PDE4B

Доступные конструкции

Поиск человеческого UniProt: PDBe RCSB

Список идентификационных кодов PDB
1F0J , 1RO6 , 1RO9 , 1ROR , 1TB5 , 1XLX , 1XLZ , 1XM4 , 1XM6 , 1XMU , 1XMY , 1XN0 , 1XOS , 1XOT , 1Y2H , 1Y2J , 2CHM , 2QYL , 3G3P , 3FRG , 3hd , 3hd , 3hc , 3hc , 3hd , 3hd , 3hd 3КТ , 3ЛИ2, 3O0J , 3O56 , 3O57 , 3W5E , 3WD9 , 4KP6 , 4MYQ , 4NW7 , 4WZI , 4X0F

Идентификаторы

Псевдонимы

PDE4B , DPDE4, PDEIVB, фосфодиэстераза 4B

Внешние идентификаторы

OMIM : 600127 MGI : 99557 HomoloGene : 1953 GeneCards : PDE4B

Расположение гена ( человек )

Chr.	Хромосома 1 (человека) ^[1]

Группа	1п31.3	Начинать	65 792 514 п.н. ^[1]
Группа	1п31.3	Конец	66 374 579 п.н. ^[1]

Расположение гена ( Мышь )

Chr.	Хромосома 4 (мышь) ^[2]

Группа	4 C6 \| 4 46.99 см	Начинать	102 087 543 п.н. ^[2]
Группа	4 C6 \| 4 46.99 см	Конец	102 607 259 п.н. ^[2]

Паттерн экспрессии РНК

Дополнительные данные эталонного выражения

Генная онтология
Молекулярная функция	• ион металла связывания • 3' , 5'-циклический нуклеотид фосфодиэстеразы активность • гидролазная активность • связывание цАМФ • связывание гамма-тубулина • ионный канал связывания • фосфорная диэфир гидролазы активность • 3' , 5'-циклический-AMP фосфодиэстеразы активность • GO : 0001948 связывание с белками
Сотовый компонент	• комплекс потенциал-управляемых кальциевых каналов • комплекс гамма-тубулин • периферия клетки • цитозоль • GO: 0097483, GO: 0097481 постсинаптическая плотность • дендритный позвоночник • мембрана • центросома • диск Z • возбуждающий синапс • синаптический пузырь
Биологический процесс	• регуляция активности высоковольтных кальциевых каналов • гомеостаз нейтрофилов • клеточный ответ на лекарство • регуляция сокращения клеток сердечной мышцы • позитивная регуляция продукции гамма-интерферона • передача сигнала • клеточный ответ на липополисахарид • позитивная регуляция выработки интерлейкина-2 • миграция лейкоцитов • негативная регуляция расслабления сердечной мышцы • клеточный ответ на стимул адреналина • сигнальный путь рецептора Т-клеток • хемотаксис нейтрофилов • Катаболический процесс цАМФ • Путь передачи сигналов рецептора, сопряженного с G-белком
Источники: Amigo / QuickGO

Ортологи

Разновидность

Человек

Мышь

Entrez


5142


18578

Ансамбль


ENSG00000184588


ENSMUSG00000028525

UniProt


Q07343


н / д

RefSeq (мРНК)

NM_001037339 NM_001037340 NM_001037341 NM_001297440 NM_001297441
NM_001297442 NM_002600

NM_001177980 NM_001177981 NM_001177982 NM_001177983 NM_019840
NM_001374780

RefSeq (белок)

NP_001032416 NP_001032417 NP_001032418 NP_001284369 NP_001284370
NP_001284371 NP_002591 NP_001032418.1 NP_002591.2


н / д

Расположение (UCSC)

Chr 1: 65.79 - 66.37 Мб

Chr 4: 102,09 - 102,61 Мб

PubMed поиск

^[3]

^[4]

Викиданные

Просмотр / редактирование человека

Просмотр / редактирование мыши

цАМФ-специфические 3' , 5'-циклический фосфодиэстеразы 4B представляет собой фермент , который у человека кодируется PDE4B гена . ^[5]

Этот ген является членом типа IV, циклический АМФ (цАМФ) -специфический, циклический нуклеотид фосфодиэстеразы семьи (ФДЭ). Циклические нуклеотиды являются важными вторичными посредниками, которые регулируют и опосредуют ряд клеточных ответов на внеклеточные сигналы, такие как гормоны , свет и нейротрансмиттеры . В циклические нуклеотидные фосфодиэстеразы (ФДЭ - ферменты) регулируют клеточные концентрации циклических нуклеотидов и тем самым играют роль в сигнальной трансдукции. Этот ген кодирует белок, который специфически гидролизует цАМФ . Были охарактеризованы альтернативные варианты транскрипционного сплайсинга, кодирующие разные изоформы . ^[5]^[6]

Клиническая значимость [ править ]

Измененная активность этого белка связана с шизофренией и биполярным расстройством . ^[5] Считается, что PDE4B является подтипом PDE4, участвующим в антипсихотических эффектах ингибиторов PDE4, таких как ролипрам . ^[7] PDE4B участвует в поведении, связанном с допамином и стрессом. ^[8] Также недавно было обнаружено, что он модулирует познавательные способности, поскольку снижение активности PDE4B улучшает память и долгосрочную пластичность на моделях мышей, что, возможно, поддерживает дальнейшие терапевтические применения. ^[9]

Ингибиторы [ править ]

AN2728 , борсодержащий препарат-кандидат, который с 2015 года находился в разработке Anacor Pharmaceuticals для местного лечения псориаза и атопического дерматита (атопической экземы). ^[10]^[11]^{[12] в} основном действует на PDE4B. ^[12]

Ссылки [ править ]

^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000184588 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028525 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ a b c «Ген Entrez: PDE4B фосфодиэстераза 4B, цАМФ-специфическая (гомолог фосфодиэстеразы E4 dunce, Drosophila)» .
^ Свердлоу, Нил Р. (2010-08-19). Поведенческая нейробиология шизофрении и ее лечение . Springer Science & Business Media. ISBN 9783642137174.
^ Porteous DJ, Миллар JK, Brandon NJ, Савва A (декабрь 2011). «DISC1 в 10: соединение психиатрической генетики и нейробиологии» . Тенденции в молекулярной медицине . 17 (12): 699–706. DOI : 10.1016 / j.molmed.2011.09.002 . PMC 3253483 . PMID 22015021 .
^ Фрэнсис, SH; Конти, М; Houslay, MD, eds. (2011). Фосфодиэстеразы как мишени для лекарств (PDF) . Справочник по экспериментальной фармакологии. 204 . Springer Berlin Heidelberg. DOI : 10.1007 / 978-3-642-17969-3 . ISBN 978-3-642-17968-6.^{[ постоянная мертвая ссылка ]}
^ http://newsdaily.com/2015/08/scientists-researching-brain-disorders-create-super-clever-mice/
^ Anacor AN2728 на сайте Anacor Page доступ 15 мая 2015
^ Назарян R, Weinberg JM (ноябрь 2009). «AN-2728, ингибитор PDE4 для потенциального местного лечения псориаза и атопического дерматита». Текущее мнение об исследуемых лекарствах . 10 (11): 1236–42. PMID 19876791 .
^ a b Moustafa F, Feldman SR (май 2014 г.). «Обзор ингибирования фосфодиэстеразы и потенциальной роли ингибиторов фосфодиэстеразы 4 в клинической дерматологии» . Дерматол. Онлайн Дж . 20 (5): 22608. PMID 24852768 .

Дальнейшее чтение [ править ]

Шпирер К., Шпирер Дж., Ривьер М., Суиннен Дж., Вичини Э, Конти М. (1995). «Хромосомная локализация генов человека и крысы (PDE4D и PDE4B), кодирующих цАМФ-специфические фосфодиэстеразы 3 и 4». Цитогенетика и клеточная генетика . 69 (1–2): 11–4. DOI : 10.1159 / 000133927 . PMID 7835077 .
Болджер Г.Б., Роджерс Л., Риггс М. (ноябрь 1994 г.). «Дифференциальная экспрессия в ЦНС альтернативных изоформ мРНК генов млекопитающих, кодирующих цАМФ-специфические фосфодиэстеразы». Джин . 149 (2): 237–44. DOI : 10.1016 / 0378-1119 (94) 90155-4 . PMID 7958996 .
Милатович А., Болджер Г., Михаэли Т., Франк У. (март 1994 г.). «Хромосомные локализации генов пяти цАМФ-специфических фосфодиэстераз у человека и мыши». Соматическая клетка и молекулярная генетика . 20 (2): 75–86. DOI : 10.1007 / BF02290677 . PMID 8009369 . S2CID 19182571 .
McLaughlin MM, Cieslinski LB, Burman M, Torphy TJ, Livi GP (март 1993 г.). «Низкая Km, ролипрам-чувствительная, цАМФ-специфическая фосфодиэстераза из человеческого мозга. Клонирование и экспрессия кДНК, биохимическая характеристика рекомбинантного белка и распределение мРНК в тканях» . Журнал биологической химии . 268 (9): 6470–6. DOI : 10.1016 / S0021-9258 (18) 53275-0 . PMID 8384210 .
Обернолте Р., Бхакта С., Альварес Р., Бах С., Цуппан П., Малкинс М., Джарнагин К., Шелтон Е. Р. (июль 1993 г.). «КДНК циклической AMP фосфодиэстеразы лимфоцитов человека (PDE IV) выявляет мультигенное семейство». Джин . 129 (2): 239–47. DOI : 10.1016 / 0378-1119 (93) 90274-7 . PMID 8392015 .
Болджер Г., Михаэли Т., Мартинс Т., Сент-Джон Т., Штайнер Б., Роджерс Л., Риггс М., Виглер М., Фергюсон К. (октябрь 1993 г.). «Семейство человеческих фосфодиэстераз, гомологичных глупому продукту гена обучения и памяти Drosophila melanogaster, является потенциальной мишенью для антидепрессантов» . Молекулярная и клеточная биология . 13 (10): 6558–71. DOI : 10.1128 / mcb.13.10.6558 . PMC 364715 . PMID 8413254 .
Huston E, Lumb S, Russell A, Catterall C, Ross AH, Steele MR, Bolger GB, Perry MJ, Owens RJ, Houslay MD (декабрь 1997 г.). «Молекулярное клонирование и временная экспрессия в клетках COS7 новой человеческой PDE4B cAMP-специфической фосфодиэстеразы, HSPDE4B3» . Биохимический журнал . 328 (Pt 2): 549–58. DOI : 10.1042 / bj3280549 . PMC 1218954 . PMID 9371714 .
Ма Д., Ву П., Иган Р. В., Билла М. М., Ван П. (январь 1999 г.). «Транскрипция гена фосфодиэстеразы 4B активируется липополисахаридом и ингибируется интерлейкином-10 в моноцитах человека». Молекулярная фармакология . 55 (1): 50–7. DOI : 10.1124 / mol.55.1.50 . PMID 9882697 .
Secchiero P, Zella D, Curreli S, Mirandola P, Capitani S, Gallo RC, Zauli G (декабрь 2000 г.). «Основная роль циклической нуклеозид фосфодиэстеразы 4 в Tat-опосредованной гиперактивации CD4 + Т-клеток и репликации ВИЧ 1 типа» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (26): 14620–5. Bibcode : 2000PNAS ... 9714620S . DOI : 10.1073 / pnas.011512398 . PMC 18968 . PMID 11114167 .
Заули Г., Милани Д., Мирандола П., Маццони М., Секкиеро П., Миша С., Капитани С. (февраль 2001 г.). «Белок Tat ВИЧ-1 подавляет экспрессию фактора транскрипции CREB в нейрональных клетках PC12 посредством пути фосфатидилинозитол-3-киназы / AKT / циклической нуклеозидфосфодиэстеразы». Журнал FASEB . 15 (2): 483–91. DOI : 10,1096 / fj.00-0354com . PMID 11156964 . S2CID 26315564 .
Moon E, Lee R, Near R, Weintraub L, Wolda S, Lerner A (февраль 2002 г.). «Ингибирование PDE3B усиливает апоптоз, индуцированный ингибитором PDE4, в подгруппе пациентов с хроническим лимфолейкозом». Клинические исследования рака . 8 (2): 589–95. PMID 11839681 .
Shepherd M, McSorley T., Olsen AE, Johnston LA, Thomson NC, Baillie GS, Houslay MD, Bolger GB (март 2003 г.). «Молекулярное клонирование и субклеточное распределение новой изоформы фосфодиэстеразы PDE4B4 cAMP» . Биохимический журнал . 370 (Pt 2): 429–38. DOI : 10.1042 / BJ20021082 . PMC 1223190 . PMID 12441002 .
Арп Дж., Кирххоф М.Г., Бароджа М.Л., Назарян С.Х., Чау Т.А., Стратди Калифорния, Болл Э.Х., Мадренас Дж. (Ноябрь 2003 г.). «Регулирование активации Т-клеток фосфодиэстеразой 4B2 требует ее динамического перераспределения во время формирования иммунологических синапсов» . Молекулярная и клеточная биология . 23 (22): 8042–57. DOI : 10.1128 / MCB.23.22.8042-8057.2003 . PMC 262363 . PMID 14585965 .
Бранденбергер Р., Вэй Х., Чжан С., Лей С., Мурадж Дж., Фиск Дж. Дж., Ли И, Сюй С., Фанг Р., Гуглер К., Рао М. С., Мандалам Р., Лебковски Дж., Стэнтон Л. В. (июнь 2004 г.). «Характеристика транскриптома проясняет сигнальные сети, которые контролируют рост и дифференцировку человеческих ES-клеток». Природа Биотехнологии . 22 (6): 707–16. DOI : 10,1038 / NBT971 . PMID 15146197 . S2CID 27764390 .
Смит П.Г., Ван Ф., Уилкинсон К.Н., Сэвидж К.Дж., Кляйн Ю., Нойберг Д.С., Боллаг Г., Шипп М.А., Агияр Р. «Фосфодиэстераза PDE4B ограничивает цАМФ-ассоциированный PI3K / AKT-зависимый апоптоз в диффузной крупноклеточной В-клеточной лимфоме» . Кровь . 105 (1): 308–16. DOI : 10.1182 / кровь-2004-01-0240 . PMID 15331441 .
Баллиф Б.А., Виллен Дж., Босолей С.А., Шварц Д., Гиги С.П. (ноябрь 2004 г.). «Фосфопротеомный анализ развивающегося мозга мыши» . Молекулярная и клеточная протеомика . 3 (11): 1093–101. DOI : 10.1074 / mcp.M400085-MCP200 . PMID 15345747 .
Миллар Дж. К., Пикард Б. С., Маки С., Джеймс Р., Кристи С., Бьюкенен С. Р., Маллой М. П., Чабб Дж. , Blackwood DH, Muir WJ, Porteous DJ (ноябрь 2005 г.). «DISC1 и PDE4B являются взаимодействующими генетическими факторами при шизофрении, которые регулируют передачу сигналов цАМФ». Наука . 310 (5751): 1187–91. Bibcode : 2005Sci ... 310.1187M . DOI : 10.1126 / science.1112915 . PMID 16293762 . S2CID 3060031 .
Кимура К., Вакамацу А., Судзуки И., Ота Т., Нисикава Т., Ямасита Р., Ямамото Дж., Секин М., Цуритани К., Вакагури Х., Исии С., Сугияма Т., Сайто К., Исоно Й, Ирие Р, Кушида Н., Йонеяма Т. , Otsuka R, Kanda K, Yokoi T, Kondo H, Wagatsuma M, Murakawa K, Ishida S, Ishibashi T, Takahashi-Fujii A, Tanase T, Nagai K, Kikuchi H, Nakai K, Isogai T, Sugano S (январь 2006 г.) ). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека» . Геномные исследования . 16 (1): 55–65. DOI : 10.1101 / gr.4039406 . PMC 1356129 . PMID 16344560 .

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000184588 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028525 - Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] «Ген Entrez: PDE4B фосфодиэстераза 4B, цАМФ-специфическая (гомолог фосфодиэстеразы E4 dunce, Drosophila)» .

[6] Свердлоу, Нил Р. (2010-08-19). Поведенческая нейробиология шизофрении и ее лечение . Springer Science & Business Media. ISBN 9783642137174.

[7] Porteous DJ, Миллар JK, Brandon NJ, Савва A (декабрь 2011). «DISC1 в 10: соединение психиатрической генетики и нейробиологии» . Тенденции в молекулярной медицине . 17 (12): 699–706. DOI : 10.1016 / j.molmed.2011.09.002 . PMC 3253483 . PMID 22015021 .

[8] Фрэнсис, SH; Конти, М; Houslay, MD, eds. (2011). Фосфодиэстеразы как мишени для лекарств (PDF) . Справочник по экспериментальной фармакологии. 204 . Springer Berlin Heidelberg. DOI : 10.1007 / 978-3-642-17969-3 . ISBN 978-3-642-17968-6.^{[ постоянная мертвая ссылка ]}

[9] ttp://newsdaily.com/2015/08/scientists-researching-brain-disorders-create-super-clever-mice/

[Anacor-10] Anacor AN2728 на сайте Anacor Page доступ 15 мая 2015

[Nazarian-11] Назарян R, Weinberg JM (ноябрь 2009). «AN-2728, ингибитор PDE4 для потенциального местного лечения псориаза и атопического дерматита». Текущее мнение об исследуемых лекарствах . 10 (11): 1236–42. PMID 19876791 .

[Moustafa-12] Moustafa F, Feldman SR (май 2014 г.). «Обзор ингибирования фосфодиэстеразы и потенциальной роли ингибиторов фосфодиэстеразы 4 в клинической дерматологии» . Дерматол. Онлайн Дж . 20 (5): 22608. PMID 24852768 .