Анализ отпечатков пальцев , также известный как анализ ингибирования удлинения праймеров , [1] - это метод, используемый в молекулярной биологии, который позволяет исследовать взаимодействия между информационной РНК и рибосомами или РНК-связывающими белками . [2] Он отличается от более широко используемого анализа отпечатков пальцев ДНК . Анализ отпечатков пальцев использовали для изучения образования комплекса инициации трансляции. [3]
Для проведения анализа отпечатка пальца необходимы интересующая мРНК, рибосомы, праймер ДНК , свободные нуклеотиды и обратная транскриптаза (RT), а также другие реагенты . [4] Анализ включает в себя возможность генерировать кДНК ОТ до тех пор, пока она не будет заблокирована какими-либо связанными рибосомами, в результате чего образуются более короткие фрагменты, называемые отпечатками пальцев, когда результаты наблюдаются на геле для секвенирования .
Рекомендации
- ^ Hartz, D .; McPheeters, DS; Траут, Р .; Голд, Л. (1988-01-01). «Анализ ингибирования удлинения комплексов инициации трансляции». Методы в энзимологии . 164 : 419–425. DOI : 10.1016 / s0076-6879 (88) 64058-4 . ISSN 0076-6879 . PMID 2468068 .
- ^ Широких, Николай Е .; Алкалаева, Елена З .; Василенко, Константин С .; Афонина, Жанна А .; Алехина, Ольга М .; Киселев, Лев Л .; Спирин, Александр Сергеевич (01.01.2010). «Количественный анализ комплексов рибосома – мРНК на разных этапах трансляции» . Исследования нуклеиновых кислот . 38 (3): e15. DOI : 10.1093 / NAR / gkp1025 . ISSN 0305-1048 . PMC 2817456 . PMID 19910372 .
- ^ Чанг, JT; Зеленый, CB; Вольф, RE (1995-11-01). «Ингибирование инициации трансляции мРНК gnd Escherichia coli путем образования вторичной структуры дальнего действия, включающей сайт связывания рибосомы и внутреннюю комплементарную последовательность» . Журнал бактериологии . 177 (22): 6560–6567. DOI : 10.1128 / jb.177.22.6560-6567.1995 . ISSN 0021-9193 . PMC 177509 . PMID 7592434 .
- ^ Козак, М (1998-11-01). «Анализ удлинения праймеров эукариотических комплексов рибосома-мРНК» . Исследования нуклеиновых кислот . 26 (21): 4853–4859. DOI : 10.1093 / NAR / 26.21.4853 . ISSN 0305-1048 . PMC 147915 . PMID 9776744 .
Внешние ссылки
- (A) Схема анализа ингибирования удлинения праймера (отпечатка пальца)