Список имитационных моделей COVID-19

Имитационные модели COVID-19 представляют собой математические модели инфекционных заболеваний для распространения COVID-19 . ^[1] Список не следует путать с приложениями COVID-19, используемыми в основном для цифрового отслеживания контактов .

Обратите внимание, что некоторые из перечисленных приложений являются моделями или симуляторами только для веб-сайтов , а некоторые из них полагаются (или используют) данные в реальном времени из других источников.

Модели с самой научной поддержкой [ править ]

Подсписок содержит тренажеры, основанные на теоретических моделях. Из-за большого количества предпечатных исследований, созданных и вызванных пандемией Covid-19 ^[2], особенно новые модели следует рассматривать только с дальнейшей научной строгостью . ^[3]^[4]^[5]

Chen et al. имитация ^{[6] на} основе модели «летучие мыши-хозяева-водохранилища-люди» (BHRP) (упрощенная только до RP)
CovidSim - Имперский колледж Лондона , Центр глобального анализа инфекционных заболеваний MRC , Neil Ferguson et al.
CovidSIM ^[7] - Schneider et al.
CovidSIM.eu ^[8] - Мартин Эйхнер, Маркус Швем при поддержке Тюбингенского университета и при финансовой поддержке Федерального министерства образования и исследований Германии .
COVIDSim - написано в MATLAB ^[9] Нг и Гуи ^[10] )
Всплеск COVID-19 - CDC ^[11]
CoSim19 - Проф Лер, на основе модели SEIRD
Симулятор COVID-19 - Гарвардская медицинская школа на основе проверенной модели системной динамики (отсек) ^[12]
МОДЕЛИРОВАНИЕ МОБИЛЬНОСТИ COVID-19 - Стэнфорд на основе модели SEIR ^[13]
CovidSim - исследовательский проект Мюнхенского университета прикладных наук, профессор Кёстер
COVIDSIM - Марк Кок Ю Нг и др.
Модель доктора Гаффарзадегана ^[14]^[15]
Горизонт событий - COVID-19 - HU Berlin на основе модели SIR-X ^[16]
https://corona-lab.ch - разумное вложение ресурсов для тестирования вирусной РНК для улучшения смягчения последствий Covid-19 ^[17]
Модель IHME - модель COVID Института показателей и оценки здоровья
SC-COSMO - Имитационная модель коронавируса Stanford-CIDE
Siam «S Эпидемиология Collection
Юян Гу модель COVID

Консорциумы, исследовательские кластеры, другие коллекции [ править ]

Список включения прогнозов и допущений CDC - большой список с различными моделями и т. Д.
Центр прогнозов COVID-19 - служит центральным хранилищем прогнозов и прогнозов от более чем 50 международных исследовательских групп. ^[18]^[19]
SIMID - Simulation Models of Infectious Diseases - Бельгийский исследовательский консорциум
RAMP - Быстрая помощь в моделировании пандемии ^[20] (Великобритания)
UT Остин Консорциум моделирования COVID-19

Мониторы, модели или информационные панели вакцинации [ править ]

Simulation der COVID19-Impfkampagne - Монитор кампании вакцинации в Германии от Zi Data Science Lab
Прогнозы COVID-19 Института показателей и оценки здоровья (IHME)
- См. Также модель COVID Института показателей здоровья и оценки.

Модели с менее научным обоснованием [ править ]

Следующие модели предназначены исключительно для образовательных целей.

https://www.coronasimulator.com/
https://c19model.com/
COVID19: 7 лучших - тщательно подобранный список размещен на Medium ^[21]
Simul8 - Ресурсы по моделированию COVID-19 ^[22]
Имитация коронавируса с помощью модели SIR
https://github.com/topics/covid-19
Симулятор COVID-19 ISEE Systems

Другие связанные симуляции, модели или источники данных [ править ]

Корнельский институт социальных и экономических исследований (CISER): источники данных о COVID-19
Отслеживание данных COVID CDC
Наш мир в данных «s коронавируса Источник данных
Atlantic «s COVID 19 Project Tracking
Vadere - Фреймворк с открытым исходным кодом для моделирования пешеходов и толпы
Эйлерово-лагранжевое многофазное моделирование, например, для передачи COVID-19 в лифтах на основе CFD ^[23]

Тренинги и другие ресурсы [ править ]

Специализация по моделированию инфекционных заболеваний - предоставляется на Coursera Имперским колледжем Лондона
Представляем симулятор COVID-19 и набор инструментов машинного обучения для прогнозирования распространения COVID-19 - блог AWS Machine Learning

Дальнейшее чтение [ править ]

Дэвид Адам, Специальный отчет: Моделирование реакции мира на COVID-19 , Nature 580, 316-318 (2020) ^[1]
Учебное пособие по моделированию ковидов WXML 2020 - Джарод Альпер, доцент математики Вашингтонского университета

См. Также [ править ]

Модель SIR
Компьютерное моделирование
Моделирование в здравоохранении
Математическое моделирование инфекционного заболевания
Вычислительная биология
Биоинформатика

Ссылки [ править ]

^ а б Адам Д. (апрель 2020 г.). «Специальный репортаж: моделирование реакции мира на COVID-19» . Природа . 580 (7803): 316–318. DOI : 10.1038 / d41586-020-01003-6 . PMID 32242115 .
^ Бриерли Л. "Роль исследовательских препринтов в академическом ответе на эпидемию COVID-19" . DOI : 10,22541 / au.158516578.89167184 . Цитировать журнал требует |journal=( помощь )
^ «Еще 178 000 смертей? Последний вирусный прогноз ученых - предупреждение» . NBC News . Проверено 22 февраля 2021 года .
^ Tufekci Z (2020-04-02). «Не верьте моделям COVID-19» . Атлантика . Проверено 22 февраля 2021 года .
^ Гонсалвиш В (2020-09-09). «Моделирование эпидемии 102: все модели CoVID-19 неверны, но некоторые полезны» . Средний . Проверено 22 февраля 2021 года .
↑ Chen TM, Rui J, Wang QP, Zhao ZY, Cui JA, Yin L (февраль 2020 г.). «Математическая модель для моделирования фазовой передачи нового коронавируса» . Инфекционные болезни бедности . 9 (1): 24. DOI : 10,1186 / s40249-020-00640-3 . PMC 7047374 . PMID 32111262 .
^ Schneider К., Нгва Г.А., Schwehm M, L Eichner, Eichner M (ноябрь 2020). «Инструмент моделирования готовности к пандемии COVID-19: CovidSIM» . BMC Инфекционные болезни . 20 (1): 859. DOI : 10,1186 / s12879-020-05566-7 . PMC 7675392 . PMID 33213360 .
^ «CovidSIM» . covidsim.eu . Проверено 13 марта 2021 .
^ Ng M (2020-12-23), nkymark / COVIDSim , получено 2021-03-09
↑ Ng KY, Gui MM (октябрь 2020 г.). «COVID-19: Разработка надежной математической модели и пакета имитационного моделирования с учетом старения населения и временной задержки для управляющих воздействий и возможности восстановления» . Физика Д. Нелинейные явления . 411 : 132599. DOI : 10.1016 / j.physd.2020.132599 . PMC 7282799 . PMID 32536738 .
^ CDC (2020-02-11). «Работники здравоохранения» . Центры по контролю и профилактике заболеваний . Проверено 22 февраля 2021 года .
^ «Методология симулятора политики» . Симулятор COVID-19 . Проверено 21 февраля 21 .
^ Чанг S, Пирсон Е, Ко PW, Gerardin Дж, Редбердо В, Д Граски, Leskovec J (январь 2021 года). «Модели мобильной сети COVID-19 объясняют несправедливость и информируют о повторном открытии» . Природа . 589 (7840): 82–87. DOI : 10.1038 / s41586-020-2923-3 . PMID 33171481 .
^ Ghaffarzadegan N (2021-02-01). «Анализ« что если »на основе моделирования для контроля распространения Covid-19 в университетах» . PLOS ONE . 16 (2): e0246323. DOI : 10.1371 / journal.pone.0246323 . PMC 7850497 . PMID 33524045 .
^ «Имитационная модель COVID-19 создает сценарии» . www.vtnews.vt.edu . Проверено 21 февраля 21 .
^ Maier BF, Брокман D (май 2020). «Эффективное сдерживание объясняет субэкспоненциальный рост недавних подтвержденных случаев COVID-19 в Китае» . Наука . 368 (6492): 742–746. DOI : 10.1126 / science.abb4557 . PMID 32269067 .
^ Горджи Н, Arnoldini М, Дженни DF, Хардт WD, Дженни Р (2020-12-02). «Умное вложение ресурсов для тестирования вирусной РНК для улучшения смягчения последствий Covid-19». medRxiv : 2020.11.30.20239566. DOI : 10.1101 / 2020.11.30.20239566 .
^ Лучший R, Boice J (2020-05-01). «Куда последние модели COVID-19 думают, что нас возглавляют - и почему они не согласны» . FiveThirtyEight . Проверено 21 февраля 21 .
^ "Главная - Центр прогнозов COVID 19" . covid19forecasthub.org . Проверено 21 февраля 21 .
^ «Быстрая помощь в моделировании пандемии: RAMP | Королевское общество» . royalsociety.org . Проверено 9 марта 2021 .
^ Прабово A (2020-05-03). «COVID19: 7 лучших интерактивных онлайн-симуляторов, отобранные» . Средний . Проверено 21 февраля 21 .
^ «Ресурсы моделирования COVID-19» . Проверено 21 февраля 2020 .
^ Dbouk Т, Drikakis D (январь 2021 года). «О воздушной передаче вирусов в лифтах и закрытых помещениях» . Физика жидкостей . 33 (1): 011905. DOI : 10,1063 / 5,0038180 . PMC 7984422 . PMID 33790526 .

[:0-1] а б Адам Д. (апрель 2020 г.). «Специальный репортаж: моделирование реакции мира на COVID-19» . Природа . 580 (7803): 316–318. DOI : 10.1038 / d41586-020-01003-6 . PMID 32242115 .

[2] Бриерли Л. "Роль исследовательских препринтов в академическом ответе на эпидемию COVID-19" . DOI : 10,22541 / au.158516578.89167184 . Цитировать журнал требует |journal=( помощь )

[3] «Еще 178 000 смертей? Последний вирусный прогноз ученых - предупреждение» . NBC News . Проверено 22 февраля 2021 года .

[4] Tufekci Z (2020-04-02). «Не верьте моделям COVID-19» . Атлантика . Проверено 22 февраля 2021 года .

[5] Гонсалвиш В (2020-09-09). «Моделирование эпидемии 102: все модели CoVID-19 неверны, но некоторые полезны» . Средний . Проверено 22 февраля 2021 года .

[6] Chen TM, Rui J, Wang QP, Zhao ZY, Cui JA, Yin L (февраль 2020 г.). «Математическая модель для моделирования фазовой передачи нового коронавируса» . Инфекционные болезни бедности . 9 (1): 24. DOI : 10,1186 / s40249-020-00640-3 . PMC 7047374 . PMID 32111262 .

[7] Schneider К., Нгва Г.А., Schwehm M, L Eichner, Eichner M (ноябрь 2020). «Инструмент моделирования готовности к пандемии COVID-19: CovidSIM» . BMC Инфекционные болезни . 20 (1): 859. DOI : 10,1186 / s12879-020-05566-7 . PMC 7675392 . PMID 33213360 .

[8] «CovidSIM» . covidsim.eu . Проверено 13 марта 2021 .

[9] Ng M (2020-12-23), nkymark / COVIDSim , получено 2021-03-09

[10] Ng KY, Gui MM (октябрь 2020 г.). «COVID-19: Разработка надежной математической модели и пакета имитационного моделирования с учетом старения населения и временной задержки для управляющих воздействий и возможности восстановления» . Физика Д. Нелинейные явления . 411 : 132599. DOI : 10.1016 / j.physd.2020.132599 . PMC 7282799 . PMID 32536738 .

[11] CDC (2020-02-11). «Работники здравоохранения» . Центры по контролю и профилактике заболеваний . Проверено 22 февраля 2021 года .

[12] «Методология симулятора политики» . Симулятор COVID-19 . Проверено 21 февраля 21 .

[13] Чанг S, Пирсон Е, Ко PW, Gerardin Дж, Редбердо В, Д Граски, Leskovec J (январь 2021 года). «Модели мобильной сети COVID-19 объясняют несправедливость и информируют о повторном открытии» . Природа . 589 (7840): 82–87. DOI : 10.1038 / s41586-020-2923-3 . PMID 33171481 .

[14] Ghaffarzadegan N (2021-02-01). «Анализ« что если »на основе моделирования для контроля распространения Covid-19 в университетах» . PLOS ONE . 16 (2): e0246323. DOI : 10.1371 / journal.pone.0246323 . PMC 7850497 . PMID 33524045 .

[15] «Имитационная модель COVID-19 создает сценарии» . www.vtnews.vt.edu . Проверено 21 февраля 21 .

[16] Maier BF, Брокман D (май 2020). «Эффективное сдерживание объясняет субэкспоненциальный рост недавних подтвержденных случаев COVID-19 в Китае» . Наука . 368 (6492): 742–746. DOI : 10.1126 / science.abb4557 . PMID 32269067 .

[17] Горджи Н, Arnoldini М, Дженни DF, Хардт WD, Дженни Р (2020-12-02). «Умное вложение ресурсов для тестирования вирусной РНК для улучшения смягчения последствий Covid-19». medRxiv : 2020.11.30.20239566. DOI : 10.1101 / 2020.11.30.20239566 .

[18] Лучший R, Boice J (2020-05-01). «Куда последние модели COVID-19 думают, что нас возглавляют - и почему они не согласны» . FiveThirtyEight . Проверено 21 февраля 21 .

[19] "Главная - Центр прогнозов COVID 19" . covid19forecasthub.org . Проверено 21 февраля 21 .

[20] «Быстрая помощь в моделировании пандемии: RAMP | Королевское общество» . royalsociety.org . Проверено 9 марта 2021 .

[21] Прабово A (2020-05-03). «COVID19: 7 лучших интерактивных онлайн-симуляторов, отобранные» . Средний . Проверено 21 февраля 21 .

[22] «Ресурсы моделирования COVID-19» . Проверено 21 февраля 2020 .

[23] Dbouk Т, Drikakis D (январь 2021 года). «О воздушной передаче вирусов в лифтах и закрытых помещениях» . Физика жидкостей . 33 (1): 011905. DOI : 10,1063 / 5,0038180 . PMC 7984422 . PMID 33790526 .

[1]