Из Википедии, бесплатной энциклопедии
  (Перенаправлено с Methanopyrus kandleri )
Перейти к навигации Перейти к поиску

Метанопирус
Научная классификация
Домен:
Археи
Королевство:
Euryarchaeota
Тип:
Euryarchaeota
Класс:
Метанопири
Заказ:
Methanopyrales
Семья:
Methanopyraceae
Род:
Метанопирус
Биномиальное имя
Метанопирус
Курр и др. 1992 г.
Разновидность

В систематике , Methanopyrus является родом из Methanopyraceae . [1]

Methanopyrus - это род метаногена с единственным описанным видом M. kandleri . Это гипертермофил , обнаруженный на стене черного курильщика из Калифорнийского залива на глубине 2000 м при температуре 84–110 ° C. Штамм 116 был обнаружен в жидкости черного курильщика гидротермального поля Кайрей; он может выжить и воспроизвести при 122 ° C. [2] Он живет в водороде - углекислый газа богатой среды, а также как и других метаногены уменьшает последний метана . Он находится среди Euryarchaeota , в своем собственном классе.

Структура клетки [ править ]

Methanopyrus kandleri - метаноген в форме стержня, который производит метан в результате восстановления двуокиси углерода. [3] [4]

Methanopyrus kandleri отличается от других архей, потому что он все еще имеет одну из простейших версий мембранных липидов. [3] Мембрана M. kandleri состоит из терпеноидных липидов, которые представляют собой группу липидов, содержащих холестерин, гопаноиды, каротиноиды, фитан и бисфитан. [5] Хотя терпеноиды являются основным компонентом мембраны M. kandleri , они в большей степени являются опорной структурой у эукариот и бактерий. [5]

Methanopyrus kandleri имеет высокую концентрацию циклического 2,3-дифосфоглицерата. [3] Это соединение часто встречается у гипертермофилов, помогая предотвратить денатурацию белка при высоких температурах. [6] Повышенная концентрация циклического 2,3-дифосфоглицерата защищает метаноген, помогая ему выжить в среде, недоступной для многих других организмов. Помимо этого соединения, помогающего защитить белки, M. kandleri также имеет высокую концентрацию соли внутри своей мембраны. [3] Повышенная концентрация соли способствует стабильности ферментов и способствует активности ферментов при более высоких температурах. [7]

Геномика [ править ]

Полный геном Methanopyrus kandleri был секвенирован исследователями Fidelity Systems. Было установлено, что это GC-богатый геном, содержащий 1 694 969 нуклеотидов, из которых около 62,1% составляют гуанин или цитозин. [3] В целом геном M. kandleri считается «минималистским», потому что очень мало генов было перенесено от других бактерий в его собственный геном. Это может быть связано с экстремальной средой, в которой он живет, и небольшим количеством потенциальных перемещений, которые могут быть из-за этого. [3]

Исследование [ править ]

Methanopyrus kandleri - также единственный вид, который, как известно, имеет топоизомеразу 5. Топоизомераза 5 позволяет M. kandleri выживать при таких высоких температурах и помогает расслабить как положительно, так и отрицательно сверхспиральную ДНК. [8] Это удивительно, потому что многим другим гипертермофилам было бы полезно иметь что-то подобное, чтобы помочь им выжить при повышенных температурах. В связи с этим проводятся дополнительные исследования, чтобы полностью понять, как M. kandleri получила топоизомеразу 5 и почему ее нет у других гипертермофилов.

Ссылки [ править ]

  1. ^ См. Веб-страницу NCBI о Methanopyrus . Данные извлечены из "ресурсов таксономии NCBI" . Национальный центр биотехнологической информации . Проверено 19 марта 2007 .
  2. ^ Такай К., Накамура К., Токи Т, Цуногай У, Миядзаки М, Миядзаки Дж и др. (Август 2008 г.). «Клеточная пролиферация при 122 градусах Цельсия и производство изотопно тяжелого CH4 гипертермофильным метаногеном при культивировании под высоким давлением» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 105 (31): 10949–54. Bibcode : 2008PNAS..10510949T . DOI : 10.1073 / pnas.0712334105 . PMC 2490668 . PMID 18664583 .  
  3. ^ Б с д е е Слесарев А.И., Межевая К.В., Макарова К.С., Полушин Н.Н., Щербинина О.В., Шахова В.В., и др. (Апрель 2002 г.). «Полный геном гипертермофила Methanopyrus kandleri AV19 и монофилия архейных метаногенов» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 99 (7): 4644–9. DOI : 10.1073 / pnas.032671499 . PMID 11930014 . 
  4. ^ «Euryarchaeota | Безграничная микробиология» . course.lumenlearning.com . Проверено 23 апреля 2021 .
  5. ^ a b Накатани И., Рибейро Н., Штрайфф С., Гото М., Поцци Г., Дезобри Л., Милон А. (сентябрь 2014 г.). «Поиск самых« примитивных »мембран и их усилителей: обзор теории полипренилфосфатов» . Истоки жизни и эволюция биосферы . 44 (3): 197–208. DOI : 10.1007 / s11084-014-9365-6 . PMC 4669544 . PMID 25351682 .  
  6. ^ "ИнтерПро" . www.ebi.ac.uk . Проверено 23 апреля 2021 .
  7. ^ Брейтунг Дж, Börner G, Scholz S, D Линдер, Штеттер КО, Thauer РК (декабрь 1992). «Зависимость от соли, кинетические свойства и каталитический механизм N-формилметанофурана: тетрагидрометаноптерин формилтрансфераза из экстремального термофила Methanopyrus kandleri» . Европейский журнал биохимии . 210 (3): 971–81. DOI : 10.1111 / j.1432-1033.1992.tb17502.x . PMID 1483480 . 
  8. ^ Фортер P (июнь 2006). «ДНК-топоизомераза V: новая складка загадочного происхождения». Тенденции в биотехнологии . 24 (6): 245–7. DOI : 10.1016 / j.tibtech.2006.04.006 . PMID 16650908 . 

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Шахерл М., Вальтерспергер С., Бауманн У. (декабрь 2013 г.). "Структурная характеристика киназы суперсемейства ASKHA рибонуклеазы Н-подобного типа MK0840 из Methanopyrus kandleri". Acta Crystallographica. Секция D, Биологическая кристаллография . 69 (Pt 12): 2440–50. DOI : 10.1107 / S0907444913022683 . PMID  24311585 .
  • Су АА, Трипп В., Рандау Л. (июль 2013 г.). «Анализ RNA-Seq выявляет порядок событий обработки тРНК и созревание C / D box и CRISPR РНК в гипертермофиле Methanopyrus kandleri» . Исследования нуклеиновых кислот . Издательство Оксфордского университета . 41 (12): 6250–8. DOI : 10.1093 / NAR / gkt317 . PMC  3695527 . PMID  23620296 .
  • Курр М., Хубер Р., Кениг Х., Яннаш Х. В., Фрике Х., Тринконе А., Кристьянссон Дж. К., Стеттер К. О. (сентябрь 1991 г.). «Methanopyrus kandleri, gen. И sp. Nov. Представляет новую группу гипертермофильных метаногенов, растущих при 110 ° C». Архив микробиологии . 156 (4): 239–247. DOI : 10.1007 / BF00262992 .
  • Huber R; Стеттер К.О. (2001). «Семья I. Methanopyralceae fam. Nov.». В DR Boone; Р. У. Кастенхольц (ред.). Руководство Берджи по систематической бактериологии Том 1: Археи и глубоко ветвящиеся и фототрофные бактерии (2-е изд.). Нью-Йорк: Springer Verlag . п. 169 . ISBN 978-0-387-98771-2.

Научные базы данных [ править ]

  • Ссылки PubMed для Methanopyrus
  • Ссылки PubMed Central для Methanopyrus
  • Ссылки Google Scholar для Methanopyrus

Внешние ссылки [ править ]

  • Страница таксономии NCBI для Methanopyrus
  • Поиск по страницам таксономии "Древо жизни" для Methanopyrus
  • Страница поиска видов 2000 для Methanopyrus
  • Страница MicrobeWiki для Methanopyrus
  • Страница LPSN для Methanopyrus
  • Типовой штамм Methanopyrus kandleri в Bac Dive - база метаданных по бактериальному разнообразию
  • v
  • т
  • е