Kobuvirus - это род вирусов отряда Picornavirales в семействе Picornaviridae . Человек и крупный рогатый скот служат естественными хозяевами. Естьнастоящее время шести видов в этом родевключая вид типа Aichivirus А . Заболевания, связанные с этим видом, включают: гастроэнтерит . [1] [2] Род был назван из-за бугристого вида вирусных частиц при электронной микроскопии; «кобу» в переводе с японского означает «ручка». [3]
Кобувирус | |
---|---|
Классификация вирусов | |
(без рейтинга): | Вирус |
Царство : | Рибовирия |
Королевство: | Орторнавиры |
Тип: | Писувирикота |
Класс: | Pisoniviricetes |
Заказ: | Пикорнавиралес |
Семья: | Picornaviridae |
Род: | Кобувирус |
Типовой вид | |
Айтивирус А |
Три вида этого рода включают Aichivirus A (ранее вирус Aichi ), Aichivirus B (ранее Bovine kobuvirus ) и Aichivirus C (ранее Porcine kobuvirus ), каждый из которых обладает одним серотипом . Собачий kobuvirus принадлежат к виду Aichivirus А . [4] Вирус айти инфицирует людей, [5] [6] в то время как бычий кобувирус, [7] свиной кобувирус [8] [9] и собачий кобувирус, судя по их названиям, заражают рогатый скот, свиней, собак и кошек.
В 2014 году новый кобувирус козлов был охарактеризован после выделения от корейской черной козы. [10]
Анализ последовательности нуклеиновых кислот и ОТ-ПЦР в основном используются в качестве методов обнаружения и генотипирования кобувируса, хотя существуют и другие методы, такие как EM и ELISA. [11]
Частицы вируса
Вирусы в Kobuvirus не имеют оболочки, имеют икосаэдрическую и сферическую геометрию и T = псевдо3-симметрию. Диаметр около 30 нм. Геномы бывают линейными и несегментированными, длиной около 8,25 килобайт. [1] Молекулярная масса типичной вирионной частицы этого рода обычно составляет от восьми до девяти миллионов. Вирионы вирусов этого рода состоят из капсидов диаметром от 27 до 30 нм. [5] Капсид, как полагают, состоит из 12 капсомеров, и структура оболочки капсида этих вирионов имеет однослойный состав. [5] Используя обычную электронную микроскопию, можно визуализировать структуру поверхности капсида. [5] [6] Вирусные частицы содержат один вид оцРНК. Эти вирионы имеют коэффициент седиментации 140–165 S20w. Описано, что частицы являются «относительно стабильными» in vitro (по сравнению с другими вирусами) и стабильными в кислых условиях с pH 3,5. [6] Также было обнаружено, что они нечувствительны к обработке некоторыми химическими веществами, включая хлороформ, эфир и неионные детергенты. [6]
Род | Состав | Симметрия | Капсид | Геномное расположение | Геномная сегментация |
---|---|---|---|---|---|
Кобувирус | Икосаэдр | Псевдо T = 3 | Без оболочки | Линейный | Одночастный |
Жизненный цикл
Репликация вируса происходит в цитоплазме. Проникновение в хозяйскую клетку достигается прикреплением вируса к рецепторам хозяина, что опосредует эндоцитоз. Репликация следует модели репликации вируса с положительной цепью РНК. Транскрипция вируса с положительной цепью РНК - это метод транскрипции. Вирус покидает клетку-хозяина путем лизиса и виропоринов. Человек и крупный рогатый скот служат естественным хозяином. Пути передачи фекально-оральные. [1]
Род | Детали хоста | Тканевый тропизм | Детали входа | Детали выпуска | Сайт репликации | Сайт сборки | Передача инфекции |
---|---|---|---|---|---|---|---|
Кобувирус | Люди | Никто | Эндоцитоз клеточных рецепторов | Лизис | Цитоплазма | Цитоплазма | Орально-фекальный; кровь |
Генетика
Вирусы этого рода имеют однонитевые, линейные несегментированные геномы с позитивно-смысловой РНК длиной приблизительно 8,2-8,3 т.п.н. [6] [7]
Рекомендации
- ^ a b c «Вирусная зона» . ExPASy . Проверено 15 июня 2015 года .
- ^ ICTV. «Таксономия вирусов: выпуск 2014 г.» . Проверено 15 июня 2015 года .
- ^ Рейтер Г., Борос А., Панкович П. (январь 2011 г.). «Кобувирусы - всесторонний обзор». Обзоры в медицинской вирусологии . 21 (1): 32–41. DOI : 10.1002 / rmv.677 . PMID 21294214 .
- ^ Кармона-Висенте Н., Буэса Дж., Браун П.А., Мерга Дж. Ю., Дарби А.С., Стависки Дж., Сэдлер Л., Гаскелл Р.М., Доусон С., Рэдфорд А.Д. (июнь 2013 г.). «Филогения и распространенность кобувирусов у собак и кошек в Великобритании» . Ветеринарная микробиология . 164 (3–4): 246–52. DOI : 10.1016 / j.vetmic.2013.02.014 . PMC 7127238 . PMID 23490561 .
- ^ а б в г Ямасита Т., Кобаяси С., Сакаэ К., Наката С., Чиба С., Исихара Ю., Исомура С. (ноябрь 1991 г.). «Выделение цитопатических маленьких круглых вирусов с клетками BS-C-1 от пациентов с гастроэнтеритом». Журнал инфекционных болезней . 164 (5): 954–7. DOI : 10.1093 / infdis / 164.5.954 . PMID 1658159 .
- ^ а б в г д Ямасита Т., Сакаэ К., Цузуки Н., Судзуки Ю., Исикава Н., Такеда Н., Миямура Т., Ямадзаки С. (октябрь 1998 г.). «Полная нуклеотидная последовательность и генетическая организация вируса Aichi, отдельного представителя Picornaviridae, связанного с острым гастроэнтеритом у людей» . Журнал вирусологии . 72 (10): 8408–12. DOI : 10,1128 / JVI.72.10.8408-8412.1998 . PMC 110230 . PMID 9733894 .
- ^ а б Ямасита Т., Ито М., Кабашима Ю., Цузуки Х., Фудзюра А., Сакаэ К. (ноябрь 2003 г.). «Выделение и характеристика нового вида кобувируса, связанного с крупным рогатым скотом» . Журнал общей вирусологии . 84 (Pt 11): 3069–3077. DOI : 10.1099 / vir.0.19266-0 . PMID 14573811 .
- ^ Рейтер Г., Болдишар А., Поцелуй I, Панкович П. (декабрь 2008 г.). «Кандидат в новые виды кобувируса у свиней-хозяев» . Возникающие инфекционные заболевания . 14 (12): 1968–70. DOI : 10.3201 / eid1412.080797 . PMC 2634637 . PMID 19046542 .
- ^ Рейтер Г., Болдишар А., Панкович П. (2009). «Полные нуклеотидные и аминокислотные последовательности и генетическая организация кобувируса свиней, члена нового вида в роду Kobuvirus, семейства Picornaviridae». Архив вирусологии . 154 (1): 101–8. DOI : 10.1007 / s00705-008-0288-2 . PMID 19096904 .
- ^ Оэм Дж. К., Ли М. Х., Ли К. К., ди-джей (август 2014 г.). «Новый вид кобувируса, идентифицированный у черной козы с диареей». Ветеринарная микробиология . 172 (3–4): 563–7. DOI : 10.1016 / j.vetmic.2014.06.009 . PMID 24984842 .
- ^ Khamrin P, Maneekarn N, Okitsu S, Ushijima H (2014). «Эпидемиология кобувирусов человека и животных» . Вирусное заболевание . 25 (2): 195–200. DOI : 10.1007 / s13337-014-0200-5 . PMC 4188179 . PMID 25674585 .
Внешние ссылки
- Вирусная зона : Кобувирус
- ICTV