Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску

Многоволновая аномальная дифракция (иногда Многоволновая аномальная дисперсия ; сокращенно MAD ) - это метод, используемый в рентгеновской кристаллографии, который облегчает определение трехмерной структуры биологических макромолекул (например, ДНК, рецепторов лекарств) через раствор фазы проблема . [1]

MAD был разработан Уэйном Хендриксоном, когда он работал докторантом под руководством Джерома Карла в Лаборатории военно-морских исследований США . [2] Математика, на которой основывались MAD (и предшественник аномальной дисперсии на одной длине волны ), была разработана Джеромом Карлом , за работу которого он был удостоен Нобелевской премии по химии 1985 года (вместе с Гербертом Хауптманом ).

См. Также [ править ]

Ссылки [ править ]

  1. Перейти ↑ Hendrickson W, Ogata C (1997). «Определение фазы из измерений многоволновой аномальной дифракции» . Методы в энзимологии . 276 : 494–523 . DOI : 10.1016 / S0076-6879 (97) 76074-9 . ISBN 978-0-12-182177-7. PMID  27799111 .
  2. ^ Хендриксон WA (1985). «Анализ структуры белка по дифракционным измерениям на нескольких длинах волн». Сделки ACA . 21 .

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Хендриксон WA (1985). «Анализ структуры белка по дифракционным измерениям на нескольких длинах волн». Сделки ACA . 21 .
  • Карл Дж (1980). "Некоторые разработки в области аномальной дисперсии для структурных исследований макромолекулярных систем в биологии". Международный журнал квантовой химии: симпозиум по квантовой биологии . 7 : 357–367. DOI : 10.1002 / qua.560180734 .
  • Карл Дж (1989). «Линейно-алгебраический анализ конструкций с одним преобладающим типом аномального рассеивателя» . Acta Crystallographica . 45 (4): 303–307. DOI : 10.1107 / s0108767388013042 . PMID  2559755 .
  • Палер А., Смит Дж. Л., Хендриксон В. А. (1990). «Вероятностное представление информации о фазе из многоволновой аномальной дисперсии» . Acta Crystallographica . 46 (7): 537–540. DOI : 10.1107 / s0108767390002379 .
  • Тервиллигер TC (1994). «MAD Phasing: байесовские оценки FA» . Acta Crystallographica D . 50 : 11–16. DOI : 10.1107 / s0907444993008224 .
  • Тервиллигер TC (1994). «Стадия MAD: обработка дисперсионных различий как информации об изоморфном замещении» . Acta Crystallographica D . 50 (Pt 1): 17–23. DOI : 10.1107 / s0907444993008236 . PMID  15299472 .
  • Fourme R, Shepard W., Kahn R, l'Hermite G, de La Sierra, Иллинойс (1995). «Метод многоволновой аномальной контрастности растворителя (MASC) в макроколекулярной кристаллографии». Журнал синхротронного излучения . 2 (Pt 1): 36–48. DOI : 10.1107 / S0909049594006680 . PMID  16714785 .
  • de la Fortelle E, Bricogne G (1997). "Максимально вероятное уточнение параметров тяжелых атомов для методов множественного изоморфного замещения и многоволновой аномальной дифракции" . Методы в энзимологии. 276 : 472–494 . DOI : 10.1016 / S0076-6879 (97) 76073-7 . ISBN 978-0-12-182177-7. PMID  27799110 . Цитировать журнал требует |journal=( помощь )
  • Хендриксон WA, Огата CM (1997). "Определение фазы из измерений аномальной дифракции на нескольких длинах волн" . Методы в энзимологии. 276 : 494–523 . DOI : 10.1016 / S0076-6879 (97) 76074-9 . ISBN 978-0-12-182177-7. PMID  27799111 . Цитировать журнал требует |journal=( помощь )
  • Белла Дж, Россманн MG (1998). «Общий алгоритм фазирования для множественных данных MAD и MIR». Acta Crystallographica D . 54 (2): 159–174. DOI : 10.1107 / s0907444997010469 . PMID  9761882 .
  • Гусс Дж. М., Мерритт Е. А., Физакерли Р. П., Хедман Б., Мурата М., Ходжсон К. О. , Фриман ХК (1989). «Определение фазы с помощью дифракции рентгеновских лучей на нескольких длинах волн: кристаллическая структура основного синего белка меди из огурцов». Наука . 241 (4867): 806–811. Bibcode : 1988Sci ... 241..806G . DOI : 10.1126 / science.3406739 . PMID  3406739 .

Внешние ссылки [ править ]

  • MAD phasing - подробное руководство с примерами, иллюстрациями и ссылками.
  • HHMI Bio для Уэйна Хендриксона
  • Домашняя страница Уэйна Хендриксона
  • Хендриксон Лаборатория Резюме исследований
  • Джером Карл Нобель биография
  • Признание NRL Нобелевской премии

Компьютерные программы [ править ]

  • Пакет абсорбции SSRL - Бреннан С., Коуэн П.Л. (1992). «Набор программ для расчета характеристик поглощения, отражения и дифракции рентгеновских лучей для различных материалов на произвольных длинах волн» . Обзор научных инструментов . 63 (1): 850. Bibcode : 1992RScI ... 63..850B . DOI : 10.1063 / 1.1142625 .
  • CHOOCH - Эванс Г., Петтифер РФ (2001). «CHOOCH: программа для получения факторов аномального рассеяния из спектров рентгеновской флуоресценции» . Журнал прикладной кристаллографии . 34 : 82–86. DOI : 10.1107 / S0021889800014655 .
  • Встряхните и испеките ( SnB ) - Смит Г. Д., Нагар Б., Рини Дж. М., Хауптман Г. А., Благословение Р. Х. (1998). «Использование Snb для определения субструктуры аномального рассеяния». Acta Crystallographica D . 54 (Pt 5): 799–804. DOI : 10.1107 / S0907444997018805 . PMID 9757093 . 
  • SHELX - Шелдрик GM (1998). «ШЕЛКС: приложения к макромолекулам». В С. Фортье (ред.). Прямые методы решения макромолекулярных структур . Дордрехт: Kluwer Academic Publishers. С. 401–411. ISBN 0-7923-4949-0.

Учебники и примеры [ править ]

  • Эванс, Гвиндаф (октябрь 1994 г.). «Метод множественной аномальной дифракции длин волн с использованием синхротронного излучения при оптимальных энергиях рентгеновского излучения: применение в кристаллографии белков» . Кандидатская диссертация . Уорикский университет.