Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску

Гаплогруппа X
Гаплогруппа X (мтДНК) .PNG
Возможное время происхожденияок. 45 000–20 000 лет назад [1]
ПредокN
ПотомкиХ1, Х2
Определение мутаций73, 7028, 11719, 12705, 14766, 16189, 16223, 16278 [2]

Гаплогруппа X - это гаплогруппа митохондриальной ДНК человека (мтДНК) . Он встречается в Америке , Европе , Западной Азии , Северной Африке и на Африканском Роге .

Таблица возможных крупных миграций людей на основе мтДНК .

Гаплогруппа X возникла из гаплогруппы N примерно 30 000 лет назад (незадолго до или во время последнего ледникового максимума ). Он, в свою очередь, является предком субкладов X2 и X1, возникших ок. 20000 и ок. 12000 лет назад соответственно. [1]

Распространение [ править ]

Гаплогруппа X обнаруживается примерно 7% от коренных европейцев , [3] и 3% всех коренных жителей Северной Америки . [4]

В целом гаплогруппа X встречается примерно у 2% населения Европы , Ближнего Востока и Северной Африки . Это особенно распространено, 14,3%, среди уроженцев оазиса Бахария ( Западная пустыня, Египет . [5] Субклад X1 встречается гораздо реже и в основном ограничен Северной Африкой, Африканским Рогом и Ближним Востоком.

Субклад X2, похоже, претерпел обширное расширение населения и расселение во время или вскоре после последнего ледникового максимума , примерно 20 000 лет назад. Он более широко представлен на Ближнем Востоке, Кавказе и в Южной Европе и несколько менее широко представлен в остальной Европе. Самые высокие концентрации обнаружены в Грузии (8%), Оркнейских островах ( Шотландия ) (7%) и среди друзов в Израиле (27%). Субклады X2a и X2g встречаются в Северной Америке, но отсутствуют у коренных жителей Южной Америки. [6]

Археогенетика [ править ]

Гаплогруппа X была обнаружена в различных других окаменелостях, которые были проанализированы на предмет наличия древней ДНК, включая образцы, связанные с линейной керамикой Альфельда (X2b-T226C, Garadna-Elkerülő út site 2, 1/1 или 100%), Linearbandkeramik (X2d1, Halberstadt- Sonntagsfeld, 1/22 или ~ 5%), и Iberia Chalcolithic (X2b, La Chabola de la Hechicera, 1/3 или 33%; X2b, El Sotillo, 1/3 или 33%; X2b, El Mirador Cave, 1 / 12 или ~ 8%) культур. [7] Гаплогруппа X была обнаружена в древнеегипетских мумиях, раскопанных на археологическом участке Абусир-эль-Мелек в Среднем Египте, которые датируются поздним периодом Нового царства и римским периодом. [8] Было обнаружено, что окаменелости, раскопанные на территории позднего неолита Келиф-эль-Боруд (Кехф-эль-Баруд) в Марокко , возрастом около 5000 лет, также содержат субклад X2. [9]

Друзы [ править ]

Наибольшая частота гаплогруппы X наблюдается у друзов , меньшинства в Израиле , Иордании , Ливане и Сирии , как в X1 (16%), так и в X2 (11%). [10] У друзов также много разнообразия X-линий. Этот образец гетерогенного родительского происхождения согласуется с устной традицией друзов. Галилее друза представляет собой изолят населения, поэтому их сочетание высокой частоты и разнообразия X означает филогенетический рефугиум, обеспечивая образец снимок генетического ландшафта Ближнего Востока до современной эпохи. [11]

Северная Америка [ править ]

Дополнительная информация: Генетическая история коренных народов Америки

Гаплогруппа X также является одной из пяти гаплогрупп коренных народов Америки . [12] (а именно, субклад X2a).

Хотя это встречается только с частотой около 3% для всего нынешнего коренного населения Америки, это более крупная гаплогруппа в северной части Северной Америки, где у алгонкинских народов она составляет до 25% типов мтДНК. [13] [14] Он также присутствует в меньшем количестве к западу и югу от этой области - среди сиу (15%), нуу-ча-нулт (11–13%), навахо (7%). , и Якама (5%). [15]

В отличие от четырех основных гаплогрупп мтДНК коренных американцев ( A , B , C , D ), X не сильно связан с Восточной Азией . Основное обнаруженное к настоящему времени появление X в Азии у алтайцев в Сибири . [16]

Одна из теорий о том, как X-гаплогруппа оказалась в Северной Америке, заключается в том, что люди, несущие ее, мигрировали из Центральной Азии вместе с гаплогруппами A, B, C и D от предка из Алтайского региона Центральной Азии . [17] Две последовательности гаплогруппы X2 были отобраны восточнее Алтая у эвенков Центральной Сибири. [10] Эти две последовательности принадлежат X2 * и X2b. Неясно, представляют ли они остаток миграции X2 через Сибирь или более недавний вклад. [17]

Это относительное отсутствие гаплогруппы X2 в Азии является одним из основных факторов, используемых для поддержки гипотезы солютрианства в начале 2000-х годов. Гипотеза Solutrean постулирует, что гаплогруппа X достигла Северной Америки с волной европейской миграции, возникшей из культуры Solutrean , примерно 20 000 лет назад. [18] [19] культура каменного века на юго-западе Франции и в Испании , на лодке вокруг южного края арктического льда.. С конца 2000-х и в течение 2010-х годов свидетельства обернулись против гипотезы солютриана, поскольку в Европе или на Ближнем Востоке не было обнаружено присутствия mt-ДНК, предка X2a. Линии Нового Света X2a и X2g не являются производными от линий Старого Света X2b, X2c, X2d, X2e и X2f, что указывает на раннее происхождение линий Нового Света, «вероятно, в самом начале их экспансии и распространения с Ближнего Востока» . [17] Исследование 2008 года пришло к выводу, что присутствие гаплогруппы X в Северной и Южной Америке не поддерживает миграцию из Европы солютрейского периода. [20] Линия гаплогруппы X в Америке не происходит от европейского субклада, а скорее представляет собой независимый субклад, обозначенный X2a. [21] Субклад X2a не был обнаружен в Евразии и, скорее всего, возник среди раннего палеоиндийского населения примерно 13000 лет назад. [22] Базальный вариант X2a был обнаружен в окаменелости человека Кенневика (около 9000 лет назад). [23]

Субклады [ править ]

Дерево [ править ]

Это филогенетическое дерево субкладов гаплогруппы X основано на статье Манниса ван Овена и Манфреда Кайзера. Обновленное комплексное филогенетическое дерево глобальных вариаций митохондриальной ДНК человека [2] и последующих опубликованных исследований.

  • Икс
    • X1
      • X1a
        • X1a1
      • X1b
    • X2
      • X2a
        • X2a1
          • X2a1a
          • X2a1b
        • X2a2
      • X2b
        • X2b1
        • X2b2
        • X2b3
        • X2b4
      • X2c
        • X2c1
        • X2c2
      • X2d
      • X2e
        • X2e1
          • X2e1a
            • X2e1a1
              • X2e1a1a
        • X2e2
          • X2e2a
      • X2f
      • X2g
      • X2h

См. Также [ править ]

  • Гаплогруппы митохондриальной ДНК человека
  • Коренные американские генетические исследования
  • Kennewick Man
  • Семь дочерей Евы

Филогенетическое дерево гаплогрупп митохондриальной ДНК человека (мтДНК)

 Митохондриальная Ева ( L )  
L0L1–6 
L1L2 L3  L4L5L6
MN 
CZDEграммQ ОАSр яWИксY
CZBFR0 pre-JT п U
HVJTK
ЧАСVJТ

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b X оценивается как31,8+12,8
    –12,1     kya     ( 95% ДИ ) в: «Исправление для очищающего отбора: дополнительный материал по улучшенным митохондриальным молекулярным часам человека (стр. 87)» (PDF) . 2009: 89. Архивировано из оригинального (PDF) 29 декабря 2009 года. Цитировать журнал требует |journal=( помощь )
  2. ^ a b van Oven M, Kayser M (февраль 2009 г.). «Обновленное комплексное филогенетическое дерево глобальных вариаций митохондриальной ДНК человека» . Мутация человека . 30 (2): E386–394. DOI : 10.1002 / humu.20921 . PMID 18853457 . S2CID 27566749 .  
  3. ↑ Брайан Сайкс (2001). Семь дочерей Евы . Лондон; Нью-Йорк: Bantam Press. ISBN 978-0-393-02018-2.
  4. ^ Малхи и Смит, Краткое сообщение: гаплогруппа X, подтвержденная в доисторической Северной Америке , Американский журнал физической антропологии , том 119, выпуск 1, (сентябрь 2002 г.), страницы 84–86.
  5. ^ Мартина Куянова; Луиза Перейра; Вероника Фернандес; Жоана Б. Перейра; Виктор Черный (2009). "Ближневосточный неолитический генетический вклад в небольшой оазис египетской Западной пустыни". Американский журнал физической антропологии . 140 (2): 336–346. DOI : 10.1002 / ajpa.21078 . PMID 19425100 . 
  6. ^ Perego UA (2009). «Отличительные палеоиндийские миграционные пути из Берингии, отмеченные двумя редкими гаплогруппами мтДНК». Текущая биология . 19 (1): 1–8. DOI : 10.1016 / j.cub.2008.11.058 . PMID 19135370 . S2CID 9729731 .  
  7. ^ Марк Липсон; и другие. (2017). «Параллельные палеогеномные трансекты раскрывают сложную генетическую историю ранних европейских фермеров» . Природа . 551 (7680): 368–372. Bibcode : 2017Natur.551..368L . DOI : 10.1038 / nature24476 . PMC 5973800 . PMID 29144465 . Проверено 16 ноября 2017 года .  
  8. ^ Schuenemann, Верена J .; и другие. (2017). «Геномы древних египетских мумий предполагают увеличение числа африканских предков к югу от Сахары в постримские периоды» . Nature Communications . 8 : 15694. Bibcode : 2017NatCo ... 815694S . DOI : 10.1038 / ncomms15694 . PMC 5459999 . PMID 28556824 .  
  9. ^ Фрегель; и другие. (2018). «Древние геномы из Северной Африки свидетельствуют о доисторических миграциях в Магриб как из Леванта, так и из Европы». bioRxiv 10.1101 / 191569 . 
  10. ^ а б Рейдла М., Кивисилд Т., Мецпалу Э, Калдма К., Тамбец К., Толк Х.В. и др. (Ноябрь 2003 г.). «Происхождение и распространение мтДНК гаплогруппы X» . Американский журнал генетики человека . 73 (5): 1178–1190. DOI : 10.1086 / 379380 . PMC 1180497 . PMID 14574647 .  
  11. ^ Шлуш Л.И., Бехар Д.М., Юдковский Г. (2008). «Друзы: популяционно-генетический рефугиум Ближнего Востока» . PLOS ONE . 3 (5): e2105. Bibcode : 2008PLoSO ... 3.2105S . DOI : 10.1371 / journal.pone.0002105 . PMC 2324201 . PMID 18461126 .  
  12. ^ "Учебный центр ДНК Долана - гаплогруппы коренных американцев: европейское происхождение, Дуглас Уоллес" . Dnalc.org . Проверено 28 января 2011 года .
  13. ^ «Население Америки: генетическое происхождение влияет на здоровье» . Scientific American .
  14. ^ "Узнайте о гаплогруппе Q Y-ДНК" . Венди Тымчук - старший технический редактор . Системы генных баз. 2008. Архивировано из оригинала (возможно устное руководство) 22 июня 2010 года . Проверено 21 ноября 2009 года .
  15. ^ Fagundes NJ, Каниц R, Эккерт R, Valls AC, Бого MR, Salzano FM, Смит Д., Сильва WA, Zago MA, Ribeiro-дос-Сантос АК, Сантос SE, Petzl-Эрлер ML, Bonatto SL (март 2008). «Геномика митохондриальной популяции поддерживает единственное происхождение до Хлодвига с прибрежным маршрутом для заселения Америки» . Американский журнал генетики человека . 82 (3): 583–592. DOI : 10.1016 / j.ajhg.2007.11.013 . PMC 2427228 . PMID 18313026 . (Щелкните здесь, чтобы перейти в формат PDF)  
  16. ^ Деренко М.В., Гжибовский Т, Малярчук Б.А., Чарны Дж, Miścicka-Сливка Д, Захаров И.А. (июль 2001 г.). «Наличие митохондриальной гаплогруппы x у алтайцев из Южной Сибири» . Американский журнал генетики человека . 69 (1): 237–241. DOI : 10.1086 / 321266 . PMC 1226041 . PMID 11410843 .  
  17. ^ a b c Рейдла М., Кивисилд Т., Мецпалу Э, Калдма К., Тамбец К., Толк Х.В. и др. (Ноябрь 2003 г.). «Происхождение и распространение мтДНК гаплогруппы X» . Американский журнал генетики человека . 73 (5): 1178–1190. DOI : 10.1086 / 379380 . PMC 1180497 . PMID 14574647 .  Очевидно, что мтДНК гаплогруппы X коренных американцев произошли от X2 в результате уникальной комбинации пяти мутаций. Примечательно, что X2 включает две полные последовательности X коренных американцев, которые составляют отличительную кладу X2a, кладу, которой не хватает близких родственников во всем Старом Свете, включая Сибирь. Положение X2a в филогенетическом дереве предполагает раннее отделение от других клад X2, вероятно, в самом начале их экспансии и распространения с Ближнего Востока к северо-востоку от Алтая, последовательности гаплогруппы X были обнаружены у тунгусоязычных эвенков, бассейна Подкаменной Тунгуски (Средняя Сибирь). В отличие от алтайцев, у эвенков не было никаких западно-евразийских гаплогрупп мтДНК, кроме X. Однако ни один из двух гаплотипов X эвенков не обнаружил мутаций, характерных для клады X2a коренных американцев. Вместо этого одна последовательность была членом X2b, а другая - X2. Таким образом, один из возможных сценариев состоит в том, что несколько гаплотипов X прибыли в Сибирь из Западной Азии во время палеолита, но только X2a пересекли Берингию и выжили у современных коренных американцев.
  18. ^ «Североатлантический коридор кромки льда: возможный путь палеолита в Новый Свет». Брюс Брэдли и Деннис Стэнфорд. Мировая археология 2004 Vol. 36 (4): 459–478. http://planet.uwc.ac.za/nisl/Conservation%20Biology/Karen%20PDF/Clovis/Bradley%20&%20Stanford%202004.pdf
  19. ↑ Кэри, Бьорн (19 февраля 2006 г.). "Первые американцы могли быть европейцами . Наука о жизни . Проверено 10 августа 2007 года.
  20. ^ "Наши результаты убедительно подтверждают гипотезу о том, что гаплогруппа X вместе с другими четырьмя основными гаплогруппами мтДНК была частью генофонда одного коренного населения Америки; поэтому они не поддерживают модели, которые предлагают независимые от гаплогрупп миграции миграции, такие как миграция из Европы, выдвинутая гипотезой солютриана ... Здесь мы показываем, используя 86 полных митохондриальных геномов, что все гаплогруппы коренных американцев, включая гаплогруппу X, были частью единой популяции, тем самым опровергая модели множественной миграции ". (Фагундес и др., 2008 г.)
  21. ^ «Сходство в возрасте и географическом распределении C4c и ранее проанализированной линии X2a подтверждает сценарий двойного происхождения палеоиндейцев. Принимая во внимание, что C4c глубоко укоренен в азиатской части филогении мтДНК и несомненно азиатского происхождения, открытие того, что C4c и X2a характеризуются параллельной генетической историей, окончательно опровергает противоречивую гипотезу о маршруте входа атлантического ледника в Северную Америку. Hooshiar Kashani B, Perego UA, Olivieri A, Angerhofer N, Gandini F, Carossa V, Lancioni H, O Semino, Woodward SR, Achilli A, Torroni A (январь 2012) "митохондриальная гаплогруппа C4c: редкий род ввод Америки через безледовый коридор".. Американский журнал физической антропологии . 147(1): 35–39. DOI : 10.1002 / ajpa.21614 . PMID  22024980 .
  22. ^ X2a датирован12,8+7,1
    −6,7     kya     в Soares et al. (2009).
  23. ^ «X2a не был обнаружен нигде в Евразии, и филогеография не дает нам веских оснований полагать, что он скорее из Европы, чем из Сибири. Кроме того, анализ полного генома человека Кенневика, который принадлежит к самой основной линии. X2a еще не идентифицирован, не указывает на недавнее европейское происхождение и перемещает расположение самой глубокой ветви X2a на западное побережье, что согласуется с принадлежностью X2a к той же предковой популяции, что и другие митохондриальные гаплогруппы-основатели. Также нет никаких исследований с высоким разрешением полногеномных данных индейского населения дали какие-либо доказательства европейского происхождения плейстоцена или трансатлантического потока генов ». Рафф, Дженнифер А .; Болник, Дебора А (2015).«Указывает ли митохондриальная гаплогруппа X на древнюю трансатлантическую миграцию в Америку? Критическая переоценка» . ПалеоАмерика . 1 (4): 297–304. DOI : 10.1179 / 2055556315Z.00000000040 .

Внешние ссылки [ править ]

  • Общий
    • Манниса ван Овена - поддерево мтДНК N
  • Гаплогруппа X
    • Наличие митохондриальной гаплогруппы X у алтайцев из Южной Сибири Мирослава В. Деренко, Томаш Гржибовский и другие
    • Сайт ДНК Яна Логана
    • Проект мтДНК X Кэролайн Бенсон в Family Tree DNA
    • Распространение гаплогруппы X от National Geographic
    • CBC, The Solutrean Hypothesis, и Jennifer Raff, Подкаст с обсуждением Jennifer Raff в 2018 году утверждает, что гаплогруппа X связана с Solutrean гипотезой

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Ribetio-dos-Santos AK, Santos SE, Machado AL, Guapindaia V, Zago MA (сентябрь 1996 года). «Неоднородность гаплотипов митохондриальной ДНК в доколумбовых аборигенах региона Амазонки». Американский журнал физической антропологии . 101 (1): 29–37. DOI : 10.1002 / (SICI) 1096-8644 (199609) 101: 1 <29 :: AID-AJPA3> 3.0.CO; 2-8 . PMID  8876812 .
  • Питер Н. Джонс (2004). МтДНК американских индейцев, генетические данные Y-хромосомы и население Северной Америки . Боулдер: Bauu Press. ISBN 978-0-9721349-1-0. Архивировано из оригинального 27 сентября 2007 года.
  • Истон Р.Д., Мерриуэзер Д.А., Крюс Д.Р., Феррелл Р.Э. (июль 1996 г.). «Вариация мтДНК у яномами: свидетельства дополнительных основополагающих линий Нового Света» . Американский журнал генетики человека . 59 (1): 213–225. PMC  1915132 . PMID  8659527 .
  • Браун, доктор медицины, Хоссейни С.Х., Торрони А., Бандельт Х.Дж., Аллен Дж.С., Шурр Т.Г., Скоццари Р., Крусиани Ф., Уоллес, округ Колумбия (декабрь 1998 г.). "Гаплогруппа X мтДНК: древняя связь между Европой / Западной Азией и Северной Америкой?" . Американский журнал генетики человека . 63 (6): 1852–1861. DOI : 10.1086 / 302155 . PMC  1377656 . PMID  9837837 .
  • Смит Д.Г., Малхи Р.С., Эшлеман Дж., Лоренц Дж. Г., Кестле Ф.А. (ноябрь 1999 г.). «Распределение гаплогруппы X мтДНК среди коренных жителей Северной Америки». Американский журнал физической антропологии . 110 (3): 271–284. DOI : 10.1002 / (SICI) 1096-8644 (199911) 110: 3 <271 :: AID-AJPA2> 3.0.CO; 2-C . PMID  10516561 .
  • Захаров И.А., Деренко М.В., Малярчук Б.А., Дамбуева И.К., Доржу С.М., Рычков С.Ю. (апрель 2004 г.). «Вариации митохондриальной ДНК в аборигенных популяциях Алтае-Байкальского региона: значение для генетической истории Северной Азии и Америки». Летопись Нью-Йоркской академии наук . 1011 (1): 21–35. Bibcode : 2004NYASA1011 ... 21Z . DOI : 10.1196 / annals.1293.003 . PMID  15126280 .