В этой статье не процитировать какие - либо источники . ( декабрь 2009 г. ) ( Узнайте, как и когда удалить этот шаблон сообщения ) |
Молекулярные биологи используют несколько сокращенных терминов, когда говорят о молекулах нуклеиновых кислот , таких как ДНК и РНК , которые в совокупности называются номенклатурой нуклеиновых кислот .
Наиболее распространенным является представление пар оснований в виде писем-ан - аденин - нуклеотида , сокращенно A , гуанина в качестве G , цитозина , как C , тимина , как T , так и в РНК, урацил , как U .
Кроме того, положения атомов углерода в сахаре рибозы, который формирует основу цепи нуклеиновой кислоты, пронумерованы и используются для указания направления нуклеиновых кислот (5 '-> 3' по сравнению с 3 '-> 5'). Это называется направленностью .
Расширенный буквенный код [ править ]
В дополнение к обычным символам GATC существует расширенный буквенный код для указания позиции в последовательности, которая может быть гибкой при определении последовательностей.
Письмо | Включены нуклеотиды |
---|---|
А | А |
Т | Т |
грамм | грамм |
C | C |
U | U |
р | G или A |
Y | Т или С |
M | А или С |
K | G или T |
S | G или C |
W | А или Т |
ЧАС | A или C или T |
B | G или T или C |
V | G или C или A |
D | G или T или A |
N | G или T или A или C |
Например, если известно, что последовательности, связывающие белок X, представляют собой AAAAAAGAAA, AAAAAACAAA, AAAAAATAAA и AAAAAAAAAA, это можно выразить как AAAAAANAAA.
Базовое соединение Triple Helix [ править ]
Пары оснований Watson и Crick обозначены знаком «•», «-» или «». (пример: A • T или поли (rC) • 2poly (rC)).
Пары оснований тройной спирали Hoogsteen обозначены знаком «*» или «:» (пример: C • G * G +, или T • A * T, или C • G * G, или T • A * A).