Тиобациллы | |
---|---|
Научная классификация | |
Королевство: | |
Тип: | |
Учебный класс: | |
Заказ: | |
Семья: | |
Род: | Тиобациллы |
Разновидность | |
Thiobacillus thioparus |
Тиобациллы - это род грамотрицательных бетапротеобактерий . Thiobacilus thioparus является типовым видом этого рода, а его типовым штаммом является штамм Starkey T , выделенный Робертом Старки в 1930-х годах с поля в Университете Рутгерса в Соединенных Штатах Америки . Хотя более 30 «видов» были названы в этом роде с тех пор, как он был определен Мартинусом Бейеринком в 1904 году, [1] [2] (первый штамм был обнаружен биологическим океанологом Александром Натансоном в 1902 году - вероятно, то, что мы теперь назвали быHalothiobacillus neapolitanus [3] ), большинство названий так и не были опубликованы достоверно или эффективно. Остальные были либо переклассифицированы в Paracoccus , Starkeya (оба в Alphaproteobacteria ); Sulfuriferula , Annwoodia , Thiomonas (в составе бетапротеобактерий ); Halothiobacillus , Guyparkeria (в Gammaproteobacteria ) или Thermithiobacillus или Acidithiobacillus (в Acidithiobacillia ). Очень свободно определяемый «вид» Thiobacillus trautweiniiИменно здесь в 1910-1960-е годы были назначены окисляющие серу гетеротрофы и хемолитогетеротрофы , большинство из которых, вероятно, были видами Pseudomonas . [4] Многие виды, названные в этом роде, никогда не поступали в служебные коллекции и были утеряны. [4] [3]
Все виды являются облигатными автотрофами [1] [2] [3] (с использованием трансальдолазной формы цикла Кальвина-Бенсона-Бассема [4] ), использующих элементарную серу, тиосульфат или политионаты в качестве источников энергии - прежние Thiobacillus aquaesulis могут расти слабо на сложных средах как гетеротроф, но был переклассифицирован в Annwoodia aquaesulis . Некоторые штаммы (E6 и Tk-m) типового вида Thiobacillus thioparus могут использовать серу из диметилсульфида , диметилдисульфида или сероуглерода для поддержки автотрофного роста - они окисляют углерод этих видов вуглекислый газ и усваивает его. Окисление серы осуществляется по методу Келли-Трудингера .
Реклассификация [ править ]
В результате анализа последовательности рибосомной РНК 16S многие представители Thiobacillus были переназначены. [5] [4] [6]
- Thiobacillus по сравнению с Paracoccus
- Thiobacillus acidophilus к Acidiphilium
- Thiobacillus intermediateus , Thiobacillus perometabolis , Thiobacillus thermosulfatus и Thiobacilus cuprinus к Thiomonas
- Thiobacillus thiooxidans , Thiobacillus ferrooxidans , Thiobacillus caldus и Thiobacillus albertensis к Acidithiobacillus
- Thiobacillus aquaesulis к Annwoodia aquaesulis . [4]
- Thiobacillus neapolitanus - Halothiobacillus
- Thiobacillus thyasiris к Thiomicrospira thyasirae [7]
- Thiobacillus hydrothermalis и Thiobacillus halophilus сначала к Halothiobacillus, а затем к Guyparkeria [6]
- Thiobacillus tepidarius к Thermithiobacillus [5]
Ссылки [ править ]
- ^ a b Бейеринк MW (1904). "Phénomènes de réduction produits par les microbes". Arch Neel Sci Exact Nat (Раздел 2) . 9 : 131–157.
- ^ a b Бейеринк MW (1904). "Ueber die Bakterien, welche sich im Dunkeln mit Kohlensäure als Kohlenstoffquelle ernähren können". Centralbl Bakteriol Parasitenkd Infektionskr Hyg Abt II . 11 : 592–599.
- ^ а б в Боден Р. (2017). «115 лет серного обмена» . Письма о микробиологии FEMS . 364 : fnx043. DOI : 10.1093 / femsle / fnx043 .
- ^ а б в г д Боден Р., Hutt LP, Rae AW (2017). "Реклассификация Thiobacillus aquaesulis (Wood & Kelly, 1995) как Annwoodia aquaesulis gen. Nov., Comb . Nov., Перенос Thiobacillus (Beijerinck, 1904) из Hydrogenophilales в Nitrosomonadales , предложение о Hydrogenophilalia class. Nov." В Proteobacillus class. , и четыре новых семейства в отрядах Nitrosomonadales и Rhodocyclales " . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 67: 1191–1205. DOI : 10.1099 / ijsem.0.001927 . PMID 28581923 .
- ^ a b Келли Д.П. Дерево AP (2000). «Реклассификация некоторых видов Thiobacillus в недавно обозначенные роды Acidithiobacillus gen. Nov., Halothiobacillus gen. Nov. И Thermithiobacillus gen. Nov» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 50 : 511–516. DOI : 10.1099 / 00207713-50-2-511 . PMID 10758854 . Дата обращения 19 декабря 2015 .
- ^ а б Боден Р. (2017). «Реклассификация Halothiobacillus hydrothermalis и Halothiobacillus halophilus в Guyparkeria gen. Nov. В семействе Thioalkalibacteraceae nov., С исправленными описаниями рода Halothiobacillus и семейства Halothiobacillaceae » . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 67 : 3919–3928. DOI : 10.1099 / ijsem.0.002222 . PMID 28884673 . Проверено 9 декабря 2017 .
- ^ Келли DP; WoodAP (1993). «Реклассификация Thiobacillus thyasiris как Thiomicrospira thyasirae, новая комбинация, организм, проявляющий плеоморфизм в ответ на условия окружающей среды». Архив микробиологии . 159 : 45–47. DOI : 10.1007 / BF00244262 .