Киммен Сьоландер (урожденная Варноу) — почетный профессор Калифорнийского университета в Беркли на кафедре биоинженерии. Она хорошо известна своей работой по анализу белковых последовательностей .
Шоландер работала как в бакалавриате, так и в аспирантуре Калифорнийского университета в Санта-Крус на факультете компьютерных наук, получив степень бакалавра в 1993 году и докторскую степень в 1997 году под руководством Дэвида Хаусслера . [1] Она была главным научным сотрудником группы молекулярных приложений с 1997 по 1999 год (компания, соучредителем которой является Майкл Левитт ), а затем главным научным сотрудником по белковой информатике в Celera Genomics с 1999 по 2001 год, где она была членом команды ( вместе с Дж. Крейгом Вентером и Джином Майерсом ), которые собрали и аннотировали геном человека. [2] Она присоединилась к факультету Калифорнийского университета в Беркли на кафедре биоинженерии в 2001 году в качестве доцента. В 2006 г. она была назначена на должность, а в 2012 г. получила звание профессора. [1]
Шоландер получил премию NSF CAREER Award [1] и президентскую премию за раннюю карьеру для ученых и инженеров в 2003 году. [3]
Шоландер наиболее известна своей работой в области филогеномных методов анализа последовательности белков, включая методы машинного обучения для прогнозирования функциональных сайтов и идентификации ортологов, а также методы скрытой марковской модели (HMM) для прогнозирования структуры белка, классификации функциональных подсемейств и ортологов, удаленного обнаружения гомологии. , множественное выравнивание последовательностей и оценка филогенетического дерева. Ее алгоритмы использовались в функциональной аннотации генома человека в Celera Genomics , в базах данных и порталах биоинформатики PhyloFacts, а также внесены в базу данных ModBase .