Ферментибактерии

Ферментибактерии
Научная классификация
Домен:	Бактерии
Суперфилум:	Группа FCB
Тип:	Ферментибактерии

Ферментибактерии (ранее Hyd24-12) - это тип бактерий со статусом кандидата . Это часть группы FCB . ^[1]

Исходная последовательность клона, использованная для определения Fermentibacteria как филума ( AJ535232 ), была извлечена из среды холодного просачивания Hydrate Ridge (Cascadia Margin, офшор из OR, США). ^[2] Первые геномы этого типа были извлечены из образцов полномасштабных мезофильных анаэробных варочных котлов на датских очистных сооружениях. ^[1] Предполагалось, что все три извлеченных генома представляют организмы, которые полагаются на ферментацию простых сахаров в качестве источника энергии, и поэтому было предложено название «ферментибактерии» (от «ферментировать»). ^[1]

Члены этого типа были обнаружены в широком диапазоне сред, включая выходы метана, ^[3] пески коралловых рифов ^[4] и пасть дельфинов. ^[5]

Предлагаемые виды включают Fermentibacter daniensis ^[1] и Sabulitectum Silens ^[6].

Ссылки [ править ]

^ ^a ^b ^c ^d Киркегор, Расмус Хансен; Дуэхольм, Мортен Симонсен; Макилрой, Саймон Джон; Ниерихло, Марта; Карст, Сорен Майкл; Альбертсен, Мадс; Нильсен, Пер Халькьер (октябрь 2016 г.). «Геномное понимание членов кандидата филума Hyd24-12, часто встречающегося в мезофильных анаэробных ферментных реакторах» . Журнал ISME . 10 (10): 2352–2364. DOI : 10.1038 / ismej.2016.43 . ISSN 1751-7370 . PMC 5030696 . PMID 27058503 .
^ Knittel, Katrin; Боэтиус, Антье; Лемке, Андреас; Эйлерс, Хайке; Лохте, Карин; Пфаннкуче, Олаф; Линке, Питер; Аманн, Рудольф (июль 2003 г.). «Активность, распределение и разнообразие сульфатредукторов и других бактерий в отложениях над газовым гидратом (Каскадия Марджин, Орегон)». Геомикробиологический журнал . 20 (4): 269–294. DOI : 10.1080 / 01490450303896 . hdl : 21.11116 / 0000-0001-D20F-2 . ISSN 0149-0451 . S2CID 140639772 .
^ Ерш, С. Эмиль; Биддл, Дженнифер Ф .; Теске, Андреас П .; Knittel, Katrin; Боэтиус, Антье; Раметт, Албан (16 марта 2015 г.). «Глобальное распространение и локальная диверсификация микробиома просачиваемого метана» . Труды Национальной академии наук . 112 (13): 4015–4020. Bibcode : 2015PNAS..112.4015R . DOI : 10.1073 / pnas.1421865112 . ISSN 0027-8424 . PMC 4386351 . PMID 25775520 .
^ Шёттнер, Сандра; Пфицнер, Барбара; Грюнке, Стефани; Рашид, Мохаммед; Дикий, Кристиан; Раметт, Олбан (2011-05-09). «Драйверы динамики бактериального разнообразия в проницаемых карбонатных и силикатных песках коралловых рифов Красного моря» . Экологическая микробиология . 13 (7): 1815–1826. DOI : 10.1111 / j.1462-2920.2011.02494.x . ISSN 1462-2912 . PMC 3207121 . PMID 21554515 .
^ Дудек, Наташа К .; Сан, Кристин Л .; Бурштейн, Дэвид; Кантор, Роза С .; Алиага Гольцман, Даниэла С .; Бик, Элизабет М .; Томас, Брайан Ч .; Банфилд, Джиллиан Ф .; Релман, Дэвид А. (18 декабря 2017 г.). «Новое микробное разнообразие и функциональный потенциал в оральном микробиоме морских млекопитающих» . Текущая биология . 27 (24): 3752–3762.e6. DOI : 10.1016 / j.cub.2017.10.040 . ISSN 1879-0445 . PMID 29153320 .
^ Саад, Сайнаб; Бхатнагар, Шриджак; Тегетмейер, Халина Е .; Geelhoed, Jeanine S .; Строус, Марк; Руфф, С. Эмиль (2017). «Кратковременное воздействие кислорода или нитратов раскрывает экофизиологию ферментативных и сульфатредуцирующих популяций бентосных микробов» . Экологическая микробиология . 19 (12): 4866–4881. DOI : 10.1111 / 1462-2920.13895 . ISSN 1462-2920 . PMC 5763382 . PMID 28836729 .

Эта статья о бактериях незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[:0-1] Киркегор, Расмус Хансен; Дуэхольм, Мортен Симонсен; Макилрой, Саймон Джон; Ниерихло, Марта; Карст, Сорен Майкл; Альбертсен, Мадс; Нильсен, Пер Халькьер (октябрь 2016 г.). «Геномное понимание членов кандидата филума Hyd24-12, часто встречающегося в мезофильных анаэробных ферментных реакторах» . Журнал ISME . 10 (10): 2352–2364. DOI : 10.1038 / ismej.2016.43 . ISSN 1751-7370 . PMC 5030696 . PMID 27058503 .

[2] Knittel, Katrin; Боэтиус, Антье; Лемке, Андреас; Эйлерс, Хайке; Лохте, Карин; Пфаннкуче, Олаф; Линке, Питер; Аманн, Рудольф (июль 2003 г.). «Активность, распределение и разнообразие сульфатредукторов и других бактерий в отложениях над газовым гидратом (Каскадия Марджин, Орегон)». Геомикробиологический журнал . 20 (4): 269–294. DOI : 10.1080 / 01490450303896 . hdl : 21.11116 / 0000-0001-D20F-2 . ISSN 0149-0451 . S2CID 140639772 .

[3] Ерш, С. Эмиль; Биддл, Дженнифер Ф .; Теске, Андреас П .; Knittel, Katrin; Боэтиус, Антье; Раметт, Албан (16 марта 2015 г.). «Глобальное распространение и локальная диверсификация микробиома просачиваемого метана» . Труды Национальной академии наук . 112 (13): 4015–4020. Bibcode : 2015PNAS..112.4015R . DOI : 10.1073 / pnas.1421865112 . ISSN 0027-8424 . PMC 4386351 . PMID 25775520 .

[4] Шёттнер, Сандра; Пфицнер, Барбара; Грюнке, Стефани; Рашид, Мохаммед; Дикий, Кристиан; Раметт, Олбан (2011-05-09). «Драйверы динамики бактериального разнообразия в проницаемых карбонатных и силикатных песках коралловых рифов Красного моря» . Экологическая микробиология . 13 (7): 1815–1826. DOI : 10.1111 / j.1462-2920.2011.02494.x . ISSN 1462-2912 . PMC 3207121 . PMID 21554515 .

[5] Дудек, Наташа К .; Сан, Кристин Л .; Бурштейн, Дэвид; Кантор, Роза С .; Алиага Гольцман, Даниэла С .; Бик, Элизабет М .; Томас, Брайан Ч .; Банфилд, Джиллиан Ф .; Релман, Дэвид А. (18 декабря 2017 г.). «Новое микробное разнообразие и функциональный потенциал в оральном микробиоме морских млекопитающих» . Текущая биология . 27 (24): 3752–3762.e6. DOI : 10.1016 / j.cub.2017.10.040 . ISSN 1879-0445 . PMID 29153320 .

[6] Саад, Сайнаб; Бхатнагар, Шриджак; Тегетмейер, Халина Е .; Geelhoed, Jeanine S .; Строус, Марк; Руфф, С. Эмиль (2017). «Кратковременное воздействие кислорода или нитратов раскрывает экофизиологию ферментативных и сульфатредуцирующих популяций бентосных микробов» . Экологическая микробиология . 19 (12): 4866–4881. DOI : 10.1111 / 1462-2920.13895 . ISSN 1462-2920 . PMC 5763382 . PMID 28836729 .

[1]