Открытое Дерево жизни представляет собой интернет - филогенетическое древо жизни - совместные усилия, финансируемое Национальный научный фонд . [2] [3] Первый проект, включающий 2,3 миллиона видов, был выпущен в сентябре 2015 года. [4] Интерактивный график позволяет пользователю увеличивать масштаб таксономических классификаций, филогенетических деревьев и информации об узле. При нажатии на вид будет возвращена его исходная и справочная таксономия.
Доступно в | английский |
---|---|
URL | opentreeoflife.org |
Коммерческий | нет |
Регистрация | не требуется |
Запущен | Сентябрь 2015 г. |
Текущее состояние | активный |
Лицензия на контент | BSD с двумя предложениями (FreeBSD) [1] |
Подход
В проекте используется подход супердерева для создания единого филогенетического дерева (обслуживаемого на tree.opentreeoflife.org [5] ) на основе комплексной таксономии и тщательно подобранного набора опубликованных филогенетических оценок.
Таксономия представляет собой комбинацию нескольких крупных классификаций, созданных другими проектами; он создается с помощью программного инструмента под названием «smasher» [6] . Полученная таксономия называется таксономией открытого дерева (OTT), и ее можно просматривать в режиме онлайн. [7]
История
Проект был запущен в июне 2012 года с трехлетней награды NSF исследователям десяти университетов. В 2015 году исследователям трех институтов была присуждена дополнительная двухлетняя награда.
Смотрите также
Рекомендации
- ^ "Лицензия OpenTreeOfLife" .
- ^ Hinchliff CE, Smith SA, Allman JF, Burleigh JG, Chaudhary R, Coghill LM и др. (Октябрь 2015 г.). «Синтез филогении и систематики в единое древо жизни» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 112 (41): 12764–9. Bibcode : 2015PNAS..11212764H . DOI : 10.1073 / pnas.1423041112 . PMC 4611642 . PMID 26385966 .
- ^ «Сборка, визуализация и анализ древа жизни» . Национальный научный фонд (NSF) . Проверено 11 февраля 2016 .
- ^ Pennisi E (21 сентября 2015 г.). «Первое всеобъемлющее древо жизни показывает, насколько вы связаны с миллионами видов» . Научный журнал .
- ^
, разработчики Open Tree of Life. @gmail.com>"открытое дерево" . - ^ Рис Дж. А., Крэнстон К. (2017). «Автоматизированная сборка справочной таксономии для синтеза филогенетических данных» . Журнал данных о биоразнообразии . 5 (5): e12581. DOI : 10.3897 / BDJ.5.e12581 . PMC 5515096 . PMID 28765728 .
- ^ "tree.opentreeoflife.org" .