Метавирусы — род вирусов семейства Metaviridae . [1] Это ретротранспозоны , которые вторгаются в геном эукариотического хозяина и могут реплицироваться только после того, как вирус заразил хозяина. [2] Эти генетические элементы существуют для заражения и репликации в геноме хозяина и происходят от предковых элементов, не связанных с хозяином. Метавирус может использовать несколько разных хозяев для передачи, и было обнаружено, что он передается через семяпочки и пыльцу некоторых растений. [3]
Метавирус содержит пять семейств элемента Ty3/Gypsy с одной или двумя открытыми рамками считывания ; это семейства mdg1, mdg3, blastopia, 412 и micropia . [4] Каждое из пяти семейств содержит одну или две открытые рамки считывания, gag3 и/или pol3 . [5] Имеются данные, подтверждающие, что отсутствие аминокислот в элементах генома хозяина часто вызывает сдвиг рамки считывания в сторону элемента Ty3 . [6] Метавирус соответствует генетической линии Ogre/Tat . [7]
Виды метавирусов представляют собой ретротранспозоны одноцепочечной РНК. Они имеют икосаэдрическую и линейную форму и не заключены в оболочку. [8] Их диаметр составляет примерно 50 нм, а длина обычно составляет от 42 до 52 нм. [8] Эти генетические элементы содержат ядро и капсид.
Из-за их высокой скорости мутаций и рекомбинаций, а также их способности проводить горизонтальный перенос генов , проследить эволюционную историю многих ретроэлементов может быть сложно (Benachenhou et al., 2013). [9] Ученые часто обращаются к геномам метавирусов , чтобы сравнить последовательности нуклеиновых кислот с последовательностями других вирусов, создавая линии и предлагая общих предков.
Несколько таксонов Metavirus имеют геномную последовательность, которая гомологична другим родам Metaviridae и предполагает общего предка и / или совместную эволюцию. [10] Ученые часто рассматривают капсидные белки в поисках доказательств эволюции метавирусов . [11] Большая часть происхождения метавируса остается нераскрытой и в настоящее время исследуется.
Масканьи и др. (2017) провели исследование, чтобы найти гомологов и идентифицировать нити в видах подсолнечника. В ходе эксперимента из различных видов Helianthus была выделена ДНК и с помощью анализа BLASTX были идентифицированы геномы ретротранспозонов . Филогенетические деревья были построены с использованием метода кластеризации с соседним соединением, и был построен биоинформационный конвейер, позволяющий проводить геномный анализ. Два элемента, SURE и Helicopia, были идентифицированы и помещены в надсемейства Gypsy и Copia соответственно. [12] Таким образом, элемент SURE принадлежит к цыганской группе огров/татов .линия, род Metavirus . [12] Дальнейший анализ привел Mascagni et al. (2017), чтобы выявить мутации и сделать вывод, что линия метавирусов эволюционировала до сиревирусов. Масканьи и др. (2017) также обнаружили доказательства того, что элементы SURE и элементы Helicopia гибридизировались, что может привести к появлению новых линий.