Джозеф Лайман ДеРизи - американский биохимик , специализирующийся на молекулярной биологии , паразитологии , геномике , вирусологии и вычислительной биологии .
Джозеф ДеРизи | |
---|---|
Национальность | Американец |
Альма-матер | Стэнфордский университет , Калифорнийский университет, Санта-Крус |
Известен | ViroChip, работа по идентификации вируса SARS , экспрессия гена в Plasmodium falciparum |
Научная карьера | |
Поля | Биология |
Учреждения | Калифорнийский университет, Сан-Франциско Медицинский институт Говарда Хьюза |
Тезис | Анализ экспрессии полногеномных генов у почкующихся дрожжей Saccharomyces cerevisiae . (1999) |
Докторант | Патрик О. Браун |
Жизнь
Он получил степень бакалавра биохимии и молекулярной биологии (1992) в Калифорнийском университете в Санта-Крус и докторскую степень. Доктор биохимии (1999) Стэнфордского университета .
Джозеф Деризи является сопредседателем Чан Цукерберг Biohub и председателем Отдела биохимии и биофизики в Университете Калифорнии, Сан - Франциско (UCSF) при совместном назначении в Калифорнийском институте количественного Biosciences (QB3). [1] [2] Он бывший следователь Медицинского института Говарда Хьюза (HHMI).
Наиболее известные достижения DeRisi в печати первого весь массива экспрессии генома , [3] выполнение первого широкого анализа дифференциальной экспрессии генов в раковых клетках, [4] профилирование экспрессии генов на протяжении всего жизненного цикла малярии -causing простейших плазмодия фальципарума , [5 ] его открытие вируса атипичной пневмонии [6] и новаторское открытие вируса с использованием массива гибридизации генов и технологий секвенирования ДНК. [7]
ДеРизи широко использует микроматрицы в своей работе, а также разработал и построил как аппаратное, так и программное обеспечение для микрочипов. Он является сторонником открытого доступа к технологии микрочипов, [ цитата необходима ] и поддерживает веб-сайт с программным обеспечением и протоколами для операций с микрочипами. [ необходима цитата ] Он также является сторонником публикации в открытом доступе , [ необходима цитата ] и имеет публикации в журналах Публичной научной библиотеки . [8]
ДеРизи идентифицировал предполагаемые болезнетворные вирусы у людей (рак, атипичная пневмония , другие респираторные инфекции, паранеопластический энцефалит и т. Д.), А также у животных, от попугаев и корелл до медоносных пчел и удавов. [9] Он и его партнер по исследованиям Дон Ганем определили паразита, Nosema ceranae , который, по-видимому, ответственен за разрушение колоний среди медоносных пчел. [10] Он также развенчал связь вирусов с определенными подгруппами рака человека. [11]
Возможно, наиболее актуально для современного глобального здравоохранения, основываясь на обширной характеристике возбудителя малярии Plasmodium falciparum , группа ДеРизи разработала многообещающие лекарства-кандидаты для лечения малярии. [12]
В 2004 году ДеРизи был назван стипендиатом Макартура (награда «Гений»), в 2008 году был удостоен 14-й ежегодной премии Хайнца в области технологий, экономики и занятости, в 2013 году был избран членом Калифорнийской академии наук и Академии Американского общества микробиологии, а в 2014 году он получил премию Джона Дж. Карти за развитие науки от Национальной академии наук . [13] [14] В 2015 году он был избран членом Американской академии искусств и наук , а в 2016 году был избран членом Национальной академии наук и Национальной академии медицины . [15] [16]
Он участвовал в разработке ViroChip, который используется для быстрой идентификации вирусов в жидкостях организма. Он был использован для идентификации вируса тяжелого острого респираторного синдрома в 2003 году. Он также принимал участие в разработке онлайн-платформы под названием IDseq [17], поддерживаемой Chan Zuckerberg Initiative и Chan Zuckerberg Biohub, которая используется для идентификации вирусов. из данных метагеномного секвенирования . [18] [19]
В 2020 году, во время пандемии COVID-19 , ДеРизи возглавил команду, которая за восемь дней превратила пустое лабораторное пространство рядом с CZ Biohub в сертифицированный CLIA центр для тестирования COVID-19 . CLIAhub стал одним из ведущих национальных центров тестирования на COVID-19, обрабатывая тысячи тестов в день и становясь образцом для страны. [20] [21] [22] [23] [24]
В то же время ДеРизи стал активным сторонником разработки национальной системы эпиднадзора за COVID-19 для выявления и мониторинга мутаций вируса COVID-19. [25] [26] [23]
Награды
- 2001 Сирлская стипендиальная премия, Программа стипендиатов Сирла , Нортбрук, Иллинойс
- 2001 Премия JP Morgan Chase Health Award, Технический музей инноваций, Сан-Хосе, Калифорния
- 2002 Гордон Томкинс Кафедра биохимии и биофизики, Калифорнийский университет, Сан-Франциско
- Стипендия Паккарда для науки и техники 2003 г., Фонд Дэвида и Люсиль Паккард , Лос-Альтос, Калифорния
- Стипендия Макартуров 2004 г., Фонд Джона Д. и Кэтрин Т. Макартуров , Чикаго, Иллинойс
- 2004 Wired RAVE Award, Здоровье и медицина, журнал WIRED , Сан-Франциско, Калифорния
- 2005 Награда за научные достижения BayBio, BayBio, Сан-Франциско, Калифорния
- Награда за достижения выпускникам 2006 г., Калифорнийский университет, Санта-Крус , Санта-Крус, Калифорния
- 2007 Премия науки Шабо, Космический и научный центр Шабо , Окленд, Калифорния
- 2008 14-я ежегодная премия Хайнца в области технологий, экономики и занятости, Питтсбург, Пенсильвания.
Рекомендации
- Рианна Керр, Дара (21 сентября 2016 г.). «Инициатива Чана Цукерберга инвестирует 3 миллиарда долларов в лечение всех болезней» . cnet.com . Проверено 1 мая 2021 года .
- ^ Геррити, Эшли (22 сентября 2016 г.). «Калифорнийский университет в Беркли будет сотрудничать с UCSF, Стэнфорд в Chan Zuckerberg Biohub» . dailycal.org . Проверено 1 мая 2021 года .
- ^ DeRisi, JL; Айер, ВР; Браун, ПО (1997). «Изучение метаболического и генетического контроля экспрессии генов в геномном масштабе». Наука . 278 (5338): 680–6. Bibcode : 1997Sci ... 278..680D . CiteSeerX 10.1.1.335.7937 . DOI : 10.1126 / science.278.5338.680 . PMID 9381177 .
- ^ DeRisi, J; Penland, L; Браун, ПО; Биттнер, ML; Мельцер, ПС; Рэй, М; Чен, Y; Вс, Ю.А.; Трент, Дж. М. (1996). «Использование микроматрицы кДНК для анализа паттернов экспрессии генов при раке человека». Нат Жене . 14 (4): 457–60. DOI : 10.1038 / ng1296-457 . PMID 8944026 . S2CID 23091561 .
- ^ Ллинас, Мануэль; Боздеч, Збынек; Вонг, Эдит Д .; Адай, Алекс Т .; Derisi, Джозеф Л. (2006), "Сравнительный анализ генома всего транскрипт три малярийных плазмодий штаммы", Nucleic Acids Research , 34 (4): 1166-73, DOI : 10,1093 / NAR / gkj517 , PMC 1380255 , PMID 16493140
- ^ Rota, Paul A .; Оберсте, М. Стивен; Монро, Стефан С .; Никс, У. Аллан; Кампаньоли, Рэй; Icenogle, Joseph P .; Пеньяранда, Сильвия; Банкамп, Беттина; Махер, Кайджа; Беллини, Уильям Дж. (2003), «Характеристика нового коронавируса, связанного с тяжелым острым респираторным синдромом», Science , 300 (5624): 1394–9, Bibcode : 2003Sci ... 300.1394R , doi : 10.1126 / science.1085952 , PMID 12730500
- ^ Wang, D; Coscoy, L; Зильберберг, М; Авила, ПК; Boushey, HA; Ganem, D; ДеРизи, JL (2002). «Обнаружение и генотипирование вирусных патогенов на основе микрочипов» . Proc Natl Acad Sci USA . 99 (24): 15687–92. Bibcode : 2002PNAS ... 9915687W . DOI : 10.1073 / pnas.242579699 . PMC 137777 . PMID 12429852 .
- ^ Боздеч, Збынек; Ллинас, Мануэль; Пуллиам, Брайан Ли; Вонг, Эдит Д .; Чжу, Цзинчунь; Деризи, Джозеф Л. (2003), «Транскриптом внутриэритроцитарного цикла развития Plasmodium falciparum», PLOS Biology , 1 (1): e5, doi : 10.1371 / journal.pbio.0000005 , PMC 176545 , PMID 12929205
- ^ Дубей, Дивяншу; Мандель-Брем, Кейли (4 июля 2019 г.). "Кельч-подобные антитела к белку 11 в связанном с семиномой паранеопластическом энцефалите" . Медицинский журнал Новой Англии . 381 (1): 47–54. DOI : 10.1056 / NEJMoa1816721 . PMC 6800027 . PMID 31269365 .
- ^ «Сыщики UCSF идентифицируют подозреваемых в тайне исчезновения пчел» .
- ^ Алдай, Эрин (15 июля 2019 г.). «Открытие редкого заболевания: антитела, борющиеся с раком, продолжают атаковать мозг» . sfchronicle.com . Проверено 1 мая 2021 года .
- ^ Хименес-Диас, Мария; Эберт, Дэниел (1 декабря 2014 г.). «(+) - SJ733, клинический кандидат от малярии, который действует через АТФ4, вызывая быстрое опосредованное хозяином клиренс Plasmodium» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 111 (50): E5455-62. DOI : 10.1073 / pnas.1414221111 . PMC 4273362 . PMID 25453091 . Проверено 3 мая 2021 года .
- ^ «Калифорнийская академия наук приветствует новых стипендиатов, награждает ежегодными наградами» . calacademy.org . 4 октября 2013 . Проверено 1 мая 2021 года .
- ^ «65 стипендиатов, избранных в Американскую академию микробиологии» . asm.org . 16 февраля 2021 . Проверено 1 мая 2021 года .
- ^ Национальная академия наук и члены иностранных Партнеров Избранная , Новости из Национальной академии наук, Национальная академии наук , 3 мая 2016 года, архив с оригинала на 6 мая 2016 года , восстановлена 2016-05-14.
- ^ Бай, Нина (17 октября 2016 г.). «3 факультета UCSF избраны в Национальную медицинскую академию на 2016 год» . ucsf.edu . Проверено 1 мая 2021 года .
- ^ Калантар, Катрина Л; Карвалью, Тьяго; де Бурси, Шарль Ф.А.; Димитров, Борис; Дингл, Грег; Эггер, Ребекка; Хан, Джули; Холмс, Оливия Б; Хуан, Юнь-Фан; Кинг, Райан; Кислюк, Андрей (октябрь 2020). «IDseq - облачный конвейер с открытым исходным кодом и служба анализа для обнаружения и мониторинга метагеномных патогенов» . GigaScience . 9 (10). DOI : 10,1093 / gigascience / giaa111 . ISSN 2047-217X . PMC 7566497 . PMID 33057676 .
- ^ «Более простой способ разобраться с загадочными болезнями в бедных странах» . Атлантический океан. 16 октября 2018 . Проверено 27 ноября 2018 года .
- ^ Мастерсон, Кэтлин (22 апреля 2015 г.). «4 преподавателя UCSF избраны в класс Американской академии искусств и наук 2015 года» . ucsf.edu . Проверено 1 мая 2021 года .
- ^ «Модель для нации: создание лаборатории тестирования на COVID-19 всего за восемь дней» . chanzuckerberg.com . 21 октября 2020 года . Проверено 1 мая 2021 года .
- ^ Льюис, Майкл (16 апреля 2020 г.). «Лаборатория тестирования Covid, которая могла бы спасти Америку» . bloomberg.com . Проверено 1 мая 2021 года .
- ^ Льюис, Майкл (8 мая 2020 г.). «Вооруженные мазками, охотники на ковидов преследуют свою добычу» . bloomberg.com . Проверено 1 мая 2021 года .
- ^ а б Льюис, Майкл (21 июня 2020 г.). «Новое оружие в войне против Covid-19» . bloomberg.com . Проверено 1 мая 2021 года .
- ^ Льюис, Майкл (7 апреля 2020 г.). «В Беркли охотятся на туалетную бумагу и уворачиваются от туристов» . bloomberg.com . Проверено 1 мая 2021 года .
- ^ Данн, Лорен (8 января 2021 г.). «По мере того, как британский вариант распространяется в США, ученые предупреждают, что страна не делает достаточно для отслеживания штаммов Covid» . NBCNews.com . Проверено 1 мая 2021 года .
- ^ Алдай, Эрин (23 января 2021 г.). «Внутренняя история того, как был обнаружен вариант коронавируса в районе залива» . sfchronicle.com . Проверено 1 мая 2021 года .
Внешние ссылки
- DeRisi Lab
- Джозеф ДеРизи, доктор философии , биография на сайте Медицинского института Говарда Хьюза
- microarrays.org ( Интернет-архивная копия)
- Joseph L. DeRisi , профиль на Searle Ученые программы сайта
- Tech Awards, лауреат премии в области здравоохранения 2001 г., Джозеф Л. ДеРизи
- Стипендия Packard для науки и техники
- Объявление стипендиатов MacArthur 2004 г.
- 2004 Wired RAVE Awards
- Пантеон BayBio
- Награды выпускников за достижения
- Премия науки Шабо 2007 г.
- Награды Heinz Awards, профиль Джозефа ДеРизи
- Джо ДеРизи решает медицинские загадки , доклад TED