Фактор транскрипции II E ( TF II E ) является одним из нескольких общих факторов транскрипции, которые составляют преинициативный комплекс РНК-полимеразы II . [1] Он представляет собой тетрамер из двух альфа и двух бета-цепей и взаимодействует с TAF6 / TAFII80, ATF7IP и белком IE63 вируса ветряной оспы. [2]
TFIIE рекрутирует TFIIH в комплекс инициации и стимулирует активность киназы С-концевого домена РНК-полимеразы II и ДНК-зависимую АТФазную активность TFIIH. И TFIIH, и TFIIE необходимы для очистки промотора РНК-полимеразой. [2] Фактор транскрипции II E кодируется генами GTF2E1 и GTF2E2 . [3] [4] [5] [6] Считается, что TFIIE участвует в плавлении ДНК на промоторе : он содержит мотив цинковой ленты, который может связывать одноцепочечную ДНК. [7]
^ Левин, Бенджамин (2004). Гены VIII . Река Аппер Сэдл, Нью-Джерси: Пирсон Прентис Холл стр. 636 -637. ISBN0-13-144946-X.
^ a b "UniProtKB - P29083 (T2EA_HUMAN)" . UniProt . Проверено 19 октября 2016 .
^ Ohkuma Y, S Хашимото, Рёдер Р.Г., Хорикоси М (1992). «Идентификация двух больших субдоменов в TFIIE-альфа на основе гомологии между последовательностями Xenopus и человека» . Nucleic Acids Res . 20 (21): 5838. DOI : 10,1093 / NAR / 20.21.5838 . PMC 334425 . PMID 1454543 .
^ Сумитомо Н, Ohkuma У, Зинн Е, Като Н, Shimasaki S, Хорикоси М, Рёдер Р. (1991). «Мотивы консервативных последовательностей в малой субъединице общего фактора транскрипции человека TFIIE». Природа . 354 (6352): 401–4. Bibcode : 1991Natur.354..401S . DOI : 10.1038 / 354401a0 . PMID 1956404 . S2CID 4288495 .
^ Ohkuma Y, Сумитомо Н, Хоффман А, Shimasaki S, Хорикоси М, Рёдер RG (декабрь 1991). «Структурные мотивы и потенциальные сигма-гомологии в большой субъединице человеческого общего фактора транскрипции TFIIE». Природа . 354 (6352): 398–401. DOI : 10.1038 / 354398a0 . PMID 1956403 . S2CID 4325438 .
Перейти ↑ Lee TI, Young RA (2000). «Транскрипция генов, кодирующих эукариотические белки». Анну. Преподобный Жене . 34 : 77–137. DOI : 10.1146 / annurev.genet.34.1.77 . PMID 11092823 .
Внешние ссылки [ править ]
Транскрипция + фактор + TFIIE в Национальных медицинских предметных рубриках США (MeSH)
vтеПередача сигналов клеток / передача сигналов
Сигнальные пути
GPCR
Wnt
РТК
TGF бета
MAPK / ERK
Notch
JAK-STAT
Акт / ПКБ
Fas апоптоз
Бегемот
Путь PI3K / AKT / mTOR
Интегриновые рецепторы
Агенты
Рецепторные лиганды
Гормоны
Нейротрансмиттеры / нейропептиды / нейрогормоны
Цитокины
Факторы роста
Сигнальные молекулы
Рецепторы
Поверхность клетки
Внутриклеточный
Ко-рецептор
Второй посланник
цАМФ-зависимый путь
Сигнализация Ca 2+
Липидная сигнализация
Помощники:
Адаптерный белок, передающий сигнал
Каркасный белок
Факторы транскрипции
Общий
Комплекс преинициации транскрипции
TFIID
TFIIH
По расстоянию
Juxtacrine
АУТОКРИННЫЙ / Паракринный
Эндокринный
Другие концепции
Внутрикринное действие
Нейрокринная передача сигналов
Синаптическая передача
Химический синапс
Нейроэндокринная передача сигналов
Экзокринная передача сигналов
Феромоны
Механотрансдукция
Фототрансдукция
Стробирование ионного канала
Щелевой переход
vтеФакторы транскрипции и внутриклеточные рецепторы
(1) Базовые домены
(1.1) Базовая лейциновая молния ( bZIP )
Активирующий фактор транскрипции
AATF
1
2
3
4
5
6
7
АП-1
c-Fos
FOSB
FOSL1
FOSL2
JDP2
с-июн
JUNB
JunD
БАХ
1
2
BATF
BLZF1
C / EBP
α
β
γ
δ
ε
ζ
CREB
1
3
L1
CREM
ДАД
DDIT3
ГАБПА
GCN4
HLF
MAF
B
F
грамм
K
NFE
2
L1
L2
L3
NFIL3
NRL
NRF
1
2
3
XBP1
(1.2) Базовая спираль-петля-спираль ( bHLH )
Группа А
AS-C
ASCL1
ASCL2
ATOH1
РУКА
1
2
MESP2
Миогенные регуляторные факторы
MyoD
Миогенин
MYF5
MYF6
NeuroD
1
2
Нейрогенины
1
2
3
ОЛИГ
1
2
Paraxis
TCF15
Склераксис
SLC
LYL1
TAL
1
2
Крутить
Группа B
FIGLA
Мой с
c-Myc
l-Myc
n-Myc
MXD4
TCF4
Группа C bHLH- PAS
AhR
AHRR
ARNT
ARNTL
ARNTL2
ЧАСЫ
HIF
1А
EPAS1
3А
NPAS
1
2
3
SIM
1
2
Группа D
BHLH
2
3
9
Pho4
Я БЫ
1
2
3
4
Группа E
HES
1
2
3
4
5
6
7
ПРИВЕТ
1
2
L
Группа F bHLH-COE
EBF1
(1.3) bHLH-ZIP
АП-4
МАКСИМУМ
MXD1
MXD3
MITF
MNT
MLX
MLXIPL
MXI1
Мой с
SREBP
1
2
USF1
(1.4) НФ-1
NFI
А
B
C
Икс
SMAD
R-SMAD
1
2
3
5
9
I-SMAD
6
7
4 )
(1.5) RF-X
RFX
1
2
3
4
5
6
АНК
(1.6) Базовая спираль-пролет-спираль (bHSH)
АП-2
α
β
γ
δ
ε
(2) ДНК-связывающие домены цинкового пальца
(2.1) Ядерный рецептор (Cys 4 )
подсемейство 1
Гормон щитовидной железы
α
β
МАШИНА
FXR
LXR
α
β
PPAR
α
β / δ
γ
PXR
RAR
α
β
γ
ROR
α
β
γ
Rev-ErbA
α
β
VDR
подсемейство 2
КУП-ТФ
( Я
II
Ухо-2
HNF4
α
γ
PNR
RXR
α
β
γ
Рецептор яичка
2
4
TLX
подсемейство 3
Стероидный гормон
Андроген
Эстроген
α
β
Глюкокортикоид
Минералокортикоид
Прогестерон
Связанный с эстрогеном
α
β
γ
подсемейство 4
NUR
NGFIB
NOR1
NURR1
подсемейство 5
LRH-1
SF1
подсемейство 6
GCNF
подсемейство 0
DAX1
SHP
(2.2) Другой Cys 4
GATA
1
2
3
4
5
6
MTA
1
2
3
TRPS1
(2.3) Cys 2 His 2
Общие факторы транскрипции
TFIIA
TFIIB
TFIID
TFIIE
1
2
ТФИИФ
1
2
TFIIH
1
2
4
2I
3А
3C1
3C2
ATBF1
BCL
6
11А
11B
CTCF
E4F1
EGR
1
2
3
4
ERV3
GFI1
GLI- Kruppel семьи
1
2
3
ОТДЫХ
S1
S2
YY1
ИК
1
2
HIVEP
1
2
3
IKZF
1
2
3
ILF
2
3
KLF
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
ПРОДАЖА
1
2
3
4
SP
1
2
4
7
8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
7А
7B
ZBTB
11
16
17
20
32
33
40
цинковый палец
3
7
9
10
19
22
24
33B
34
35 год
41 год
43 год
44 год
51
74
143
146
148
165
202
217
219
238
239
259
267
268
281
295
300
318
330
346
350
365
366
384
423
451
452
471
593
638
644
649
655
804A
(2.4) Cys 6
HIVEP1
(2.5) Чередующийся состав
AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
1
2
4
ДЖАРИД
1А
1B
1С
1D
2
JMJD1B
(2.6) WRKY
WRKY
(3) Домены спираль-поворот-спираль
(3.1) Гомеодомен
Antennapedia класс Antp
protoHOX Hox-подобный
ParaHox
GSX
1
2
Xlox
PDX1
Cdx
1
2
4
расширенный Hox: Evx1
Evx2
MEOX1
MEOX2
Homeobox
A1
A2
A3
A4
A5
A7
A9
A10
A11
A13
B1
Би 2
B3
B4
B5
B6
B7
B8
B9
B13
C4
C5
C6
C8
C9
C10
C11
C12
C13
D1
D3
D4
D8
D9
D10
D11
D12
D13
GBX1
GBX2
MNX1
metaHOX NK-подобный
BARHL1
BARHL2
BARX1
BARX2
BSX
DBX
1
2
DLX
1
2
3
4
5
6
EMX
1
2
EN
1
2
HHEX
HLX
LBX1
LBX2
MSX
1
2
NANOG
NKX
2-1
2-2
2-3
2-5
3-1
3-2
HMX1
HMX2
HMX3
6-1
6-2
НАТО
TLX1
TLX2
TLX3
VAX1
VAX2
Другие
ARX
CRX
CUTL1
FHL
1
2
3
HESX1
HOPX
LMX
1А
1B
NOBOX
СКАЗКА
IRX
1
2
3
4
5
6
MKX
Я ЕСТЬ
1
2
АТС
1
2
3
PKNOX
1
2
ШЕСТЬ
1
2
3
4
5
PHF
1
3
6
8
10
16
17
20
21А
POU домен
PIT-1
БРН-3 : А
B
C
Фактор транскрипции октамера : 1
2
3/4
6
7
11
SATB2
ZEB
1
2
(3.2) Парная коробка
PAX
1
2
3
4
5
6
7
8
9
PRRX
1
2
PROP1
ФОКС
2А
2B
RAX
SHOX
SHOX2
VSX1
VSX2
Бикоид
GSC
BICD2
OTX
1
2
PITX
1
2
3
(3.3) Головка вилки / крылатая спираль
E2F
1
2
3
4
5
FOX белки
A1
A2
A3
C1
C2
D3
D4
E1
E3
F1
G1
H1
I1
J1
J2
K1
K2
L2
M1
N1
N3
O1
O3
O4
P1
P2
P3
P4
(3.4) Факторы теплового удара
HSF
1
2
4
(3.5) Кластеры триптофана
ELF
2
4
5
EGF
ELK
1
3
4
ERF
ETS
1
2
ЭРГ
СПИБ
ETV
1
4
5
6
FLI1
Факторы регуляции интерферона
1
2
3
4
5
6
7
8
MYB
MYBL2
(3.6) Домен TEA
фактор усиления транскрипции
1
2
3
4
(4) Факторы β-каркаса с малыми контактами канавок
(4.1) Область гомологии Rel
NF-κB
NFKB1
NFKB2
REL
РЕЛА
RELB
NFAT
C1
C2
C3
C4
5
(4.2) СТАТИСТИКА
СТАТИСТИКА
1
2
3
4
5
6
(4.3) p53-подобный
p53 p63 семья p73
p53
TP63
стр. 73
TBX
1
2
3
5
19
21 год
22
TBR1
TBR2
TFT
MYRF
(4.4) Коробка MADS
Mef2
А
B
C
D
SRF
(4.6) ТАТА-связывающие белки
TBP
TBPL1
(4.7) Высокомобильная группа
BBX
HMGB
1
2
3
4
HMGN
1
2
3
4
HNF
1А
1B
SOX
1
2
3
4
5
6
8
9
10
11
12
13
14
15
18
21 год
SRY
SSRP1
TCF / LEF
TCF
1
3
4
LEF1
ТОКС
1
2
3
4
(4.9) Зернистая голова
TFCP2
(4.10) Область холодного удара
CSDA
YBX1
(4.11) Runt
CBF
CBFA2T2
CBFA2T3
RUNX1
RUNX2
RUNX3
RUNX1T1
(0) Другие факторы транскрипции
(0.2) HMGI (Y)
HMGA
1
2
HBP1
(0.3) Карманный домен
Руб.
RBL1
RBL2
(0.5) Факторы, связанные с AP-2 / EREBP
Апетала 2
EREBP
B3
(0.6) Разное
ARID
1А
1B
2
3А
3B
4А
ШАПКА
ЕСЛИ Я
16
35 год
MLL
2
3
T1
MNDA
NFY
А
B
C
Ро / Сигма
см. также дефицит фактора транскрипции / корегулятора
Эта статья о генах - незавершенная . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .