Андрей Шали | |
|---|---|
 Шали выступает на ISMB 2012. | |
| Родившийся | 1963 (57–58 лет) |
| Альма-матер | Биркбек-колледж, Лондонский университет |
| Научная карьера | |
| Учреждения | Калифорнийский университет, Сан-Франциско, Гарвардский университет, Рокфеллеровский университет, Биркбекский колледж, Лондонский университет, Университет Любляны |
| Тезис | Моделирование трехмерной структуры белка по его аминокислотной последовательности (1991) |
| Докторант | Том Бланделл |
| Известные студенты | Илья Ваксер Роберто Санчес Андрас Фисер Бино Джон Майя Топф Франсиско Мело М.С. Мадхусудхан Франк Альбер Рэйчел Карчин Дмитрий Коркин Дэвид Баркан |
| Интернет сайт | www |
Андрей Шали (род. 1963, Крань, Словения ) - вычислительный структурный биолог . С 2003 года он был профессором кафедры биоинженерии и терапевтических наук Калифорнийского университета в Сан-Франциско. [1] Он также является редактором журнала « Структура» .
Образование [ править ]
Шали получил степень бакалавра химии в Люблянском университете в 1987 году; его докторская степень. в молекулярной биофизики из Биркбекского колледжа , [2] Лондонский университет , 1991 (работа с Томом Бланделла ); и работал с докторской степенью в Гарвардском университете (работая с Мартином Карплюсом ).
Исследование [ править ]
Сали присоединился к преподавательскому составу Университета Рокфеллера в 1995 году после его докторской диссертации в Гарвардском университете . Он использует вычисления, основанные на законах физики и эволюции, для изучения структуры и функций белков. Например, он разработал сравнительное моделирование структуры белков путем удовлетворения пространственных ограничений, реализованное в программе MODELLER [3], и интегративное определение структуры макромолекулярных ансамблей, реализованное в программе IMP. [4]
Влияние исследования [ править ]
Сали вносит большой вклад в структурную биологию, разрабатывая и применяя вычислительные методы для структурного моделирования и анализа белков. Две наиболее часто используемые программы, разработанные его исследовательской группой, включают «MODELLER» для сравнительного моделирования структуры белков и «IMP» для определения интегральной структуры.
По состоянию на июнь 2017 года Шали опубликовал около 370 статей [5], которые цитировались примерно 56 000 раз в Google Scholar. Его индекс Хирша - 104 (т. Е. 104 публикации были процитированы как минимум 104 раза).
В 2018 году Шали был избран членом Национальной академии наук в знак признания его вклада в биофизику и вычислительную биологию. [6]
Известные выпускники лаборатории Шали [ править ]
| Имя | Положение лаборатории | Продолжительность | Текущее местоположение | Текущая позиция |
|---|---|---|---|---|
| Фрэнк Альбер | Сотрудник докторантуры | Калифорнийский университет, Лос-Анджелес, Калифорния, США | Профессор | |
| Андрас Фисер | Сотрудник докторантуры | Сентябрь 1997 г. - декабрь 2002 г. | Медицинский колледж Альберта Эйнштейна, Бронкс, Нью-Йорк | Профессор |
| Рэйчел Карчин | Сотрудник докторантуры | С августа 2003 г. по август 2006 г. | Университет Джона Хопкинса | Доцент |
| Марк А. Марти-Реном | Сотрудник докторантуры Адъюнкт-профессор | С февраля 1999 г. по июнь 2006 г. | Национальный центр геномного анализа (CNAG), Барселона, Испания | Лидер группы |
| М.С. Мадхусудхан | Докторант | С февраля 2000 г. по март 2008 г. | IISER, Пуна, Индия | Доцент |
| Дэвид Баркан | Кандидат наук. Ученик | Сентябрь 2006 г. - октябрь 2011 г. | Protagonist Therapeutics | Научный сотрудник |
Ссылки [ править ]
- ^ Список публикаций из Microsoft Academic
- ^ Сали, Андрей (1984). Моделирование трехмерной структуры белка по его аминокислотной последовательности (кандидатская диссертация). Лондон, Биркбек-колледж.
- ^ Šali, A .; Бланделл, Т.Л. (1993). "Сравнительное моделирование белков удовлетворением пространственных ограничений". Журнал молекулярной биологии . 234 (3): 779–815. DOI : 10.1006 / jmbi.1993.1626 . PMID 8254673 .
- ^ Рассел, Д .; Lasker, K .; Webb, B .; Velázquez-Muriel, J .; Tjioe, E .; Шнейдман-Духовны, Д .; Петерсон, Б .; Сали, А. (2012). «Собираем части вместе: программное обеспечение платформы интегративного моделирования для определения структуры макромолекулярных сборок» . PLOS Биология . 10 (1): e1001244. DOI : 10.1371 / journal.pbio.1001244 . PMC 3260315 . PMID 22272186 .
- ^ Андрей Сали в Publications
- ^ "Андрей Сали" . Национальная академия наук . Проверено 23 июля 2018 .
Внешние ссылки [ править ]
- Домашняя страница лаборатории Шали
