В молекулярной биологии домен C4 коллагена IV типа (или домен NC1 коллагена IV) представляет собой дублированный домен, присутствующий на С-конце коллагенов IV типа . Каждый коллаген типа IV содержит длинный трехспиральный коллагеновый домен, фланкированный коротким 7S-доменом из 25 аминокислот и глобулярным неколлагеновым доменом C4 из ~ 230 аминокислот на N- и C-конце соответственно. В сборке протомеров домены C4 трех цепей взаимодействуют, образуя тример C4, чтобы выбрать и зарегистрировать цепи для образования тройной спирали . При сборке сети тримеры C4 двух протомеров взаимодействуют, образуя структуру гексамера C4, чтобы выбрать и соединить протомеры. [1] [2] [3]
C4 | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | ||||||||
Символ | C4 | |||||||
Pfam | PF01413 | |||||||
Клан пфам | CL0056 | |||||||
ИнтерПро | IPR001442 | |||||||
УМНАЯ | C4 | |||||||
ПРОФИЛЬ | PDOC00031 | |||||||
МЕРОПЫ | C47 | |||||||
SCOP2 | 1 час / СФЕРА / СУПФАМ | |||||||
TCDB | 2.A.16 | |||||||
|
Домен C4 коллагена IV содержит 12 цистеинов , и все они участвуют в дисульфидных связях . Он складывается в третичную структуру с преимущественно бета-цепями. Домен C4 коллагена IV состоит из двух подобным образом свернутых субдоменов, стабилизированных 3 внутрицепочечными дисульфидными связями, включающими следующие пары: C1-C6, C2-C5 и C3-C4. Каждый субдомен представляет собой компактную стабилизированную дисульфидом треугольную структуру, из которой петля в виде пальца шпильки выступает в не полностью сформированный шестицепочечный бета-лист соседнего субдомена того же самого или соседней цепи, плотно зажимая субдомены вместе. [1] [2] [3]
Рекомендации
- ^ a b Than ME, Хенрих С., Хубер Р., Рис А., Манн К., Кун К., Тимпл Р., Буренков Г. П., Бартуник Г. Д., Боде В. (май 2002 г.). «Кристаллическая структура 1.9-A неколлагенового (NC1) домена коллагена IV плаценты человека демонстрирует стабилизацию через новый тип ковалентной поперечной связи Met-Lys» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 99 (10): 6607–12. DOI : 10.1073 / pnas.062183499 . PMC 124450 . PMID 12011424 .
- ^ а б Сундарамурти М., Мейаппан М., Тодд П., Хадсон Б.Г. (август 2002 г.). «Кристаллическая структура доменов NC1. Структурная основа сборки коллагена IV типа в базальных мембранах» . J. Biol. Chem . 277 (34): 31142–53. DOI : 10.1074 / jbc.M201740200 . PMID 11970952 .
- ^ а б Ванакор Р. М., Шанмугасундарарадж С., Фридман Д. Б., Бондар О., Хадсон Б. Г., Сундарамурти М. (октябрь 2004 г.). «Сеть alpha1.alpha2 коллагена IV. Усиленная стабилизация неколлагенового домена-1 нековалентными силами и отсутствием поперечных связей Met-Lys» . J. Biol. Chem . 279 (43): 44723–30. DOI : 10.1074 / jbc.M406344200 . PMID 15299013 .