. DOI : 10.1016 / j.procs.2011.04.070 .
- ^ Браммер, Г.Р .; Кросби, RW; Мэтьюз, SJ; Уильямс, TL (2011). «Бумажное маше: создание динамической воспроизводимой науки» . Процедуры информатики . 4 : 658–667. DOI : 10.1016 / j.procs.2011.04.069 .
- ^ Новаковский, П .; Ciepiela, E .; Harężlak, D .; Kocot, J .; Каштельник, М .; Bartyński, T .; Meizner, J .; Dyk, G .; Малавский, М. (2011). «Среда создания коллажей» . Процедуры информатики . 4 : 608–617. DOI : 10.1016 / j.procs.2011.04.064 .
- ^ Джеффри, Грета; Анита, Бандровски; Дэвис, Бэнкс; Кристофер, Кондит; Амарнатх, Гупта; Стивен, Ларсон; Юелинг, Ли; Ибрагим, Озюрт; Андреа, Стагг; Патрисия, Ветзель; Луис, Маренко; Перри, Миллер; Риксин, Ван; Гордон, пастырь; Марианн, Мартоне (2014). «SciCrunch: совместная платформа для поиска данных и ресурсов для научных сообществ» . Границы нейроинформатики . 8 . DOI : 10,3389 / conf.fninf.2014.18.00069 .
- ^ Ван Горп, П .; Мазанек, С. (2011). «ПОДЕЛИТЬСЯ: веб-портал для создания и обмена исполняемыми исследовательскими работами» . Процедуры информатики . 4 : 589–597. DOI : 10.1016 / j.procs.2011.04.062 .