Сигнальные пептидазы - это ферменты, которые превращают секреторные и некоторые мембранные белки в их зрелые или проформы путем отщепления своих сигнальных пептидов от их N-концов .
Пептидаза_S26 | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | ||||||||
Символ | Пептидаза_S26 | |||||||
Pfam | PF10502 | |||||||
Клан пфам | CL0299 | |||||||
ИнтерПро | IPR019533 | |||||||
МЕРОПЫ | S26 | |||||||
OPM суперсемейство | 137 | |||||||
Белок OPM | 1т7д | |||||||
Мембранома | 323 | |||||||
|
Субъединица 3 сигнального пептидазного комплекса | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | ||||||||
Символ | SP3 | |||||||
Pfam | PF04573 | |||||||
ИнтерПро | IPR007653 | |||||||
Мембранома | 369 | |||||||
|
Сигнальная пептидаза I | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | ||||||||
ЕС нет. | 3.4.21.89 | |||||||
№ CAS | 65979-36-4 | |||||||
Базы данных | ||||||||
IntEnz | Просмотр IntEnz | |||||||
BRENDA | BRENDA запись | |||||||
ExPASy | Просмотр NiceZyme | |||||||
КЕГГ | Запись в KEGG | |||||||
MetaCyc | метаболический путь | |||||||
ПРИАМ | профиль | |||||||
Структуры PDB | RCSB PDB PDBe PDBsum | |||||||
Генная онтология | Amigo / QuickGO | |||||||
|
Сигнальная пептидаза II | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | ||||||||
ЕС нет. | 3.4.23.36 | |||||||
№ CAS | 171715-14-3 | |||||||
Базы данных | ||||||||
IntEnz | Просмотр IntEnz | |||||||
BRENDA | BRENDA запись | |||||||
ExPASy | Просмотр NiceZyme | |||||||
КЕГГ | Запись в KEGG | |||||||
MetaCyc | метаболический путь | |||||||
ПРИАМ | профиль | |||||||
Структуры PDB | RCSB PDB PDBe PDBsum | |||||||
Генная онтология | Amigo / QuickGO | |||||||
|
Сигнальные пептидазы первоначально наблюдались во фракциях мембран, полученных из эндоплазматического ретикулума (ER), выделенных из клеток миеломы мыши . [1] Ключевое наблюдение Сезара Мильштейна и его коллег заключалось в том, что легкие цепи иммуноглобулина продуцировались в форме с более высокой молекулярной массой, которая подвергалась процессингу мембранной фракцией ER. Непосредственно за этим открытием последовало открытие механизма транслокации . [2] Сигнальные пептидазы также обнаруживаются в прокариотах, а также в механизмах импорта белков митохондрий и хлоропластов . [3]
Все описанные сигнальные пептидазы являются сериновыми протеазами . Активный сайт, который эндопротеолитически отщепляет сигнальные пептиды от транслоцированных белков-предшественников, расположен во внецитоплазматическом сайте мембраны. Эукариотическая сигнальная пептидаза представляет собой интегральный мембранный белковый комплекс. Первой субъединицей, которая была идентифицирована генетикой дрожжей, является Sec11, мембранный белок 17 кДа, связанный с тремя субъединицами, названными Spc3p (21 кДа), Spc2p (18 кДа) и Spc1p (11 кДа). Sec11 является единственным существенным фактором процессинга сигнального пептида, что может быть определено по дефекту роста при его делеции. [4] Функциональный комплекс сигнальной пептидазы был сначала очищен из фракции мембран ER собаки. [5] Пять субъединиц млекопитающих названы SPC12 , SPC18 , SPC21 , SPC22 / 23 и SPC25 в соответствии с их молекулярной массой.
Рекомендации
- Перейти ↑ Milstein C, Brownlee GG, Harrison TM, Mathews MB (сентябрь 1972 г.). «Возможный предшественник легких цепей иммуноглобулина». Природа Новая Биология . 239 (91): 117–20. DOI : 10.1038 / newbio239117a0 . PMID 4507519 .
- ^ Блобель Г., Добберштейн Б. (декабрь 1975 г.). «Перенос белков через мембраны. I. Присутствие протеолитически обработанных и необработанных образующихся легких цепей иммуноглобулина на мембраносвязанных рибосомах миеломы мыши» (PDF) . J. Cell Biol . 67 (3): 835–51. DOI : 10,1083 / jcb.67.3.835 . PMC 2111658 . PMID 811671 .
- ^ Паэтцель М., Карла А., Стринадка, Северная Каролина, Далби Р. Э. (декабрь 2002 г.). «Сигнальные пептидазы». Chem. Ред . 102 (12): 4549–80. DOI : 10.1021 / cr010166y . PMID 12475201 .
- ^ Böhni PC, Deshaies RJ, Schekman RW (апрель 1988 г.). «SEC11 необходим для процессинга сигнального пептида и роста дрожжевых клеток» . J. Cell Biol . 106 (4): 1035–42. DOI : 10,1083 / jcb.106.4.1035 . PMC 2115025 . PMID 3283143 .
- ^ Эванс Э.А., Гилмор Р., Блобель Г. (февраль 1986 г.). «Очистка микросомальной сигнальной пептидазы как комплекса» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 83 (3): 581–5. Bibcode : 1986PNAS ... 83..581E . DOI : 10.1073 / pnas.83.3.581 . PMC 322907 . PMID 3511473 .
Внешние ссылки
- сигнал + пептидаза в Национальных медицинских предметных рубриках США (MeSH)
дальнейшее чтение
- Calo, D; Эйхлер, Дж (март 2011 г.). «Пересечение мембраны в архее, третьей сфере жизни» . Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Биомембраны . 1808 (3): 885–91. DOI : 10.1016 / j.bbamem.2010.03.020 . PMID 20347718 .