Из Википедии, бесплатной энциклопедии
  (Перенаправлен с вируса гепатита Е )
Перейти к навигации Перейти к поиску
Ортогепевирус А
ПЭМ-микрофотография вирионов "Orthohepevirus A"
ПЭМ микрофотография из Orthohepevirus A вирионов
Классификация вирусов е
(без рейтинга):Вирус
Царство :Рибовирия
Королевство:Орторнавиры
Тип:Kitrinoviricota
Учебный класс:Alsuviricetes
Заказ:Hepelivirales
Семья:Hepeviridae
Род:Ортогепевирус
Разновидность:
Ортогепевирус А
Синонимы [1]
  • Вирус гепатита Е

Вирус гепатита Е ( HEV ) является возбудителем гепатита Е . Это вид Orthohepevirus A. [a] [2] [1]

Глобальное бремя инфекций от двух основных генотипов (1 и 2) оценивается в 20 миллионов в год, что приводит к 70 000 смертей и 3 000 мертворождений. [3]

Вирусная частица была впервые обнаружена в 1983 г. [4], но была клонирована только на молекулярном уровне в 1989 г. [5]

Геном и протеом [ править ]

Ортогепевирус A можно разделить на восемь различных генотипов из разных географических регионов: генотип 1 (Азия), генотип 2 (Африка и Мексика), генотип 3 (Европа и Северная Америка), генотип 4 (Азия); генотипы 5 и 6 были обнаружены у азиатских кабанов, а генотипы 7 и 8 - у верблюдов. [2] [6]

Вирусный геном представляет собой одну цепь положительно-смысловой РНК, которая имеет длину около 7200 оснований. Три открытые рамки считывания (ORF1, ORF2 и ORF3) кодируют три белка (O1, O2, O3), два из которых являются полипротеинами, то есть расщепляются на фрагменты, которые выполняют фактические функции вируса (см. фигура). О1 белок состоит из семи таких фрагментов, а именно Меты (метилтрансферазы), Y (Y-домен), Plp (папаин , как протеаза), V (пролин-богатого вариабельной области), Х (Х-домен, макро-домен), Hel (геликаза) и Rdrp (РНК-зависимая РНК-полимераза). PVXдомен представляет собой гибридный белок, состоящий из доменов Plp, V и X. О3 белок , кодируемый одной открытой рамки считывания-(orf3). О2 белок кодирует капсид, который состоит из трех доменов, а именно домен оболочки ( S ) и два выступающих доменов ( Р1 , Р2 ). [7] Цифры на рисунке указывают положения в последовательности РНК.

Геном ортогепевируса А и кодируемые белки

Интерактом [ править ]

Белок-белковый интерактом между белками Orthohepevirus A был картирован Osterman et al. (2015), которые обнаружили 25 взаимодействий между 10 изученными белками. Практически все (24) из этих взаимодействий были признаны «качественными». [8]

Структура [ править ]

Вирусные частицы имеют диаметр от 27 до 34 нанометров и не покрыты оболочкой. [2] [4]

Таксономия [ править ]

Ранее он был отнесен к семейству Caliciviridae . Однако его геном больше напоминает вирус краснухи . В настоящее время он классифицируется как представитель рода Orthohepevirus семейства Hepeviridae . [2]

Эволюция [ править ]

Штаммы HEV, которые существуют сегодня, возможно, произошли от общего предка вируса 536–1344 лет назад. [9] Другой анализ датировал происхождение гепатита E ~ 6000 лет назад, с предположением, что это было связано с одомашниванием свиней. [10] В какой-то момент две клады, возможно, разошлись - антропотропная форма и энзоотическая форма - которые впоследствии эволюционировали в генотипы 1 и 2 и генотипы 3 и 4 соответственно. [11]

В то время как генотип 2 по-прежнему обнаруживается реже, чем другие генотипы, генетический эволюционный анализ показывает, что генотипы 1, 3 и 4 значительно распространились за последние 100 лет. [12]

См. Также [ править ]

  • Гепатит А
  • Гепатит B ( вирус гепатита B )
  • Гепатит С ( вирус гепатита С )
  • Гепатит D
  • Гепатит E

Заметки [ править ]

  1. ^ Первое название вида был вирус гепатита Е . [1]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c Purdy, Майкл А .; и другие. (Июнь 2014 г.). «Новая схема классификации Hepeviridae » (PDF) . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) . Дата обращения 1 мая 2019 . Видов вируса гепатита Е будет переименован Orthohepevirus , а также виды вируса гепатита Е Птичий будет переименован Orthohepevirus Б .
  2. ^ a b c d "Отчет ICTV Online (10-е)" .
  3. ^ Rein, DB, Stevens, GA, Theaker, J., Wittenborn, JS & Wiersma, ST (2012) Глобальное бремя генотипов 1 и 2 вируса гепатита Е в 2005 г. Гепатология 55, 988–97
  4. ^ а б Балаян М.С., Анджапаридзе А.Г., Савинская С.С. и др. (1983). «Доказательства наличия вируса гепатита не-А и не-В, передаваемого фекально-оральным путем». Интервирология . 20 (1): 23–31. DOI : 10.1159 / 000149370 . PMID 6409836 . 
  5. ^ Reyes GR, Purdy MA, Kim JP и др. (1990). «Выделение кДНК из вируса, ответственного за кишечно передаваемый гепатит не-A, не-B». Наука . 247 (4948): 1335–9. Bibcode : 1990Sci ... 247.1335R . DOI : 10.1126 / science.2107574 . PMID 2107574 . 
  6. ^ Schlauder, GG & Mushahwar, IK (2001) Генетическая гетерогенность вируса гепатита E. J Med Virol 65, 282–92.
  7. Перейти ↑ Ahmad I, Holla RP, Jameel S (2011). «Молекулярная вирусология вируса гепатита Е» . Virus Res . 161 (1): 47–58. DOI : 10.1016 / j.virusres.2011.02.011 . PMC 3130092 . PMID 21345356 .  
  8. ^ Остерман А, Stellberger Т, Джебхардт А, М Kurz, Фриделя CC, Uetz Р, Nitschko Н, Baiker А, Vizoso-Pinto MG (2015). «Интравирусный интерактом вируса гепатита Е» . Sci Rep . 5 : 13872. Bibcode : 2015NatSR ... 513872O . DOI : 10.1038 / srep13872 . PMC 4604457 . PMID 26463011 .  
  9. ^ Худяков, Юрий Е .; Парди, Майкл А. (17 декабря 2010 г.). «Эволюционная история и популяционная динамика вируса гепатита Е» . PLOS ONE . 5 (12): e14376. Bibcode : 2010PLoSO ... 514376P . DOI : 10.1371 / journal.pone.0014376 . ISSN 1932-6203 . PMC 3006657 . PMID 21203540 .   
  10. ^ Баха, Сарра; Бехлул, Нуредин; Лю, Чжэньчжэнь; Вэй, Вэньцзюань; Ши, Руйхуа; Мэн, Цзихун (2019-10-29). «Комплексный анализ генетических и эволюционных особенностей вируса гепатита Е» . BMC Genomics . 20 (1): 790. DOI : 10,1186 / s12864-019-6100-8 . ISSN 1471-2164 . PMID 31664890 .  
  11. ^ Mirazo S, Мир D, G Белло, Рамос Н, Мусто Н, Arbiza J (2016). «Новые взгляды на филодинамику и историю эволюции вируса гепатита Е генотипа 3». Заразить Genet Evol . 43 : 267–73. DOI : 10.1016 / j.meegid.2016.06.003 . PMID 27264728 . CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
  12. ^ Изопет Дж, Абраванель Ф, Далтон Х, Нассим Р.К. (2014) Инфекция вируса гепатита Е. Clin Micro Обзоры 27 (1) 116–138

Внешние ссылки [ править ]

  • «Hepeviridae - Hepeviridae - вирусы с положительной РНК» .
  • Вирус гепатита + E + по медицинским предметным рубрикам Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)
  • «База данных вирусных патогенов и ресурс для анализа (ViPR) - Hepeviridae - База данных генома с инструментами визуализации и анализа» .