В таксономии , то Methanosarcinaceae являются семья из Methanosarcinales . [1]
Methanosarcinaceae | |
---|---|
Methanosarcina barkeri fusaro | |
Научная классификация | |
Домен: | |
Королевство: | |
Тип: | |
Класс: | |
Заказ: | |
Семья: | Methanosarcinaceae |
Биномиальное имя | |
Methanosarcinaceae Балч и Вульф 1981 | |
Роды | |
|
Филогения
В настоящее время принятая таксономия основана на Списке названий прокариот, стоящих в номенклатуре (LPSN) [2] и Национальном центре биотехнологической информации (NCBI) [3], а филогения основана на версии 106 LTP на основе 16S рРНК, разработанной « Проект «Всевидовое живое дерево» . [4]
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Примечания:
♠ Штаммы, обнаруженные в Национальном центре биотехнологической информации (NCBI), но не перечисленные в Списке названий прокариот, стоящих в номенклатуре (LPSN)
♦ Типовой штамм утерян или недоступен
Биохимия
Примечательной чертой Methanosarcinaceae является то, что они являются метаногенами, которые включают в свои ферменты необычную аминокислоту пирролизин . [5] Фермент монометиламинметилтрансфераза катализирует реакцию монометиламина с метаном . Этот фермент включает пирролизин. Необычная аминокислота вставляется с помощью уникальной тРНК , антикодоном которой является UAG. У большинства организмов и в большинстве белков Methanosarcinaceae UAG является стоп-кодоном . Однако в этот фермент и где-либо еще пирролизин включен, вероятно, через контекстные маркеры на мРНК, загруженная пирролизином тРНК вставляется вместо фактора высвобождения . У них также есть уникальная аминоацил-тРНК синтетаза, которая специфически загружает эту тРНК пирролизином. Эта уникальная адаптация до сих пор является предметом серьезных исследований.
Рекомендации
- ^ См. Веб-страницу NCBI о Methanosarcinaceae . Данные извлечены из "ресурсов таксономии NCBI" . Национальный центр биотехнологической информации . Проверено 19 марта 2007 .
- ^ JP Euzéby. «Метаномикробия» . Список названий прокариот, стоящих в номенклатуре (LPSN). Архивировано из оригинала на 2013-01-27 . Проверено 17 ноября 2011 .
- ^ Сэйерс; и другие. «Метаномикробия» . База данных таксономии Национального центра биотехнологической информации (NCBI) . Проверено 5 июня 2011 .
- ^ Проект «Живое дерево всех видов» . «Выпуск 106 LTP на основе 16S рРНК (полное дерево)» (PDF) . Silva Полная база данных рибосомных РНК . Проверено 17 ноября 2011 .
- ^ Lehninger A, Nelson D, Cox M. Lehninger принципы биохимии. 6-е изд. Нью-Йорк: WH Freeman; 2013 г. 1124-1126.
дальнейшее чтение
Научные журналы
- Кавальер-Смит, Т. (2002). «Неомуранское происхождение архебактерий, негибактериальный корень универсального дерева и бактериальная мегаклассификация» . Int. J. Syst. Evol. Microbiol . 52 (Pt 1): 7–76. DOI : 10.1099 / 00207713-52-1-7 . PMID 11837318 .
- Springer E; Sachs MS; Woese CR; Бун Д.Р. (1995). «Частичные генные последовательности для субъединицы A метил-кофермента М редуктазы (mcrI) как филогенетический инструмент для семейства Methanosarcinaceae» . Int. J. Syst. Бактериол . 45 (3): 554–559. DOI : 10.1099 / 00207713-45-3-554 . PMID 8590683 .
- Кавальер-Смит, Т. (1986). «Царства организмов». Природа . 324 (6096): 416–417. Bibcode : 1986Natur.324..416C . DOI : 10.1038 / 324416a0 . PMID 2431320 .
- Сеятели КР; Джонсон JL; Ферри Дж. Г. (1984). «Филогенетические отношения между метилотрофными метан-продуцирующими бактериями и исправление семейства Methanosarcinaceae» . Int. J. Syst. Бактериол . 34 (4): 444–450. DOI : 10.1099 / 00207713-34-4-444 .
- Balch WE; Fox GE; Magrum LJ; Woses CR; и другие. (1979). «Метаногены: переоценка уникальной биологической группы» . Microbiol. Ред . 43 (2): 260–296. DOI : 10.1128 / MMBR.43.2.260-296.1979 . PMC 281474 . PMID 390357 .
Научные книги
- Boone DR; Whitman WB; Кога Й (2001). «Орден III. Methanosarcinales ord. Nov.». В DR Boone; Р. У. Кастенхольц (ред.). Руководство Берджи по систематической бактериологии Том 1: Археи и глубоко ветвящиеся и фототрофные бактерии (2-е изд.). Нью-Йорк: Springer Verlag . С. 169 . ISBN 978-0-387-98771-2.
- Грант WD; Камекура М; McGenity TJ; Ventosa A (2001). «Класс III. Класс галобактерий. Nov.». В DR Boone; Р. У. Кастенхольц (ред.). Руководство Берджи по систематической бактериологии Том 1: Археи и глубоко ветвящиеся и фототрофные бактерии (2-е изд.). Нью-Йорк: Springer Verlag. С. 169 . ISBN 978-0-387-98771-2.
Научные базы данных
- Ссылки PubMed на Methanosarcinaceae
- Ссылки PubMed Central на Methanosarcinaceae
- Ссылки Google Scholar по Methanosarcinaceae
Внешние ссылки
- Страница таксономии NCBI для Methanosarcinaceae
- Поиск на страницах таксономии "Древо жизни" для Methanosarcinaceae
- Страница поиска на 2000 видов для Methanosarcinaceae
- Страница MicrobeWiki для Methanosarcinaceae
- Страница LPSN для Methanosarcinaceae