Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Майкл Эйзен
Plos eisen.jpg
Майкл Эйзен
Родившийся
Майкл Брюс Эйзен

( 1967-04-13 )13 апреля 1967 г. (53 года)
Бостон , Массачусетс , США
НациональностьАмериканец
Альма-матерГарвардский университет ( AB , PhD )
ИзвестенПубличная научная библиотека (PLOS)
НаградыПремия Бенджамина Франклина (биоинформатика) (2002)
Научная карьера
Поля
УчрежденияКалифорнийский университет в Беркли
ТезисСтруктурные исследования белков вируса гриппа А  (1996 г.)
ДокторантДон Крейг Вайли [ необходима ссылка ]
Интернет сайт

Майкл Брюс Эйзен (родился 13 апреля 1967 г.) - американский компьютерный биолог и главный редактор журнала eLife . [2] Он является профессором генетики , геномики и развития в Университете Калифорнии, Беркли . [3] [4] [5] [6] [7] Он является ведущим сторонником научных публикаций с открытым доступом и соучредителем Публичной научной библиотеки (PLOS) . В 2018 году Эйзен объявил свою кандидатуру в Сенат США от Калифорнии в качестве независимого представителя , хотя он не прошел квалификацию для голосования.[8]

Ранняя жизнь и образование [ править ]

Эйзен и его брат Джонатан родились в Бостоне и выросли в семье ученых. Их дедушка был рентгеновским кристаллографом , их отец, Говард Эйзен, врач, и мать, Лаура [9], биохимик. Они переехали в Бетесду, штат Мэриленд, когда Эйзену было четыре или пять лет. Братья проводили лето на Лонг-Айленде с бабушкой и дедушкой. Эйзен утверждает, что он любил лягушек и саламандр. «Даже больше, чем у меня есть фетиш на лягушек, у меня есть болотный фетиш. Мне очень нравится быть в болотах». Он также очень интересовался математикой и был капитаном математической команды средней школы . Эйзен окончил среднюю школу Уолта Уитмена.в 1985 году. Намереваясь получить специализацию по математике в Гарвардском университете, он понял, что там [он может встретить] других более блестящих студентов-математиков, это был момент Доброй Уиллы Хантинг, и он решил, что не хочет специализироваться по математике »,« Ты Я не хочу быть Сальери для Моцарта ». В годы учебы в Гарварде Эйзен работал над« открытием трехмерных структур белков ». Ему показали микрочип ДНК, который научил его «новому способу заниматься биологией». [10]

Эйзен получил степень доктора философии в Гарвардском университете по биофизике и степень бакалавра наук (также в Гарварде) по математике. [11] Он находился под наблюдением Дона Крейга Вили [12] во время изучения белков вируса гриппа А. [13]

Есть вещи, которые действительно очень трудны, это те проблемы, над которыми нужно работать. Не так-то просто отличить невозможную проблему от действительно очень сложной. Но научиться этому критически важно. - Вещи, которые я узнал, работая с Пэтом Брауном - 2015 [12]

Получив докторскую степень, Эйзен был научным сотрудником Стэнфордского университета в лаборатории Дэвида Ботстайна , где он, в первую очередь, разработал метод интерпретации данных экспрессии генов с микрочипов. Основополагающее исследовательское издание об этом проекте, автором которого является Эйзен, было процитировано более 16 000 раз. [14]

Бейсбол и биология [ править ]

Когда Айзен жил в штате Теннесси , он работал диктором игры по игре для бейсбольной команды Малой лиги, [11] в Колумбии мулов . Он самопровозглашенный фанатик Red Sox . [10]Он и компьютерный биолог Джеймс Фрейзер записали для iBiology видео о роли бейсбольной статистики в их исследованиях. Их аргумент состоит в том, что секвенирование ДНК похоже на подсчет очков в бейсбольном матче, и что многие компьютерные биологи научились думать о научных вычислениях из-за навязчивого интереса к бейсбольной статистике. Упражнение по сравнению статистики конкретного игрока с базой данных других похожих игроков позволяет фанату бейсбола предсказать будущие результаты. Эта же система работает с белками и функциями прогнозирования. По мере разработки инструментов, которые анализируют и отслеживают всю статистику, касающуюся бейсболистов, технологии будут совершенствоваться вместе с генетикой. Как в бейсболе, так и в генетике разрабатываются инструменты, уточняющие модели. [15] На лекции в 2015 году Эйзен заявил, что он получил компьютер от своего деда на свой двенадцатый день рождения и провел следующие пять лет, обучаясь программированию, чтобы он мог отслеживать бейсбольную статистику. [12]

Исследование [ править ]

Его научные исследования фокусируются на эволюции в регуляции генов . [16] [17] [18] [19] Несмотря на эту направленность, работа Эйзена исторически охватывала очень разные дисциплины. Например, его 5 наиболее цитируемых статей охватывают широкий круг тем, включая методы иерархической кластеризации , [16] приложения к раку груди человека (с Дэвидом Ботстайном и Чарльзом Перу) [5] и открытие подтипов опухолей в диффузных больших В-клетках лимфома (с Эшем Ализаде и Луи Штаудтом ). [17]Его большая исследовательская работа была посвящена дрозофилам и дрозофилам [20], а также тому, как они «развиваются из крошечного одноклеточного яйца до зрелого взрослого человека. Он говорит, что они понимают, что происходит у людей с возрастом». [11] Он получает финансирование от Медицинского института Говарда Хьюза на свои исследования. [20]

Гонка в Сенате США в 2018 г. [ править ]

Основная статья: 2018 выборы в Сенат США в Калифорнии

25 января Эйзен объявил через Твиттер о своем намерении баллотироваться в Сенат США от Калифорнии в 2018 году на место сенатора-демократа Дайанн Файнштейн , зарегистрировав в Твиттере имя SenatorPhD . [21] Его предвыборный лозунг был «Свобода, равенство, реальность». Причины, по которым Эйзен баллотировался в Конгресс, включали его веру в то, что администрация Трампа не реагирует на изменение климата.и другие вопросы, связанные с наукой. Другой причиной, по которой Эйзен решил баллотироваться, был его опыт наблюдения за тем, как назначенные Кабинетом министров брали интервью в Сенате об изменении климата. Он подумал: «Было бы действительно хорошо, если бы ученые задавали вопросы назначенным в Кабинет министров, потому что сенаторы, похоже, не понимают проблемы и задают неправильные вопросы». [11] Он считает, что если наука должен быть в авангарде разработки политики, «ученые должны баллотироваться на посты». Он чувствовал, что праймериз в джунглях Калифорнии в 2018 году предоставил ему больше шансов попасть в последние два на всеобщих выборах, но он не попал в финал двое (это были Дайан Файнштейн и Кевин де Леон ). [11]

В течение очень долгого времени ученые наблюдали, как политические процессы разрушаются, и наблюдали, как политики открыто высмеивают науку, игнорируя роль, которую наука играет в нашей повседневной жизни. Ученые сидели здесь, надеясь, что кто-нибудь придет и защитит этих принципов. На мой взгляд, политика должна функционировать аналогично науке. Мы должны попытаться выяснить, что происходит в мире, а затем обсудить, как это сделать, чтобы сделать мир лучше. Лучшие инструменты, которые у нас есть для характеристики реальности, - это инструменты наблюдений, которые наука использует постоянно. Слишком много политиков отвергло тот основной принцип, что ученые все время живут и дышат. [11]

Эйзен выбыл из гонки, когда не прошел квалификацию на первичное голосование в июне 2018 года. [22]

Защита открытого доступа [ править ]

На протяжении всей своей карьеры он был сторонником « открытой науки », то есть бесплатного распространения материальных и интеллектуальных продуктов научных исследований. Он является ведущим сторонником научных публикаций с открытым доступом [23] [24] [25], соучредителем Публичной научной библиотеки (PLOS) и членом совета PLOS, Академического руководящего и правозащитного комитета Открытой гуманитарной библиотеки. , [26] и является советником Science Commons .

В 2012 году Эйзен начал протестовать против Закона о научно-исследовательских работах в рамках своего призыва содействовать открытому доступу к информации. [27]

Награды и награды [ править ]

В 2002 году Эйзен был награжден первой премией Бенджамина Франклина в области биоинформатики за свою работу над PLOS и доступность его программного обеспечения кластерного анализа микрочипов в открытом доступе. [28]

Ссылки [ править ]

  1. ^ Публикации Майкла Эйзена, проиндексированные Google Scholar
  2. ^ "eLife приветствует Майкла Эйзена в качестве главного редактора" . eLife . 2019-03-05 . Проверено 5 марта 2019 .
  3. ^ "Майкл Б. Эйзен, доктор философии" . Медицинский институт Говарда Хьюза . Проверено 23 сентября 2013 года .
  4. ^ Публикации Майкла Эйзен в индексируется Scopus библиографической базы данных. (требуется подписка)
  5. ^ а б Перу, CM; Sørlie, T; Эйзен, МБ; Ван Де Рейн, М; Джеффри, СС; Рис, Калифорния; Поллак-младший; Росс, Д.Т.; Johnsen, H; Акслен, Л.А.; Fluge, O; Пергаменщиков А; Уильямс, C; Чжу, SX; Лённинг, ЧП; Børresen-Dale, AL; Браун, ПО; Ботштейн, Д. (2000). «Молекулярные портреты опухолей груди человека» . Природа . 406 (6797): 747–52. DOI : 10.1038 / 35021093 . PMID 10963602 . S2CID 1280204 .  
  6. ^ Айер, В. Р. (1999). «Программа транскрипции в ответе фибробластов человека на сыворотку». Наука . 283 (5398): 83–7. Bibcode : 1999Sci ... 283 ... 83I . DOI : 10.1126 / science.283.5398.83 . PMID 9872747 . 
  7. ^ Росс, DT; Scherf, U; Эйзен, МБ; Перу, CM; Рис, C; Spellman, P; Айер, В; Джеффри, СС; Ван Де Рейн, М; Waltham, M; Пергаменщиков А; Ли, JC; Лашкари, Д; Шалон, Д; Майерс, Т.Г.; Вайнштейн, JN; Botstein, D; Браун, ПО (2000). «Систематические вариации в паттернах экспрессии генов в линиях раковых клеток человека» . Генетика природы . 24 (3): 227–35. DOI : 10.1038 / 73432 . PMID 10700174 . S2CID 1135137 .  
  8. ^ CohenJan. 27, Джон; 2017; Вечер, 15:30 (27.01.2017). «Вопросы и ответы: Майкл Эйзен претендует на звание первого биолога-мухи в Сенате США» . Наука | AAAS . Проверено 13 апреля 2020 .CS1 maint: числовые имена: список авторов ( ссылка )
  9. ^ Оки, Сьюзен. «УЧЕНЫЙ NIH САМОУБИЙСТВО НА ПРОБЛЕМЕ БУМАГИ» . Вашингтон Пост . Проверено 7 февраля +2017 .
  10. ^ a b Механик, Майкл. «Украдите эту исследовательскую работу! (Вы уже заплатили за это.)» . Мать Джонс . Проверено 7 февраля +2017 .
  11. ^ a b c d e f Кригер, Лиза (2017-02-04). «Молекулярный биолог района Залива Майкл Эйзен объявляет заявку на избрание в Сенат США» . Новости Калифорнии . Новости Сан-Хосе Меркьюри . Проверено 7 февраля +2017 .
  12. ^ a b c «Майкл Эйзен: бейсбол, математика и биология» . Индия Био Наука . Проверено 7 февраля +2017 .
  13. ^ Эйзен, Майкл Брюс (1996). Структурные исследования белков вируса гриппа А (кандидатская диссертация). Гарвардский университет. OCLC 48938206 . 
  14. ^ Эйзен, МБ; Spellman, PT; Браун, ПО; Ботштейн, Д. (8 декабря 1998 г.). «Кластерный анализ и отображение паттернов экспрессии всего генома» . Proc Natl Acad Sci USA . 95 (25): 14863–8. Bibcode : 1998PNAS ... 9514863E . DOI : 10.1073 / pnas.95.25.14863 . PMC 24541 . PMID 9843981 .  
  15. ^ «Джеймс Фрейзер и Майкл Эйзен: бейсбол встречает биологию» . Образование . iBiology . Проверено 7 февраля +2017 .
  16. ^ а б Эйзен, М .; Spellman, P .; Браун, П .; Ботштейн, Д. (1998). «Кластерный анализ и отображение паттернов экспрессии всего генома» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 95 (25): 14863–14868. Bibcode : 1998PNAS ... 9514863E . DOI : 10.1073 / pnas.95.25.14863 . PMC 24541 . PMID 9843981 .  
  17. ^ a b Ализаде, А.А. Эйзен, МБ ; Дэвис, RE; Ma, C .; Lossos, IS; Розенвальд, А .; Болдрик, JC; Sabet, H .; Тран, Т .; Yu, X .; Пауэлл, JI; Ян, Л .; Марти, GE; Мур, Т .; Hudson Jr, J .; Lu, L .; Льюис, ДБ; Tibshirani, R .; Шерлок, Дж .; Чан, туалет; Greiner, TC; Weisenburger, DD; Армитаж, Джо; Warnke, R .; Levy, R .; Wilson, W .; Grever, MR; Byrd, JC; Botstein, D .; Браун, ПО (2000). «Определенные типы диффузной крупноклеточной В-клеточной лимфомы, идентифицированные с помощью профилирования экспрессии генов». Природа . 403 (6769): 503–511. Bibcode : 2000Natur.403..503A . DOI : 10.1038 / 35000501 . PMID 10676951 . S2CID  4382833 .
  18. ^ Drosophila 12 Genomes, Консорциум; Clark, AG; Эйзен, МБ ; Смит, Д.Р .; Бергман, CM; Оливер, B; Марков, Т.А.; Кауфман, ТК; Келлис, М; Гелбарт, Вт; Айер, В.Н.; Поллард, Д.А. Sackton, TB; Ларракуенте, AM; Сингх, Северная Дакота; Abad, JP; Abt, DN; Адриан, Б; Агуаде, М; Акаши, H; Андерсон, WW; Aquadro, CF; Арделл, DH; Arguello, R; Артьери, CG; Барбаш Д.А.; Баркер, Д; Barsanti, P; Баттерхэм, П; и другие. (2007). «Эволюция генов и геномов на филогении дрозофилы» . Природа . 450 (7167): 203–18. Bibcode : 2007Natur.450..203C . DOI : 10,1038 / природа06341 . PMID 17994087 .
  19. ^ Спеллман, PT; Шерлок, Дж .; Чжан, MQ; Айер, ВР; Андерс, К .; Эйзен, МБ; Браун, ПО; Botstein, D .; Футчер, Б. (1998). «Комплексная идентификация генов, регулируемых клеточным циклом дрожжей Saccharomyces cerevisiae, с помощью гибридизации микрочипов» . Молекулярная биология клетки . 9 (12): 3273–97. DOI : 10.1091 / mbc.9.12.3273 . PMC 25624 . PMID 9843569 .  
  20. ^ а б Хармон, Эми; Генри Фонтан (6 февраля 2017 г.). «В эпоху Трампа ученые демонстрируют признаки политического импульса» . Нью-Йорк Таймс . NYT . Проверено 7 февраля +2017 .
  21. ^ Рирдон, Сара (2017). «Генетик подает заявку на участие в Сенате США» . Природа . DOI : 10.1038 / nature.2017.21381 . S2CID 78431422 . Проверено 7 февраля +2017 . 
  22. ^ "Майкл Эйзен" . Баллотпедия . Проверено 13 апреля 2020 .
  23. ^ Эйзен, Майкл (8 октября 2003 г.). «Публикуй и хвалийся» . Хранитель . Проверено 23 сентября 2013 года .
  24. ^ Браун, ПО ; Эйзен, МБ ; Вармус, HE (2003). «Почему PLoS стала издателем» . PLOS Биология . 1 (1): E36. DOI : 10.1371 / journal.pbio.0000036 . PMC 212706 . PMID 14551926 .  
  25. ^ https://www.wired.com/wired/archive/12.04/rave_pr.html 2004 Wired Magazine Rave Awards "За то, что сломал хребет научному картелю"
  26. Рианна Ховард, Дженнифер (29 января 2013 г.). «Проект направлен на привнесение открытости в стиле PLoS в гуманитарные науки» . Хроника высшего образования . Проверено 19 ноября 2013 года .
  27. ↑ Доббс, Дэвид (6 января 2012 г.). «Конгресс рассматривает возможность платного доступа к науке, за которую вы уже заплатили» . wired.com . Проверено 12 февраля 2012 года .
  28. ^ "Премия Бенджамина Франклина - Bioinformatics.org" . www.bioinformatics.org . Проверено 7 февраля +2017 .

Внешние ссылки [ править ]

  • Это НЕ барахло - Личный блог Майкла Эйзена
  • Открытое письмо президенту Трампу о замене Фрэнсиса Коллинза на посту директора Национального института здоровья
  • Майкл Эйзен (I) в Сенат