Манхэттен участок представляет собой тип диаграммы разброса , как правило , используется для отображения данных с большим количеством данных точек, многими из ненулевой амплитуды, так и с распределением значений более высокой величиной. График обычно используется в полногеномных ассоциативных исследованиях (GWAS) для отображения значимых SNP . [1]
Он получил свое название из-за сходства такого сюжета с горизонтом Манхэттена : профиль небоскребов, возвышающихся над «зданиями» нижнего уровня, которые варьируются в зависимости от более низкой высоты.
GWAS [ править ]
На графиках GWAS Manhattan координаты генома отображаются вдоль оси X с отрицательным логарифмом p- значения ассоциации для каждого одиночного нуклеотидного полиморфизма (SNP), отображаемым на оси Y, что означает, что каждая точка на графике Manhattan означает SNP. Поскольку самые сильные ассоциации имеют наименьшие значения p (например, 10 -15 ), их отрицательные логарифмы будут наибольшими (например, 15). Разные цвета каждого блока обычно показывают размер каждой хромосомы.
Ссылки [ править ]
- ^ Гибсон, Грег (2010). «Намеки на скрытую наследственность в GWAS». Генетика природы . 42 (7): 558–560. DOI : 10.1038 / ng0710-558 . PMID 20581876 .
 | Викискладе есть медиафайлы, связанные с заговором на Манхэттене . |
 | Эта статья о статистике незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |
