Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску

Pseudomonas представляет собой род из грамотрицательных , гамма-протеобактерии , принадлежащий к семейству Pseudomonadaceae и содержащий 191 правомерно описанных видов. [1] Представители рода демонстрируют большое метаболическое разнообразие и, следовательно, способны колонизировать широкий спектр ниш. [2] Простота культивирования in vitro и доступность все большего числапоследовательностей генома штамма Pseudomonas сделали этот род отличным местом для научных исследований; среди наиболее изученных видов P. aeruginosa играет роль условно-патогенногопатоген человека, возбудитель растений P. syringae , почвенная бактерия P. putida и способствующие росту растений P. fluorescens , P. lini , P. migulae и P. graminis . [3] [4]

Из-за их широкого распространения в воде и семенах растений , таких как двудольные , псевдомонады были обнаружены в начале истории микробиологии . Общее название Pseudomonas создано для этих организмов была определена в довольно расплывчатых терминах по Вальтер Мигула в 1894 и 1900 годах как род грамотрицательных, в форме стержня, и полярно жгутиковых бактерий с некоторыми видами спорообразующих, [5] [6] Последнее утверждение позже оказалось неверным и связано с преломляющими гранулами запасных материалов. [7] Несмотря на расплывчатое описание, типовой вид Pseudomonas pyocyanea (базонимPseudomonas aeruginosa ), оказался лучшим описателем. [7]

История классификации [ править ]

Как и большинство бактериальных родов, последний общий предок псевдомонад [примечание 1] жил сотни миллионов лет назад. Первоначально они были классифицированы в конце 19 века, когда впервые были идентифицированы Уолтером Мигулой . Этимология имени не была определена в то время и впервые появилась в седьмом издании Руководства по систематической бактериологии Берджи (главный авторитет в бактериальной номенклатуре) как греческий псевдоним (ψευδής) «ложный» и -monas (μονάς / μονάδος) » единая единица ", что может означать ложную единицу; однако, Мигула, возможно , имел в виду ложного Монаса , протиста с нанофлагелляциями [7] (впоследствии термин «монада» использовался в ранней истории микробиологии для обозначения одноклеточных организмов). Вскоре другие виды, соответствующие несколько расплывчатому первоначальному описанию Мигулы, были выделены из многих природных ниш, и в то время многие были отнесены к этому роду . Однако с тех пор многие штаммы были переклассифицированы на основе более современной методологии и использования подходов, включающих исследования консервативных макромолекул. [8]

Недавно анализ последовательности 16S рРНК изменил таксономию многих видов бактерий. [9] В результате род Pseudomonas включает штаммы, ранее относившиеся к родам Chryseomonas и Flavimonas . [10] Другие штаммы, ранее относившиеся к роду Pseudomonas , теперь относятся к родам Burkholderia и Ralstonia . [11] [12]

В 2020 году филогеномный анализ 494 полных геномов Pseudomonas выявил два четко определенных вида ( P. aeruginosa и P. chlororaphis ) и четыре более широкие филогенетические группы ( P. fluorescens, P. stutzeri, P. syringae, P. putida ) с достаточное количество доступных протеомов. [13] Четыре более широкие эволюционные группы включают более одного вида, исходя из определения видов на основе средних уровней нуклеотидной идентичности. [14] Кроме того, филогеномный анализ выявил несколько штаммов, которые были неправильно отнесены к неправильному виду или эволюционной группе. [13] Об этой проблеме неправильной аннотации сообщалось и в других исследованиях. [15]

Геномика [ править ]

В 2000 году полная последовательность генома в А Pseudomonas была определена видов; совсем недавно была определена последовательность других штаммов, включая штаммы P. aeruginosa PAO1 (2000), P. putida KT2440 (2002), P. protegens Pf-5 (2005), P. syringae pathovar помидор DC3000 (2003), P. syringae pathovar syringae B728a (2005), P. syringae pathovar phaseolica 1448A (2005), P. fluorescens Pf0-1 и P. entomophila L48. [8]

К 2016 году было секвенировано более 400 штаммов Pseudomonas . [16] Секвенирование геномов сотен штаммов выявило сильно различающиеся виды внутри рода. Фактически, многие геномы Pseudomonas имеют только 50-60% общих генов, например P. aeruginosa и P. putida имеют только 2971 белок из 5350 (или ~ 55%). [16]

К 2020 году в Генбанке было доступно более 500 полных геномов Pseudomonas . Филогеномный анализ использовал 494 полных протеома и идентифицировал 297 основных ортологов, общих для всех штаммов. [13] Этот набор основных ортологов на уровне рода был обогащен белками, участвующими в метаболизме, трансляции и транскрипции, и использовался для создания филогеномного дерева всего рода, чтобы очертить отношения между основными эволюционными группами Pseudomonas . [13] Кроме того, групповые основные белки были идентифицированы для большинства эволюционных групп, что означает, что они присутствовали у всех членов конкретной группы, но отсутствовали у других псевдомонад . Например, несколькоБыли идентифицированы основные белки , специфичные для P. aeruginosa, которые, как известно, играют важную роль в патогенности этого вида, такие как CntL, CntM, PlcB, Acp1, MucE, SrfA, Tse1, Tsi2, Tse3 и EsrC . [13]

Характеристики [ править ]

Члены рода демонстрируют следующие определяющие характеристики: [17]

  • Стержневидный
  • Грамотрицательный
  • Жгутик один или несколько, обеспечивающих подвижность
  • Аэробный
  • Не образующий спор
  • Каталаза-положительный
  • Оксидаза-положительный

Другие характеристики, которые, как правило, связаны с видами Pseudomonas (за некоторыми исключениями), включают секрецию пиовердина , флуоресцентного желто-зеленого сидерофора [18] в условиях лимитирования железа. Некоторые Pseudomonas виды могут также произвести дополнительные типы сидерофора, такие как пиоцианин пути синегнойной палочки [19] и с помощью thioquinolobactin синегнойного Шогезсепза ,. [20] Виды Pseudomonas также обычно дают положительный результат теста на оксидазу., отсутствие газообразования из глюкозы, глюкоза окисляется в тесте окисления / ферментации с использованием теста Хью и Лейфсона O / F, бета- гемолитического (на кровяном агаре ), индол- отрицательного, метилового красного отрицательного, отрицательного теста Фогеса – Проскауэра и положительного цитрат- положительного .

Pseudomonas может быть наиболее распространенным зародышеобразователем кристаллов льда в облаках, поэтому они имеют огромное значение для образования снега и дождя во всем мире. [21]

Формирование биопленки [ править ]

Все виды и штаммы Pseudomonas исторически относились к строгим аэробам . Исключения из этой классификации недавно были обнаружены в биопленках Pseudomonas . [22] Значительное количество клеток может продуцировать экзополисахариды, связанные с образованием биопленок. Секреция экзополисахаридов, таких как альгинат, затрудняет фагоцитоз псевдомонад лейкоцитами млекопитающих . [23] Производство экзополисахаридов также способствует колонизации поверхности биопленками.которые трудно удалить с поверхностей для приготовления пищи. Рост псевдомонад на испорченных продуктах может вызывать «фруктовый» запах.

Устойчивость к антибиотикам [ править ]

Большинство Pseudomonas spp. обладают естественной устойчивостью к пенициллину и большинству родственных бета-лактамных антибиотиков , но некоторые из них чувствительны к пиперациллину , имипенему , тикарциллину или ципрофлоксацину . [23] Другими вариантами терапии являются аминогликозиды, такие как тобрамицин , гентамицин и амикацин .

Эта способность процветать в суровых условиях является результатом их выносливых клеточных стенок , содержащих порины . Их устойчивость к большинству антибиотиков объясняется оттоком , который выкачивает некоторые антибиотики, прежде чем они начинают действовать.

Pseudomonas aeruginosa все чаще признается новым условно-патогенным микроорганизмом, имеющим клиническое значение. Одна из его наиболее тревожных характеристик - низкая чувствительность к антибиотикам. [24] Такая низкая восприимчивость объясняется согласованным действием насосов оттока нескольких лекарственных препаратов с хромосомно-кодируемымигенами устойчивости к антибиотикам (например, mexAB-oprM , mexXY и т. Д. [25] ) и низкой проницаемостью клеточных оболочек бактерий. Помимо внутренней устойчивости, P. aeruginosa легко развивает приобретенную устойчивость либо за счет мутации в генах, кодируемых хромосомами, либо за счет горизонтального переноса генов.детерминант устойчивости к антибиотикам. Развитие множественной лекарственной устойчивости пути синегнойных изолят требует несколько различных генетических событий , которые включают в себя приобретение различных мутаций и / или горизонтального переносе генов устойчивости к антибиотикам. Гипермутация способствует отбору управляемой мутацией устойчивости к антибиотикам у штаммов P. aeruginosa , вызывающих хронические инфекции, тогда как кластеризация нескольких различных генов устойчивости к антибиотикам в интегронах способствует согласованному приобретению детерминант устойчивости к антибиотикам. Некоторые недавние исследования показали фенотипическую резистентность, связанную с образованием биопленок или с появлением небольших колоний-вариантов, которые могут быть важны в ответной реакцииПопуляции P. aeruginosa для лечения антибиотиками . [8]

Чувствительность к галлию [ править ]

Хотя галлий не выполняет естественной функции в биологии, ионы галлия взаимодействуют с клеточными процессами аналогично железу (III). Когда ионы галлия по ошибке поглощаются бактериями, такими как Pseudomonas , вместо железа (III) , ионы мешают дыханию, и бактерии погибают. Это происходит потому, что железо обладает окислительно-восстановительной активностью, позволяя переносить электроны во время дыхания, в то время как галлий неактивен. [26] [27]

Патогенность [ править ]

Патогены животных [ править ]

Инфекционные виды включают P. aeruginosa , P. oryzihabitans и P. plecoglossicida . P. aeruginosa процветает в больничных условиях и представляет собой особую проблему в этой среде, поскольку это вторая по частоте инфекция у госпитализированных пациентов ( нозокомиальные инфекции ) [ необходима цитата ] . Этот патогенез частично может быть связан с белками, секретируемыми P. aeruginosa . Бактерия обладает широким спектром систем секреции , которые экспортируют множество белков, имеющих отношение к патогенезу клинических штаммов. [28] Интересно, что несколько генов, участвующих в патогенезеP.aeruginosa, такие как CntL, CntM, PlcB, Acp1, MucE, SrfA, Tse1, Tsi2, Tse3 и EsrC, специфичны для основной группы [13], что означает, что они являются общими для подавляющего большинства штаммов P. aeruginosa , но их нет у других псевдомонад .

Патогены растений [ править ]

P. syringae является плодовитым патогеном растений . Он существует в виде более 50 различных патоваров , многие из которых демонстрируют высокую степень специфичности растения-хозяина. Многие другие виды Pseudomonas могут выступать в качестве патогенов растений, особенно все другие представители подгруппы P. syringae , но P. syringae является наиболее распространенным и наиболее изученным.

Хотя P. tolaasii не является строго патогеном растений, он может представлять серьезную проблему в сельском хозяйстве, поскольку может вызывать бактериальное пятно на культивируемых грибах . [29] Точно так же P. agarici может вызывать капание жабр у культивируемых грибов. [30]

Использовать в качестве агентов биоконтроля [ править ]

С середины 1980-х годов некоторые представители рода Pseudomonas применялись к семенам зерновых или применялись непосредственно в почве как способ предотвращения роста или закрепления патогенов сельскохозяйственных культур. Эта практика обычно называется биологическим контролем . Свойства биоконтроля штаммов P. fluorescens и P. protegens (например, CHA0 или Pf-5) в настоящее время изучены лучше всего, хотя точно неясно, как достигаются свойства P. fluorescens по стимулированию роста растений . Существуют следующие теории: бактерии могут вызывать системную резистентность у растения-хозяина, чтобы оно могло лучше противостоять атакам настоящего патогена; бактерии могут победить другие (патогенные) почвенные микробы, например, сидерофорыпредоставление конкурентного преимущества при утилизации железа; бактерии могут производить соединения, антагонистические по отношению к другим почвенным микробам, такие как антибиотики феназинового типа или цианистый водород . Экспериментальные данные подтверждают все эти теории. [31]

Другие известные виды Pseudomonas со свойствами биоконтроля включают P. chlororaphis , который продуцирует активный антибиотик феназинового типа против определенных грибковых патогенов растений [32], и близкородственный вид P. aurantiaca , который продуцирует ди-2,4-диацетилфторглюцилметан, a соединение, обладающее антибиотической активностью в отношении грамположительных организмов. [33]

Использовать в качестве агентов биоремедиации [ править ]

Некоторые представители этого рода способны метаболизировать химические загрязнители в окружающей среде и, как следствие, могут использоваться для биоремедиации . Известные виды, продемонстрированные как подходящие для использования в качестве агентов биоремедиации, включают:

  • P. alcaligenes , которые могут разлагать полициклические ароматические углеводороды . [34]
  • P. mendocina , который способен разлагать толуол . [35]
  • P. pseudoalcaligenes , который может использовать цианид в качествеисточника азота . [36]
  • P. Resinovorans , который может разлагать карбазол . [37]
  • P. veronii , который, как было показано, разлагает множество простых ароматических органических соединений . [38] [39]
  • P. putida , который обладает способностью разлагать органические растворители, такие как толуол . [40] По крайней мере, один штамм этой бактерии способен превращать морфин в водном растворе в более сильный и довольно дорогой в производстве лекарственный гидроморфон (Дилаудид).
  • Штамм KC P. stutzeri , способный разлагать четыреххлористый углерод . [41]

Обнаружение в молоке агентов порчи продуктов [ править ]

Одним из способов идентификации и классификации нескольких бактериальных организмов в образце является риботипирование. [42] При риботипировании хромосомная ДНК разной длины выделяется из образцов, содержащих виды бактерий, и расщепляется на фрагменты. [42] Сходные типы фрагментов от разных организмов визуализируются и их длина сравнивается друг с другом с помощью саузерн-блоттинга или гораздо более быстрого метода полимеразной цепной реакции (ПЦР) . [42] Затем фрагменты можно сопоставить с последовательностями, обнаруженными у видов бактерий. [42] Показано, что риботипирование является методом выделения бактерий, способных к порче. [43] Около 51% PseudomonasБактерии, обнаруженные на предприятиях по переработке молока, - это P. fluorescens , причем 69% этих изолятов содержат протеазы, липазы и лецитиназы, которые способствуют разложению компонентов молока и последующей порче. [43] Другие виды Pseudomonas могут обладать какой-либо одной из протеаз, липаз или лецитиназ или вообще не иметь. [43] Аналогичную ферментативную активность проявляют Pseudomonas одного и того же риботипа, причем каждый риботип показывает различную степень порчи молока и влияние на вкус. [43] Количество бактерий влияет на интенсивность порчи, при этом неферментативные виды Pseudomonas в большом количестве вносят свой вклад в порчу. [43]

Порча пищевых продуктов наносит ущерб пищевой промышленности из-за производства летучих соединений организмами, метаболизирующими различные питательные вещества, содержащиеся в пищевом продукте. [44] Загрязнение вызывает опасность для здоровья в результате производства токсичных соединений, а также неприятных запахов и запахов. [44] Технология электронного носа позволяет быстро и непрерывно измерять микробиологическую порчу пищевых продуктов, ощущая запахи, создаваемые этими летучими соединениями. [44] Таким образом, технология электронного носа может применяться для обнаружения следов порчи молока Pseudomonas и выделения ответственных видов Pseudomonas . [45]Датчик газа состоит из носовой части, состоящей из 14 модифицируемых полимерных датчиков, которые могут обнаруживать определенные продукты разложения молока, производимые микроорганизмами. [45] Данные датчика формируются путем изменения электрического сопротивления 14 полимеров при контакте с целевым соединением, в то время как четыре параметра датчика могут быть отрегулированы для уточнения реакции. [45] Затем ответы могут быть предварительно обработаны нейронной сетью, которая затем может различать микроорганизмы порчи молока, такие как P. fluorescens и P. aureofaciens . [45]

Виды, ранее отнесенные к этому роду [ править ]

Недавно анализ последовательности 16S рРНК изменил таксономию многих видов бактерий, ранее классифицированных как принадлежащие к роду Pseudomonas . [9] Виды, удаленные из Pseudomonas , перечислены ниже; щелчок по виду покажет его новую классификацию. Термин «псевдомонады» не применяется строго только к роду Pseudomonas и может также использоваться для включения предыдущих представителей, таких как роды Burkholderia и Ralstonia .

α протеобактерии: P. abikonensis , P. aminovorans , P. azotocolligans , P. carboxydohydrogena , P. carboxidovorans , П. compransoris , П. diminuta , P. echinoides , P. extorquens , П. lindneri , П. mesophilica , P. paucimobilis , П. radiora , П. Rhodos , П. рибофлавин , П. лишай , П. vesicularis .

бета протеобактерии: П. acidovorans , П. alliicola , П. antimicrobica , П. avenae , П. butanovorae , П. caryophylli , П. cattleyae , П. cepacia , П. cocovenenans , П. delafieldii , П. Facilis , П. Flava , P. gladioli , P. glathei , P. glumae , P. graminis , P. huttiensis , P. indigofera , P. lanceolata , P. lemoignei , P. mallei, П. mephitica , П. Mixta , П. palleronii , П. phenazinium , П. pickettii , П. plantarii , П. pseudoflava , П. pseudomallei , П. pyrrocinia , П. rubrilineans , П. rubrisubalbicans , П. saccharophila , P solanacearum , P. spinosa , P. syzygii , P. taeniospiralis , P. terrigena , P. testosteroni .

γ-β протеобактерии: P. beteli , P. boreopolis , P. cissicola , P. geniculata , P. hibiscicola , P. maltophilia , P. pictorum .

γ протеобактерии: P. beijerinckii , P. diminuta , P. doudoroffii , P. elongata , P. flectens , P. halodurans , P. halophila , P. iners , P. marina , P. nautica , P. nigrifaciens , P. pavonacea , [46] P. piscicida , P. stanieri .

δ протеобактерии: P. formicans .

Бактериофаг [ править ]

Существует ряд бактериофагов, которые инфицируют Pseudomonas , например:

  • Фаг Pseudomonas Φ6
  • Фаг Pseudomonas aeruginosa EL [47]
  • Фаг Pseudomonas aeruginosa ΦKMV [48]
  • Фаг Pseudomonas aeruginosa LKD16 [49]
  • Фаг Pseudomonas aeruginosa LKA1 [49]
  • Фаг Pseudomonas aeruginosa LUZ19
  • Фаг Pseudomonas aeruginosa ΦKZ [47]
  • Pseudomonas putida phage gh-1 [50]

См. Также [ править ]

  • Коллекция культур для списка коллекций культур.

Сноски [ править ]

  1. ^ Чтобы помочь в потоке прозы на английском языке, названия родов могут быть "упрощены", чтобы сформировать народное название для обозначения члена рода: для рода Pseudomonas это "pseudomonad" (множественное число: "pseudomonads"), вариант на не-номинативных случаях в греческом склонении из МОНАС, Монады . [51] По историческим причинам представители нескольких родов, которые ранее были классифицированы каквиды Pseudomonas, могут быть названы псевдомонадами, в то время как термин «флуоресцентная псевдомонада» относится строго к нынешним членам рода Pseudomonas , поскольку они продуцируют пиовердин , флуоресцентныйсидерофор . [2] Последний термин, флуоресцентная псевдомонада, отличается от термина группа P. fluorescens , который используется для различения подмножества членов Pseudomonas sensu stricto, а не в целом.

Ссылки [ править ]

  1. ^ Запись Pseudomonas в LPSN ; Euzéby, JP (1997). «Список названий бактерий со статусом в номенклатуре: папка, доступная в Интернете» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 47 (2): 590–2. DOI : 10.1099 / 00207713-47-2-590 . PMID  9103655 .
  2. ^ а б Мэдиган М; Мартинко Дж, ред. (2005). Брок Биология микроорганизмов (11-е изд.). Прентис Холл. ISBN 0-13-144329-1.
  3. ^ Падда, Киран Прит; Пури, Акшит; Чануэй, Крис (2019-11-01). «Эндофитная азотфиксация - возможный« скрытый »источник азота для лесных сосен, произрастающих на невосстановленных участках добычи гравия» . FEMS Microbiology Ecology . 95 (11). DOI : 10.1093 / femsec / fiz172 . ISSN 0168-6496 . PMID 31647534 .  
  4. ^ Падда, Киран Прит; Пури, Акшит; Чануэй, Крис П. (20.09.2018). «Выделение и идентификация эндофитных диазотрофов из стволов сосен, растущих на нереализованных карьерах по добыче гравия в центральной части Британской Колумбии, Канада». Канадский журнал исследований леса . 48 (12): 1601–1606. DOI : 10,1139 / cjfr-2018-0347 . ЛВП : 1807/92505 . ISSN 0045-5067 . 
  5. ^ Migula, W. (1894) Über ein neues System der Bakterien. Арб Бактериол Институт Карлсруэ 1: 235–238.
  6. ^ Migula, W. (1900) Система дер Bakterien, Vol. 2. Йена, Германия: Густав Фишер.
  7. ^ a b c Паллерони, Нью-Джерси (2010). «История псевдомонады» . Экологическая микробиология . 12 (6): 1377–1383. DOI : 10.1111 / j.1462-2920.2009.02041.x . PMID 20553550 . 
  8. ^ a b c Корнелис П., изд. (2008). Псевдомонады: геномика и молекулярная биология (1-е изд.). Caister Academic Press. ISBN 978-1-904455-19-6.
  9. ^ а б Анзай Y; Kim H; Парк, JY; Вакабаяси Х (2000). «Филогенетическая принадлежность псевдомонад на основе последовательности 16S рРНК». Int J Syst Evol Microbiol . 50 (4): 1563–89. DOI : 10.1099 / 00207713-50-4-1563 . PMID 10939664 . 
  10. ^ Анзай, Y; Кудо, Y; Ояйдзу, Х (1997). «Филогения родов Chryseomonas , Flavimonas и Pseudomonas поддерживает синонимию этих трех родов» . Int J Syst Bacteriol . 47 (2): 249–251. DOI : 10.1099 / 00207713-47-2-249 . PMID 9103607 . 
  11. ^ Yabuuchi, E .; Kosako, Y .; Oyaizu, H .; Яно, И .; Hotta, H .; Hashimoto, Y .; Ezaki, T .; Аракава, М. (1992). "Предложение Burkholderia gen. Nov. И перевод семи видов группы гомологии рода Pseudomonas II в новый род с типовым видом Burkholderia cepacia (Palleroni and Holmes 1981) comb. Nov" . Микробиология и иммунология . 36 (12): 1251–1275. DOI : 10.1111 / j.1348-0421.1992.tb02129.x . PMID 1283774 . S2CID 46648461 .  
  12. ^ Yabuuchi, E .; Kosako, Y .; Яно, И .; Hotta, H .; Нисиучи Ю. (1995). "Перенос двух видов Burkholderia и Alcaligenes в Ralstonia gen. Ноябрь: Предложение о гребне Ralstonia pickettii (Ralston, Palleroni and Doudoroff 1973). Ноябрь, гребень Ralstonia solanacearum (Smith 1896). Ноябрь и Ralstonia eutropha (Davis 1969). гребешок. ноя » . Микробиология и иммунология . 39 (11): 897–904. DOI : 10.1111 / j.1348-0421.1995.tb03275.x . PMID 8657018 . S2CID 28187828 .  
  13. ^ a b c d e f Николаидис, Мариос; Моссиалос, Димитрис; Оливер, Стивен Дж .; Амуциас, Григориос Д. (24.07.2020). «Сравнительный анализ основных протеомов среди основных эволюционных групп Pseudomonas выявляет видоспецифические адаптации для Pseudomonas aeruginosa и Pseudomonas chlororaphis» . Разнообразие . 12 (8): 289. DOI : 10,3390 / d12080289 . ISSN 1424-2818 . 
  14. ^ Рихтер, Майкл; Росселло-Мора, Рамон (10 ноября 2009 г.). «Изменение золотого стандарта генома для определения видов прокариот» . Труды Национальной академии наук . 106 (45): 19126–19131. DOI : 10.1073 / pnas.0906412106 . ISSN 0027-8424 . PMC 2776425 . PMID 19855009 .   
  15. ^ Тран, Phuong N .; Савка, Михаил А .; Ган, Хан Мин (2017-07-12). «Таксономическая классификация 373 геномов In-silico выявляет неправильную идентификацию видов и новые геновиды в пределах рода Pseudomonas» . Границы микробиологии . 8 : 1296. DOI : 10,3389 / fmicb.2017.01296 . ISSN 1664-302X . PMC 5506229 . PMID 28747902 .   
  16. ^ a b Koehorst, Jasper J .; Дамба, фургон Джесси Си Джей; Черт, Рубен Г.А. ван; Сачченти, Эдоардо; Сантос, Витор А.П. Мартинс дос; Суарес-Диез, Мария; Шаап, Питер Дж. (2016-12-06). «Сравнение 432 штаммов Pseudomonas путем интеграции геномных, функциональных, метаболических и экспрессионных данных» . Научные отчеты . 6 (1): 38699. Bibcode : 2016NatSR ... 638699K . DOI : 10.1038 / srep38699 . ISSN 2045-2322 . PMC 5138606 . PMID 27922098 .   
  17. ^ Криг, Ноэль (1984). Руководство Берджи по систематической бактериологии, Том 1 . Балтимор: Уильямс и Уилкинс. ISBN 0-683-04108-8.
  18. ^ Мейер JM; Жоффрой В.А.; Байда Н; Гардан, Л .; и другие. (2002). «Типирование сидерофоров, мощный инструмент для идентификации флуоресцентных и нефлуоресцентных псевдомонад» . Прил. Environ. Microbiol . 68 (6): 2745–2753. DOI : 10,1128 / AEM.68.6.2745-2753.2002 . PMC 123936 . PMID 12039729 .  
  19. ^ Lau GW; Hassett DJ; Ran H; Конг Ф (2004). «Роль пиоцианина в инфекции Pseudomonas aeruginosa». Тенденции в молекулярной медицине . 10 (12): 599–606. DOI : 10.1016 / j.molmed.2004.10.002 . PMID 15567330 . 
  20. ^ Matthijs S; Tehrani KA; Laus G; Джексон RW; и другие. (2007). «Тиохинолобактин, сидерофор Pseudomonas с противогрибковым и антипитиевым действием». Environ. Microbiol . 9 (2): 425–434. DOI : 10.1111 / j.1462-2920.2006.01154.x . PMID 17222140 . 
  21. ^ Biello, Дэвид (28 февраля 2008) Do Микробы сделать снег? Scientific American
  22. ^ Хассетт D; Cuppoletti J; Trapnell B; Lymar S; и другие. (2002). «Анаэробный метаболизм и определение кворума биопленками Pseudomonas aeruginosa в дыхательных путях с хроническим муковисцидозом: переосмысление стратегий лечения антибиотиками и мишеней для лекарств». Adv Drug Deliv Rev . 54 (11): 1425–1443. DOI : 10.1016 / S0169-409X (02) 00152-7 . PMID 12458153 . 
  23. ^ а б Райан К.Дж.; Рэй CG, ред. (2004). Шеррис Медицинская микробиология (4-е изд.). Макгроу Хилл. ISBN 0-8385-8529-9.
  24. ^ Ван Eldere J (февраль 2003). «Многоцентровое наблюдение за паттернами восприимчивости к Pseudomonas aeruginosa при нозокомиальных инфекциях» . J. Antimicrob. Chemother . 51 (2): 347–352. DOI : 10,1093 / JAC / dkg102 . PMID 12562701 . 
  25. Перейти ↑ Poole K (январь 2004 г.). «Опосредованная оттоком множественная резистентность у грамотрицательных бактерий» . Clin. Microbiol. Заразить . 10 (1): 12–26. DOI : 10.1111 / j.1469-0691.2004.00763.x . PMID 14706082 . Архивировано из оригинала на 2013-01-05. 
  26. ^ «Стратегия троянского коня, выбранная для борьбы с бактериями». INFOniac.com. 2007-03-16. Проверено 20 ноября 2008.
  27. ^ Смит, Майкл (2007-03-16). «Галлий может обладать антибиотическими свойствами». MedPage сегодня. Проверено 20 ноября 2008.
  28. ^ Харди (2009). «Секретные белки синегнойной палочки : механизмы их экспорта и их вклад в патогенез». Бактериальные секретируемые белки: секреторные механизмы и роль в патогенезе . Caister Academic Press. ISBN 978-1-904455-42-4.
  29. ^ Brodey CL; Рейни ПБ; Тестер М; Джонстон К. (1991). «Бактериальная пятнистость культивируемых грибов вызывается ионным каналом, образующим липодепсипептидный токсин». Молекулярные взаимодействия растений и микробов . 1 (4): 407–11. DOI : 10.1094 / MPMI-4-407 .
  30. Перейти ↑ Young JM (1970). «Жаберные жабры: бактериальное заболевание культурных грибов, вызываемое Pseudomonas agarici n. Sp.» . NZ J Agric Res . 13 (4): 977–90. DOI : 10.1080 / 00288233.1970.10430530 .
  31. ^ Haas D; Defago G (2005). «Биологическая борьба с почвенными патогенами с помощью флуоресцентных псевдомонад». Обзоры природы микробиологии . 3 (4): 307–319. DOI : 10.1038 / nrmicro1129 . PMID 15759041 . S2CID 18469703 .  
  32. ^ Чин-А-Вунг TF; Bloemberg, Guido V .; Малдерс, Инэ Х.М.; Деккерс, Линда С.; и другие. (2000). « Заселение корней бактерией Pseudomonas chlororaphis PCL1391, продуцирующей феназин -1-карбоксамид, имеет важное значение для биологической борьбы с гнилью томатов и корневой гнилью» . Mol Plant Microbe Interactive . 13 (12): 1340–1345. DOI : 10.1094 / MPMI.2000.13.12.1340 . PMID 11106026 . 
  33. ^ Есипов; Аданин ВМ; Баскунов, БП; Киприанова Е.А.; и другие. (1975). «Новый антибиотически активный фторглюцид из Pseudomonas aurantiaca ». Антибиотики . 20 (12): 1077–81. PMID 1225181 . 
  34. ^ O'Mahony MM; Добсон А.Д .; Barnes JD; Синглтон I (2006). «Использование озона для восстановления почв, загрязненных полициклическими ароматическими углеводородами». Chemosphere . 63 (2): 307–314. Bibcode : 2006Chmsp..63..307O . DOI : 10.1016 / j.chemosphere.2005.07.018 . PMID 16153687 . 
  35. ^ Йен КМ; Карл MR; Blatt LM; Саймон, MJ; и другие. (1991). «Клонирование и характеристика кластера генов KR1 Pseudomonas mendocina , кодирующего толуол-4-монооксигеназу» . J. Bacteriol . 173 (17): 5315–27. DOI : 10.1128 / jb.173.17.5315-5327.1991 . PMC 208241 . PMID 1885512 .  
  36. ^ Huertas MJ; Луке-Альмагро ВМ; Мартинес-Луке М; Blasco, R .; и другие. (2006). «Цианидный метаболизм Pseudomonas pseudoalcaligenes CECT5344: роль сидерофоров». Биохим. Soc. Пер . 34 (Pt 1): 152–5. DOI : 10.1042 / BST0340152 . PMID 16417508 . 
  37. ^ Нодзири H; Maeda K; Сэкигучи Н; Урата, Масааки; и другие. (2002). «Организация и транскрипционная характеристика генов деградации катехолов, участвующих в деградации карбазола штаммом CA10 Pseudomonas Resinovorans» . Biosci. Biotechnol. Биохим . 66 (4): 897–901. DOI : 10.1271 / bbb.66.897 . PMID 12036072 . 
  38. ^ Нам; Чанг, Ю.С.; Hong, HB; Ли, Й.Е. (2003). «Новая катаболическая активность Pseudomonas veronii в биотрансформации пентахлорфенола». Прикладная микробиология и биотехнология . 62 (2–3): 284–290. DOI : 10.1007 / s00253-003-1255-1 . PMID 12883877 . S2CID 31700132 .  
  39. ^ Онака; Кенингер, М; Engesser, KH; Альтенбухнер, Дж (май 2007 г.). «Разложение алкилметилкетонов Pseudomonas veronii » . Журнал бактериологии . 189 (10): 3759–3767. DOI : 10.1128 / JB.01279-06 . PMC 1913341 . PMID 17351032 .  
  40. ^ Marqués S; Рамос Дж. Л. (1993). «Транскрипционный контроль катаболических путей плазмиды Pseudomonas putida TOL». Мол. Microbiol . 9 (5): 923–929. DOI : 10.1111 / j.1365-2958.1993.tb01222.x . PMID 7934920 . S2CID 20663917 .  
  41. ^ Сепульведа-Торрес; Rajendran, N; Дыбас, MJ; Колыбель, CS (1999). «Создание и начальная характеристика мутантов KC Pseudomonas stutzeri с нарушенной способностью разлагать четыреххлористый углерод». Arch Microbiol . 171 (6): 424–429. DOI : 10.1007 / s002030050729 . PMID 10369898 . S2CID 19916486 .  
  42. ^ a b c d Dasen, SE; LiPuma, JJ; Костман, младший; Стулл, Т.Л. (1 октября 1994 г.). «Характеристика ПЦР-риботипирования на Burkholderia (Pseudomonas) cepacia» . Журнал клинической микробиологии . 32 (10): 2422–2424. DOI : 10.1128 / JCM.32.10.2422-2424.1994 . ISSN 0095-1137 . PMC 264078 . PMID 7529239 .   
  43. ^ a b c d e Доган, Белгин; Бур, Кэтрин Дж. (1 января 2003 г.). «Генетическое разнообразие и возможности порчи среди видов Pseudomonas, выделенных из жидких молочных продуктов и предприятий по переработке молока» . Прикладная и экологическая микробиология . 69 (1): 130–138. DOI : 10,1128 / AEM.69.1.130-138.2003 . ISSN 0099-2240 . PMC 152439 . PMID 12513987 .   
  44. ^ a b c Казалинуово, Ида А .; Ди Пьеро, Донато; Колетта, Массимилиано; Ди Франческо, Паоло (1 ноября 2006 г.). «Применение электронных носов для диагностики заболеваний и обнаружения порчи пищевых продуктов» . Датчики . 6 (11): 1428–1439. DOI : 10.3390 / s6111428 . PMC 3909407 . 
  45. ^ а б в г Маган, Нареш; Павлов, Алексей; Хризантакис, Иоаннис (5 января 2001 г.). «Milk-sense: летучая сенсорная система распознает бактерии порчи и дрожжи в молоке». Датчики и исполнительные механизмы B: химические . 72 (1): 28–34. DOI : 10.1016 / S0925-4005 (00) 00621-3 .
  46. ^ Ван Ландсхут, А .; Rossau, R .; Де Лей, Дж. (1986). «Внутри- и межродовое сходство цистронов рибосомной рибонуклеиновой кислоты Acinetobacter » . Международный журнал систематической бактериологии . 36 (2): 150. DOI : 10.1099 / 00207713-36-2-150 .
  47. ^ a b Hertveldt, K .; Lavigne, R .; Плетенева, Е .; Сернова, Н .; Курочкина, Л .; Корчевский, Р .; Роббен, Дж .; Месянжинов, В .; Крылов, ВН; Volckaert, Г. (2005). «Сравнение генома больших фагов Pseudomonas aeruginosa » (PDF) . Журнал молекулярной биологии . 354 (3): 536–545. DOI : 10.1016 / j.jmb.2005.08.075 . PMID 16256135 . Архивировано из оригинального (PDF) 04 марта 2016 года . Проверено 27 августа 2015 .  
  48. ^ Lavigne, R .; Noben, JP; Hertveldt, K .; Ceyssens, PJ; Biers, Y .; Dumont, D .; Roucourt, B .; Крылов, ВН; Месянжинов, В.В.; Роббен, Дж .; Volckaert, Г. (2006). «Структурный протеом бактериофага Pseudomonas aeruginosa KMV». Микробиология . 152 (2): 529–534. DOI : 10.1099 / mic.0.28431-0 . PMID 16436440 . 
  49. ^ a b Ceyssens, P. -J .; Lavigne, R .; Mattheus, W .; Chibeu, A .; Hertveldt, K .; Mast, J .; Роббен, Дж .; Volckaert, Г. (2006). «Геномный анализ фагов Pseudomonas aeruginosa LKD16 и LKA1: создание подгруппы KMV в супергруппе T7» . Журнал бактериологии . 188 (19): 6924–6931. DOI : 10.1128 / JB.00831-06 . PMC 1595506 . PMID 16980495 .  
  50. ^ Ли, L .; Боэзи, Дж. (1966). «Характеристика бактериофага gh-1 для Pseudomonas putida » . Журнал бактериологии . Американское общество микробиологии. 92 (6): 1821–1827. DOI : 10.1128 / JB.92.6.1821-1827.1966 . PMC 316266 . PMID 5958111 .  
  51. Перейти ↑ Buchanan, RE (1955). «Таксономия». Ежегодный обзор микробиологии . 9 : 1–20. DOI : 10.1146 / annurev.mi.09.100155.000245 . PMID 13259458 . 

Внешние ссылки [ править ]

Общие [ править ]

  • Псевдомонады в происхождении дождя и снега в мире
  • Псевдомонады выживают в ядерном реакторе
  • База данных генома Pseudomonas
  • Псевдомонады
  • Видео о флуоресцентном псевдомонаде