PDE4D

Доступные конструкции

Поиск человеческого UniProt: PDBe RCSB

Список идентификационных кодов PDB
1MKD , 1OYN , 1PTW , 1Q9M , 1TB7 , 1TBB , 1XOM , 1XON , 1XOQ , 1XOR , 1Y2B , 1Y2C , 1Y2D , 1Y2E , 1Y2K , 1ZKN , 2FM0 , 2FM5 , 2PW3 , 2QYN , 3G4G , 3G4I , 3G4K , 3G4L , 3G58 , 3IAD , 3IAK, 3K4S , 3SL3 , 3SL4 , 3SL5 , 3SL6 , 3SL8 , 3V9B , 4OGB , 4W1O , 4WCU

Идентификаторы

Псевдонимы

PDE4D , ACRDYS2, DPDE3, HSPDE43, PDE4DN2, STRK1, фосфодиэстераза 4D

Внешние идентификаторы

OMIM : 600129 HomoloGene : 129755 GeneCards : PDE4D

Расположение гена ( человек )

Chr.	Хромосома 5 (человека) ^[1]

Группа	5q11.2-q12.1	Начинать	58 969 038 п.н. ^[1]
Группа	5q11.2-q12.1	Конец	60 522 120 п.н. ^[1]

Паттерн экспрессии РНК

Дополнительные данные эталонного выражения

Генная онтология
Молекулярная функция	• АТФаза связывания • каркасный белок связывания • связывания цАМФа • иона металла связывание • бета-2 адренергические рецепторы связывание • GO: связывание 0001948 белка • лекарственного средства связывания • фосфорной диэфир гидролазы активность • ферментов связывание • гидролазы активности • убиквитина белка лигазы связывания • связывания ионного канала • Активность 3 ', 5'-циклического АМФ фосфодиэстеразы • Активность 3', 5'-циклической нуклеотидной фосфодиэстеразы
Сотовый компонент	• цитоплазма • цитозоль • центросома • центр организации микротрубочек • апикальная плазматическая мембрана • цитоскелет • мембрана • комплекс кальциевых каналов • комплекс потенциал-управляемых кальциевых каналов • клеточная мембрана • ядерная мембрана
Биологический процесс	• установление эндотелиального барьера • сокращение гладкой мускулатуры • положительная регуляция продукции интерлейкина-5 • рост многоклеточного организма • старение • регуляция активности рецепторов • положительная регуляция продукции гамма-интерферона • хемотаксис нейтрофилов • положительная регуляция продукции интерлейкина-2 • регуляция коммуникация между клетками посредством электрического взаимодействия, участвующего в сердечной проводимости • сигнальный путь адренергических рецепторов • клеточный ответ на липополисахарид • сигнальный путь Т-клеточного рецептора • сигнальный путь адренергических рецепторов, участвующий в позитивной регуляции частоты сердечных сокращений • cAMP-опосредованная передача сигналов • клеточный ответ на цАМФ • передача сигнала • миграция лейкоцитов • негативная регуляция расслабления сердечной мышцы • регуляция высвобождения секвестрированного иона кальция в цитозоль саркоплазматическим ретикулумом • отрицательный регуляция сердечных сокращений • регуляция частоты сердечных сокращений • регуляция активности рианодин-чувствительных каналов высвобождения кальция • катаболический процесс цАМФ • клеточный ответ на стимул адреналина • регуляция сокращения клеток сердечной мышцы • негативная регуляция фосфорилирования пептидил-серина • сигнальный путь рецептора, сопряженного с G-белком • негативная регуляция передачи сигналов, опосредованной цАМФ
Источники: Amigo / QuickGO

Ортологи

Разновидность

Человек

Мышь

Entrez


5144


н / д

Ансамбль


ENSG00000113448


н / д

UniProt


Q08499


н / д

RefSeq (мРНК)

NM_001104631 NM_001165899 NM_001197218 NM_001197219 NM_001197220
NM_001197221 NM_001197222 NM_001197223 NM_006203 NM_001349241 NM_001349242 NM_001349243 NM_001364599 NM_001364600 NM_001364601 NM_001364602 NM_001364603 NM_001364604


н / д

RefSeq (белок)

NP_001098101 NP_001159371 NP_001184147 NP_001184148 NP_001184149
NP_001184150 NP_001184151 NP_001184152 NP_006194 NP_001336170 NP_001336171 NP_001336172 NP_001351528 NP_001351529 NP_001351530 NP_001351531 NP_001351532 NP_001351533


н / д

Расположение (UCSC)

Chr 5: 58.97 - 60.52 Мб

н / д

PubMed поиск

^[2]

н / д

Викиданные

Просмотр / редактирование человека

цАМФ-специфические 3' , 5'-циклический фосфодиэстеразы 4D представляет собой фермент , который у человека кодируется PDE4D гена .

Функция [ править ]

Ген PDE4D сложен и имеет по крайней мере 9 различных изоформ, которые кодируют функциональные белки. Эти белки разрушают второй мессенджер цАМФ, который является ключевой молекулой передачи сигнала во многих типах клеток, включая клетки сосудов (Dominiczak and McBride, 2003). [Предоставлено OMIM] ^[3]

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что PDE4D взаимодействует с миомегалином ^[4] и GNB2L1 . ^[5]^[6]

Клиническая значимость [ править ]

Мутации в этом гене были связаны со случаями акродизостоза . ^[7]

Это подтип PDE4, который, по-видимому, участвует в рвотном и антидепрессивном эффектах ингибиторов PDE4 . ^[8]

Кроме того, изменения в экспрессии изоформы PDE4D7 были предложены в качестве биомаркера рака простаты. ^[9]^[10]^[11]

Ссылки [ править ]

^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000113448 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ген Entrez: PDE4D фосфодиэстераза 4D, цАМФ-специфический (гомолог фосфодиэстеразы E3 dunce, Drosophila)» .
^ Верде Я, Пальке G, Salanova М, G Чжан, Ван S, Coletti D, Onuffer J, Джин SL, Конти М (апрель 2001 г.). «Миомегалин - это новый белок гольджи / центросомы, который взаимодействует с циклической нуклеотидной фосфодиэстеразой» . Журнал биологической химии . 276 (14): 11189–98. DOI : 10.1074 / jbc.M006546200 . PMID 11134006 .
^ Ярвуд SJ, Steele MR, Шотландия G, Houslay MD, Болджер GB (май 1999). «Белок сигнального каркаса RACK1 избирательно взаимодействует с цАМФ-специфической изоформой фосфодиэстеразы PDE4D5» . Журнал биологической химии . 274 (21): 14909–17. DOI : 10.1074 / jbc.274.21.14909 . PMID 10329691 .
↑ Стил М.Р., МакКахилл А., Томпсон Д.С., Маккензи С., Айзекс Н.В., Хауслей М.Д., Болджер, Великобритания (июль 2001 г.). «Идентификация поверхности бета-пропеллерного белка RACK1, которая взаимодействует с цАМФ-специфической фосфодиэстеразой PDE4D5». Сотовая связь . 13 (7): 507–13. DOI : 10.1016 / S0898-6568 (01) 00167-X . PMID 11516626 .
^ Michot C, Le Goff C, Goldenberg A, Abhyankar A, Klein C, Kinning E, Guerrot AM, Flahaut P, Duncombe A, Baujat G, Lyonnet S, Thalassinos C, Nitschke P, Casanova JL, Le Merrer M, Munnich A , Кормье-Дэр V (апрель 2012 г.). «Секвенирование экзома идентифицирует мутации PDE4D как другую причину акродизостоза» . Американский журнал генетики человека . 90 (4): 740–5. DOI : 10.1016 / j.ajhg.2012.03.003 . PMC 3322219 . PMID 22464250 .
^ Zhang HT (2009). «Циклическая AMP-специфическая фосфодиэстераза-4 как мишень для разработки антидепрессантов». Текущий фармацевтический дизайн . 15 (14): 1688–98. DOI : 10,2174 / 138161209788168092 . PMID 19442182 .
^ Беттхер R, Henderson DJ, Dulla K, ван Strijp D, Waanders LF, ТЭВЗ G, Леман ML, Merkle D, ван Leenders GJ, Бэйли GS, Jenster G, Houslay MD, Hoffmann R (ноябрь 2015). «Экспрессия человеческой фосфодиэстеразы 4D7 (PDE4D7) увеличивается при TMPRSS2-ERG-положительном первичном раке простаты и независимо увеличивает риск послеоперационного прогрессирования заболевания» . Британский журнал рака . 113 (10): 1502–11. DOI : 10.1038 / bjc.2015.335 . PMC 4815894 . PMID 26575822 .
^ Беттхер R, Dulla К, ван Strijp Д, Диц Н, Верхоэф Е.И., Бэйли Г.С., ван Линдерс ГДж, Houslay MD, Jenster G, R Гофмана (октябрь 2016). «Композиция изоформы PDE4D человека не регулируется при первичном раке простаты и свидетельствует о прогрессировании заболевания и развитии отдаленных метастазов» . Oncotarget . 7 (43): 70669–70684. DOI : 10.18632 / oncotarget.12204 . PMC 5342582 . PMID 27683107 .
^ Хендерсон DJ, Бирн A, Dulla K, Jenster G, Hoffmann R, Бэйли GS, Houslay MD (март 2014). «ЦАМФ-фосфодиэстераза-4D7 (PDE4D7) подавляется в андрогеннезависимых клетках рака простаты и опосредует пролиферацию путем компартментализации цАМФ на плазматической мембране клеток рака простаты VCaP» . Британский журнал рака . 110 (5): 1278–87. DOI : 10.1038 / bjc.2014.22 . PMC 3950871 . PMID 24518597 .

Дальнейшее чтение [ править ]

Ван Кью (май 2005 г.). «Молекулярная генетика ишемической болезни сердца» . Текущее мнение в кардиологии . 20 (3): 182–8. DOI : 10.1097 / 01.hco.0000160373.77190.f1 . PMC 1579824 . PMID 15861005 .
Свиннен СП, Джозеф Д. Р., Конти М. (ноябрь 1989 г.). «МРНК, кодирующая высокоаффинную фосфодиэстеразу цАМФ, регулируется гормонами и цАМФ» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 86 (21): 8197–201. DOI : 10.1073 / pnas.86.21.8197 . PMC 298247 . PMID 2554303 .
Милатович А., Болджер Г., Михаэли Т., Франк У. (март 1994 г.). «Хромосомные локализации генов пяти цАМФ-специфических фосфодиэстераз у человека и мыши». Соматическая клетка и молекулярная генетика . 20 (2): 75–86. DOI : 10.1007 / BF02290677 . PMID 8009369 . S2CID 19182571 .
Baecker PA, Obernolte R, Bach C, Yee C., Shelton ER (январь 1994). «Выделение кДНК, кодирующей человеческую ролипрам-чувствительную циклическую АМФ-фосфодиэстеразу (PDE IVD)». Джин . 138 (1–2): 253–6. DOI : 10.1016 / 0378-1119 (94) 90818-4 . PMID 8125310 .
Болджер Г., Михаэли Т., Мартинс Т., Сент-Джон Т., Штайнер Б., Роджерс Л., Риггс М., Виглер М., Фергюсон К. (октябрь 1993 г.). «Семейство человеческих фосфодиэстераз, гомологичных глупому продукту гена обучения и памяти Drosophila melanogaster, является потенциальной мишенью для антидепрессантов» . Молекулярная и клеточная биология . 13 (10): 6558–71. DOI : 10.1128 / mcb.13.10.6558 . PMC 364715 . PMID 8413254 .
Böttcher R, Henderson DJ, Dulla K, van Strijp D, Waanders LF, Tevz G, Lehman ML, Merkle D, van Leenders GJ, Baillie GS, Jenster G, Houslay MD, Hoffmann R (ноябрь 2015 г.). «Экспрессия человеческой фосфодиэстеразы 4D7 (PDE4D7) увеличивается при TMPRSS2-ERG-положительном первичном раке простаты и независимо увеличивает риск послеоперационного прогрессирования заболевания» . Британский журнал рака . 113 (10): 1502–11. DOI : 10.1038 / bjc.2015.335 . PMC 4815894 . PMID 26575822 .
Бёттчер Р., Дулла К., ван Страйп Д., Дитс Н., Верхоф Е. И., Бейли Г. С., ван Лендерс Г. Дж., Хауслей М. Д., Йенстер Г., Хоффманн Р. (октябрь 2016 г.). «Композиция изоформы PDE4D человека не регулируется при первичном раке простаты и свидетельствует о прогрессировании заболевания и развитии отдаленных метастазов» . Oncotarget . 7 (43): 70669–70684. DOI : 10.18632 / oncotarget.12204 . PMC 5342582 . PMID 27683107 .
Хендерсон Д. Д., Бирн А., Дулла К., Йенстер Г., Хоффманн Р., Бейли Г. С., Хуслей М. Д. (март 2014 г.). «ЦАМФ фосфодиэстераза-4D7 (PDE4D7) подавляется в андрогеннезависимых клетках рака простаты и опосредует пролиферацию путем компартментализации цАМФ на плазматической мембране клеток рака простаты VCaP» . Британский журнал рака . 110 (5): 1278–87. DOI : 10.1038 / bjc.2014.22 . PMC 3950871 . PMID 24518597 .
Sette C, Conti M (июль 1996 г.). «Фосфорилирование и активация цАМФ-специфической фосфодиэстеразы цАМФ-зависимой протеинкиназой. Участие серина 54 в активации фермента» . Журнал биологической химии . 271 (28): 16526–34. DOI : 10.1074 / jbc.271.28.16526 . PMID 8663227 .
Немоз Дж., Чжан Р., Сетте С., Конти М. (апрель 1996 г.). «Идентификация вариантов циклической AMP-фосфодиэстеразы из гена PDE4D, экспрессируемого в периферических мононуклеарных клетках человека». Письма FEBS . 384 (1): 97–102. DOI : 10.1016 / 0014-5793 (96) 00300-6 . PMID 8797812 . S2CID 42228241 .
Bolger GB, Erdogan S, Jones RE, Loughney K, Scotland G, Hoffmann R, Wilkinson I, Farrell C, Houslay MD (декабрь 1997 г.). «Характеристика пяти различных белков, продуцируемых альтернативным сплайсингом мРНК из гена цАМФ-специфической фосфодиэстеразы PDE4D человека» . Биохимический журнал . 328 (Pt 2): 539–48. DOI : 10.1042 / bj3280539 . PMC 1218953 . PMID 9371713 .
Hoffmann R, Baillie GS, MacKenzie SJ, Yarwood SJ, Houslay MD (февраль 1999 г.). «Киназа MAP ERK2 ингибирует циклическую AMP-специфическую фосфодиэстеразу HSPDE4D3, фосфорилируя ее по Ser579» . Журнал EMBO . 18 (4): 893–903. DOI : 10.1093 / emboj / 18.4.893 . PMC 1171182 . PMID 10022832 .
Ярвуд SJ, Стил MR, Шотландия G, Houslay MD, Bolger GB (май 1999). «Белок сигнального каркаса RACK1 избирательно взаимодействует с цАМФ-специфической изоформой фосфодиэстеразы PDE4D5» . Журнал биологической химии . 274 (21): 14909–17. DOI : 10.1074 / jbc.274.21.14909 . PMID 10329691 .
Борода МБ, О'Коннелл Дж. С., Болджер Дж. Б., Хауслей, Мэриленд (октябрь 1999 г.). «Уникальный N-концевой домен цАМФ фосфодиэстеразы PDE4D4 позволяет взаимодействовать со специфическими доменами SH3» . Письма FEBS . 460 (1): 173–7. DOI : 10.1016 / S0014-5793 (99) 01335-6 . PMID 10571082 . S2CID 42574718 .
Маккензи SJ, Baillie GS, McPhee I, Bolger GB, Houslay MD (июнь 2000 г.). «Связывание митоген-активируемой протеинкиназы ERK2, фосфорилирование и регуляция PDE4D cAMP-специфических фосфодиэстераз. Участие COOH-концевых участков стыковки и NH2-концевых областей UCR» . Журнал биологической химии . 275 (22): 16609–17. DOI : 10.1074 / jbc.275.22.16609 . PMID 10828059 .
Миро X, Казакуберта Дж. М., Гутьеррес-Лопес, доктор медицины, де Ландазури, Миссури, Пучдоменек П. (август 2000 г.). «Варианты сплайсинга фосфодиэстераз 4D и 7A в ответе клеток HUVEC на TNF-альфа (1)». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях . 274 (2): 415–21. DOI : 10.1006 / bbrc.2000.3146 . PMID 10913353 .
Verde I, Pahlke G, Salanova M, Zhang G, Wang S, Coletti D, Onuffer J, Jin SL, Conti M (апрель 2001 г.). «Миомегалин - это новый белок гольджи / центросомы, который взаимодействует с циклической нуклеотидной фосфодиэстеразой» . Журнал биологической химии . 276 (14): 11189–98. DOI : 10.1074 / jbc.M006546200 . PMID 11134006 .
Заули Г., Милани Д., Мирандола П., Маццони М., Секкиеро П., Миша С., Капитани С. (февраль 2001 г.). «Белок Tat ВИЧ-1 подавляет экспрессию фактора транскрипции CREB в нейрональных клетках PC12 посредством пути фосфатидилинозитол-3-киназы / AKT / циклической нуклеозидфосфодиэстеразы». Журнал FASEB . 15 (2): 483–91. DOI : 10,1096 / fj.00-0354com . PMID 11156964 . S2CID 26315564 .
Dodge KL, Khouangsathiene S, Kapiloff MS, Mouton R, Hill EV, Houslay MD, Langeberg LK, Scott JD (апрель 2001 г.). «mAKAP собирает модуль передачи сигналов цАМФ протеинкиназы A / PDE4 фосфодиэстеразы» . Журнал EMBO . 20 (8): 1921–30. DOI : 10.1093 / emboj / 20.8.1921 . PMC 125429 . PMID 11296225 .
Стил М.Р., МакКахилл А., Томпсон Д.С., Маккензи К., Айзекс Н.В., Хауслей М.Д., Болджер, Великобритания (июль 2001 г.). «Идентификация поверхности бета-пропеллерного белка RACK1, которая взаимодействует с цАМФ-специфической фосфодиэстеразой PDE4D5». Сотовая связь . 13 (7): 507–13. DOI : 10.1016 / S0898-6568 (01) 00167-X . PMID 11516626 .
Gretarsdottir S, Sveinbjörnsdottir S, Jonsson HH, Jakobsson F, Einarsdottir E, Agnarsson U, Shkolny D, Einarsson G, Gudjonsdottir HM, Valdimarsson EM, Einarsson OB, Thorgeirsson G, Jonsdotrussic Rd , Gudlaugsdottir GJ, Gill R, Lindpaintner K, Sainz J, Hannesson HH, Sigurdsson GT, Frigge ML, Kong A, Gudnason V, Stefansson K, Gulcher JR (март 2002 г.). «Локализация гена предрасположенности к распространенным формам инсульта к 5q12» . Американский журнал генетики человека . 70 (3): 593–603. DOI : 10.1086 / 339252 . PMC 384939 . PMID 11833004 .
Moon E, Lee R, Near R, Weintraub L, Wolda S, Lerner A (февраль 2002 г.). «Ингибирование PDE3B усиливает апоптоз, индуцированный ингибитором PDE4, в подгруппе пациентов с хроническим лимфолейкозом». Клинические исследования рака . 8 (2): 589–95. PMID 11839681 .
Ле Jeune IR, Shepherd M, Van Heeke G, Houslay MD, Hall IP (сентябрь 2002 г.). «Циклическое AMP-зависимое повышение транскрипции фосфодиэстеразы 4D5 в клетках гладких мышц дыхательных путей человека. Идентификация и характеристика нового промотора PDE4D5» . Журнал биологической химии . 277 (39): 35980–9. DOI : 10.1074 / jbc.M204832200 . PMID 12121997 .

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000113448 - Ensembl , май 2017 г.

[2] "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-3] «Ген Entrez: PDE4D фосфодиэстераза 4D, цАМФ-специфический (гомолог фосфодиэстеразы E3 dunce, Drosophila)» .

[pmid11134006-4] Верде Я, Пальке G, Salanova М, G Чжан, Ван S, Coletti D, Onuffer J, Джин SL, Конти М (апрель 2001 г.). «Миомегалин - это новый белок гольджи / центросомы, который взаимодействует с циклической нуклеотидной фосфодиэстеразой» . Журнал биологической химии . 276 (14): 11189–98. DOI : 10.1074 / jbc.M006546200 . PMID 11134006 .

[pmid10329691-5] Ярвуд SJ, Steele MR, Шотландия G, Houslay MD, Болджер GB (май 1999). «Белок сигнального каркаса RACK1 избирательно взаимодействует с цАМФ-специфической изоформой фосфодиэстеразы PDE4D5» . Журнал биологической химии . 274 (21): 14909–17. DOI : 10.1074 / jbc.274.21.14909 . PMID 10329691 .

[pmid11516626-6] Стил М.Р., МакКахилл А., Томпсон Д.С., Маккензи С., Айзекс Н.В., Хауслей М.Д., Болджер, Великобритания (июль 2001 г.). «Идентификация поверхности бета-пропеллерного белка RACK1, которая взаимодействует с цАМФ-специфической фосфодиэстеразой PDE4D5». Сотовая связь . 13 (7): 507–13. DOI : 10.1016 / S0898-6568 (01) 00167-X . PMID 11516626 .

[pmid.22464250-7] Michot C, Le Goff C, Goldenberg A, Abhyankar A, Klein C, Kinning E, Guerrot AM, Flahaut P, Duncombe A, Baujat G, Lyonnet S, Thalassinos C, Nitschke P, Casanova JL, Le Merrer M, Munnich A , Кормье-Дэр V (апрель 2012 г.). «Секвенирование экзома идентифицирует мутации PDE4D как другую причину акродизостоза» . Американский журнал генетики человека . 90 (4): 740–5. DOI : 10.1016 / j.ajhg.2012.03.003 . PMC 3322219 . PMID 22464250 .

[8] Zhang HT (2009). «Циклическая AMP-специфическая фосфодиэстераза-4 как мишень для разработки антидепрессантов». Текущий фармацевтический дизайн . 15 (14): 1688–98. DOI : 10,2174 / 138161209788168092 . PMID 19442182 .

[pmid.26575822-9] Беттхер R, Henderson DJ, Dulla K, ван Strijp D, Waanders LF, ТЭВЗ G, Леман ML, Merkle D, ван Leenders GJ, Бэйли GS, Jenster G, Houslay MD, Hoffmann R (ноябрь 2015). «Экспрессия человеческой фосфодиэстеразы 4D7 (PDE4D7) увеличивается при TMPRSS2-ERG-положительном первичном раке простаты и независимо увеличивает риск послеоперационного прогрессирования заболевания» . Британский журнал рака . 113 (10): 1502–11. DOI : 10.1038 / bjc.2015.335 . PMC 4815894 . PMID 26575822 .

[pmid.27683107-10] Беттхер R, Dulla К, ван Strijp Д, Диц Н, Верхоэф Е.И., Бэйли Г.С., ван Линдерс ГДж, Houslay MD, Jenster G, R Гофмана (октябрь 2016). «Композиция изоформы PDE4D человека не регулируется при первичном раке простаты и свидетельствует о прогрессировании заболевания и развитии отдаленных метастазов» . Oncotarget . 7 (43): 70669–70684. DOI : 10.18632 / oncotarget.12204 . PMC 5342582 . PMID 27683107 .

[pmid.24518597-11] Хендерсон DJ, Бирн A, Dulla K, Jenster G, Hoffmann R, Бэйли GS, Houslay MD (март 2014). «ЦАМФ-фосфодиэстераза-4D7 (PDE4D7) подавляется в андрогеннезависимых клетках рака простаты и опосредует пролиферацию путем компартментализации цАМФ на плазматической мембране клеток рака простаты VCaP» . Британский журнал рака . 110 (5): 1278–87. DOI : 10.1038 / bjc.2014.22 . PMC 3950871 . PMID 24518597 .