SARS-CoV-2 вариант Зета


Из Википедии, свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску

Вариант Zeta , также известный как линия P.2 , [a] является вариантом SARS - CoV-2 , вируса, вызывающего COVID-19 . Впервые он был обнаружен в штате Рио-де-Жанейро ; он содержит мутацию E484K , но не мутации N501Y и K417T. Он независимо развился в Рио-де-Жанейро, не имея прямого отношения к гамма-варианту из Манауса. [1] [2]

Согласно упрощенной схеме наименования, предложенной Всемирной организацией здравоохранения , P.2 был помечен как «вариант Зета» и считался вариантом, представляющим интерес (VOI), но не вариантом, вызывающим озабоченность . [3] Второй волне предшествовало в ноябре 2020 года увеличение распространенности варианта Зета среди генетических последовательностей из штата Сан-Паулу, депонированных в базе данных GISAID . [4] С июля 2021 года Зета больше не рассматривается ВОЗ как вариант, представляющий интерес. [5]

Мутации

В геноме Zeta есть 3 аминокислотные мутации: E484K , D614G и V1176F, все из которых обнаружены в коде шипового белка вируса . [6] По данным Центров по контролю и профилактике заболеваний , F565L был обнаружен в некоторых последовательностях вариантов Дзета, но не во всех. [7]

  • Аминокислотные мутации варианта SARS-CoV-2 Zeta нанесены на карту генома SARS-CoV-2 с акцентом на спайке. [6]

Примечания

  1. ^ Подраздел B.1.1.28

использованная литература

  1. ^ "Линии ПАНГО Lineage P.2" . Происхождение COV . Проверено 28 января 2021 года . P.2… Псевдоним B.1.1.28.2, бразильское происхождение
  2. ^ Волоч, Каролина М .; да Силва Франсиско, Роналду; де Алмейда, Луис Г.П.; Cardoso, Cynthia C .; Brustolini, Otavio J .; Гербер, Александра Л .; Гимарайнш, Ана Паула де К .; Мариани, Диана; да Коста, Раисса Мирелла; Феррейра, Орландо К.; Кавальканти, Адриана Кони (26 апреля 2021 г.). «Геномная характеристика новой линии происхождения SARS-CoV-2 из Рио-де-Жанейро, Бразилия» . Журнал вирусологии . 95 (10). DOI : 10.1128 / JVI.00119-21 . ISSN 0022-538X . PMC 8139668 . PMID 33649194 .   
  3. ^ «Геномная характеристика новой линии передачи SARS-CoV-2 в Манаусе: предварительные результаты» . Вирусологический . 12 января 2021 г. Проверено 26 июня 2021 года .
  4. Перейти ↑ Ranzani , Otavio (2021). «Эффективность вакцины CoronaVac для пожилого населения во время эпидемии COVID-19, связанной с гамма-вариантом, в Бразилии» (PDF) . medRxiv. DOI : 10.1101 / 2021.05.19.21257472 . S2CID 234893958 .   Цитировать журнал требует |journal=( помощь )
  5. ^ "Отслеживание вариантов SARS-CoV-2" . who.int . Всемирная организация здравоохранения.
  6. ^ a b «Варианты шипа: вариант Зетов, он же P.2» . covdb.stanford.edu . База данных по антивирусам и устойчивости к коронавирусу Стэнфордского университета . 1 июля 2021 г. Проверено 5 июля 2021 года .
  7. ^ "Классификации и определения вариантов SARS-CoV-2" . CDC.gov . Центры по контролю и профилактике заболеваний. 11 февраля 2020 . Проверено 5 июля 2021 года .


Получено с https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=SARS-CoV-2_Zeta_variant&oldid=1064073458 .