| Pasteurellaceae | |
|---|---|
 | |
| Haemophilus ducreyi | |
| Научная классификация | |
| Королевство: | |
| Тип: | |
| Учебный класс: | |
| Заказ: | Пастереллы |
| Семья: | Pasteurellaceae Кастеллани и Чалмерс, 1919 год. |
| Роды | |
Actinobacillus | |
Pasteurellaceae содержат большое семейство грамотрицательных бактерий . Большинство членов живут как комменсалы на поверхности слизистых оболочек птиц и млекопитающих, особенно в верхних дыхательных путях. [3] Pasteurellaceae обычно имеют палочковидную форму и представляют собой заметную группу факультативных анаэробов . Их биохимические характеристики можно отличить от родственных Enterobacteriaceae по присутствию оксидазы , а от большинства других подобных бактерий - по отсутствию жгутиков .
Бактерии семейства Pasteurellaceae были разделены на несколько родов на основе метаболических свойств, но эти классификации, как правило, не являются точным отражением эволюционных взаимоотношений между различными видами. Haemophilus influenzae был первым организмом, чей геном был секвенирован, и был интенсивно изучен генетическими и молекулярными методами. Род Haemophilus - это печально известный человеческий патоген, связанный с бактериемией , пневмонией , менингитом и шанкроидом . Другие патогенные представители семейства Pasteurellaceae включают Aggregatibacter , Mannheimia ,Pasteurella ивиды Actinobacillus .
Молекулярные сигнатуры и филогенетическая позиция [ править ]
Сравнительный анализ геномов Pasteurellaceae выявил большое количество (> 20) консервативных сигнатурных инделей (CSI) в различных важных белках, которые однозначно являются общими для всех секвенированных видов / штаммов Pasteurellaceae, но не обнаруживаются ни у каких других бактерий. На основании многих других CSI, специфичных для подгрупп видов Pasteurellaceae, было предложено разделить семейство как минимум на две клады. [4] Одна из предлагаемых кладов включает Aggregatibacter , Pasteurella , Actinobacillus succinogenes , Haemophilus influenzae , Haemophilus somnus и Mannheimia succiniciproducens , а другая включаетActinobacillus minor , Actinobacillus pleuropneumoniae , Haemophilus ducreyi , Haemophilus parasuis и Mannheimia haemolytica .
Молекулярные сигнатуры в форме CSI также использовались для определения полифилетического распределения трех основных родов в семействе Pasteurellaceae: Actinobacillus , Haemophilus и Pasteurella . [5] [6] [7] Эти роды демонстрируют обширную полифилию по всему семейству, однако было обнаружено, что CSI постоянно разделяются некоторыми видами, которые образуют монофилетическую группу внутри каждого соответствующего рода. [5] Распределение CSI соответствует sensu stricto кладам «настоящих» Actinobacillus , Haemophilus и Pasteurella.виды соответственно. Поскольку они указывают на общее происхождение, было высказано предположение, что распределение CSI можно использовать для определения родовой идентичности, когда виды, которые не разделяют CSI, могут быть переклассифицированы как другой род. Также были обнаружены CSI, которые специфичны для Aggregatibacter и Mannheimia , двух клинически значимых родов. [5]
Pasteurellales, наряду с Enterobacterales , относятся к недавно разошедшимся отрядам Gammaproteobacteria . [8] Их отличие от всех других отрядов подтверждается наличием нескольких консервативных сигнатурных белков (CSP), которые являются общими для этих двух отрядов и отсутствуют у всех других бактерий. [8] Pasteurellales также разделяют дополнительные CSP с Enterobacterales, Vibrionales , Aeromonadales и Alteromonadales , добавляя дополнительное разрешение к их эволюционному ветвлению и филогенетическому положению среди большого класса Gammaproteobacteria. [8]
Ссылки [ править ]
- ^ Паркер, Чарльз Томас; Гаррити, Джордж М. (2018). «Таксономия рода Caviibacterium Adhikary et al. 2018». DOI : 10.1601 / tx.31260 . Цитировать журнал требует
|journal=( помощь ) - ^ Паркер, Чарльз Томас; Гаррити, Джордж М. (2018). «Таксономия рода Conservatibacter Adhikary et al. 2018». DOI : 10.1601 / tx.31262 . Цитировать журнал требует
|journal=( помощь ) - ^ Кокотович, Бранко; Фриис, Нильс Ф; Аренс, Питер (2007). «Mycoplasma alkalescens продемонстрирована в бронхоальвеолярном лаваже крупного рогатого скота в Дании» . Acta Veterinaria Scandinavica . 49 (1): 2. DOI : 10,1186 / 1751-0147-49-2 . ISSN 1751-0147 . PMC 1766361 . PMID 17204146 .
- ^ Наушад, HS; Гупта, РС (январь 2012 г.). «Молекулярные сигнатуры (консервативные индели) в белковых последовательностях, которые специфичны для отряда Pasteurellales и различают две его основные клады». Антони ван Левенгук . 101 (1): 105–24. DOI : 10.1007 / s10482-011-9628-4 . PMID 21830122 .
- ^ a b c Наушад С., Адеолу М., Гоэль Н., Хадка Б., Аль-Дахви А., Гупта Р. С. (2015). «Филогеномное и молекулярное разграничение основных членов полифилетических pasteurellaceae родов actinobacillus, haemophilus и pasteurella» . Int J Genom . 2015 : 198560. дои : 10,1155 / 2015/198560 . PMC 4363679 . PMID 25821780 .
- ↑ Olsen I, Dewhirst FE, Paster BJ, Busse HJ (2005) Семья I. Pasteurellaceae. В: Руководство Берджи по систематической бактериологии, изд. 2. Т. 2. С. 851–856. Eds Brenner DJ, Krieg NR, Garrity GM, Staley JT Springer-: Нью-Йорк.
- ^ Dewhirst FE, Пастер BJ, Olsen I, Fraser GJ (1992). «Филогения 54 репрезентативных штаммов видов семейства Pasteurellaceae, определенная путем сравнения последовательностей 16S рРНК» . J Bacteriol . 174 (6): 2002–2013. DOI : 10.1128 / jb.174.6.2002-2013.1992 . PMC 205807 . PMID 1548238 .
- ^ a b c Гао Б., Мохан Р., Гупта Р.С. (2009). «Филогеномика и белковые сигнатуры, выясняющие эволюционные отношения между Gammaproteobacteria» . Int J Syst Evol Microbiol . 59 (Pt 2): 234–247. DOI : 10.1099 / ijs.0.002741-0 . PMID 19196760 .
