HLA-DQ4 (DQ4) является подгруппой серотипов внутри серотипов HLA-DQ (DQ). Серотип определяется по распознаванию антителом β 4 подмножества β-цепей DQ. Β-цепь DQ кодируется локусом HLA-DQB1, а DQ4 кодируется группой аллелей HLA-DQB1 * 04 . Эта группа в настоящее время содержит 2 общих аллеля, DQB1 * 0401 и DQB1 * 0402 . HLA-DQ4 и HLA-DQB1 * 04 почти синонимы по значению. DQ4 бета-цепи в сочетании с альфа-цепей, кодируемых генетически связанных HLA-DQA1 аллелями, с образованием цис - гаплотипизоформы. Эти изоформы, получившие название DQ4.3 и DQ4.4, также кодируются генами DQA1 * 0303 и DQA1 * 0401 соответственно.
HLA-DQ4 ( MHC Class II , антиген клеточной поверхности DQ ) | |||
Иллюстрация HLA-DQ с пептидом глиадина в связывающем кармане. | |||
Цис-гаплотип | Гаплотип | ||
изоформа | подтип | DQA1 | DQB1 |
DQ α 3 β 4,1 | DQ4.3a | * 0303 | * 0401 |
DQ α 3 β 4,2 | DQ4.3b | * 0303 | * 0402 |
DQ α 4 β 4,2 | DQ4.2 | * 0401 | * 0402 |
Серотип
DQB1 * | DQ4 | DQ3 | Образец |
аллель | % | % | размер (N) |
* 0401 | 71 | 10 | 176 |
* 0402 | 86 | 2 | 1085 |
Красный цвет указывает на уровень «ложной» реакции у серотипов, не относящихся к DQ4. |
Аллели
DQB1 * 0401
DQB1 * 0402
Гаплотипы
DQ4.3
DQA1 * 0303: DQB1 * 0401 связан с DRB1 * 0405 и распространен в западной части Тихого океана, от Индонезии до Японии и внутренних районах Восточной Азии. В Японии он вызывает предрасположенность к ювенильному диабету, вероятно, через ген DR4.
DQA1 * 0303: DQB1 * 0402 в основном встречается в Северо-Восточной Азии и на западе Тихоокеанского побережья. Он похож на DQA1 * 0303: DQB1 * 0402.
DQ4.2
DQA1 * 0401: DQB1 * 0402 имеет тримодальное глобальное распределение. Самые высокие частоты наблюдаются в высокогорных регионах нового мира, достигая максимума в северо-западных районах Мексики и в Андах . Он также встречается в больших количествах в Намибии и Ботсване . Между этими двумя популяциями он умеренно высок у айнов на севере Японии.
DQ4 и болезнь
DQ4 связан с:
Гаплотип DR8-DQ4 связан с
- папиллярный рак щитовидной железы [4]
- ювенильный идиопатический артрит [5] через аллель DR8, [6]
- хроническая хламидиозная инфекция , [7]
- возможно пузырчатка [8]
DR4-DQ4 (DRB1 * 0405: DQB1 * 0401) связан с:
- аутоиммунный панкреатит, [9]
- ювенильный диабет 1 типа , [10]
- ревматоидный артрит [11] на японском языке.
Гаплотип DQA1 * 0303: DQB1 * 04 связан с:
Среди других упомянутых заболеваний - высокогорный отек легких , болезнь Фогта – Коянаги – Харада (DRB1 * 0405, см. Таблицу для японского языка), резистентность к ВИЧ в США и гемофилия A (реакция на ингибиторы FVIII).
Распределение DQ4
DQ | DR - DQ | DR | DQ | Частота | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Серотип | гаплотип | B1 | A1 | B1 | % [14] | классифицировать | ||
DQ4 | DR4 - DQ4 | 0405 | 0303 | 0401 | 14. | 3 | ² | |
0410 | 0303 | 0402 | 1. | 9 | 11 | |||
DR8 - DQ4 | 0802 | 0401 | 0402 | 1. | 3 | 15 | ||
DQ5 | DR1 - DQ5 | 0101 | 0101 | 0501 | 6. | 4 | 5 | |
DR14 - DQ5 | 1401 | 0104 | 0502 | 1. | 1 | 17 | ||
1401 | 0104 | 0503 | 0. | 8 | 18 | |||
1405 | 0104 | 0503 | 1. | 6 | 13 | |||
DQ6 | DR8 - DQ6 | 0803 | 0103 | 0601 | 9. | 3 | 4 | |
DR13 - DQ6 | 1302 | 0102 | 0604 | 6. | 0 | 6 | ||
DR15 - DQ6 | 1502 | 0103 | 0601 | 12. | 9 | ³ | ||
1501 | 0102 | 0602 | 6. | 0 | 7 | |||
DQ7 | DR11 - DQ7 | 1101 | 0505 | 0301 | 1. | 8 | 12 | |
DR12 - DQ7 | 1201 | 0505 | 0301 | 2. | 7 | 9 | ||
1202 | 0601 | 0301 | 1. | 3 | 15 | |||
DR14 - DQ7 | 1403 | 0503 | 0301 | 1. | 4 | 14 | ||
DQ8 | DR4 - DQ8 | 0403 | 0301 | 0302 | 1. | 9 | 10 | |
0406 | 0301 | 0302 | 3. | 4 | 8 | |||
DR8 - DQ8 | 0802 | 0401 | 0302 | 0. | 7 | 19 | ||
DQ9 | DR9 - DQ9 | 0901 | 0302 | 0303 | 16. | 0 | 1 |
В таблице слева показаны значения японских [14] (значения, преобразованные из частот фенотипов в частоты гаплотипов для согласованности) типов DR-DQ. Эта таблица представлена здесь из-за разнообразия типов DQ4 в популяции Японии, не встречающегося в других местах. DQ4, как правило, редко встречается в большинстве стран мира, но там, где он появляется чаще, представляет интерес. Узел DQ4 находится с гаплотипом DQA1 * 0401: DQB1 * 0402 (DQ4.24 для этой страницы) в северо-западной Мексике и высокогорном регионе западной части Южной Америки, достигая 40% частот гаплотипов в этой области. За пределами коренного американского населения DQ4.24 повышен на 10% у айнов Хоккайдо, Япония. Существует ряд других гаплотипов AB, которые предполагают связь между айнами и мезоамериканским и андским населением, а также у лакота сиу уровни DQ4 выше, чем у айнов. Связь DQ4 в Азии, по-видимому, наиболее тяжелая с DR8 (DR * 0801, DR * 0802, DR * 0804) для DQ4.24, и частота повышается от островов Рюкю до Охотска, Ульчи, Негидаля, Тофалара примерно на 10%. падение у манси на 4% и промежуточные уровни. Разнообразие гаплотипов DQB1 * 0402, по-видимому, сосредоточено вокруг цепи реки Амур / Японских островов, а разнообразие DQB1 * 0401 примерно следует аналогичной схеме. DQ4.24 также высок у шведов, однако это может быть связано с тем, что поток генов с востока на запад прослеживается в других локусах HLA.
Поскольку DQA1 * 0401: DQB1 * 0402 обнаружен в! Кунг, можно разумно предположить, что он развился в Африке и мигрировал с одной из нескольких потенциальных волн, возможно самой ранней. Проследить путь миграции чрезвычайно сложно, но похоже, что возможный второй узел экспансии в Центральной Азии, а не в Западно-Тихоокеанском регионе / австро-индийском маршруте, постулируется как раннее расселение людей. Наиболее распространенные гаплотипы! Kung (например, Cw-B), которые также появляются в Евразии, по-видимому, связаны с самой ранней миграцией и наводят на мысль о прибрежной миграции; однако относительно высокие частоты в бассейне айнов [15] и Амура [16] предполагают миграцию через Забайкалье, что согласуется с археологией примерно с 18 тыс. лет назад. При таком маршруте можно ожидать, что корейцы будут выше японцев, а японцы выше, а рюкюанцы все равно будут выше, чем аборигены Тайваня. С запада частоты генов в Леванте и регионе Черного моря находятся на «диффузном» уровне, тогда как есть очаги повышенной частоты у зороастрийцев региона Ядз (DQA1 * 0401 и DQB1 * 0402). Таким образом, гаплотип DR8-DQ4.24, вероятно, имеет западное происхождение.
DR4-DQA1 * 0303: DQB1 * 040X можно найти на высоких частотах в высокогорных группах PNG [17], но не в DQ4.24. Установлено, что DR * 0405 и DR * 410 специфически связаны с этими типами DQ, и существует некоторое разнообразие гаплотипов. Таким образом, кажется, что присутствие DQA1 * 03: DQB1 * 04 происходит из Западно-Тихоокеанского региона у японцев и ближайших сибиряков, но, к сожалению, у аборигенов Тайваня в настоящее время нет типизации этих гаплотипов. Присутствие в Индонезии может быть результатом ретроградного потока генов, который может быть установлен другими типами HLA, а также мтДНК.
Рекомендации
- ^ получено из IMGT / HLA
- ^ Мимура Т, Фунацу Х, Утигата Й, Китано С, Нома Х, Симидзу Э, Конно Й, Амано С, Арайе М, Йошино О, Ивамото Y, Хори S (2003). «Взаимосвязь между статусом антигена лейкоцитов человека и пролиферативной диабетической ретинопатией у пациентов с сахарным диабетом 1 типа с более ранним началом». Am J Ophthalmol . 135 (6): 844–8. DOI : 10.1016 / S0002-9394 (02) 02291-2 . PMID 12788125 .
- ^ Мимура Т., Фунацу Х, Утигата Й, Китано С., Симидзу Э, Амано С., Ямагами С., Нома Х, Арайе М., Хори С. (2005). «Распространенность аутоантител к декарбоксилазе глутаминовой кислоты и ассоциация с генотипом HLA у пациентов с более молодым диабетом типа 1 и пролиферативной диабетической ретинопатией». Офтальмология . 112 (11): 1904–1909. DOI : 10.1016 / j.ophtha.2005.05.016 . PMID 16157380 .
- ^ Порту Т., Коэльо I, Боавида Дж., Перейра К., Нуньес Дж., Мендонса Д., Мартинс Б., Собриньо Л., Лейте В. (2006). «Ассоциация гаплотипа HLA DQ4-DR8 с папиллярными карциномами щитовидной железы». Clin Endocrinol . 64 (2): 179–83. DOI : 10.1111 / j.1365-2265.2006.02445.x . PMID 16430717 .
- ^ Смердел А., Ли Б., Финхольт С., Плоски Р., Фёрре Э, Ундлиен Д., Торсби Э. (2003). «Дополнительный ген восприимчивости к ювенильному идиопатическому артриту в области HLA класса I на нескольких гаплотипах DR-DQ». Тканевые антигены . 61 (1): 80–4. DOI : 10.1034 / j.1399-0039.2003.610107.x . PMID 12622778 .
- ^ Смердел А., Плоски Р., Флетё Б., Мусей-Новаковска Е., Торсби Е., Фёрре Ø (2002). «Ювенильный идиопатический артрит (ЮИА) в первую очередь связан с HLA-DR8, но не с DQ4 в гаплотипе DR8-DQ4» . Ann Rheum Dis . 61 (4): 354–7. DOI : 10.1136 / ard.61.4.354 . PMC 1754045 . PMID 11874841 .
- ^ Бецоу Ф., Боррего М., Гийом Н., Кэтри М., Ромао С., Мачадо-Каэтано Дж., Сьюур Дж., Упоминание Дж., Фаилле Н., Орфила Дж. (2003). «Перекрестная реактивность между белком теплового шока 10 Chlamydia trachomatis и фактором ранней беременности» . Clin Diagn Lab Immunol . 10 (3): 446–50. DOI : 10,1128 / CDLI.10.3.446-450.2003 . PMC 154954 . PMID 12738647 .
- ^ Бирол А, Анадолу Р., Туткак Х., Гюргей Э. (2002). «Антигены HLA-класса 1 и 2 у турецких пациентов с пузырчаткой». Int J Dermatol . 41 (2): 79–83. DOI : 10,1046 / j.1365-4362.2002.01370.x . PMID 11982641 .
- ^ Кава С., Ота М., Ёсизава К., Хориучи А., Хамано Х, Очи Й, Накаяма К., Токутаке Ю., Кацуяма Ю., Сайто С., Хасебе О, Киёсава К. (2002). «Гаплотип HLA DRB10405-DQB10401 связан с аутоиммунным панкреатитом у населения Японии». Гастроэнтерология . 122 (5): 1264–9. DOI : 10,1053 / gast.2002.33022 . PMID 11984513 .
- ^ Кикуока Н., Сугихара С., Янагава Т., Икезаки А., Ким Н., Мацуока Н., Кобаяси Ю., Ватаки К., Конда С., Сато Н., Миямото С., Сасаки Н., Сакамаки Т., Ниими Н., Мурата М. (2001). «Полиморфизм гена антигена 4 цитотоксических Т-лимфоцитов придает предрасположенность к диабету 1 типа у японских детей: анализ ассоциации с генотипами HLA и аутоантителами». Clin Endocrinol . 55 (5): 597–603. DOI : 10.1046 / j.1365-2265.2001.01397.x . PMID 11894970 .
- ^ Цутия К., Кимура А., Кондо М., Нисимура Ю., Сасадзуки Т. (2001). «Комбинация аллелей HLA-A и HLA класса II контролирует предрасположенность к ревматоидному артриту». Тканевые антигены . 58 (6): 395–401. DOI : 10.1034 / j.1399-0039.2001.580608.x . PMID 11929590 .
- ^ Матаке Х, Окабе Н, Найто С, Яо Т (1992). «Исследование HLA на 149 японских пациентах с болезнью Крона». Gastroenterol Jpn . 27 (4): 496–501. PMID 1526431 .
- ^ Накадзима А., Мацухаши Н., Кодама Т., Язаки Ю., Таказоэ М., Кимура А. (1995). «HLA-связанные гены восприимчивости и устойчивости при болезни Крона». Гастроэнтерология . 109 (5): 1462–7. DOI : 10.1016 / 0016-5085 (95) 90631-2 . PMID 7557126 .
- ^ а б Танака Т., Омори М., Ясунага С., Охшима К., Кикучи М., Сасадзуки Т. (1999). «Типирование ДНК генов HLA класса II (HLA-DR, -DQ и -DP) у японских пациентов с гистиоцитарно-некротическим лимфаденитом (болезнь Кикучи)». Тканевые антигены . 54 (3): 246–253. DOI : 10.1034 / j.1399-0039.1999.540305.x . PMID 10519361 .
- ^ Баннаи М., Токунага К., Иманиши Т., Харихара С., Фудзисава К., Джуджи Т., Омото К. (1996). «Аллели HLA класса II у айнов, проживающих в районе Хидака, Хоккайдо, северная Япония». Am J Phys Anthropol . 101 (1): 1–9. DOI : 10.1002 / (SICI) 1096-8644 (199609) 101: 1 <1 :: AID-AJPA1> 3.0.CO; 2-Z . PMID 8876810 .
- ^ Uinuk-Ool TS, Takezaki N, Sukernik RI, Nagl S, Klein J (2002). «Происхождение и родство коренных сибирских популяций по частотам генов HLA класса II». Генетика человека . 110 (3): 209–226. DOI : 10.1007 / s00439-001-0668-0 . PMID 11935333 .
- ^ Гао X, Бхатия К., Трент Р.Дж., Серджантсон С.В. (1992). «Полиморфизмы нуклеотидных последовательностей HLA-DR, DQ в пяти меланезийских популяциях». Тканевые антигены . 40 (1): 31–37. DOI : 10.1111 / j.1399-0039.1992.tb01954.x . PMID 1440559 .