Из Википедии, свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску

Victivallis vadensis
Научная классификация
Царство:
Бактерии
Тип:
Lentisphaerae
Класс:
Лентисфаерия
Приказ:
Victivallales
Семья:
Victivallaceae
Род:
Victivallis
Разновидность:
vadensis
Биномиальное имя
Victivallis vadensis

Victivallis vadensis - это грамотрицательные кокковидные бактерии, обнаруженные в пищеварительном тракте человека. [1] Его диаметр составляет примерно 0,5–1,3 микрометра, он неподвижен, хемоорганотрофен и не образует споры. [2] Victivallis vadensis строго анаэробен , как и 90 процентов бактерий в пищеварительной системе человека. [3]

История [ править ]

Victivallis vadensis был первоначально известен как штамм Cello T , поскольку он может использовать целлобиозу в качестве источника углерода (Прокариоты), но был переименован в область в Нидерландах, известную как пищевая долина, недалеко от ученых из Университета Вагенингена , которые впервые идентифицировали организм. Victus по-латыни означает «еда», vallis по-латыни означает «долина»; «Продовольственная долина» относится к « Продовольственной долине » Вагенингена в Нидерландах, в которой наука о продуктах питания является одной из нескольких популярных областей исследований. Vada of vadensis относится к Вагенингену. [2]

Разнообразие [ править ]

Victavallis vadensis - это факультативный анаэроб, как и большинство кишечных микробов. На сегодняшний день он был получен только из фекалий человека, и поэтому известно, что он существует только в желудочно-кишечном тракте человека [2], и в настоящее время является единственным организмом, принадлежащим к отряду Victivallales и роду Victivallis . [4] Посредством секвенирования 16S рРНК было определено, что штамм Cello T образует свой собственный кластер в подразделении Verrumicrobia , и были обнаружены два родственных, но некультивируемых клона, которые имеют 94% сходства последовательностей гена 16S рРНК. [2]

В Victavallis vadensis геном содержит 4,577,257 базы с 3,541 последовательностей , кодирующих белок, из которых 2 031 являются функциональными. Основания GC составляют 59,5% ДНК. [1] Эта бактерия наиболее близка к Lentisphaera araneosa с 84,4% той же 16S рРНК. [4] Эти два организма также различаются в зависимости от среды, в которой они обитают. Lentisphaera spp. находятся в морской воде, а V. vadensis - в пищеварительной системе человека. [5]

Посмотреть последние данные генетического секвенирования Victavallis vadensis можно здесь: Запись GenBank ABDE02000001.1 Запись GenBank ABDE02000027.1

Бактерии -> Lentisphaerae ->, включая Oligosphaera ethanolica , Lentisphaera araneosa и Victivallis vadensis [5]

 
 

Oligosphaera ethanolica [4]

 
 
 

Lentisphaera araneosa [4]

 
 

Victivallis vadensis [2]

 
 
 

Биохимия [ править ]

Поскольку более половины микробиома кишечника человека еще предстоит культивировать, недавно обнаруженные виды, такие как Victivallis vadensis, нуждаются в тщательном культивировании, чтобы определить, в каких ситуациях они лучше всего развиваются. Этот микроб, взятый из образца фекалий человека, был впервые выращен в Нидерландах при оптимальной температуре 37 градусов Цельсия и 6,5 pH. Исследователи обнаружили, что он лучше всего растет в жидком или мягком агаре с одним из следующих сахаров: целлобиоза, фруктоза, галактоза, глюкоза, лактоза, лактулоза, мальтоза, мальтотриоза, маннит, мелибиоза, мио-инозит, рафтилоза, рамноза, рибоза, сахароза и цилоза » [2], которые он использует в ферментативных целях. [4] Формирование бактериальных колоний в этих условиях занимает около 10 дней. [2]

Victivallis vadensis образует слизистый слой за пределами своей клеточной мембраны , [2] , который появляется гало, как при микроскопическом исследовании. [4] Исследователи также могли видеть скопления с плотными группами электронов внутри клеток, которые, по их мнению, являются осадками белков или используются для хранения клеток. [2] Колонии имеют форму линз, [4] бежевые и блестящие. [2] Его можно культивировать синтрофически с Methanospirillum hungatei , где он производит метан из глюкозы в соответствующих средах. При попытке выделить в культуре стрептомицин и полимиксин Bмогут быть добавлены в среду для предотвращения роста загрязняющих агентов; следовательно, Victivallis vadensis устойчив к стрептомицину и полимиксину B. [4]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c Ван Пассель, Марк (11 марта 2011 г.). «Последовательность генома Victivallis vadensis ATCC BAA-548, анаэробной бактерии из Phylum Lentisphaerae, выделенной из желудочно-кишечного тракта человека» . Журнал бактериологии . 193 (9): 2373–2374. DOI : 10.1128 / JB.00271-11 . PMC  3133096 . PMID  21398537 .
  2. ^ Б с д е е г ч я J K Zoetendal, Эрвин Г. (2003). «Victivallis vadensis gen. Nov., Sp. Nov., Анаэроб, ферментирующий сахар, из человеческих фекалий» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 53 (1): 211–215. DOI : 10.1099 / ijs.0.02362-0 . PMID 12656175 . 
  3. ^ a b Гварнер, Франциско (8 февраля 2003 г.). «Флора кишечника в здоровье и болезни» . Ланцет . 361 (9356): 512–519. DOI : 10.1016 / S0140-6736 (03) 12489-0 . PMID 12583961 . Проверено 11 ноя 2014 . 
  4. ↑ a b c d e f g h i Чо, Чан-Чхон (2011). Руководство Берджи по систематической бактериологии (2-е изд.). Нью-Йорк: Springer Verlag. С. 13, 785–793. ISBN 978-0-387-68572-4.
  5. ^ a b c Чо, Чан-Чхон (2004). «Lentisphaera araneosa gen. Nov., Sp. Nov, прозрачный экзополимер, продуцирующий морскую бактерию, и описание нового бактериального типа, Lentisphaerae». Экологическая микробиология . 6 (6): 611–621. DOI : 10.1111 / j.1462-2920.2004.00614.x . PMID 15142250 . 

Внешние ссылки [ править ]

  • Типовой штамм Victivallis vadensis в Bac Dive - база метаданных по бактериальному разнообразию