| Лаговирус | |
|---|---|
 | |
| КриоЭМ реконструкция капсида вируса геморрагической болезни кроликов (RHDV) . EMDB запись EMD-1933 [1] | |
Классификация вирусов  | |
| (без рейтинга): | Вирус |
| Царство : | Рибовирия |
| Королевство: | Орторнавиры |
| Тип: | Писувирикота |
| Класс: | Pisoniviricetes |
| Заказ: | Пикорнавиралес |
| Семья: | Caliciviridae |
| Род: | Лаговирус |
| Типовой вид | |
| Вирус геморрагической болезни кроликов | |
| Разновидность | |
Лаговирус - это род вирусов семейства Caliciviridae . [2] [3] Зайцеводы служат естественными хозяевами. В настоящее время существует только два вида этого рода, включая типовой вид вируса геморрагической болезни кроликов . Заболевания, связанные с этим видом, включают: некротический гепатит, приводящий к смертельным кровотечениям. [4]
Таксономия [ править ]
Группа: оцРНК (+) Порядок: Picornavirales Семейство: Caliciviridae Род: Lagovirus
Свойства вириона [ править ]
Морфология [ править ]
Вирионы состоят из капсида . Капсид вируса без оболочки, круглый с Т = 3 икосаэдрической симметрией . Изометрический капсид имеет диаметр 35–39 нм. Также наблюдаются частицы с симметрией T = 1, состоящие из 60 капсидных белков, которые имеют диаметр около 15 нм. [4] Капсиды имеют очертания от круглых до шестиугольных . Структура поверхности капсида имеет регулярный узор с отличительными особенностями. Расположение капсомеров хорошо видно. Капсид с 32 чашеобразными углублениями.
| Род | Состав | Симметрия | Капсид | Геномное расположение | Геномная сегментация |
|---|---|---|---|---|---|
| Лаговирус | Икосаэдр | Т = 1, Т = 3 | Без оболочки | Линейный | Одночастный |
Жизненный цикл [ править ]
Репликация вируса происходит в цитоплазме. Проникновение в хозяйскую клетку достигается за счет прикрепления к рецепторам хозяина, которые опосредуют эндоцитоз. Репликация следует модели репликации вируса с положительной цепью РНК. Транскрипция вируса с положительной цепью РНК - это метод транскрипции. Трансляция происходит посредством терминации-повторной инициации РНК. Зайцеобразные служат естественным хозяином. [3] [4]
| Род | Детали хоста | Тканевый тропизм | Детали входа | Детали выпуска | Сайт репликации | Сайт сборки | Передача инфекции |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Лаговирус | Зайцеобразные | Печень | Эндоцитоз клеточных рецепторов | Лизис | Цитоплазма | Цитоплазма | Контакт |
Физические и химические свойства [ править ]
Молекулярная масса (г) вирионов составляет 15 × 10 6 . Вирионы имеют плавучую плотность в хлориде цезия (CsCl) 1,33–1,36 г / см 3 . Градиент плотности вирионов в калия тартрат-Глицерин является 1,29 г / см 3 . Коэффициент седиментации 170–187 сведберг (s 20, w ); из другого (ых) - пик 160–170 Сведберга (s 20, w ) (предполагается, что он состоит из дефектных мешающих частиц). В условиях in vitro вирионы инактивируются в кислой среде с pH.4,5–7; устойчив в щелочной среде pH 7–10,5. Вирионы нестабильны при повышенной температуре в присутствии высокой концентрации Mg ++ . Вирионы чувствительны к обработке трипсином (у некоторых штаммов нечувствительны к обработке мягкими детергентами, эфиром или хлороформом . Инфекционность усиливается после обработки трипсином (у некоторых штаммов).
Геном [ править ]
Генома не сегментирован и содержит одну молекулу линейной положительной смысле , сс РНК . Минорные разновидности негеномной нуклеиновой кислоты иногда также обнаруживаются в вирионах. Инкапсидированная нуклеиновая кислота в основном имеет геномное происхождение, но вирионы также могут содержать субгеномную РНК. Полный геном составляет 7450 нуклеотидов . В геноме содержание гуанин + цитозин составляет 49,3–50,1%. 5' конца генома , как правило , имеет геном-связанный белок ( ВПГ ), или метилированный нуклеотидный колпачок (в случае вируса гепатита Е ). В3 'конец имеет поли (А) тракт. Каждый вирион содержит полную копию или дефектные мешающие копии .
Белки [ править ]
Вирусный геном кодирует вирусный структурный белок . Вирионы состоят из 1 структурного белка (ов) (основные виды расположены в капсиде.
Структурный вирус вируса : белок капсида имеет молярную массу 59000–71000 Да ; это белок оболочки . Белок капсида имеет небольшую молекулярную массу «растворимых» 28-30 кДа .
Антигенность [ править ]
Обнаружена перекрестная реактивность . Перекрестная реактивность между видами одного серотипа , но не с видами другого серотипа и некоторыми видами того же серотипа, но не со всеми. Хотя степень антигенной специфичности зависит от степени родства, антигенность отличается от серогрупп того же рода. Большинство видов этого рода имеют антигенное родство. Они разделяют некоторые эпитопы в структурных белках.
Ссылки [ править ]
- ^ Luque, D .; González, JM; Gómez-Blanco, J .; Marabini, R .; Chichón, J .; Mena, I .; Angulo, I .; Carrascosa, JL; Verdaguer, N .; Trus, BL; Bárcena, J .; Кастон, младший (2012). «Вставка эпитопа в N-концевой молекулярный переключатель вируса геморрагической болезни кроликов T = 3 капсидного белка приводит к увеличению T = 4 капсидов» (PDF) . Журнал вирусологии . 86 (12): 6470–6480. DOI : 10,1128 / JVI.07050-11 . PMC 3393579 . PMID 22491457 .
- ^ Vinjé, J; Estes, MK; Эстевес, П; Грин, Кентукки; Катаяма, К. Ноулз, штат Нью-Джерси; L'Homme, Y; Мартелла, V; Vennema, H; Белый, PA; Консорциум отчетов ICTV (ноябрь 2019 г.). "Профиль таксономии вирусов ICTV: Caliciviridae " . Журнал общей вирусологии . 100 (11): 1469–1470. DOI : 10,1099 / jgv.0.001332 . PMID 31573467 .
- ^ a b c «Отчет ICTV Caliciviridae» .
- ^ a b c «Вирусная зона» . ExPASy . Проверено 15 июня 2015 года . CS1 maint: обескураженный параметр ( ссылка )
- Управление ICTVdB (2006). 00.012.0.02. Лаговирус. В: ICTVdB - Универсальная база данных вирусов, версия 4. Бюхен-Осмонд, К. (Эд), Колумбийский университет, Нью-Йорк, США.
Внешние ссылки [ править ]
- Отчет ICTV: Caliciviridae
- Вирусная зона : Лаговирус
