ModBase - это база данных аннотированных моделей сравнительной структуры белков , содержащая модели для более чем 3,8 миллиона уникальных последовательностей белков. [1] Модели создаются конвейером сравнительного моделирования ModPipe, который полагается на программу MODELLER .
Содержание | |
---|---|
Описание | База данных сравнительных моделей структуры белков |
Контакт | |
Исследовательский центр | Калифорнийский университет в Сан-Франциско |
Лаборатория | Кафедра биоинженерии и терапевтических наук |
Авторы | Урсула Пипер, Эсвар Нараянан, Бен Уэбб, Андрей Сали |
Первичное цитирование | Пайпер и др. (2011) [1] |
Дата выпуска | 1998 г. |
Доступ | |
Веб-сайт | http://salilab.org/modbase |
Скачать URL | ftp://salilab.org/databases/modbase |
URL-адрес веб-службы | http://salilab.org/modweb |
ModBase разработан в лаборатории Андрея Сали в UCSF . Модели ModBase также доступны через Портал моделей белков .
Смотрите также
Рекомендации
- ^ a b Пайпер, Урсула; Уэбб Бенджамин М; Баркан Дэвид Т; Шнейдман-Духовны Дина; Шлессингер Авнер; Браберг Ханнес; Ян Чжэн; Meng Elaine C; Петтерсен Эрик Ф; Хуанг Конрад C; Датта Ручира S; Сампаткумар Партхасарати; Мадхусудхан Маллур S; Сьоландер Киммен; Феррин Томас Э; Берли Стивен К.; Сали Андрей (январь 2011 г.). «ModBase, база данных аннотированных моделей сравнительной структуры белков и связанных ресурсов» . Nucleic Acids Res . Англия. 39 (выпуск базы данных): D465-74. DOI : 10.1093 / NAR / gkq1091 . PMC 3013688 . PMID 21097780 .