Varisulca

Varisulca

Ancyromonas sp.
Научная классификация
Домен:	Эукариоты
Клэйд :	Opimoda
Клэйд :	Подята
(без рейтинга):	Варисулка Кавальер-Смит , 2002 г.
Классы
Хиломонадеа Дифиллатея Glissodiscea

Varisulca был предложенным базальным таксоном Podiate . ^[1] Он включал несколько ветвей гетеротрофных протистов , в первую очередь анциромонады (планомонады), коллодиктиониды (дифиллеиды), ригифилиды ( Rigifila , Micronuclearia ) и мантамонадиды . Недавние данные свидетельствуют о том, что последние три тесно связаны друг с другом, образуя кладу, называемую CRuM , но маловероятно , что это связано конкретно с анциромонадами ^[2]

Кавалье-Смит предложил новый подтип Varisulca, который состоит из классов Hilomonadea , Diphyllatea и Glissodiscea . ^[3] Обоснованность этой предложенной таксономии еще не решена Обществом протистологов. Маловероятно, что он получит широкое признание, поскольку Varisulca, по-видимому, является парафилетическим или полифилетическим (анциромонады не считаются сестринской группой CRuM). Glissodiscea и Multirhiza (таксон, включающий Diphyllatea и Glissodiscea) также кажутся парафилетическими или полифилетическими, поскольку Mantamonas принадлежит к CRuM, а анциромонады - нет.

Varisulca, по-видимому, является парафилетическим стволом Podiata . Таким образом, другие базальные Podiata, такие как Malawimonas , Metamonada и / или Amoebozoa и Amorphea, могли появиться в Varisulca. ^[4]^[5] Некоторые группы Apusozoa теперь считаются Varisulca. Apusomonadida (например Thecamonas ) в настоящее время непосредственно не связанный с Varisulca но считается сестрой из заднежгутиковых . Sulcozoa (первоначально только Varisulca и Apusozoa) ^[6] теперь включает Unikonta / Amorphea и становится эквивалентом (основы) Podiata и Sarcomastigota.^{[ необходима цитата ]}

Эукариоты

Скотокариоты /

Метамонада

Малавимонас

Подята

Varisulca

Аморфея /

Амебозоа

Obazoa

Breviata

	Апусомонадида

	Опистоконта

Юниконт

Opimoda / Neozoa

Corticata / Diphoda / Diaphoretickes / Bikont

Mantamonadida , кажется, сестра Apusomonadida в Apusozoa в некоторых выводах. ^[7]^[8]

Таксономия [ править ]

[Предупреждение: Varisulca, Multirhiza и Glissodiscea не имеют молекулярной филогенетической поддержки и, согласно недавним исследованиям, являются сильно немонофилетическими]

Подтип Varisulca Cavalier-Smith 2012

Суперкласс Hilomonadia Cavalier-Smith 2012
- Класс Hilomonadea Cavalier-Smith 2008 em. 2012 г.
  - Заказать Rigifilida Cavalier-Smith & Yabuki 2012
    - Семья Rigifilidae Cavalier-Smith & Yabuki 2012
      - Род Rigifila Cavalier-Smith & Yabuki 2012
    - Семейство Micronucleariidae Cavalier-Smith 2008
      - Род Micronuclearia Mikrjukov & Mylnikov 2001
Суперкласс Multirhiza Cavalier-Smith 2012
- Класс Diphyllatea Cavalier-Smith 2003 [Anisomonadea]
  - Отряд Diphylleida Cavalier-Smith 1993 [Collodictyonida]
    - Семья Sulcomonadidae Cavalier-Smith 2012
      - Род Sulcomonas Brugerolle 2006
    - Семейство Diphylleidae Cavalier-Smith, 1993 [Collodictyonidae Brugerolle et al. 2002 ]
      - Род Diphylleia Massart 1920 non Michaux 1803
      - Род Collodictyon Carter 1865.
- Класс Glissodiscea Cavalier-Smith 2012
  - Заказать Discocelida Cavalier-Smith 1997 г.
    - Семья Discoceliidae Cavalier-Smith 2012
      - Род Discocelia Cavalier-Smith 2013 [ Discocelis Vørs 1988 non Ehrenberg 1836 ]
  - Заказать Mantamonadida Cavalier-Smith Glücksman et al. 2011 г.
    - Семейство Mantamonadidae Cavalier-Smith Glücksman et al. 2011 г.
      - Род Mantamonas Cavalier-Smith Glücksman et al. 2011 г.
  - Заказ Planomonadida Cavalier-Smith 2008 ^[9] ( Ancyromonadida Cavalier-Smith 1998 исправление. Аткинс 2000 )
    - Семья Ancyromonadidae Cavalier-Smith 1993
      - Род Ancyromonas Kent 1880 г.
    - Семейство Planomonadidae Cavalier-Smith 2008
      - Род Fabomonas Glücksman & Cavalier-Smith 2013.
      - Род Planomonas Cavalier-Smith 2008 исправляет. Кавалер-Смит 2013
    - Семейство Nutomonadidae Cavalier-Smith 2013
      - Род Nutomonas Cavalier-Smith 2013.

Ссылки [ править ]

^ Кавальер-Смит, Томас; Chao, Ema E .; Snell, Elizabeth A .; Берни, Седрик; Фиоре-Донно, Анна Мария; Льюис, Родри (01.12.2014). «Многогенная филогения эукариот раскрывает вероятных простейших предков опистоконтов (животных, грибов, хоанозоа) и амебозоа» . Молекулярная филогенетика и эволюция . 81 : 71–85. DOI : 10.1016 / j.ympev.2014.08.012 . PMID 25152275 .
^ Браун, Мэтью W; Хейсс, Аарон А; Камикава, Риома; Инагаки, Юдзи; Ябуки, Акинори; Тайс, Александр К; Ширатори, Такаши; Исида, Кен-Ичиро; Хасимото, Тецуо (19 января 2018 г.). «Филогеномика помещает сиротские линии протистана в новую эукариотическую супергруппу» . Геномная биология и эволюция . 10 (2): 427–433. DOI : 10.1093 / GbE / evy014 . ISSN 1759-6653 . PMC 5793813 . PMID 29360967 .
Перейти ↑ Cavalier-Smith T (2013). «Ранняя эволюция способов питания эукариот, структурное разнообразие клеток и классификация простейших типов Loukozoa, Sulcozoa и Choanozoa». Eur J Protistol . 49 (2): 115–78. DOI : 10.1016 / j.ejop.2012.06.001 . PMID 23085100 .
^ Cavalier-Smith, Томас (2017-02-05). «Происхождение многоклеточности животных: предшественники, причины, последствия - переход хоанофлагеллята / губка, нейрогенез и кембрийский взрыв» . Фил. Пер. R. Soc. B . 372 (1713): 20150476. DOI : 10.1098 / rstb.2015.0476 . ISSN 0962-8436 . PMC 5182410 . PMID 27994119 .
^ Кавальер-Смит, Томас; Chao, Ema E .; Льюис, Родри (2016). «Филогения из 187 генов простейших типа Amoebozoa раскрывает новый класс (Cutosea) глубоко разветвленных, ультраструктурно уникальных, обволакивающих морских Lobosa и проясняет эволюцию амеб» . Молекулярная филогенетика и эволюция . 99 : 275–296. DOI : 10.1016 / j.ympev.2016.03.023 . PMID 27001604 .
↑ Ruggiero, Michael A .; Гордон, Деннис П .; Оррелл, Томас М .; Байи, Николас; Бургуэн, Тьерри; Бруска, Ричард С .; Кавальер-Смит, Томас; Guiry, Michael D .; Кирк, Пол М. (2015-04-29). «Классификация всех живых организмов высшего уровня» . PLOS ONE . 10 (4): e0119248. Bibcode : 2015PLoSO..1019248R . DOI : 10.1371 / journal.pone.0119248 . ISSN 1932-6203 . PMC 4418965 . PMID 25923521 .
^ Glucksman E, Снелл Е.А., Berney C, Chao EE, Bass D, Cavalier-Smith T (сентябрь 2010). "Новый род морских планирующих зоофлагеллят Mantamonas (Mantamonadida ord. N .: Apusozoa)". Протист . 162 (2): 207–221. DOI : 10.1016 / j.protis.2010.06.004 . PMID 20884290 .
^ Орр, Рассел Дж. С.; Чжао, Сен; Клавенесс, Даг; Ябуки, Акинори; Икеда, Кейджи; Макото, Ватанабэ М .; Шалчян-Тебризи, Камран (2017-10-08). «Загадочные эукариоты Diphyllatea: культивирование и целевое секвенирование ампликона PacBio RS выявили таксономическое разнообразие более высокого порядка и глобальное распространение». bioRxiv 10.1101 / 199125 .
^ Glucksman, Snell & Cavalier-Smith (2013). «Филогения и эволюция Planomonadida (Sulcozoa): восемь новых видов и новых родов Fabomonas и Nutomonas». Европейский журнал протистологии . 49 (2): 179–200. DOI : 10.1016 / j.ejop.2012.08.007 . PMID 23369787 .

[1] Кавальер-Смит, Томас; Chao, Ema E .; Snell, Elizabeth A .; Берни, Седрик; Фиоре-Донно, Анна Мария; Льюис, Родри (01.12.2014). «Многогенная филогения эукариот раскрывает вероятных простейших предков опистоконтов (животных, грибов, хоанозоа) и амебозоа» . Молекулярная филогенетика и эволюция . 81 : 71–85. DOI : 10.1016 / j.ympev.2014.08.012 . PMID 25152275 .

[2] Браун, Мэтью W; Хейсс, Аарон А; Камикава, Риома; Инагаки, Юдзи; Ябуки, Акинори; Тайс, Александр К; Ширатори, Такаши; Исида, Кен-Ичиро; Хасимото, Тецуо (19 января 2018 г.). «Филогеномика помещает сиротские линии протистана в новую эукариотическую супергруппу» . Геномная биология и эволюция . 10 (2): 427–433. DOI : 10.1093 / GbE / evy014 . ISSN 1759-6653 . PMC 5793813 . PMID 29360967 .

[Cavalier-Smith2013-3] Перейти ↑ Cavalier-Smith T (2013). «Ранняя эволюция способов питания эукариот, структурное разнообразие клеток и классификация простейших типов Loukozoa, Sulcozoa и Choanozoa». Eur J Protistol . 49 (2): 115–78. DOI : 10.1016 / j.ejop.2012.06.001 . PMID 23085100 .

[4] Cavalier-Smith, Томас (2017-02-05). «Происхождение многоклеточности животных: предшественники, причины, последствия - переход хоанофлагеллята / губка, нейрогенез и кембрийский взрыв» . Фил. Пер. R. Soc. B . 372 (1713): 20150476. DOI : 10.1098 / rstb.2015.0476 . ISSN 0962-8436 . PMC 5182410 . PMID 27994119 .

[5] Кавальер-Смит, Томас; Chao, Ema E .; Льюис, Родри (2016). «Филогения из 187 генов простейших типа Amoebozoa раскрывает новый класс (Cutosea) глубоко разветвленных, ультраструктурно уникальных, обволакивающих морских Lobosa и проясняет эволюцию амеб» . Молекулярная филогенетика и эволюция . 99 : 275–296. DOI : 10.1016 / j.ympev.2016.03.023 . PMID 27001604 .

[6] Ruggiero, Michael A .; Гордон, Деннис П .; Оррелл, Томас М .; Байи, Николас; Бургуэн, Тьерри; Бруска, Ричард С .; Кавальер-Смит, Томас; Guiry, Michael D .; Кирк, Пол М. (2015-04-29). «Классификация всех живых организмов высшего уровня» . PLOS ONE . 10 (4): e0119248. Bibcode : 2015PLoSO..1019248R . DOI : 10.1371 / journal.pone.0119248 . ISSN 1932-6203 . PMC 4418965 . PMID 25923521 .

[pmid20884290-7] Glucksman E, Снелл Е.А., Berney C, Chao EE, Bass D, Cavalier-Smith T (сентябрь 2010). "Новый род морских планирующих зоофлагеллят Mantamonas (Mantamonadida ord. N .: Apusozoa)". Протист . 162 (2): 207–221. DOI : 10.1016 / j.protis.2010.06.004 . PMID 20884290 .

[8] Орр, Рассел Дж. С.; Чжао, Сен; Клавенесс, Даг; Ябуки, Акинори; Икеда, Кейджи; Макото, Ватанабэ М .; Шалчян-Тебризи, Камран (2017-10-08). «Загадочные эукариоты Diphyllatea: культивирование и целевое секвенирование ампликона PacBio RS выявили таксономическое разнообразие более высокого порядка и глобальное распространение». bioRxiv 10.1101 / 199125 .

[Glücksman,_Snell_&_Cavalier-Smith_2013-9] Glucksman, Snell & Cavalier-Smith (2013). «Филогения и эволюция Planomonadida (Sulcozoa): восемь новых видов и новых родов Fabomonas и Nutomonas». Европейский журнал протистологии . 49 (2): 179–200. DOI : 10.1016 / j.ejop.2012.08.007 . PMID 23369787 .

[1]