Омнибус экспрессии генов

Эта статья требует дополнительных ссылок для проверки . Пожалуйста, помогите улучшить эту статью , добавив цитаты из надежных источников . Материал, не полученный от источника, может быть оспорен и удален.
Найти источники: «Омнибус экспрессии генов» - новости · газеты · книги · ученый · JSTOR ( январь 2021 г. ) ( Узнайте, как и когда удалить это сообщение-шаблон )

Омнибус экспрессии генов

Содержание
Описание	База данных по профилированию экспрессии генов и метилированию РНК
Контакт
Исследовательский центр	Национальный центр биотехнологической информации
Первичное цитирование	Эдгар Р и др. (2002) ^[1]
Доступ
Веб-сайт	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gds/?term=

Gene Expression Omnibus ( GEO ) - это база данных для профилирования экспрессии генов и профилирования метилирования РНК, управляемая Национальным центром биотехнологической информации (NCBI). ^[1] Эти данные геномного скрининга с высокой пропускной способностью получены из экспериментальных данных Microarray или RNA-Seq . ^[2] Эти данные должны соответствовать формату « Минимум информации об эксперименте с микрочипом» (MIAME). ^[3]

Глоссарий [ править ]


Сокращение	Описание
GDS	DataSet присоединение
GPL	Присоединение к платформе
GSE	Присоединение к серии
GSM	Образец присоединения

Ссылки [ править ]

^ ^а ^б Эдгар, Р; Домрачев, М; Лэш, А.Е. (1 января 2002 г.). «Омнибус экспрессии гена: экспрессия гена NCBI и репозиторий массива данных гибридизации» . Исследования нуклеиновых кислот . 30 (1): 207–10. DOI : 10.1093 / NAR / 30.1.207 . PMC 99122 . PMID 11752295 .
^ Барретт, Т; Wilhite, SE; Ledoux, P; Евангелиста, C; Ким, IF; Томашевский, М; Маршалл, штат Калифорния; Филиппи, KH; Шерман, ПМ; Холко, М; Ефанов А; Ли, Н; Zhang, N; Робертсон, К.Л .; Серова, Н; Дэвис, S; Соболева А (январь 2013). «NCBI GEO: архив наборов данных функциональной геномики - обновление» . Исследования нуклеиновых кислот . 41 (Проблема с базой данных): D991-5. DOI : 10.1093 / NAR / gks1193 . PMC 3531084 . PMID 23193258 .
^ Бразма, А; Hingamp, P; Quackenbush, J; Шерлок, Джи; Spellman, P; Stoeckert, C; Аах, Дж; Ансорге, Вт; Болл, Калифорния; Каустон, HC; Gaasterland, T; Glenisson, P; Холстеге, ФК; Ким, IF; Марковиц, V; Matese, JC; Паркинсон, H; Робинсон, А; Сарканс, У; Schulze-Kremer, S; Стюарт, Дж; Тейлор, Р. Вило, Дж; Вингрон, М. (декабрь 2001 г.). «Минимум информации об эксперименте с микрочипом (MIAME) - до стандартов для данных микрочипа» . Генетика природы . 29 (4): 365–71. DOI : 10.1038 / ng1201-365 . PMID 11726920 . S2CID 6994467 .

Эта статья, связанная с биологической базой данных, является незавершенной . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[pmid11752295-1] а ^б Эдгар, Р; Домрачев, М; Лэш, А.Е. (1 января 2002 г.). «Омнибус экспрессии гена: экспрессия гена NCBI и репозиторий массива данных гибридизации» . Исследования нуклеиновых кислот . 30 (1): 207–10. DOI : 10.1093 / NAR / 30.1.207 . PMC 99122 . PMID 11752295 .

[2] Барретт, Т; Wilhite, SE; Ledoux, P; Евангелиста, C; Ким, IF; Томашевский, М; Маршалл, штат Калифорния; Филиппи, KH; Шерман, ПМ; Холко, М; Ефанов А; Ли, Н; Zhang, N; Робертсон, К.Л .; Серова, Н; Дэвис, S; Соболева А (январь 2013). «NCBI GEO: архив наборов данных функциональной геномики - обновление» . Исследования нуклеиновых кислот . 41 (Проблема с базой данных): D991-5. DOI : 10.1093 / NAR / gks1193 . PMC 3531084 . PMID 23193258 .

[3] Бразма, А; Hingamp, P; Quackenbush, J; Шерлок, Джи; Spellman, P; Stoeckert, C; Аах, Дж; Ансорге, Вт; Болл, Калифорния; Каустон, HC; Gaasterland, T; Glenisson, P; Холстеге, ФК; Ким, IF; Марковиц, V; Matese, JC; Паркинсон, H; Робинсон, А; Сарканс, У; Schulze-Kremer, S; Стюарт, Дж; Тейлор, Р. Вило, Дж; Вингрон, М. (декабрь 2001 г.). «Минимум информации об эксперименте с микрочипом (MIAME) - до стандартов для данных микрочипа» . Генетика природы . 29 (4): 365–71. DOI : 10.1038 / ng1201-365 . PMID 11726920 . S2CID 6994467 .

[1]

vтеНациональный центр биотехнологической информации
Базы данных	GenBank , PubMed , PubMed Central , базы данных консервативного домена , dbSNP , гистоны базы данные , Интернет Мендель Наследование в Человеке , молекулярное моделирование базы данных , GenBank , NCBI Epigenomics , Entrez , RefSeq , Univec , Gene Expression Omnibus
люди	Юджин Кунин , Дэвид Ландсман , Стивен Альтшул , Ким Д. Прюитт