Альфамезонивирус | |
---|---|
Электронная микрофотография из отрицательно окрашенных NDiV вирионов | |
Классификация вирусов | |
(без рейтинга): | Вирус |
Царство : | Рибовирия |
Королевство: | Орторнавиры |
Тип: | Писувирикота |
Учебный класс: | Pisoniviricetes |
Заказ: | Нидовиралес |
Подотряд: | Mesnidovirineae |
Семья: | Mesoniviridae |
Подсемейство: | Hexponivirinae |
Род: | Альфамезонивирус |
Подроды и виды | |
Mesoniviridae - это семейство одноцепочечных РНК-вирусов с положительным смыслом. Семья названачесть размера геномовсравнению с другими nidoviruses, с мезо приходят от греческого слова Mesos , что означает средний и п быть аббревиатурой Нида . [1] Комары - естественный резервуар всех известных вирусов этого семейства. [2] [3]
Классификация [ править ]
Mesoniviridae является членом отряда Nidovirales , отряда + ssRNA вирусов с животными-хозяевами. В семействе есть только одно подсемейство Hexponivirinae , которое включает только один род Alphamesonivirus . Alphamesonivirus имеет 8 подродов и 10 видов . [4]
- Заказать Nidovirales
- Семья Mesoniviridae
- Подсемейство Hexponivirinae
- Род Alphamesonivirus
- Казавирус
- Альфамезонивирус 4
- Энселивирус
- Альфамезонивирус 8
- Ганаливирус
- Альфамезонивирус 5
- Кадиливирус
- Альфамезонивирус 7
- Карсаливирус
- Альфамезонивирус 2
- Альфамезонивирус 3
- Меноливирус
- Альфамезонивирус 9
- Намкаливирус
- Альфамезонивирус 1
- Кавалли вирус (CavV)
- Вирус Дак Нонг (DKNV)
- Вирус Нам Динь (NDiV)
- Альфамезонивирус 10
- Альфамезонивирус 1
- Офаливирус
- Альфамезонивирус 6
- Казавирус
- Род Alphamesonivirus
- Подсемейство Hexponivirinae
- Семья Mesoniviridae
Открытие и филогенетический анализ четырех дополнительных мезонивирусов в 2013 году, названных вирусом Хана, вирусом Мено, вирусом Nsé и вирусом Моумо, позволил предположить, что они представляют по крайней мере три новых вида мезонивирусов. [5] Кроме того, в 2014 году в Австралии, Индонезии и Таиланде были обнаружены четыре потенциально новых вида, названные вирусом Казуарина, вирусом Каранг Сари, вирусом Бонтаг Бару и вирусом Кампхенг Пхет, соответственно. [3] [6] По состоянию на февраль 2015 года эти открытия еще не ратифицированы Международным комитетом по таксономии вирусов (ICTV).
Структура и геном [ править ]
Члены этого семейства имеют оболочку, сферическую форму и диаметр 60–80 нм с булавовидными шипами на поверхности. Существует восемь основных структурных белков, включая белок нуклеокапсида (массой 25 кДа), четыре дифференциально гликозилированные формы мембранного белка (20, 19, 18 и 17 кДа) и белок-шип (S) (77 кДа), который является расщепляется с образованием двух субъединиц S-белка (23 и 57 кДа). [5] [7]
Геномы представляют собой линейные, позитивно-смысловые, полицистронные, одноцепочечные РНК и имеют длину около 20 000 нуклеотидов, с 3'- поли (A) хвостом и семью основными открытыми рамками считывания (ORF). Две перекрывающиеся ORF находятся на 5'-конце, кодируют основные неструктурные белки и экспрессируются как слитый белок за счет рибосомного сдвига рамки считывания . ORF 1a и 1b содержат шесть доменов репликазы , а также 3'-5 ' экзорибонуклеазу (ExoN), которая контролирует точность репликации РНК, и 2'-O-метилтрансферазу, оба из которых обнаружены в более крупных нидовирусах. ORF 1b также кодирует N7-метилтрансферазу. [2] [7]
История [ править ]
Это семейство относительно новое, оно было обнаружено только в 2011 году. Первый вирус, названный вирусом Нам Динь , был обнаружен во вьетнамской провинции Намин . [2] Второй вирус, названный вирусом Кавалли , был обнаружен в Кот-д'Ивуаре . [7] Позже было обнаружено, что эти два вируса относятся к одному виду. Третий представитель этого первого вида, названный вирусом Дак Нонг , позже был обнаружен в популяциях Culex tritaeniorhynchus во Вьетнаме. [8] В 2013 году еще четыре мезонивируса были обнаружены в популяциях комаров, все в Кот-д'Ивуаре, [5]а в 2014 г. четыре мезонивируса были обнаружены в популяциях комаров в Австралии [6], Индонезии и Таиланде. [3]
Ссылки [ править ]
- ^ Lauber, C .; Ziebuhr, J .; Junglen, S .; Drosten, C .; Zirkel, F .; Nga, PT; Morita, K .; Snijder, EJ; Горбаленя АЕ (2012). «Mesoniviridae: предлагаемое новое семейство в отряде Nidovirales, образованное одним видом вирусов, переносимых комарами» . Архив вирусологии . 157 (8): 1623–1628. DOI : 10.1007 / s00705-012-1295-х . PMC 3407358 . PMID 22527862 .
- ^ a b c Nga, PT; Паркет Мдел, МДЦ; Lauber, C .; Parida, M .; Nabeshima, T .; Ю, Ф .; Thuy, NT; Inoue, S .; Ито, Т .; Окамото, К .; Ichinose, A .; Snijder, EJ; Morita, K .; Горбаленя А.Е. (2011). Барик, Ральф С. (ред.). «Открытие первого нидовируса насекомых, отсутствующего эволюционного звена в возникновении геномов крупнейших РНК-вирусов» . PLoS Патогены . 7 (9): e1002215. DOI : 10.1371 / journal.ppat.1002215 . PMC 3169540 . PMID 21931546 .
- ^ a b c Василакис, N; Гусман, H; Ферт, C; Форрестер, Нидерланды; Widen, SG; Дерево, ТГ; Росси, SL; Ghedin, E; Попов, В; Бласделл, КР; Уокер, П.Дж.; Теш, РБ (2014). «Мезонивирусы - это вирусы, специфичные для комаров, с обширным географическим распространением и диапазоном хозяев» . Журнал вирусологии . 11 : 97. DOI : 10,1186 / 1743-422X-11-97 . PMC 4038087 . PMID 24884700 .
- ^ "Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV)" .
- ^ a b c Zirkel, F .; Roth, H .; Kurth, A .; Drosten, C .; Ziebuhr, J .; Джанглен, С. (2013). «Идентификация и характеристика генетически дивергентных членов недавно созданного семейства Mesoniviridae» . Журнал вирусологии . 87 (11): 6346–6358. DOI : 10,1128 / JVI.00416-13 . PMC 3648093 . PMID 23536661 .
- ^ a b Warrilow, D; Уоттерсон, Д; Холл, РА; Дэвис, СС; Weir, R; Куруц, N; Уилан, П; Allcock, R; Холл-Менделин, S; О'Брайен, Калифорния; Хобсон-Петерс, Дж (2014). «Новый вид мезонивируса из Северной территории Австралии» . PLoS ONE . 9 (3): e91103. Bibcode : 2014PLoSO ... 991103W . DOI : 10.1371 / journal.pone.0091103 . PMC 3966781 . PMID 24670468 .
- ^ a b c Zirkel, F .; Kurth, A .; Quan, P. -L .; Briese, T .; Ellerbrok, H .; Pauli, G .; Leendertz, FH; Липкин, Висконсин; Ziebuhr, J .; Drosten, C .; Джанглен, С. (2011). «Нидовирус насекомых, появляющийся из первичных тропических лесов» . mBio . 2 (3): e00077 – e00011. DOI : 10,1128 / mBio.00077-11 . PMC 3111606 . PMID 21673192 .
- ^ Kuwata, R .; Satho, T .; Isawa, H .; Йена, NT; Фонг, ТВ; Nga, PT; Kurashige, T .; Hiramatsu, Y .; Fukumitsu, Y .; Хосино, К .; Сасаки, Т .; Кобаяши, М .; Mizutani, T .; Савабе, К. (2013). «Характеристика вируса Дак Нонг, нидовируса насекомых, выделенного из комаров Culex во Вьетнаме» . Архив вирусологии . 158 (11): 2273–2284. DOI : 10.1007 / s00705-013-1741-4 . PMC 7087109 . PMID 23728735 .
Внешние ссылки [ править ]
- Заметки о семействе: Mesoniviridae