Pedobacter является родом из грамотрицательных почвенно-ассоциированных бактерий . Виды, включая Pedobacter heparinus , ранее известную как Flavobacterium heparinum , производят гепариназу и способны использовать гепарин в качестве единственного источника углерода и азота. [1]
Педобактер | |
---|---|
Научная классификация | |
Королевство: | |
Тип: | |
Класс: | |
Заказ: | |
Семья: | |
Род: | Педобактер |
В молекулярной биологии Pedobacter также был идентифицирован как загрязнитель реагентов набора для экстракции ДНК и систем сверхчистой воды, что может привести к его ошибочному появлению в микробиоте или наборах метагеномных данных. [2]
Разновидность
- Педобактер африканский
- Педобактер агри
- Pedobacter alluvionis
- Pedobacter arcticus
- Pedobacter borealis
- Педобактерный криоконит
- Pedobacter ginsengisoli
- Педобактер гепарин
- Pedobacter insulae
- Pedobacter jejuensis
- Педобактер лентус
- [[Pedobacter lusitanus [3] ]]
- Pedobacter nyackensis
- Pedobacter rhizosphaerae
- Pedobacter salans
- Педобактер соли
- Педобактер террикола
Рекомендации
- ^ Шая, D (2006). «Кристаллическая структура гепариназы II из Pedobacter heparinus и ее комплекса с дисахаридным продуктом» . J. Biol. Chem . 281 (22): 15525–35. DOI : 10,1074 / jbc.m512055200 . PMID 16565082 .
- ^ Солтер, S; Кокс, М; Турек, Э; Калус, S; Куксон, Вт; Моффатт, М; Тернер, П; Parkhill, J; Ломан, N; Уокер, А (2014). «Загрязнение реагента может критически повлиять на анализ микробиома на основе последовательностей». bioRxiv 10.1101 / 007187 .
- ^ 10.1099 / ijsem.0.001814
дальнейшее чтение
- Кук, МуЧанг; Пак, Ёнджин; Йи, Тэ-Ху (2014). «Pedobacter jejuensis sp nov., Выделенный из почвы сосновой рощи, и исправленное описание рода Pedobacter» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 64 (Часть 5): 1789–1794. DOI : 10.1099 / ijs.0.058024-0 . PMID 24573158 . Архивировано из оригинала на 2014-11-12 . Проверено 12 ноября 2014 года .