Из Википедии, свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску

SOS-бокс - это область в промоторе различных генов, с которой связывается репрессор LexA, подавляя транскрипцию SOS-индуцированных белков. Это происходит при отсутствии повреждений ДНК . В случае повреждения ДНК связывание LexA инактивируется активатором RecA . SOS-боксы различаются последовательностями ДНК и сродством связывания с LexA от организма к организму. [1] Кроме того, блоки SOS могут присутствовать двойным образом, что указывает на то, что в одном промоторе может находиться более одного блока SOS . [2]

Примеры [ править ]

Филогенетическая кладаПоследовательностьСправка
Альфа-протеобактерииGAAC (N) 7 GAAC
GTTC (N) 7 GTTC		[3] [4]
Betaproteobacteria
гамма-протеобактерии		CTGT (N) 8 ACAG[5]
ДельтапротеобактерииCTRHAMRYBYGTTCAGS[6]
Грамположительные бактерииCGAACRNRYGTTYC[7] [8]
ЦианобактерииRGTAC (N) 3 DGTWCB[9]

См. Номенклатуру нуклеиновых кислот для объяснения букв нуклеотидов, не относящихся к GATC.

См. Также [ править ]

Ссылки [ править ]

  1. Перейти ↑ Walker, GC (октябрь 1995 г.). «SOS-регулируемые белки в транслезионном синтезе ДНК и мутагенезе». Направления биохимических наук . 20 (10): 416–20. DOI : 10.1016 / s0968-0004 (00) 89091-X . PMID  8533155 .
  2. ^ Гиллор, Оснат; Vriezen, Jan AC; Райли, Маргарет А. (июнь 2008 г.). «Роль SOS-боксов в регуляции кишечных бактериоцинов» . Микробиология . 154 (6): 1783–1792. DOI : 10.1099 / mic.0.2007 / 016139-0 . PMC 2729051 . PMID 18524933 .  
  3. ^ Фернандес де Henestrosa AR, Rivera E, Тапиас A, Барб J (июнь 1998). «Идентификация SOS-бокса Rhodobacter sphaeroides » . Мол. Microbiol . 28 (5): 991–1003. DOI : 10.1046 / j.1365-2958.1998.00860.x . PMID 9663685 . 
  4. ^ Тапиас A, Барб J (август 1999). «Регулирование дивергентной транскрипции с промоторов uvrA-ssb в Sinorhizobium meliloti ». Мол. Genet Genet . 262 (1): 121–30. DOI : 10.1007 / s004380051066 . PMID 10503543 . S2CID 2373618 .  
  5. ^ Erill я, Escribano М, Campoy S, BARBE J (ноябрь 2003 г.). «Анализ in silico выявляет существенные различия в содержании генов гамма-протеобактерий LexA-регулон» . Биоинформатика . 19 (17): 2225–36. DOI : 10.1093 / биоинформатики / btg303 . PMID 14630651 . 
  6. ^ Campoy S, Фонтес М, Падманабхан S, Кортес Р, Llagostera М, BARBE J (август 2003 г.). «LexA-независимая индукция, опосредованная повреждением ДНК, экспрессии гена в Myxococcus xanthus » . Мол. Microbiol . 49 (3): 769–81. DOI : 10.1046 / j.1365-2958.2003.03592.x . PMID 12864858 . 
  7. ^ Винтерлинг К.В., Чафин Д., Хейс Дж. Дж. И др. (15 апреля 1998 г.). «Сайт связывания DinR Bacillus subtilis: новое определение согласованной последовательности» . J. Bacteriol . 180 (8): 2201–11. DOI : 10.1128 / JB.180.8.2201-2211.1998 . PMC 107149 . PMID 9555905 .  
  8. ^ Davis EO, Dullaghan Е.М., Rand L (июнь 2002). «Определение микобактериального бокса SOS и его использование для идентификации LexA-регулируемых генов у Mycobacterium tuberculosis» . J. Bacteriol . 184 (12): 3287–95. DOI : 10.1128 / JB.184.12.3287-3295.2002 . PMC 135081 . PMID 12029045 .  
  9. ^ Масон G, Люсена JM, Campoy S, Фернандес де Henestrosa AR, Candau P, Барбе J (февраль 2004). «LexA-связывающие последовательности у грамположительных и цианобактерий тесно связаны». Мол. Genet. Геномика . 271 (1): 40–9. DOI : 10.1007 / s00438-003-0952-х . PMID 14652736 . S2CID 9219764 .  
  • Эрилл I и др. (2004). «Различия в структуре регулона LexA среди протеобактерий с помощью сравнительной геномики in vivo» . Исследования нуклеиновых кислот . 32 (22): 6617–26. DOI : 10.1093 / NAR / gkh996 . PMC  545464 . PMID  15604457 .
  • Синагава Х (1996). «SOS-ответ как адаптивный ответ на повреждение ДНК у прокариот». Стресс-индуцируемые клеточные ответы . EXS . 77 . С. 221–35. DOI : 10.1007 / 978-3-0348-9088-5_14 . ISBN 978-3-0348-9901-7. PMID  8856977 .


  • v
  • т
  • е